MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	T	6	6	1539	1544	0 %	100 %	0 %	0 %	345006829
2	NC_015955	T	6	6	1907	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	345006829
3	NC_015955	T	6	6	2706	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	345006830
4	NC_015955	A	6	6	5747	5752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015955	A	6	6	7031	7036	100 %	0 %	0 %	0 %	345006835
6	NC_015955	A	6	6	8120	8125	100 %	0 %	0 %	0 %	345006836
7	NC_015955	A	7	7	9197	9203	100 %	0 %	0 %	0 %	345006837
8	NC_015955	T	6	6	9476	9481	0 %	100 %	0 %	0 %	345006837
9	NC_015955	A	7	7	9829	9835	100 %	0 %	0 %	0 %	345006837
10	NC_015955	T	7	7	15111	15117	0 %	100 %	0 %	0 %	345006841
11	NC_015955	T	6	6	15309	15314	0 %	100 %	0 %	0 %	345006841
12	NC_015955	T	6	6	15840	15845	0 %	100 %	0 %	0 %	345006841
13	NC_015955	A	6	6	19881	19886	100 %	0 %	0 %	0 %	345006842
14	NC_015955	A	6	6	22088	22093	100 %	0 %	0 %	0 %	345006844
15	NC_015955	A	6	6	23898	23903	100 %	0 %	0 %	0 %	345006844
16	NC_015955	A	6	6	24291	24296	100 %	0 %	0 %	0 %	345006845
17	NC_015955	A	6	6	26235	26240	100 %	0 %	0 %	0 %	345006845
18	NC_015955	A	6	6	28031	28036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015955	T	6	6	31981	31986	0 %	100 %	0 %	0 %	345006850
20	NC_015955	A	6	6	32097	32102	100 %	0 %	0 %	0 %	345006850
21	NC_015955	G	6	6	44055	44060	0 %	0 %	100 %	0 %	345006863
22	NC_015955	C	6	6	54111	54116	0 %	0 %	0 %	100 %	345006868
23	NC_015955	C	6	6	58467	58472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_015955	C	6	6	63035	63040	0 %	0 %	0 %	100 %	345006878
25	NC_015955	G	6	6	63827	63832	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015955	A	7	7	64250	64256	100 %	0 %	0 %	0 %	345006879
27	NC_015955	A	7	7	66214	66220	100 %	0 %	0 %	0 %	345006882
28	NC_015955	T	6	6	72309	72314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015955	C	6	6	81982	81987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_015955	A	6	6	84116	84121	100 %	0 %	0 %	0 %	345006898
31	NC_015955	A	6	6	84377	84382	100 %	0 %	0 %	0 %	345006898
32	NC_015955	A	6	6	85476	85481	100 %	0 %	0 %	0 %	345006898
33	NC_015955	G	6	6	86164	86169	0 %	0 %	100 %	0 %	345006899
34	NC_015955	T	6	6	93479	93484	0 %	100 %	0 %	0 %	345006903
35	NC_015955	T	6	6	97125	97130	0 %	100 %	0 %	0 %	345006906
36	NC_015955	A	6	6	100073	100078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015955	A	6	6	100250	100255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015955	G	6	6	116012	116017	0 %	0 %	100 %	0 %	345006923
39	NC_015955	A	6	6	116509	116514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015955	C	6	6	118886	118891	0 %	0 %	0 %	100 %	345006928
41	NC_015955	T	6	6	120596	120601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015955	G	6	6	122577	122582	0 %	0 %	100 %	0 %	345006930
43	NC_015955	A	6	6	124370	124375	100 %	0 %	0 %	0 %	345006931
44	NC_015955	A	6	6	125186	125191	100 %	0 %	0 %	0 %	345006931
45	NC_015955	A	6	6	127647	127652	100 %	0 %	0 %	0 %	345006934
46	NC_015955	A	6	6	128551	128556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015955	T	6	6	131851	131856	0 %	100 %	0 %	0 %	345006937
48	NC_015955	C	6	6	135838	135843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_015955	T	6	6	138565	138570	0 %	100 %	0 %	0 %	345006942
50	NC_015955	T	6	6	139882	139887	0 %	100 %	0 %	0 %	345006943
51	NC_015955	T	6	6	140358	140363	0 %	100 %	0 %	0 %	345006943
52	NC_015955	C	6	6	140773	140778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_015955	A	6	6	140803	140808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015955	G	6	6	152963	152968	0 %	0 %	100 %	0 %	345006952
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64	NC_015955	T	6	6	191114	191119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015955	C	6	6	194189	194194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_015955	C	6	6	195409	195414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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74	NC_015955	G	6	6	228723	228728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_015955	T	6	6	295527	295532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015955	G	6	6	303439	303444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_015955	G	6	6	307971	307976	0 %	0 %	100 %	0 %	345007083
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93	NC_015955	G	7	7	322472	322478	0 %	0 %	100 %	0 %	345007096
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102	NC_015955	C	6	6	358237	358242	0 %	0 %	0 %	100 %	345007131
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105	NC_015955	A	6	6	363809	363814	100 %	0 %	0 %	0 %	345007139
106	NC_015955	A	6	6	365022	365027	100 %	0 %	0 %	0 %	345007140
107	NC_015955	A	6	6	365128	365133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015955	A	6	6	369593	369598	100 %	0 %	0 %	0 %	345007143
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111	NC_015955	A	6	6	374810	374815	100 %	0 %	0 %	0 %	345007150
112	NC_015955	A	6	6	378163	378168	100 %	0 %	0 %	0 %	345007156
113	NC_015955	G	6	6	381091	381096	0 %	0 %	100 %	0 %	345007158
114	NC_015955	C	6	6	390039	390044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_015955	C	6	6	394031	394036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_015955	T	6	6	399112	399117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015955	G	6	6	403031	403036	0 %	0 %	100 %	0 %	345007173
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121	NC_015955	C	6	6	408518	408523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_015955	G	6	6	410367	410372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015955	C	6	6	422103	422108	0 %	0 %	0 %	100 %	345007198
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125	NC_015955	A	6	6	430375	430380	100 %	0 %	0 %	0 %	345007209
126	NC_015955	A	6	6	430926	430931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_015955	A	7	7	434662	434668	100 %	0 %	0 %	0 %	345007212
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.