MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	GC	3	6	1566	1571	0 %	0 %	50 %	50 %	345007717
2	NC_015952	TG	3	6	1813	1818	0 %	50 %	50 %	0 %	345007718
3	NC_015952	GC	3	6	1878	1883	0 %	0 %	50 %	50 %	345007718
4	NC_015952	GC	3	6	3064	3069	0 %	0 %	50 %	50 %	345007720
5	NC_015952	GC	3	6	4358	4363	0 %	0 %	50 %	50 %	345007721
6	NC_015952	GC	3	6	4582	4587	0 %	0 %	50 %	50 %	345007722
7	NC_015952	TC	3	6	6170	6175	0 %	50 %	0 %	50 %	345007724
8	NC_015952	GC	3	6	7513	7518	0 %	0 %	50 %	50 %	345007728
9	NC_015952	GC	3	6	9192	9197	0 %	0 %	50 %	50 %	345007729
10	NC_015952	GC	3	6	10515	10520	0 %	0 %	50 %	50 %	345007729
11	NC_015952	GC	3	6	11766	11771	0 %	0 %	50 %	50 %	345007729
12	NC_015952	TC	3	6	14372	14377	0 %	50 %	0 %	50 %	345007731
13	NC_015952	CG	3	6	14544	14549	0 %	0 %	50 %	50 %	345007731
14	NC_015952	GC	3	6	14896	14901	0 %	0 %	50 %	50 %	345007731
15	NC_015952	GA	3	6	15068	15073	50 %	0 %	50 %	0 %	345007732
16	NC_015952	CG	3	6	17291	17296	0 %	0 %	50 %	50 %	345007737
17	NC_015952	CG	3	6	18294	18299	0 %	0 %	50 %	50 %	345007740
18	NC_015952	GC	3	6	19188	19193	0 %	0 %	50 %	50 %	345007740
19	NC_015952	GC	3	6	20039	20044	0 %	0 %	50 %	50 %	345007741
20	NC_015952	GC	3	6	20046	20051	0 %	0 %	50 %	50 %	345007741
21	NC_015952	TC	3	6	20215	20220	0 %	50 %	0 %	50 %	345007741
22	NC_015952	GC	3	6	21143	21148	0 %	0 %	50 %	50 %	345007741
23	NC_015952	GC	3	6	21511	21516	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
24	NC_015952	CG	3	6	21578	21583	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
25	NC_015952	GC	3	6	21640	21645	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
26	NC_015952	CG	3	6	23531	23536	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
27	NC_015952	CG	3	6	23603	23608	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
28	NC_015952	CG	3	6	23675	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
29	NC_015952	CG	3	6	23747	23752	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
30	NC_015952	CG	3	6	23891	23896	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
31	NC_015952	GC	3	6	24879	24884	0 %	0 %	50 %	50 %	345007744
32	NC_015952	CG	3	6	25619	25624	0 %	0 %	50 %	50 %	345007745
33	NC_015952	GA	3	6	26229	26234	50 %	0 %	50 %	0 %	345007746
34	NC_015952	GC	3	6	29521	29526	0 %	0 %	50 %	50 %	345007748
35	NC_015952	GC	3	6	29547	29552	0 %	0 %	50 %	50 %	345007748
36	NC_015952	CG	3	6	30961	30966	0 %	0 %	50 %	50 %	345007749
37	NC_015952	CG	3	6	32146	32151	0 %	0 %	50 %	50 %	345007750
38	NC_015952	CG	3	6	32881	32886	0 %	0 %	50 %	50 %	345007750
39	NC_015952	GC	4	8	33123	33130	0 %	0 %	50 %	50 %	345007750
40	NC_015952	GC	3	6	33347	33352	0 %	0 %	50 %	50 %	345007750
41	NC_015952	CG	3	6	33526	33531	0 %	0 %	50 %	50 %	345007750
42	NC_015952	GT	3	6	34260	34265	0 %	50 %	50 %	0 %	345007752
43	NC_015952	GC	3	6	34341	34346	0 %	0 %	50 %	50 %	345007752
44	NC_015952	CG	3	6	34457	34462	0 %	0 %	50 %	50 %	345007752
45	NC_015952	GC	3	6	34695	34700	0 %	0 %	50 %	50 %	345007753
46	NC_015952	CG	4	8	35251	35258	0 %	0 %	50 %	50 %	345007753
47	NC_015952	CG	3	6	35438	35443	0 %	0 %	50 %	50 %	345007753
48	NC_015952	GA	3	6	35507	35512	50 %	0 %	50 %	0 %	345007753
49	NC_015952	GC	3	6	37384	37389	0 %	0 %	50 %	50 %	345007754
50	NC_015952	GT	3	6	37615	37620	0 %	50 %	50 %	0 %	345007754
51	NC_015952	GC	3	6	39787	39792	0 %	0 %	50 %	50 %	345007755
52	NC_015952	AG	3	6	41189	41194	50 %	0 %	50 %	0 %	345007757
53	NC_015952	GA	3	6	41742	41747	50 %	0 %	50 %	0 %	345007758
54	NC_015952	CG	3	6	41891	41896	0 %	0 %	50 %	50 %	345007759
55	NC_015952	CG	3	6	42010	42015	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
56	NC_015952	CG	3	6	42295	42300	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
57	NC_015952	CG	3	6	42489	42494	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
58	NC_015952	CG	3	6	42931	42936	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
59	NC_015952	GT	3	6	43033	43038	0 %	50 %	50 %	0 %	345007761
60	NC_015952	GC	3	6	43149	43154	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
61	NC_015952	CG	3	6	44290	44295	0 %	0 %	50 %	50 %	345007763
62	NC_015952	AG	3	6	44524	44529	50 %	0 %	50 %	0 %	345007764
63	NC_015952	GC	3	6	44547	44552	0 %	0 %	50 %	50 %	345007764
64	NC_015952	CG	3	6	44891	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
65	NC_015952	CG	3	6	45262	45267	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
66	NC_015952	CG	3	6	45607	45612	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
67	NC_015952	GC	3	6	45614	45619	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
68	NC_015952	TC	3	6	45641	45646	0 %	50 %	0 %	50 %	345007765
69	NC_015952	GC	3	6	46564	46569	0 %	0 %	50 %	50 %	345007767
70	NC_015952	GC	3	6	48180	48185	0 %	0 %	50 %	50 %	345007768
71	NC_015952	GC	3	6	48532	48537	0 %	0 %	50 %	50 %	345007768
72	NC_015952	CG	3	6	48716	48721	0 %	0 %	50 %	50 %	345007768
73	NC_015952	CG	3	6	49035	49040	0 %	0 %	50 %	50 %	345007768
74	NC_015952	GA	3	6	49877	49882	50 %	0 %	50 %	0 %	345007769
75	NC_015952	AG	3	6	49899	49904	50 %	0 %	50 %	0 %	345007769
76	NC_015952	GC	3	6	49966	49971	0 %	0 %	50 %	50 %	345007769
77	NC_015952	GC	3	6	49988	49993	0 %	0 %	50 %	50 %	345007769
78	NC_015952	CG	3	6	50605	50610	0 %	0 %	50 %	50 %	345007771
79	NC_015952	AC	3	6	51248	51253	50 %	0 %	0 %	50 %	345007772
80	NC_015952	GC	3	6	52485	52490	0 %	0 %	50 %	50 %	345007773
81	NC_015952	CG	3	6	54106	54111	0 %	0 %	50 %	50 %	345007775
82	NC_015952	TG	3	6	54649	54654	0 %	50 %	50 %	0 %	345007776
83	NC_015952	CG	3	6	55356	55361	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
84	NC_015952	CG	3	6	55489	55494	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
85	NC_015952	GC	3	6	55533	55538	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
86	NC_015952	GT	3	6	55753	55758	0 %	50 %	50 %	0 %	345007776
87	NC_015952	GC	3	6	55873	55878	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
88	NC_015952	GC	3	6	55964	55969	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
89	NC_015952	CG	3	6	56197	56202	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
90	NC_015952	GC	3	6	56241	56246	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
91	NC_015952	CG	4	8	56535	56542	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
92	NC_015952	GC	3	6	56973	56978	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
93	NC_015952	CG	3	6	57086	57091	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
94	NC_015952	CG	3	6	57548	57553	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
95	NC_015952	CG	4	8	58050	58057	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
96	NC_015952	TG	4	8	58102	58109	0 %	50 %	50 %	0 %	345007776
97	NC_015952	CG	3	6	58897	58902	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
98	NC_015952	GC	3	6	59283	59288	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
99	NC_015952	GC	3	6	59514	59519	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
100	NC_015952	CG	3	6	59684	59689	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
101	NC_015952	TG	3	6	59773	59778	0 %	50 %	50 %	0 %	345007776
102	NC_015952	CG	3	6	59893	59898	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
103	NC_015952	CG	3	6	60316	60321	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
104	NC_015952	GC	3	6	60683	60688	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
105	NC_015952	GC	3	6	60738	60743	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
106	NC_015952	CG	3	6	62014	62019	0 %	0 %	50 %	50 %	345007776
107	NC_015952	GC	3	6	62491	62496	0 %	0 %	50 %	50 %	345007777
108	NC_015952	GC	3	6	62839	62844	0 %	0 %	50 %	50 %	345007778
109	NC_015952	GC	3	6	62894	62899	0 %	0 %	50 %	50 %	345007778
110	NC_015952	GC	3	6	62992	62997	0 %	0 %	50 %	50 %	345007778
111	NC_015952	GC	3	6	63148	63153	0 %	0 %	50 %	50 %	345007778
112	NC_015952	CG	3	6	65453	65458	0 %	0 %	50 %	50 %	345007780
113	NC_015952	GC	3	6	65693	65698	0 %	0 %	50 %	50 %	345007780
114	NC_015952	GC	3	6	66019	66024	0 %	0 %	50 %	50 %	345007781
115	NC_015952	CG	3	6	66080	66085	0 %	0 %	50 %	50 %	345007781
116	NC_015952	CG	3	6	66125	66130	0 %	0 %	50 %	50 %	345007781
117	NC_015952	GC	3	6	66167	66172	0 %	0 %	50 %	50 %	345007781
118	NC_015952	GC	3	6	67106	67111	0 %	0 %	50 %	50 %	345007781
119	NC_015952	CG	3	6	67485	67490	0 %	0 %	50 %	50 %	345007782
120	NC_015952	GC	3	6	67930	67935	0 %	0 %	50 %	50 %	345007783
121	NC_015952	CG	3	6	68638	68643	0 %	0 %	50 %	50 %	345007784
122	NC_015952	GC	3	6	69171	69176	0 %	0 %	50 %	50 %	345007784
123	NC_015952	GC	3	6	69772	69777	0 %	0 %	50 %	50 %	345007785
124	NC_015952	CG	3	6	70339	70344	0 %	0 %	50 %	50 %	345007785
125	NC_015952	TG	3	6	70352	70357	0 %	50 %	50 %	0 %	345007785
126	NC_015952	CG	4	8	70572	70579	0 %	0 %	50 %	50 %	345007785
127	NC_015952	GC	3	6	70816	70821	0 %	0 %	50 %	50 %	345007785
128	NC_015952	GC	3	6	70994	70999	0 %	0 %	50 %	50 %	345007785
129	NC_015952	CG	3	6	71732	71737	0 %	0 %	50 %	50 %	345007787
130	NC_015952	GC	3	6	72775	72780	0 %	0 %	50 %	50 %	345007787
131	NC_015952	CG	3	6	72866	72871	0 %	0 %	50 %	50 %	345007787
132	NC_015952	CG	3	6	72975	72980	0 %	0 %	50 %	50 %	345007787
133	NC_015952	CG	3	6	73345	73350	0 %	0 %	50 %	50 %	345007787
134	NC_015952	CG	3	6	73502	73507	0 %	0 %	50 %	50 %	345007788
135	NC_015952	CG	3	6	73694	73699	0 %	0 %	50 %	50 %	345007788
136	NC_015952	GC	3	6	73728	73733	0 %	0 %	50 %	50 %	345007788
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138	NC_015952	GC	3	6	73781	73786	0 %	0 %	50 %	50 %	345007788
139	NC_015952	GC	3	6	73975	73980	0 %	0 %	50 %	50 %	345007789
140	NC_015952	CG	3	6	74295	74300	0 %	0 %	50 %	50 %	345007790
141	NC_015952	GA	3	6	74632	74637	50 %	0 %	50 %	0 %	345007790
142	NC_015952	GC	3	6	74952	74957	0 %	0 %	50 %	50 %	345007790
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.