MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015951	GC	3	6	1375	1380	0 %	0 %	50 %	50 %	345007459
2	NC_015951	CG	3	6	2048	2053	0 %	0 %	50 %	50 %	345007460
3	NC_015951	AG	3	6	2505	2510	50 %	0 %	50 %	0 %	345007461
4	NC_015951	AG	3	6	2619	2624	50 %	0 %	50 %	0 %	345007461
5	NC_015951	CG	3	6	5140	5145	0 %	0 %	50 %	50 %	345007463
6	NC_015951	CG	4	8	5678	5685	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
7	NC_015951	GC	3	6	6208	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
8	NC_015951	GC	3	6	6253	6258	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
9	NC_015951	GA	3	6	6781	6786	50 %	0 %	50 %	0 %	345007464
10	NC_015951	GC	3	6	6831	6836	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
11	NC_015951	GC	3	6	7933	7938	0 %	0 %	50 %	50 %	345007466
12	NC_015951	AC	3	6	9704	9709	50 %	0 %	0 %	50 %	345007467
13	NC_015951	CG	3	6	9784	9789	0 %	0 %	50 %	50 %	345007467
14	NC_015951	CG	3	6	10428	10433	0 %	0 %	50 %	50 %	345007467
15	NC_015951	GC	4	8	10506	10513	0 %	0 %	50 %	50 %	345007467
16	NC_015951	GC	3	6	12505	12510	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
17	NC_015951	CG	3	6	12835	12840	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
18	NC_015951	GC	3	6	12974	12979	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
19	NC_015951	CG	3	6	13353	13358	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
20	NC_015951	AG	3	6	14884	14889	50 %	0 %	50 %	0 %	345007471
21	NC_015951	TC	3	6	15147	15152	0 %	50 %	0 %	50 %	345007471
22	NC_015951	CG	3	6	15270	15275	0 %	0 %	50 %	50 %	345007471
23	NC_015951	GC	3	6	15576	15581	0 %	0 %	50 %	50 %	345007472
24	NC_015951	GC	3	6	15609	15614	0 %	0 %	50 %	50 %	345007472
25	NC_015951	CG	3	6	19145	19150	0 %	0 %	50 %	50 %	345007475
26	NC_015951	CG	3	6	19537	19542	0 %	0 %	50 %	50 %	345007475
27	NC_015951	CT	3	6	19750	19755	0 %	50 %	0 %	50 %	345007476
28	NC_015951	GA	3	6	20495	20500	50 %	0 %	50 %	0 %	345007478
29	NC_015951	GC	3	6	21489	21494	0 %	0 %	50 %	50 %	345007478
30	NC_015951	CG	3	6	22053	22058	0 %	0 %	50 %	50 %	345007478
31	NC_015951	CA	3	6	22312	22317	50 %	0 %	0 %	50 %	345007478
32	NC_015951	CA	3	6	22402	22407	50 %	0 %	0 %	50 %	345007478
33	NC_015951	GT	3	6	22607	22612	0 %	50 %	50 %	0 %	345007479
34	NC_015951	CG	3	6	23154	23159	0 %	0 %	50 %	50 %	345007480
35	NC_015951	CG	3	6	23333	23338	0 %	0 %	50 %	50 %	345007480
36	NC_015951	TC	3	6	24253	24258	0 %	50 %	0 %	50 %	345007481
37	NC_015951	GC	3	6	24615	24620	0 %	0 %	50 %	50 %	345007482
38	NC_015951	GC	3	6	25594	25599	0 %	0 %	50 %	50 %	345007483
39	NC_015951	CG	3	6	26046	26051	0 %	0 %	50 %	50 %	345007483
40	NC_015951	GC	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	345007483
41	NC_015951	CG	3	6	26929	26934	0 %	0 %	50 %	50 %	345007483
42	NC_015951	GC	3	6	27242	27247	0 %	0 %	50 %	50 %	345007483
43	NC_015951	CA	3	6	27556	27561	50 %	0 %	0 %	50 %	345007483
44	NC_015951	GC	3	6	27578	27583	0 %	0 %	50 %	50 %	345007483
45	NC_015951	GC	3	6	28194	28199	0 %	0 %	50 %	50 %	345007484
46	NC_015951	CG	3	6	28228	28233	0 %	0 %	50 %	50 %	345007484
47	NC_015951	CG	3	6	28385	28390	0 %	0 %	50 %	50 %	345007484
48	NC_015951	CG	3	6	28548	28553	0 %	0 %	50 %	50 %	345007485
49	NC_015951	GC	3	6	30106	30111	0 %	0 %	50 %	50 %	345007486
50	NC_015951	AG	3	6	30132	30137	50 %	0 %	50 %	0 %	345007486
51	NC_015951	AG	3	6	30312	30317	50 %	0 %	50 %	0 %	345007486
52	NC_015951	GT	3	6	30968	30973	0 %	50 %	50 %	0 %	345007488
53	NC_015951	GT	3	6	30983	30988	0 %	50 %	50 %	0 %	345007488
54	NC_015951	GC	3	6	33862	33867	0 %	0 %	50 %	50 %	345007491
55	NC_015951	TG	3	6	35048	35053	0 %	50 %	50 %	0 %	345007492
56	NC_015951	CG	3	6	35059	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	345007492
57	NC_015951	CG	3	6	35294	35299	0 %	0 %	50 %	50 %	345007492
58	NC_015951	AC	3	6	36439	36444	50 %	0 %	0 %	50 %	345007495
59	NC_015951	GC	3	6	36507	36512	0 %	0 %	50 %	50 %	345007495
60	NC_015951	CG	5	10	36630	36639	0 %	0 %	50 %	50 %	345007495
61	NC_015951	CG	3	6	37104	37109	0 %	0 %	50 %	50 %	345007496
62	NC_015951	CG	4	8	38110	38117	0 %	0 %	50 %	50 %	345007497
63	NC_015951	CG	3	6	38873	38878	0 %	0 %	50 %	50 %	345007498
64	NC_015951	GC	3	6	39200	39205	0 %	0 %	50 %	50 %	345007498
65	NC_015951	GC	3	6	39404	39409	0 %	0 %	50 %	50 %	345007498
66	NC_015951	GC	3	6	39598	39603	0 %	0 %	50 %	50 %	345007499
67	NC_015951	CG	3	6	39793	39798	0 %	0 %	50 %	50 %	345007499
68	NC_015951	GC	3	6	40922	40927	0 %	0 %	50 %	50 %	345007500
69	NC_015951	GC	3	6	41441	41446	0 %	0 %	50 %	50 %	345007501
70	NC_015951	GC	3	6	42570	42575	0 %	0 %	50 %	50 %	345007502
71	NC_015951	TG	3	6	42792	42797	0 %	50 %	50 %	0 %	345007502
72	NC_015951	CG	3	6	45883	45888	0 %	0 %	50 %	50 %	345007505
73	NC_015951	CG	3	6	46379	46384	0 %	0 %	50 %	50 %	345007506
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75	NC_015951	CG	3	6	47469	47474	0 %	0 %	50 %	50 %	345007507
76	NC_015951	CG	3	6	47503	47508	0 %	0 %	50 %	50 %	345007507
77	NC_015951	CG	3	6	48966	48971	0 %	0 %	50 %	50 %	345007509
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79	NC_015951	TC	3	6	54503	54508	0 %	50 %	0 %	50 %	345007512
80	NC_015951	GC	3	6	54938	54943	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
81	NC_015951	CG	3	6	55327	55332	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
82	NC_015951	GC	3	6	55742	55747	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
83	NC_015951	AT	3	6	56305	56310	50 %	50 %	0 %	0 %	345007512
84	NC_015951	GT	3	6	56327	56332	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
85	NC_015951	AT	3	6	56635	56640	50 %	50 %	0 %	0 %	345007512
86	NC_015951	GA	3	6	56864	56869	50 %	0 %	50 %	0 %	345007512
87	NC_015951	TG	3	6	56906	56911	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
88	NC_015951	AG	3	6	57110	57115	50 %	0 %	50 %	0 %	345007512
89	NC_015951	TA	3	6	57227	57232	50 %	50 %	0 %	0 %	345007512
90	NC_015951	CT	3	6	57575	57580	0 %	50 %	0 %	50 %	345007512
91	NC_015951	AG	3	6	57597	57602	50 %	0 %	50 %	0 %	345007512
92	NC_015951	TG	3	6	57631	57636	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
93	NC_015951	TG	3	6	58432	58437	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
94	NC_015951	TC	3	6	60459	60464	0 %	50 %	0 %	50 %	345007512
95	NC_015951	CG	3	6	60528	60533	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
96	NC_015951	TG	3	6	61775	61780	0 %	50 %	50 %	0 %	345007513
97	NC_015951	TG	3	6	62303	62308	0 %	50 %	50 %	0 %	345007513
98	NC_015951	GA	3	6	62313	62318	50 %	0 %	50 %	0 %	345007513
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101	NC_015951	GC	3	6	65491	65496	0 %	0 %	50 %	50 %	345007515
102	NC_015951	TC	3	6	65699	65704	0 %	50 %	0 %	50 %	345007515
103	NC_015951	GC	4	8	65735	65742	0 %	0 %	50 %	50 %	345007515
104	NC_015951	GC	3	6	65887	65892	0 %	0 %	50 %	50 %	345007516
105	NC_015951	CG	3	6	66696	66701	0 %	0 %	50 %	50 %	345007516
106	NC_015951	GA	5	10	66764	66773	50 %	0 %	50 %	0 %	345007516
107	NC_015951	GA	3	6	67496	67501	50 %	0 %	50 %	0 %	345007517
108	NC_015951	CG	3	6	68072	68077	0 %	0 %	50 %	50 %	345007517
109	NC_015951	TC	3	6	68815	68820	0 %	50 %	0 %	50 %	345007519
110	NC_015951	GC	4	8	69561	69568	0 %	0 %	50 %	50 %	345007519
111	NC_015951	GC	3	6	70006	70011	0 %	0 %	50 %	50 %	345007519
112	NC_015951	CG	3	6	71203	71208	0 %	0 %	50 %	50 %	345007520
113	NC_015951	CG	3	6	71212	71217	0 %	0 %	50 %	50 %	345007520
114	NC_015951	GC	3	6	71431	71436	0 %	0 %	50 %	50 %	345007520
115	NC_015951	GT	4	8	82977	82984	0 %	50 %	50 %	0 %	345007521
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117	NC_015951	TG	3	6	85397	85402	0 %	50 %	50 %	0 %	345007523
118	NC_015951	GC	4	8	86014	86021	0 %	0 %	50 %	50 %	345007523
119	NC_015951	GC	3	6	86241	86246	0 %	0 %	50 %	50 %	345007523
120	NC_015951	GC	3	6	86700	86705	0 %	0 %	50 %	50 %	345007523
121	NC_015951	CG	3	6	86895	86900	0 %	0 %	50 %	50 %	345007523
122	NC_015951	GC	3	6	86998	87003	0 %	0 %	50 %	50 %	345007523
123	NC_015951	GA	3	6	88745	88750	50 %	0 %	50 %	0 %	345007524
124	NC_015951	CT	3	6	89341	89346	0 %	50 %	0 %	50 %	345007525
125	NC_015951	GC	3	6	90324	90329	0 %	0 %	50 %	50 %	345007526
126	NC_015951	CG	3	6	90518	90523	0 %	0 %	50 %	50 %	345007526
127	NC_015951	CG	3	6	91248	91253	0 %	0 %	50 %	50 %	345007527
128	NC_015951	GC	3	6	91697	91702	0 %	0 %	50 %	50 %	345007527
129	NC_015951	GC	3	6	92814	92819	0 %	0 %	50 %	50 %	345007529
130	NC_015951	GC	3	6	93327	93332	0 %	0 %	50 %	50 %	345007530
131	NC_015951	CG	3	6	93601	93606	0 %	0 %	50 %	50 %	345007530
132	NC_015951	CT	3	6	97494	97499	0 %	50 %	0 %	50 %	345007532
133	NC_015951	CG	3	6	99106	99111	0 %	0 %	50 %	50 %	345007533
134	NC_015951	AC	3	6	100789	100794	50 %	0 %	0 %	50 %	345007534
135	NC_015951	GC	3	6	101558	101563	0 %	0 %	50 %	50 %	345007534
136	NC_015951	CG	3	6	105238	105243	0 %	0 %	50 %	50 %	345007536
137	NC_015951	GC	3	6	105427	105432	0 %	0 %	50 %	50 %	345007536
138	NC_015951	CG	3	6	105573	105578	0 %	0 %	50 %	50 %	345007536
139	NC_015951	GC	3	6	105938	105943	0 %	0 %	50 %	50 %	345007536
140	NC_015951	CG	3	6	106142	106147	0 %	0 %	50 %	50 %	345007536
141	NC_015951	GA	3	6	110260	110265	50 %	0 %	50 %	0 %	345007539
142	NC_015951	CA	3	6	112037	112042	50 %	0 %	0 %	50 %	345007540
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.