MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 5326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015951	ACT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015951	CTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015951	CAG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015951	ACA	2	6	445	450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015951	ACC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015951	CGG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007458
7	NC_015951	ACC	2	6	743	748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007458
8	NC_015951	CTG	2	6	751	756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007458
9	NC_015951	CTG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007458
10	NC_015951	TGG	2	6	802	807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007458
11	NC_015951	CGT	3	9	835	843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015951	CGG	2	6	847	852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015951	GCG	2	6	853	858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015951	GCG	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015951	GCG	2	6	1131	1136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007459
16	NC_015951	CCG	3	9	1183	1191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007459
17	NC_015951	GCT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
18	NC_015951	GAA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007459
19	NC_015951	GGA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007459
20	NC_015951	CCA	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007459
21	NC_015951	AGC	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007459
22	NC_015951	GCT	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
23	NC_015951	GCG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007459
24	NC_015951	AGC	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007459
25	NC_015951	GCT	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
26	NC_015951	TCG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
27	NC_015951	AGG	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007460
28	NC_015951	CGG	2	6	1787	1792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007460
29	NC_015951	GCC	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
30	NC_015951	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
31	NC_015951	GCC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
32	NC_015951	ACC	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007460
33	NC_015951	CCG	2	6	2031	2036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
34	NC_015951	AGG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015951	GGC	2	6	2279	2284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015951	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015951	GTC	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
38	NC_015951	GTC	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
39	NC_015951	CGA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007461
40	NC_015951	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
41	NC_015951	CTG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015951	TGC	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015951	AGC	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015951	CTC	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015951	TGC	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015951	AGC	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015951	TCA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015951	CTG	2	6	2999	3004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015951	CCG	2	6	3210	3215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015951	GAG	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007462
51	NC_015951	GCG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
52	NC_015951	TCG	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
53	NC_015951	TCT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007462
54	NC_015951	CCA	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007462
55	NC_015951	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007462
56	NC_015951	GTC	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
57	NC_015951	CCG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007462
58	NC_015951	TCG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
59	NC_015951	CAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007462
60	NC_015951	ACC	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007462
61	NC_015951	CGG	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
62	NC_015951	GGC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
63	NC_015951	GTT	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007462
64	NC_015951	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
65	NC_015951	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
66	NC_015951	GCG	2	6	4183	4188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
67	NC_015951	CGG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
68	NC_015951	TCA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007462
69	NC_015951	CGG	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
70	NC_015951	CGG	2	6	4269	4274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
71	NC_015951	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
72	NC_015951	GCG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
73	NC_015951	CGG	2	6	4449	4454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
74	NC_015951	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007462
75	NC_015951	GCG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015951	TGC	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015951	GAG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007463
78	NC_015951	GAT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007463
79	NC_015951	GTC	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007463
80	NC_015951	CGG	2	6	4944	4949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
81	NC_015951	TTG	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007463
82	NC_015951	GCG	3	9	5029	5037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
83	NC_015951	GCG	2	6	5051	5056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
84	NC_015951	CCA	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007463
85	NC_015951	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007464
86	NC_015951	TCG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007464
87	NC_015951	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007464
88	NC_015951	TGG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
89	NC_015951	ATG	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007464
90	NC_015951	GTC	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007464
91	NC_015951	CGG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
92	NC_015951	AGG	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007464
93	NC_015951	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
94	NC_015951	AGT	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007464
95	NC_015951	GTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
96	NC_015951	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007464
97	NC_015951	CTT	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007464
98	NC_015951	GCG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
99	NC_015951	CGG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
100	NC_015951	GGC	3	9	6426	6434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
101	NC_015951	GCG	2	6	6440	6445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
102	NC_015951	GGC	2	6	6447	6452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
103	NC_015951	CGC	2	6	6518	6523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007464
104	NC_015951	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
105	NC_015951	GCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
106	NC_015951	CAG	2	6	6669	6674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007464
107	NC_015951	CGG	2	6	6696	6701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
108	NC_015951	GTG	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
109	NC_015951	TCC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007464
110	NC_015951	CGG	2	6	6788	6793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
111	NC_015951	CAA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007464
112	NC_015951	GCG	2	6	6980	6985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015951	AGG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007465
114	NC_015951	GCG	2	6	7067	7072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
115	NC_015951	GCG	2	6	7091	7096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
116	NC_015951	GGC	2	6	7097	7102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
117	NC_015951	CAG	2	6	7139	7144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007465
118	NC_015951	GGC	2	6	7157	7162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
119	NC_015951	GGC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
120	NC_015951	CGG	2	6	7277	7282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
121	NC_015951	CGT	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
122	NC_015951	TGG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007465
123	NC_015951	GCT	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
124	NC_015951	GCG	2	6	7386	7391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
125	NC_015951	GGC	2	6	7393	7398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
126	NC_015951	CGT	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
127	NC_015951	GCC	3	9	7479	7487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007465
128	NC_015951	CGG	2	6	7516	7521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
129	NC_015951	CGG	2	6	7528	7533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
130	NC_015951	GAG	2	6	7565	7570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007465
131	NC_015951	CCG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007465
132	NC_015951	GCG	2	6	7656	7661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
133	NC_015951	CGT	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
134	NC_015951	GGC	2	6	7943	7948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007466
135	NC_015951	TGC	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007466
136	NC_015951	GCT	2	6	7990	7995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007466
137	NC_015951	GGA	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007466
138	NC_015951	GAG	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007466
139	NC_015951	CGA	2	6	8220	8225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007466
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141	NC_015951	TCG	2	6	8318	8323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007466
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158	NC_015951	TTC	2	6	9107	9112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007466
159	NC_015951	GGT	2	6	9118	9123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007466
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161	NC_015951	CAC	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_015951	GCC	2	6	9461	9466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_015951	GCG	2	6	9477	9482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015951	TCG	2	6	9485	9490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015951	CGT	2	6	9544	9549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007467
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251	NC_015951	AGC	2	6	13986	13991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_015951	GCT	2	6	14018	14023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_015951	GTA	2	6	14087	14092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_015951	CGT	2	6	14104	14109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_015951	TGG	2	6	14227	14232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015951	TGT	2	6	14237	14242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015951	GGC	2	6	14253	14258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_015951	ACC	2	6	14272	14277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_015951	CAG	2	6	14433	14438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007471
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472	NC_015951	CAC	2	6	24835	24840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
473	NC_015951	CCG	2	6	24863	24868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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483	NC_015951	GAG	2	6	25398	25403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007483
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496	NC_015951	CCG	2	6	26203	26208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007483
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499	NC_015951	CCA	2	6	26288	26293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007483
500	NC_015951	TCG	2	6	26311	26316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007483

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