MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 8296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015954	GACC	2	8	44	51	25 %	0 %	25 %	50 %	345004011
2	NC_015954	CGGG	2	8	145	152	0 %	0 %	75 %	25 %	345004011
3	NC_015954	CGAG	2	8	479	486	25 %	0 %	50 %	25 %	345004011
4	NC_015954	AGCG	2	8	594	601	25 %	0 %	50 %	25 %	345004011
5	NC_015954	GCCG	2	8	623	630	0 %	0 %	50 %	50 %	345004011
6	NC_015954	AGGC	2	8	883	890	25 %	0 %	50 %	25 %	345004011
7	NC_015954	CGCC	2	8	914	921	0 %	0 %	25 %	75 %	345004011
8	NC_015954	CCAG	2	8	950	957	25 %	0 %	25 %	50 %	345004011
9	NC_015954	ACCT	2	8	1017	1024	25 %	25 %	0 %	50 %	345004011
10	NC_015954	ACTG	2	8	1190	1197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015954	CATC	2	8	1231	1238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015954	GGTA	2	8	1506	1513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015954	CAGA	2	8	1876	1883	50 %	0 %	25 %	25 %	345004012
14	NC_015954	GGCG	2	8	2304	2311	0 %	0 %	75 %	25 %	345004012
15	NC_015954	GCGA	2	8	2547	2554	25 %	0 %	50 %	25 %	345004012
16	NC_015954	GCGG	2	8	2910	2917	0 %	0 %	75 %	25 %	345004012
17	NC_015954	ACCG	2	8	3814	3821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015954	TGAC	2	8	4178	4185	25 %	25 %	25 %	25 %	345004013
19	NC_015954	CGAG	2	8	4521	4528	25 %	0 %	50 %	25 %	345004014
20	NC_015954	CGAC	2	8	4719	4726	25 %	0 %	25 %	50 %	345004014
21	NC_015954	ACGA	2	8	4871	4878	50 %	0 %	25 %	25 %	345004014
22	NC_015954	CCAG	2	8	5331	5338	25 %	0 %	25 %	50 %	345004014
23	NC_015954	GCCA	2	8	5594	5601	25 %	0 %	25 %	50 %	345004014
24	NC_015954	AGGC	2	8	6182	6189	25 %	0 %	50 %	25 %	345004015
25	NC_015954	CCAG	2	8	6415	6422	25 %	0 %	25 %	50 %	345004015
26	NC_015954	GGCT	2	8	6608	6615	0 %	25 %	50 %	25 %	345004015
27	NC_015954	GCGA	2	8	7733	7740	25 %	0 %	50 %	25 %	345004016
28	NC_015954	GGTC	2	8	7962	7969	0 %	25 %	50 %	25 %	345004016
29	NC_015954	GAGG	2	8	8030	8037	25 %	0 %	75 %	0 %	345004016
30	NC_015954	CATC	2	8	8419	8426	25 %	25 %	0 %	50 %	345004017
31	NC_015954	GGTG	2	8	8429	8436	0 %	25 %	75 %	0 %	345004017
32	NC_015954	GCTC	2	8	8905	8912	0 %	25 %	25 %	50 %	345004017
33	NC_015954	GTCT	2	8	9090	9097	0 %	50 %	25 %	25 %	345004017
34	NC_015954	ACCT	2	8	10153	10160	25 %	25 %	0 %	50 %	345004018
35	NC_015954	CGAC	2	8	10247	10254	25 %	0 %	25 %	50 %	345004018
36	NC_015954	TTCG	3	12	10753	10764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015954	GACG	2	8	10828	10835	25 %	0 %	50 %	25 %	345004019
38	NC_015954	CCCG	2	8	11451	11458	0 %	0 %	25 %	75 %	345004020
39	NC_015954	AGTC	2	8	11978	11985	25 %	25 %	25 %	25 %	345004020
40	NC_015954	GTCC	2	8	12571	12578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015954	GGGC	2	8	13988	13995	0 %	0 %	75 %	25 %	345004021
42	NC_015954	CTGG	2	8	14126	14133	0 %	25 %	50 %	25 %	345004021
43	NC_015954	ACGG	2	8	14268	14275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015954	CGGC	2	8	14912	14919	0 %	0 %	50 %	50 %	345004022
45	NC_015954	GGCC	2	8	15326	15333	0 %	0 %	50 %	50 %	345004022
46	NC_015954	GATA	2	8	15887	15894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015954	CTGG	2	8	16038	16045	0 %	25 %	50 %	25 %	345004023
48	NC_015954	CGGG	2	8	16487	16494	0 %	0 %	75 %	25 %	345004023
49	NC_015954	ACGT	2	8	16672	16679	25 %	25 %	25 %	25 %	345004023
50	NC_015954	TCAG	2	8	17126	17133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015954	CTGC	2	8	17377	17384	0 %	25 %	25 %	50 %	345004024
52	NC_015954	GCCG	2	8	18150	18157	0 %	0 %	50 %	50 %	345004024
53	NC_015954	CAGG	2	8	18387	18394	25 %	0 %	50 %	25 %	345004024
54	NC_015954	GGAT	2	8	19054	19061	25 %	25 %	50 %	0 %	345004025
55	NC_015954	CAGA	2	8	19203	19210	50 %	0 %	25 %	25 %	345004025
56	NC_015954	GTCG	2	8	19223	19230	0 %	25 %	50 %	25 %	345004025
57	NC_015954	GGCA	2	8	19574	19581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015954	TCGC	2	8	19829	19836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015954	TCGC	2	8	19879	19886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015954	GCCC	2	8	20188	20195	0 %	0 %	25 %	75 %	345004026
61	NC_015954	GCAG	2	8	20209	20216	25 %	0 %	50 %	25 %	345004026
62	NC_015954	GCGG	2	8	20824	20831	0 %	0 %	75 %	25 %	345004026
63	NC_015954	CGTC	2	8	21927	21934	0 %	25 %	25 %	50 %	345004027
64	NC_015954	CCCG	2	8	22230	22237	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_015954	GACT	2	8	22705	22712	25 %	25 %	25 %	25 %	345004028
66	NC_015954	GACG	2	8	22872	22879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015954	CGAC	2	8	23526	23533	25 %	0 %	25 %	50 %	345004030
68	NC_015954	GGCT	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	345004030
69	NC_015954	CGGT	2	8	23918	23925	0 %	25 %	50 %	25 %	345004030
70	NC_015954	CCAT	2	8	24124	24131	25 %	25 %	0 %	50 %	345004030
71	NC_015954	CAAG	2	8	24187	24194	50 %	0 %	25 %	25 %	345004030
72	NC_015954	CGGC	2	8	24583	24590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015954	CGCT	2	8	24624	24631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015954	CGCT	2	8	24649	24656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015954	TCGC	2	8	24665	24672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015954	CGGC	2	8	24800	24807	0 %	0 %	50 %	50 %	345004031
77	NC_015954	TCCA	2	8	25053	25060	25 %	25 %	0 %	50 %	345004031
78	NC_015954	GACG	2	8	25399	25406	25 %	0 %	50 %	25 %	345004032
79	NC_015954	CGGC	2	8	26651	26658	0 %	0 %	50 %	50 %	345004033
80	NC_015954	GTCT	2	8	27439	27446	0 %	50 %	25 %	25 %	345004035
81	NC_015954	TGGA	2	8	27455	27462	25 %	25 %	50 %	0 %	345004035
82	NC_015954	ATGA	2	8	27556	27563	50 %	25 %	25 %	0 %	345004035
83	NC_015954	GACT	2	8	27690	27697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015954	GGCG	2	8	27722	27729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015954	CTCG	2	8	28210	28217	0 %	25 %	25 %	50 %	345004036
86	NC_015954	ATCT	2	8	28406	28413	25 %	50 %	0 %	25 %	345004037
87	NC_015954	TTCC	2	8	28514	28521	0 %	50 %	0 %	50 %	345004037
88	NC_015954	TACG	2	8	29749	29756	25 %	25 %	25 %	25 %	345004038
89	NC_015954	AGCC	2	8	29989	29996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015954	TCGC	2	8	30236	30243	0 %	25 %	25 %	50 %	345004039
91	NC_015954	TCGT	2	8	30302	30309	0 %	50 %	25 %	25 %	345004039
92	NC_015954	TACC	2	8	30595	30602	25 %	25 %	0 %	50 %	345004039
93	NC_015954	CTCA	2	8	31269	31276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015954	GCTC	2	8	31312	31319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015954	CGTT	2	8	31474	31481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015954	TGGC	3	12	31773	31784	0 %	25 %	50 %	25 %	345004040
97	NC_015954	ACTG	2	8	32650	32657	25 %	25 %	25 %	25 %	345004041
98	NC_015954	CGTC	2	8	33311	33318	0 %	25 %	25 %	50 %	345004042
99	NC_015954	CGAG	2	8	34064	34071	25 %	0 %	50 %	25 %	345004043
100	NC_015954	CCAC	2	8	34343	34350	25 %	0 %	0 %	75 %	345004043
101	NC_015954	GGTC	2	8	34679	34686	0 %	25 %	50 %	25 %	345004043
102	NC_015954	GTCT	2	8	35649	35656	0 %	50 %	25 %	25 %	345004044
103	NC_015954	GGCG	2	8	35732	35739	0 %	0 %	75 %	25 %	345004044
104	NC_015954	CCGA	2	8	36027	36034	25 %	0 %	25 %	50 %	345004045
105	NC_015954	GTTG	2	8	36047	36054	0 %	50 %	50 %	0 %	345004045
106	NC_015954	GTTC	2	8	36125	36132	0 %	50 %	25 %	25 %	345004045
107	NC_015954	GCGT	2	8	36434	36441	0 %	25 %	50 %	25 %	345004045
108	NC_015954	TGGC	2	8	37195	37202	0 %	25 %	50 %	25 %	345004045
109	NC_015954	GCCA	2	8	38023	38030	25 %	0 %	25 %	50 %	345004046
110	NC_015954	GTTT	2	8	38914	38921	0 %	75 %	25 %	0 %	345004048
111	NC_015954	ACGT	2	8	39137	39144	25 %	25 %	25 %	25 %	345004048
112	NC_015954	CGCC	2	8	39336	39343	0 %	0 %	25 %	75 %	345004048
113	NC_015954	AGCG	2	8	39360	39367	25 %	0 %	50 %	25 %	345004048
114	NC_015954	GCTC	2	8	39941	39948	0 %	25 %	25 %	50 %	345004049
115	NC_015954	TTCT	2	8	41131	41138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015954	GTCA	2	8	41199	41206	25 %	25 %	25 %	25 %	345004050
117	NC_015954	CGAG	2	8	41585	41592	25 %	0 %	50 %	25 %	345004051
118	NC_015954	TCGG	2	8	41679	41686	0 %	25 %	50 %	25 %	345004051
119	NC_015954	GCGT	2	8	42133	42140	0 %	25 %	50 %	25 %	345004051
120	NC_015954	CCTC	2	8	42226	42233	0 %	25 %	0 %	75 %	345004051
121	NC_015954	AGCG	2	8	42391	42398	25 %	0 %	50 %	25 %	345004051
122	NC_015954	CCGA	2	8	42543	42550	25 %	0 %	25 %	50 %	345004051
123	NC_015954	GCCT	2	8	42726	42733	0 %	25 %	25 %	50 %	345004052
124	NC_015954	CCAG	2	8	42961	42968	25 %	0 %	25 %	50 %	345004052
125	NC_015954	GTCG	2	8	43643	43650	0 %	25 %	50 %	25 %	345004052
126	NC_015954	CGTC	2	8	43874	43881	0 %	25 %	25 %	50 %	345004052
127	NC_015954	CAGC	2	8	43969	43976	25 %	0 %	25 %	50 %	345004052
128	NC_015954	AGCC	2	8	43987	43994	25 %	0 %	25 %	50 %	345004052
129	NC_015954	CCTG	2	8	44144	44151	0 %	25 %	25 %	50 %	345004053
130	NC_015954	CAGC	2	8	44167	44174	25 %	0 %	25 %	50 %	345004053
131	NC_015954	GCAC	2	8	44617	44624	25 %	0 %	25 %	50 %	345004053
132	NC_015954	CGGA	2	8	44725	44732	25 %	0 %	50 %	25 %	345004053
133	NC_015954	CGTT	2	8	45235	45242	0 %	50 %	25 %	25 %	345004054
134	NC_015954	GCTG	2	8	46419	46426	0 %	25 %	50 %	25 %	345004056
135	NC_015954	TCCC	2	8	46516	46523	0 %	25 %	0 %	75 %	345004056
136	NC_015954	GTCG	2	8	46717	46724	0 %	25 %	50 %	25 %	345004056
137	NC_015954	TCCT	2	8	46921	46928	0 %	50 %	0 %	50 %	345004057
138	NC_015954	CCAG	2	8	47160	47167	25 %	0 %	25 %	50 %	345004058
139	NC_015954	CGCC	2	8	47294	47301	0 %	0 %	25 %	75 %	345004058
140	NC_015954	GCGG	2	8	47794	47801	0 %	0 %	75 %	25 %	345004058
141	NC_015954	ACCG	2	8	48308	48315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015954	TGCC	2	8	48320	48327	0 %	25 %	25 %	50 %	345004059
143	NC_015954	GACC	2	8	48342	48349	25 %	0 %	25 %	50 %	345004059
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278	NC_015954	AGCC	2	8	95211	95218	25 %	0 %	25 %	50 %	345004105
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498	NC_015954	CCAC	2	8	175284	175291	25 %	0 %	0 %	75 %	345004188
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