MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	AG	3	6	21	26	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015955	TC	3	6	1005	1010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015955	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015955	AT	3	6	2238	2243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015955	AT	3	6	3105	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015955	GA	3	6	5590	5595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015955	TC	3	6	7863	7868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015955	TG	3	6	12909	12914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015955	CT	3	6	15081	15086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015955	AC	4	8	17284	17291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015955	AT	3	6	27933	27938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015955	CA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015955	TA	3	6	28118	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015955	GA	3	6	36204	36209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015955	TA	3	6	37791	37796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015955	AT	3	6	57919	57924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015955	GA	3	6	58092	58097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015955	CT	3	6	58337	58342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015955	GC	3	6	59692	59697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015955	TG	3	6	60976	60981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015955	CG	3	6	62642	62647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015955	GC	3	6	62697	62702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015955	GT	3	6	62812	62817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015955	TA	3	6	64976	64981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015955	GC	4	8	72376	72383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015955	GT	3	6	73676	73681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015955	TC	3	6	74772	74777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015955	CT	3	6	76630	76635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015955	AG	3	6	79174	79179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015955	AC	3	6	80129	80134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015955	GA	3	6	80284	80289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015955	AC	3	6	82070	82075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015955	TC	3	6	89544	89549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015955	AT	3	6	90296	90301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015955	TA	3	6	90333	90338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015955	GA	3	6	91412	91417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015955	TG	3	6	91514	91519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015955	GA	3	6	91895	91900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015955	CG	3	6	92724	92729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015955	AC	3	6	93163	93168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015955	TA	4	8	93706	93713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015955	CA	3	6	96995	97000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015955	TA	3	6	97599	97604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015955	AC	3	6	97678	97683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015955	TC	3	6	97913	97918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015955	AT	3	6	98070	98075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015955	AT	3	6	98110	98115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015955	AC	3	6	98473	98478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015955	AC	3	6	98625	98630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015955	GA	3	6	98674	98679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015955	TC	3	6	98696	98701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015955	AT	3	6	99534	99539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015955	AG	3	6	100310	100315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015955	GA	3	6	100472	100477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015955	TA	3	6	102705	102710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015955	AT	4	8	109373	109380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015955	GT	3	6	111059	111064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015955	GA	3	6	111222	111227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015955	CT	3	6	113410	113415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015955	GA	3	6	114974	114979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015955	CA	3	6	116470	116475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015955	AC	3	6	116536	116541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015955	AG	3	6	118639	118644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015955	AG	3	6	119616	119621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015955	TG	3	6	119858	119863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015955	GC	3	6	119876	119881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015955	GA	3	6	120400	120405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015955	TA	3	6	120793	120798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015955	AC	3	6	135787	135792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015955	CT	3	6	135832	135837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015955	GA	3	6	136481	136486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015955	CT	3	6	140836	140841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015955	TC	4	8	142704	142711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015955	TC	3	6	144112	144117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015955	CT	3	6	144323	144328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015955	TC	3	6	145925	145930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015955	GT	3	6	146739	146744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015955	GA	3	6	147638	147643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015955	CT	3	6	150316	150321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015955	AG	3	6	151725	151730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015955	CG	4	8	154307	154314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015955	AT	3	6	160374	160379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015955	GA	3	6	160589	160594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_015955	CG	3	6	162643	162648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015955	GC	4	8	165202	165209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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88	NC_015955	GA	3	6	165515	165520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015955	CA	3	6	169030	169035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015955	GT	3	6	170734	170739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015955	CG	3	6	186991	186996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015955	CT	3	6	187005	187010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015955	AT	3	6	187378	187383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015955	TA	3	6	189608	189613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015955	TC	3	6	193557	193562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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97	NC_015955	GA	3	6	195073	195078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015955	GT	3	6	195337	195342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015955	AC	3	6	198368	198373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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101	NC_015955	AC	3	6	198612	198617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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109	NC_015955	GC	3	6	219539	219544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015955	CT	3	6	219600	219605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015955	GA	4	8	221226	221233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015955	GA	3	6	221455	221460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015955	TG	3	6	221684	221689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015955	GA	3	6	221775	221780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015955	AC	3	6	221865	221870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015955	TC	3	6	226208	226213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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118	NC_015955	TA	3	6	226997	227002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015955	TG	3	6	228163	228168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015955	CG	3	6	228495	228500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015955	CG	3	6	228580	228585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015955	GA	3	6	233889	233894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015955	TA	4	8	235814	235821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015955	GC	4	8	236191	236198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015955	CG	4	8	236203	236210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015955	GA	3	6	237860	237865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_015955	AT	3	6	270599	270604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015955	AC	3	6	270650	270655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015955	CA	3	6	282840	282845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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133	NC_015955	GC	3	6	285111	285116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015955	GC	3	6	286916	286921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015955	TC	3	6	288081	288086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015955	TA	3	6	288203	288208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015955	GA	3	6	292900	292905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015955	CT	3	6	294028	294033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015955	CG	3	6	294453	294458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015955	GC	3	6	294510	294515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015955	GT	3	6	295537	295542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015955	GA	3	6	295697	295702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015955	GA	3	6	297150	297155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015955	TC	3	6	298475	298480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015955	TA	3	6	301599	301604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015955	TA	3	6	301613	301618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015955	GA	3	6	301654	301659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015955	AG	3	6	301707	301712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015955	CT	3	6	302142	302147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015955	AT	3	6	302386	302391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015955	GC	3	6	310697	310702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015955	CG	4	8	310863	310870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.