MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 7529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015953	CACCT	3	15	158	172	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015953	CTGAT	2	10	919	928	20 %	40 %	20 %	20 %	344997653
3	NC_015953	ACCGA	2	10	5637	5646	40 %	0 %	20 %	40 %	344997655
4	NC_015953	TGCGC	2	10	8854	8863	0 %	20 %	40 %	40 %	344997657
5	NC_015953	TGCCT	2	10	9325	9334	0 %	40 %	20 %	40 %	344997657
6	NC_015953	GCCGA	2	10	9365	9374	20 %	0 %	40 %	40 %	344997657
7	NC_015953	TGGTC	2	10	9631	9640	0 %	40 %	40 %	20 %	344997657
8	NC_015953	GCGGT	2	10	9819	9828	0 %	20 %	60 %	20 %	344997657
9	NC_015953	CGGTG	2	10	10519	10528	0 %	20 %	60 %	20 %	344997657
10	NC_015953	CGCCT	2	10	15376	15385	0 %	20 %	20 %	60 %	344997660
11	NC_015953	TCCGG	2	10	16577	16586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015953	GGCGA	2	10	17098	17107	20 %	0 %	60 %	20 %	344997662
13	NC_015953	CGCTC	2	10	17391	17400	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015953	TCGGT	2	10	18532	18541	0 %	40 %	40 %	20 %	344997664
15	NC_015953	CGGCG	2	10	18634	18643	0 %	0 %	60 %	40 %	344997664
16	NC_015953	GCGCG	2	10	18973	18982	0 %	0 %	60 %	40 %	344997664
17	NC_015953	GCCCG	2	10	19004	19013	0 %	0 %	40 %	60 %	344997664
18	NC_015953	GGCGG	2	10	19066	19075	0 %	0 %	80 %	20 %	344997664
19	NC_015953	GCACA	2	10	19214	19223	40 %	0 %	20 %	40 %	344997664
20	NC_015953	CGCAG	2	10	20385	20394	20 %	0 %	40 %	40 %	344997666
21	NC_015953	GCTCC	2	10	20619	20628	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015953	GGTCA	2	10	21140	21149	20 %	20 %	40 %	20 %	344997667
23	NC_015953	CCTCA	2	10	21666	21675	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015953	CCCCG	2	10	22210	22219	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_015953	ACCCC	2	10	23434	23443	20 %	0 %	0 %	80 %	344997668
26	NC_015953	GGGCA	2	10	24273	24282	20 %	0 %	60 %	20 %	344997668
27	NC_015953	ACGCG	2	10	25616	25625	20 %	0 %	40 %	40 %	344997668
28	NC_015953	ACCCC	2	10	25702	25711	20 %	0 %	0 %	80 %	344997668
29	NC_015953	CGTCC	2	10	25729	25738	0 %	20 %	20 %	60 %	344997668
30	NC_015953	CGGCG	2	10	26022	26031	0 %	0 %	60 %	40 %	344997668
31	NC_015953	ATCGC	2	10	26100	26109	20 %	20 %	20 %	40 %	344997668
32	NC_015953	CCCGG	2	10	26933	26942	0 %	0 %	40 %	60 %	344997668
33	NC_015953	CAGGG	2	10	27135	27144	20 %	0 %	60 %	20 %	344997668
34	NC_015953	GCGAC	2	10	27827	27836	20 %	0 %	40 %	40 %	344997668
35	NC_015953	CGGGG	2	10	28137	28146	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015953	GCGCC	2	10	28979	28988	0 %	0 %	40 %	60 %	344997669
37	NC_015953	GGCGG	2	10	29431	29440	0 %	0 %	80 %	20 %	344997669
38	NC_015953	GCGCG	2	10	30035	30044	0 %	0 %	60 %	40 %	344997670
39	NC_015953	CGGGG	2	10	30475	30484	0 %	0 %	80 %	20 %	344997671
40	NC_015953	CGGTG	2	10	30989	30998	0 %	20 %	60 %	20 %	344997671
41	NC_015953	GCCCC	2	10	32437	32446	0 %	0 %	20 %	80 %	344997673
42	NC_015953	GCGGA	2	10	32849	32858	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015953	CTCGG	2	10	34516	34525	0 %	20 %	40 %	40 %	344997675
44	NC_015953	GGAGT	2	10	35872	35881	20 %	20 %	60 %	0 %	344997675
45	NC_015953	CGACG	2	10	36582	36591	20 %	0 %	40 %	40 %	344997676
46	NC_015953	CCGGC	2	10	37653	37662	0 %	0 %	40 %	60 %	344997677
47	NC_015953	CAGCC	2	10	40950	40959	20 %	0 %	20 %	60 %	344997680
48	NC_015953	GGCCA	2	10	41307	41316	20 %	0 %	40 %	40 %	344997680
49	NC_015953	TCGCT	2	10	42768	42777	0 %	40 %	20 %	40 %	344997682
50	NC_015953	CCCGG	2	10	43038	43047	0 %	0 %	40 %	60 %	344997682
51	NC_015953	TGTCG	2	10	43327	43336	0 %	40 %	40 %	20 %	344997682
52	NC_015953	CCGTC	2	10	45690	45699	0 %	20 %	20 %	60 %	344997682
53	NC_015953	CGCAC	2	10	46123	46132	20 %	0 %	20 %	60 %	344997683
54	NC_015953	GGCCG	2	10	47128	47137	0 %	0 %	60 %	40 %	344997684
55	NC_015953	GCTCG	2	10	48646	48655	0 %	20 %	40 %	40 %	344997684
56	NC_015953	GTCCG	2	10	49509	49518	0 %	20 %	40 %	40 %	344997685
57	NC_015953	CGCGG	2	10	50159	50168	0 %	0 %	60 %	40 %	344997686
58	NC_015953	GTGCG	2	10	51390	51399	0 %	20 %	60 %	20 %	344997687
59	NC_015953	TCGGA	2	10	51715	51724	20 %	20 %	40 %	20 %	344997688
60	NC_015953	GTGTG	2	10	52667	52676	0 %	40 %	60 %	0 %	344997688
61	NC_015953	GAAGC	2	10	54415	54424	40 %	0 %	40 %	20 %	344997689
62	NC_015953	ACTGG	2	10	55583	55592	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015953	CCCGG	2	10	55754	55763	0 %	0 %	40 %	60 %	344997690
64	NC_015953	GTGCC	2	10	56224	56233	0 %	20 %	40 %	40 %	344997690
65	NC_015953	CTCCC	2	10	57054	57063	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_015953	CCACA	2	10	57745	57754	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015953	GGACC	2	10	60603	60612	20 %	0 %	40 %	40 %	344997692
68	NC_015953	GGCGG	2	10	65307	65316	0 %	0 %	80 %	20 %	344997696
69	NC_015953	GACCT	2	10	65368	65377	20 %	20 %	20 %	40 %	344997696
70	NC_015953	GACCT	2	10	65556	65565	20 %	20 %	20 %	40 %	344997697
71	NC_015953	CACGC	2	10	65993	66002	20 %	0 %	20 %	60 %	344997697
72	NC_015953	GCCGC	2	10	66793	66802	0 %	0 %	40 %	60 %	344997697
73	NC_015953	ACCGA	2	10	67177	67186	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015953	CGGCG	2	10	68293	68302	0 %	0 %	60 %	40 %	344997700
75	NC_015953	CGGCC	2	10	69519	69528	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_015953	GCCTC	2	10	70129	70138	0 %	20 %	20 %	60 %	344997701
77	NC_015953	CCCGG	2	10	70520	70529	0 %	0 %	40 %	60 %	344997702
78	NC_015953	CCGGG	2	10	70543	70552	0 %	0 %	60 %	40 %	344997702
79	NC_015953	CTCAG	2	10	70623	70632	20 %	20 %	20 %	40 %	344997702
80	NC_015953	CCTGC	2	10	71810	71819	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_015953	GCAGC	2	10	73052	73061	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_015953	CTCGT	2	10	75898	75907	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015953	GTCTC	2	10	77591	77600	0 %	40 %	20 %	40 %	344997707
84	NC_015953	GGGAG	2	10	77907	77916	20 %	0 %	80 %	0 %	344997707
85	NC_015953	GGGCC	2	10	79465	79474	0 %	0 %	60 %	40 %	344997709
86	NC_015953	GGGAG	2	10	80602	80611	20 %	0 %	80 %	0 %	344997709
87	NC_015953	AACGG	2	10	80700	80709	40 %	0 %	40 %	20 %	344997709
88	NC_015953	TGCGA	2	10	81040	81049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015953	TCGGC	2	10	81726	81735	0 %	20 %	40 %	40 %	344997711
90	NC_015953	GTCCG	2	10	83626	83635	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015953	TCTCC	2	10	86032	86041	0 %	40 %	0 %	60 %	344997716
92	NC_015953	CCCTT	2	10	86797	86806	0 %	40 %	0 %	60 %	344997716
93	NC_015953	CGGAC	2	10	87041	87050	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015953	GTCCC	2	10	90458	90467	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_015953	GGCCC	2	10	90958	90967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_015953	GGACA	2	10	91265	91274	40 %	0 %	40 %	20 %	344997719
97	NC_015953	GTTCG	2	10	92578	92587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015953	GACCG	2	10	92615	92624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015953	TGCGT	2	10	93847	93856	0 %	40 %	40 %	20 %	344997720
100	NC_015953	TCTCG	2	10	93936	93945	0 %	40 %	20 %	40 %	344997721
101	NC_015953	GACCA	2	10	94395	94404	40 %	0 %	20 %	40 %	344997722
102	NC_015953	CCGCT	2	10	94925	94934	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_015953	GAACA	2	10	96079	96088	60 %	0 %	20 %	20 %	344997724
104	NC_015953	TCCAC	2	10	97123	97132	20 %	20 %	0 %	60 %	344997725
105	NC_015953	CACGT	2	10	98237	98246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015953	ACGGC	2	10	99200	99209	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015953	ACGTC	2	10	100404	100413	20 %	20 %	20 %	40 %	344997728
108	NC_015953	GGGCG	2	10	101025	101034	0 %	0 %	80 %	20 %	344997729
109	NC_015953	CGGCC	2	10	107827	107836	0 %	0 %	40 %	60 %	344997736
110	NC_015953	GGCCG	2	10	108096	108105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015953	AGGCG	2	10	108277	108286	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015953	GAGCC	2	10	108287	108296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015953	GGCCC	2	10	109240	109249	0 %	0 %	40 %	60 %	344997737
114	NC_015953	CGGCG	2	10	110285	110294	0 %	0 %	60 %	40 %	344997738
115	NC_015953	GCGGT	2	10	110742	110751	0 %	20 %	60 %	20 %	344997738
116	NC_015953	GACGG	2	10	112041	112050	20 %	0 %	60 %	20 %	344997738
117	NC_015953	CGTTG	2	10	115523	115532	0 %	40 %	40 %	20 %	344997741
118	NC_015953	GCGCC	2	10	116788	116797	0 %	0 %	40 %	60 %	344997742
119	NC_015953	GGCGG	2	10	117343	117352	0 %	0 %	80 %	20 %	344997743
120	NC_015953	CGCGC	2	10	117823	117832	0 %	0 %	40 %	60 %	344997743
121	NC_015953	CGGTG	2	10	119421	119430	0 %	20 %	60 %	20 %	344997745
122	NC_015953	GGTCG	2	10	119533	119542	0 %	20 %	60 %	20 %	344997745
123	NC_015953	ACGGC	2	10	119897	119906	20 %	0 %	40 %	40 %	344997746
124	NC_015953	CACCG	2	10	123042	123051	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_015953	CCAGG	2	10	123135	123144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015953	CGTCG	2	10	123184	123193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015953	GTTCG	2	10	125075	125084	0 %	40 %	40 %	20 %	344997750
128	NC_015953	CGACG	2	10	126881	126890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015953	CGTCG	2	10	127051	127060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015953	GCAGA	2	10	128718	128727	40 %	0 %	40 %	20 %	344997753
131	NC_015953	CGGTC	2	10	129490	129499	0 %	20 %	40 %	40 %	344997754
132	NC_015953	TCGCC	2	10	132221	132230	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_015953	CTGTC	2	10	132455	132464	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015953	AACGG	2	10	132600	132609	40 %	0 %	40 %	20 %	344997757
135	NC_015953	CCGGC	2	10	135787	135796	0 %	0 %	40 %	60 %	344997761
136	NC_015953	CCGGC	2	10	136188	136197	0 %	0 %	40 %	60 %	344997761
137	NC_015953	CTGGC	2	10	138208	138217	0 %	20 %	40 %	40 %	344997763
138	NC_015953	CCGCA	2	10	139156	139165	20 %	0 %	20 %	60 %	344997764
139	NC_015953	GGCCG	2	10	141709	141718	0 %	0 %	60 %	40 %	344997766
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