MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 422

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	CCCG	2	8	136	143	0 %	0 %	25 %	75 %	345007716
2	NC_015952	CATC	2	8	188	195	25 %	25 %	0 %	50 %	345007716
3	NC_015952	CCGG	2	8	348	355	0 %	0 %	50 %	50 %	345007716
4	NC_015952	TCGC	2	8	538	545	0 %	25 %	25 %	50 %	345007716
5	NC_015952	CCGG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	345007718
6	NC_015952	TGGA	2	8	2305	2312	25 %	25 %	50 %	0 %	345007719
7	NC_015952	GCCC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	25 %	75 %	345007720
8	NC_015952	GGGC	2	8	4906	4913	0 %	0 %	75 %	25 %	345007722
9	NC_015952	CCCG	2	8	6101	6108	0 %	0 %	25 %	75 %	345007724
10	NC_015952	TGCA	2	8	6275	6282	25 %	25 %	25 %	25 %	345007724
11	NC_015952	GCGA	2	8	6397	6404	25 %	0 %	50 %	25 %	345007724
12	NC_015952	GGGT	2	8	6470	6477	0 %	25 %	75 %	0 %	345007725
13	NC_015952	CGCC	2	8	6713	6720	0 %	0 %	25 %	75 %	345007726
14	NC_015952	ACCA	2	8	6726	6733	50 %	0 %	0 %	50 %	345007726
15	NC_015952	AAGC	2	8	7039	7046	50 %	0 %	25 %	25 %	345007727
16	NC_015952	GAAA	2	8	7136	7143	75 %	0 %	25 %	0 %	345007727
17	NC_015952	CCGC	2	8	7193	7200	0 %	0 %	25 %	75 %	345007727
18	NC_015952	GGCT	2	8	7901	7908	0 %	25 %	50 %	25 %	345007728
19	NC_015952	GCCT	2	8	7943	7950	0 %	25 %	25 %	50 %	345007728
20	NC_015952	CGGG	2	8	7999	8006	0 %	0 %	75 %	25 %	345007728
21	NC_015952	ACAG	2	8	8511	8518	50 %	0 %	25 %	25 %	345007728
22	NC_015952	AGCC	2	8	8576	8583	25 %	0 %	25 %	50 %	345007728
23	NC_015952	GAGC	2	8	8613	8620	25 %	0 %	50 %	25 %	345007728
24	NC_015952	TCGG	2	8	8693	8700	0 %	25 %	50 %	25 %	345007728
25	NC_015952	GGGC	2	8	8835	8842	0 %	0 %	75 %	25 %	345007728
26	NC_015952	CGGG	2	8	8983	8990	0 %	0 %	75 %	25 %	345007729
27	NC_015952	GGGT	2	8	9089	9096	0 %	25 %	75 %	0 %	345007729
28	NC_015952	GTGG	2	8	9386	9393	0 %	25 %	75 %	0 %	345007729
29	NC_015952	CTGG	2	8	9898	9905	0 %	25 %	50 %	25 %	345007729
30	NC_015952	ATCG	2	8	11018	11025	25 %	25 %	25 %	25 %	345007729
31	NC_015952	AGGA	2	8	11046	11053	50 %	0 %	50 %	0 %	345007729
32	NC_015952	GCTG	2	8	11362	11369	0 %	25 %	50 %	25 %	345007729
33	NC_015952	CGGG	2	8	11458	11465	0 %	0 %	75 %	25 %	345007729
34	NC_015952	CGCC	2	8	12990	12997	0 %	0 %	25 %	75 %	345007730
35	NC_015952	CCGG	2	8	14501	14508	0 %	0 %	50 %	50 %	345007731
36	NC_015952	GCTG	2	8	14798	14805	0 %	25 %	50 %	25 %	345007731
37	NC_015952	CCGC	2	8	14902	14909	0 %	0 %	25 %	75 %	345007731
38	NC_015952	GCCT	2	8	17088	17095	0 %	25 %	25 %	50 %	345007737
39	NC_015952	GCCC	2	8	17597	17604	0 %	0 %	25 %	75 %	345007738
40	NC_015952	CGGA	2	8	17873	17880	25 %	0 %	50 %	25 %	345007739
41	NC_015952	CTTC	2	8	18027	18034	0 %	50 %	0 %	50 %	345007740
42	NC_015952	CTGG	2	8	18073	18080	0 %	25 %	50 %	25 %	345007740
43	NC_015952	CGGA	2	8	18160	18167	25 %	0 %	50 %	25 %	345007740
44	NC_015952	CGGG	2	8	18441	18448	0 %	0 %	75 %	25 %	345007740
45	NC_015952	TGGT	2	8	18668	18675	0 %	50 %	50 %	0 %	345007740
46	NC_015952	GGTC	2	8	18987	18994	0 %	25 %	50 %	25 %	345007740
47	NC_015952	ACCG	2	8	19562	19569	25 %	0 %	25 %	50 %	345007740
48	NC_015952	CCGT	2	8	19859	19866	0 %	25 %	25 %	50 %	345007740
49	NC_015952	CCGT	2	8	20169	20176	0 %	25 %	25 %	50 %	345007741
50	NC_015952	CCGG	2	8	20588	20595	0 %	0 %	50 %	50 %	345007741
51	NC_015952	CCCG	2	8	20668	20675	0 %	0 %	25 %	75 %	345007741
52	NC_015952	GCTC	2	8	20905	20912	0 %	25 %	25 %	50 %	345007741
53	NC_015952	GCCC	2	8	21840	21847	0 %	0 %	25 %	75 %	345007742
54	NC_015952	GGCG	2	8	21983	21990	0 %	0 %	75 %	25 %	345007742
55	NC_015952	AGTC	2	8	22799	22806	25 %	25 %	25 %	25 %	345007742
56	NC_015952	TGCC	2	8	23099	23106	0 %	25 %	25 %	50 %	345007742
57	NC_015952	TGGC	2	8	24126	24133	0 %	25 %	50 %	25 %	345007743
58	NC_015952	CGGC	2	8	24312	24319	0 %	0 %	50 %	50 %	345007743
59	NC_015952	GAGG	2	8	25158	25165	25 %	0 %	75 %	0 %	345007744
60	NC_015952	CGGG	2	8	25244	25251	0 %	0 %	75 %	25 %	345007744
61	NC_015952	CCGG	2	8	25982	25989	0 %	0 %	50 %	50 %	345007745
62	NC_015952	CCAC	2	8	26277	26284	25 %	0 %	0 %	75 %	345007746
63	NC_015952	CACG	2	8	26686	26693	25 %	0 %	25 %	50 %	345007746
64	NC_015952	CCGG	2	8	26851	26858	0 %	0 %	50 %	50 %	345007746
65	NC_015952	CGCC	2	8	26977	26984	0 %	0 %	25 %	75 %	345007746
66	NC_015952	TCGG	2	8	27643	27650	0 %	25 %	50 %	25 %	345007747
67	NC_015952	CCGG	2	8	27830	27837	0 %	0 %	50 %	50 %	345007748
68	NC_015952	GCAG	2	8	27857	27864	25 %	0 %	50 %	25 %	345007748
69	NC_015952	GTGC	2	8	28694	28701	0 %	25 %	50 %	25 %	345007748
70	NC_015952	GTCC	2	8	30039	30046	0 %	25 %	25 %	50 %	345007749
71	NC_015952	CGAG	2	8	30056	30063	25 %	0 %	50 %	25 %	345007749
72	NC_015952	ACGG	2	8	30082	30089	25 %	0 %	50 %	25 %	345007749
73	NC_015952	CCGC	2	8	30263	30270	0 %	0 %	25 %	75 %	345007749
74	NC_015952	CGGA	2	8	30477	30484	25 %	0 %	50 %	25 %	345007749
75	NC_015952	GGAC	2	8	31236	31243	25 %	0 %	50 %	25 %	345007750
76	NC_015952	ACGG	2	8	31344	31351	25 %	0 %	50 %	25 %	345007750
77	NC_015952	CCGG	2	8	33056	33063	0 %	0 %	50 %	50 %	345007750
78	NC_015952	GCGA	2	8	33314	33321	25 %	0 %	50 %	25 %	345007750
79	NC_015952	CCGG	2	8	34137	34144	0 %	0 %	50 %	50 %	345007751
80	NC_015952	CGGT	2	8	34243	34250	0 %	25 %	50 %	25 %	345007752
81	NC_015952	CCGG	2	8	34435	34442	0 %	0 %	50 %	50 %	345007752
82	NC_015952	GCTG	2	8	36412	36419	0 %	25 %	50 %	25 %	345007753
83	NC_015952	CGTG	2	8	37150	37157	0 %	25 %	50 %	25 %	345007754
84	NC_015952	GTCT	2	8	37214	37221	0 %	50 %	25 %	25 %	345007754
85	NC_015952	GCGG	2	8	37798	37805	0 %	0 %	75 %	25 %	345007754
86	NC_015952	GCCA	2	8	38016	38023	25 %	0 %	25 %	50 %	345007754
87	NC_015952	CAGC	2	8	38299	38306	25 %	0 %	25 %	50 %	345007754
88	NC_015952	GCAC	2	8	38446	38453	25 %	0 %	25 %	50 %	345007754
89	NC_015952	GAGG	2	8	38681	38688	25 %	0 %	75 %	0 %	345007754
90	NC_015952	GAGC	2	8	40766	40773	25 %	0 %	50 %	25 %	345007757
91	NC_015952	CCGT	2	8	41850	41857	0 %	25 %	25 %	50 %	345007759
92	NC_015952	CGAC	2	8	42035	42042	25 %	0 %	25 %	50 %	345007760
93	NC_015952	CCGG	2	8	42113	42120	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
94	NC_015952	CATC	2	8	42341	42348	25 %	25 %	0 %	50 %	345007760
95	NC_015952	CAAC	2	8	42953	42960	50 %	0 %	0 %	50 %	345007761
96	NC_015952	CCGG	2	8	43554	43561	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
97	NC_015952	GCCA	2	8	43993	44000	25 %	0 %	25 %	50 %	345007762
98	NC_015952	GTGC	2	8	44308	44315	0 %	25 %	50 %	25 %	345007763
99	NC_015952	GTTC	2	8	44626	44633	0 %	50 %	25 %	25 %	345007764
100	NC_015952	CTTC	2	8	44957	44964	0 %	50 %	0 %	50 %	345007765
101	NC_015952	CCGG	2	8	45365	45372	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
102	NC_015952	CCGG	2	8	45391	45398	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
103	NC_015952	GACG	2	8	47062	47069	25 %	0 %	50 %	25 %	345007767
104	NC_015952	GCCT	2	8	47248	47255	0 %	25 %	25 %	50 %	345007767
105	NC_015952	CCTG	2	8	47504	47511	0 %	25 %	25 %	50 %	345007767
106	NC_015952	CGGA	2	8	47516	47523	25 %	0 %	50 %	25 %	345007767
107	NC_015952	TATC	2	8	48362	48369	25 %	50 %	0 %	25 %	345007768
108	NC_015952	AGGG	2	8	48445	48452	25 %	0 %	75 %	0 %	345007768
109	NC_015952	GGCG	2	8	48749	48756	0 %	0 %	75 %	25 %	345007768
110	NC_015952	GCGT	2	8	50151	50158	0 %	25 %	50 %	25 %	345007769
111	NC_015952	CAGG	2	8	51918	51925	25 %	0 %	50 %	25 %	345007773
112	NC_015952	CGCC	2	8	52062	52069	0 %	0 %	25 %	75 %	345007773
113	NC_015952	CCGG	2	8	52632	52639	0 %	0 %	50 %	50 %	345007773
114	NC_015952	GGCA	2	8	53843	53850	25 %	0 %	50 %	25 %	345007775
115	NC_015952	GGTG	2	8	53935	53942	0 %	25 %	75 %	0 %	345007775
116	NC_015952	CCGT	2	8	54043	54050	0 %	25 %	25 %	50 %	345007775
117	NC_015952	GGGT	2	8	54054	54061	0 %	25 %	75 %	0 %	345007775
118	NC_015952	GGTC	2	8	54372	54379	0 %	25 %	50 %	25 %	345007776
119	NC_015952	CGTG	2	8	54638	54645	0 %	25 %	50 %	25 %	345007776
120	NC_015952	GGCA	2	8	55418	55425	25 %	0 %	50 %	25 %	345007776
121	NC_015952	GGCA	2	8	55499	55506	25 %	0 %	50 %	25 %	345007776
122	NC_015952	GTCG	2	8	55848	55855	0 %	25 %	50 %	25 %	345007776
123	NC_015952	GTGC	2	8	56296	56303	0 %	25 %	50 %	25 %	345007776
124	NC_015952	CGGG	2	8	56373	56380	0 %	0 %	75 %	25 %	345007776
125	NC_015952	CCGC	2	8	56827	56834	0 %	0 %	25 %	75 %	345007776
126	NC_015952	TCGG	2	8	57434	57441	0 %	25 %	50 %	25 %	345007776
127	NC_015952	CGCT	2	8	57671	57678	0 %	25 %	25 %	50 %	345007776
128	NC_015952	CGGG	2	8	57818	57825	0 %	0 %	75 %	25 %	345007776
129	NC_015952	GACG	2	8	57840	57847	25 %	0 %	50 %	25 %	345007776
130	NC_015952	GCAG	2	8	58181	58188	25 %	0 %	50 %	25 %	345007776
131	NC_015952	CCGG	2	8	58312	58319	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
132	NC_015952	CGGG	2	8	59021	59028	0 %	0 %	75 %	25 %	345007776
133	NC_015952	GTCC	2	8	59143	59150	0 %	25 %	25 %	50 %	345007776
134	NC_015952	CGGG	2	8	59234	59241	0 %	0 %	75 %	25 %	345007776
135	NC_015952	CGGG	2	8	59909	59916	0 %	0 %	75 %	25 %	345007776
136	NC_015952	CCGC	2	8	59957	59964	0 %	0 %	25 %	75 %	345007776
137	NC_015952	GCGT	2	8	60576	60583	0 %	25 %	50 %	25 %	345007776
138	NC_015952	CGCC	2	8	62145	62152	0 %	0 %	25 %	75 %	345007776
139	NC_015952	CCCA	2	8	62366	62373	25 %	0 %	0 %	75 %	345007777
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411	NC_015952	GGAT	2	8	184762	184769	25 %	25 %	50 %	0 %	345007952
412	NC_015952	GCGT	2	8	186039	186046	0 %	25 %	50 %	25 %	345007953
413	NC_015952	TCCT	2	8	186272	186279	0 %	50 %	0 %	50 %	345007954
414	NC_015952	GATC	2	8	186334	186341	25 %	25 %	25 %	25 %	345007954
415	NC_015952	GGTC	2	8	187057	187064	0 %	25 %	50 %	25 %	345007954
416	NC_015952	CAGC	2	8	187151	187158	25 %	0 %	25 %	50 %	345007954
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418	NC_015952	ACCG	2	8	187978	187985	25 %	0 %	25 %	50 %	345007955
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420	NC_015952	CGGT	2	8	189325	189332	0 %	25 %	50 %	25 %	345007958
421	NC_015952	GCGA	2	8	189382	189389	25 %	0 %	50 %	25 %	345007958
422	NC_015952	CGGG	2	8	190567	190574	0 %	0 %	75 %	25 %	345007961

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.