MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	AACTG	2	10	39888	39897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015952	GGGAT	2	10	39929	39938	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015952	CCTTC	2	10	40012	40021	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015952	CGGGC	2	10	40606	40615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015952	TCGCG	2	10	44792	44801	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015952	CGGGT	2	10	49477	49486	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015952	GCAAA	2	10	51343	51352	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015952	TCAGA	2	10	51507	51516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015952	CTGCC	2	10	53527	53536	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015952	CTGCC	2	10	53560	53569	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_015952	GGCCG	2	10	62575	62584	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015952	CGCCC	2	10	62604	62613	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_015952	CACAT	2	10	68473	68482	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015952	GCCCC	2	10	69548	69557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_015952	GGGGC	2	10	71561	71570	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015952	TCCGC	2	10	71581	71590	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015952	CCCGG	2	10	74158	74167	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015952	GGTGG	2	10	77253	77262	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015952	CACCC	2	10	77284	77293	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_015952	GCCGG	2	10	77911	77920	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015952	TCGCT	2	10	81692	81701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015952	CGGTG	2	10	84933	84942	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015952	TCCCC	2	10	88794	88803	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_015952	TCCCC	2	10	90291	90300	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_015952	CATGT	2	10	93368	93377	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015952	GTCCG	2	10	125670	125679	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015952	GGAAC	2	10	128753	128762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015952	GCACC	2	10	130797	130806	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_015952	CGGCC	2	10	131170	131179	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015952	GGCCA	2	10	133152	133161	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015952	GGCCG	2	10	135987	135996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015952	CCGGG	2	10	141003	141012	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015952	TCCCG	2	10	147981	147990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015952	GGCCC	2	10	167256	167265	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_015952	CCGGG	2	10	169727	169736	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015952	GTGGG	2	10	174363	174372	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015952	AGGGG	2	10	179848	179857	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015952	CCCAC	2	10	181404	181413	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_015952	GCCTC	2	10	187794	187803	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.