MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015951	CGGAAC	2	12	2244	2255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015951	CACCCC	2	12	3184	3195	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3	NC_015951	AGCCCC	2	12	16851	16862	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015951	CGTGGT	2	12	18396	18407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015951	CTCCAC	2	12	20384	20395	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015951	TCCTCG	2	12	43642	43653	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015951	CGCACG	2	12	44719	44730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015951	GCCGGT	2	12	49229	49240	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015951	GGGACC	2	12	50873	50884	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015951	AAAGCG	2	12	65126	65137	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015951	CCCCCG	2	12	72410	72421	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
12	NC_015951	CGTCCC	2	12	73496	73507	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015951	CTCGAC	2	12	73527	73538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015951	CACCCC	2	12	74261	74272	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
15	NC_015951	CCCCCG	2	12	75557	75568	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_015951	CGTCCC	2	12	76643	76654	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015951	CTCGAC	2	12	76674	76685	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015951	GTCACC	2	12	76998	77009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015951	CACCCC	2	12	77408	77419	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
20	NC_015951	GATCTG	2	12	81879	81890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015951	CCCGCG	2	12	99644	99655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015951	CAGGGA	2	12	99823	99834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015951	GGTGTC	2	12	103055	103066	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015951	TCGCGC	2	12	104700	104711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015951	ACGGCG	2	12	108237	108248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015951	GGGGCC	2	12	113910	113921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015951	TTCGCG	2	12	120403	120414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015951	CTGGGA	2	12	142200	142211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015951	GTGGCC	2	12	162863	162874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015951	CCCTTT	2	12	174410	174421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015951	CCCGGC	2	12	185287	185298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015951	GGAACC	2	12	196615	196626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015951	CAGCGT	2	12	207803	207814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015951	CCATGA	2	12	217533	217544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015951	CGCCGT	2	12	217841	217852	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015951	TCGGCA	2	12	217960	217971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015951	GTACTT	2	12	229737	229748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015951	CCCGGC	2	12	229804	229815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015951	CCGTCA	2	12	229842	229853	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015951	CGGCCA	2	12	248117	248128	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015951	AGGCGC	2	12	267690	267701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015951	ACCGCC	2	12	274750	274761	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.