MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	GA	3	6	2814	2819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015952	GA	3	6	3036	3041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015952	GC	3	6	5074	5079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015952	TC	3	6	5268	5273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015952	CG	3	6	5621	5626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015952	CG	3	6	5943	5948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015952	GC	3	6	15436	15441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015952	CG	3	6	15483	15488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015952	GC	3	6	27194	27199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015952	GC	3	6	40534	40539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015952	GT	3	6	41397	41402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015952	GA	3	6	47566	47571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015952	GT	3	6	47695	47700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015952	CG	3	6	49698	49703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015952	CA	3	6	49795	49800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015952	CT	3	6	50732	50737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015952	TG	3	6	50833	50838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015952	GC	3	6	51256	51261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015952	GC	3	6	51272	51277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015952	GC	4	8	53388	53395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015952	AG	3	6	63231	63236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015952	GA	3	6	63263	63268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015952	TG	3	6	63481	63486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015952	TG	3	6	65779	65784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015952	AC	3	6	68455	68460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015952	GA	3	6	71659	71664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015952	CG	3	6	74094	74099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015952	GA	3	6	78929	78934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015952	TG	3	6	79550	79555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015952	CT	3	6	80892	80897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015952	AG	3	6	80928	80933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015952	GT	3	6	82666	82671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015952	TG	3	6	82694	82699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015952	CG	3	6	84769	84774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015952	AG	3	6	85084	85089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015952	CG	3	6	85817	85822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015952	AG	4	8	87039	87046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015952	CG	3	6	88010	88015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015952	GA	3	6	89563	89568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015952	TG	3	6	92006	92011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015952	GC	3	6	92799	92804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015952	GC	3	6	92814	92819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015952	GC	3	6	93138	93143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015952	TG	3	6	95588	95593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015952	GC	3	6	99958	99963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015952	TG	3	6	102355	102360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015952	CT	3	6	104281	104286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015952	AC	4	8	105911	105918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015952	GC	3	6	110701	110706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015952	AC	4	8	118861	118868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015952	AC	3	6	119679	119684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015952	CG	3	6	122481	122486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015952	GT	3	6	122583	122588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015952	CT	3	6	123568	123573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015952	CA	3	6	125352	125357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015952	TG	3	6	125631	125636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015952	TG	3	6	125687	125692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015952	CG	3	6	137233	137238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015952	AC	3	6	137444	137449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015952	GC	3	6	140886	140891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015952	CA	3	6	142432	142437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015952	GT	3	6	144108	144113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015952	CG	3	6	144658	144663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015952	TG	3	6	146158	146163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015952	TG	3	6	149445	149450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015952	CG	3	6	149592	149597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015952	CG	3	6	149641	149646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015952	GC	3	6	156514	156519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015952	GC	3	6	156531	156536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015952	CG	3	6	160464	160469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015952	CG	3	6	163342	163347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015952	GC	3	6	167136	167141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015952	AG	3	6	167931	167936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015952	CA	3	6	181250	181255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015952	CT	3	6	185282	185287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015952	CT	3	6	185306	185311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015952	TC	3	6	185505	185510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015952	GT	3	6	185531	185536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015952	GC	3	6	185742	185747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015952	GC	3	6	185756	185761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015952	CT	3	6	186092	186097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015952	AG	3	6	188668	188673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.