MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 6464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015954	CCG	2	6	1222	1227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015954	ACT	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015954	GTC	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015954	ACC	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015954	GAG	2	6	10793	10798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015954	CGC	2	6	12324	12329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015954	GCG	2	6	12375	12380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015954	CGA	2	6	12393	12398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015954	GTC	2	6	12433	12438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015954	GGC	2	6	12439	12444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015954	GCT	2	6	12455	12460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015954	CGA	2	6	12510	12515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015954	CGG	2	6	12611	12616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015954	ATG	2	6	12710	12715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015954	TCG	2	6	12770	12775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015954	CCT	2	6	12879	12884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015954	CGC	2	6	12951	12956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015954	GGT	2	6	12958	12963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015954	TGA	2	6	12972	12977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015954	CCT	2	6	13008	13013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015954	TCG	2	6	13022	13027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015954	GGT	2	6	13215	13220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015954	GAG	2	6	13233	13238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015954	TCG	2	6	13411	13416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015954	CGA	2	6	13430	13435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015954	CGA	2	6	13451	13456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015954	CGT	2	6	13463	13468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015954	ACG	2	6	14238	14243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015954	TCA	2	6	14291	14296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015954	ACT	2	6	15664	15669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015954	TTC	2	6	15672	15677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015954	ACG	2	6	19445	19450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015954	ACG	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015954	TGC	2	6	21114	21119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015954	GGA	2	6	21125	21130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015954	TGG	2	6	21160	21165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015954	GAC	2	6	22220	22225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015954	GAG	2	6	22756	22761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015954	TAG	2	6	24483	24488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015954	CCG	2	6	24550	24555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015954	TCG	2	6	24569	24574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015954	GCC	2	6	25199	25204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015954	CAG	2	6	26795	26800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015954	TAG	2	6	27295	27300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015954	TGG	2	6	27760	27765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015954	CGG	2	6	31513	31518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015954	TCC	2	6	31611	31616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015954	GTG	2	6	31942	31947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015954	TCG	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015954	GTG	2	6	32097	32102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015954	GTC	2	6	32167	32172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015954	GAC	2	6	32190	32195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015954	CCG	2	6	34902	34907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015954	CGA	2	6	38190	38195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015954	TAA	2	6	38767	38772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015954	GCG	2	6	39693	39698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015954	CTG	2	6	41064	41069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015954	CCG	2	6	44783	44788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015954	GTC	2	6	44896	44901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015954	TCG	2	6	44951	44956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015954	GGC	2	6	44961	44966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015954	CGG	2	6	46036	46041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015954	TGG	2	6	46270	46275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015954	GCC	2	6	46329	46334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015954	AGG	2	6	47024	47029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015954	CCG	2	6	48293	48298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015954	GTC	2	6	50167	50172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015954	TCG	2	6	51369	51374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015954	TCC	2	6	51375	51380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015954	TGG	2	6	51410	51415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015954	CGG	2	6	52285	52290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015954	CGG	2	6	52335	52340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015954	AGC	2	6	52343	52348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015954	CGG	2	6	52428	52433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015954	GCG	2	6	52496	52501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015954	GTT	2	6	65570	65575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015954	CCA	2	6	65586	65591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015954	CGA	2	6	66192	66197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015954	GCT	2	6	67632	67637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015954	ACC	2	6	68719	68724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015954	CGG	2	6	68745	68750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015954	CCG	2	6	69840	69845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015954	GTG	2	6	69887	69892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015954	TAT	2	6	70697	70702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015954	CCG	2	6	70703	70708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015954	TCC	2	6	70774	70779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015954	GGC	2	6	70781	70786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015954	CGG	3	9	70823	70831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015954	GGC	3	9	70833	70841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015954	ACT	2	6	70891	70896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015954	ACG	2	6	70924	70929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015954	ACA	2	6	71050	71055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015954	TCC	2	6	71101	71106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015954	CAT	2	6	71123	71128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015954	CAG	2	6	71178	71183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015954	GAG	2	6	71240	71245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015954	CGA	2	6	71389	71394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015954	CAG	2	6	71414	71419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015954	CAG	2	6	71453	71458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015954	ACG	3	9	71478	71486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015954	CGA	2	6	71566	71571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015954	CTG	2	6	71636	71641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015954	CGC	2	6	71671	71676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015954	CGA	2	6	71764	71769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015954	TCT	2	6	71781	71786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015954	ACG	2	6	71820	71825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015954	GCC	2	6	74824	74829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015954	TGT	2	6	75516	75521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015954	AAC	2	6	76007	76012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015954	CCA	2	6	76052	76057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015954	ACA	2	6	76094	76099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015954	GGC	2	6	78577	78582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015954	CGG	2	6	78610	78615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015954	TCG	2	6	83884	83889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015954	GCC	2	6	83893	83898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015954	CGA	2	6	83949	83954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015954	CGA	2	6	84003	84008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015954	GAG	2	6	84030	84035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015954	GTC	2	6	85714	85719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015954	GAA	2	6	85723	85728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015954	CGG	2	6	88196	88201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015954	GCA	2	6	88295	88300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015954	CCA	2	6	94489	94494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015954	AGG	2	6	96059	96064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015954	CTT	2	6	96115	96120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015954	TTC	2	6	96128	96133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015954	GCA	2	6	96220	96225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015954	GCG	2	6	97319	97324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015954	GCT	2	6	97853	97858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015954	CGT	2	6	102945	102950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015954	TAC	2	6	102987	102992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015954	CTG	2	6	102993	102998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015954	CTG	2	6	103077	103082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015954	AAC	2	6	103085	103090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015954	CTT	2	6	103268	103273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015954	CGG	2	6	103304	103309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015954	ACA	2	6	103355	103360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015954	CCG	2	6	104917	104922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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403	NC_015954	ACC	2	6	229581	229586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
404	NC_015954	GCC	2	6	230105	230110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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