MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 1064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	ACACAA	2	12	1109	1120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995334
2	NC_015949	AGATGC	2	12	1784	1795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344995335
3	NC_015949	TGAGGT	2	12	1887	1898	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344995335
4	NC_015949	AATTTC	2	12	2400	2411	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	344995335
5	NC_015949	GGAAAA	2	12	7041	7052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
6	NC_015949	GATGCA	2	12	7260	7271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344995340
7	NC_015949	CAGGAA	2	12	7836	7847	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344995340
8	NC_015949	TTCTTT	2	12	11504	11515	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	344995342
9	NC_015949	ATACAA	2	12	13859	13870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	344995343
10	NC_015949	ATGGGA	2	12	18670	18681	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	344995345
11	NC_015949	CCAACA	2	12	19931	19942	50 %	0 %	0 %	50 %	344995345
12	NC_015949	GACGGT	2	12	19957	19968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344995345
13	NC_015949	ACCGAC	2	12	19972	19983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995345
14	NC_015949	TGGTCA	2	12	20375	20386	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995345
15	NC_015949	CAACAC	2	12	20508	20519	50 %	0 %	0 %	50 %	344995345
16	NC_015949	CCAACA	2	12	20549	20560	50 %	0 %	0 %	50 %	344995345
17	NC_015949	TTAAGG	2	12	20703	20714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
18	NC_015949	TTAAGG	2	12	21150	21161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
19	NC_015949	CTGATG	2	12	22311	22322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995345
20	NC_015949	CCAACA	3	18	26459	26476	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
21	NC_015949	CCGACA	2	12	26477	26488	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995347
22	NC_015949	GACGGT	2	12	26527	26538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344995347
23	NC_015949	ACCGAC	2	12	26542	26553	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995347
24	NC_015949	TGGTCA	2	12	26945	26956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995347
25	NC_015949	CAACAC	2	12	27078	27089	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
26	NC_015949	CCAACA	2	12	27119	27130	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
27	NC_015949	TTAAGG	2	12	27273	27284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
28	NC_015949	TTAAGG	2	12	27720	27731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
29	NC_015949	TAGCAA	2	12	29136	29147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344995347
30	NC_015949	TTAATT	2	12	36754	36765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995352
31	NC_015949	AAGAAA	2	12	37641	37652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995354
32	NC_015949	ACAAGA	2	12	39151	39162	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	344995355
33	NC_015949	TTGCTT	2	12	43295	43306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344995359
34	NC_015949	TTGCAA	2	12	43515	43526	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995359
35	NC_015949	AAGCCC	2	12	44544	44555	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995360
36	NC_015949	GAAAAG	2	12	46650	46661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995362
37	NC_015949	GAAGGA	2	12	49999	50010	50 %	0 %	50 %	0 %	344995367
38	NC_015949	TTGATA	2	12	50012	50023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	344995367
39	NC_015949	GCTGAC	2	12	52290	52301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344995369
40	NC_015949	CATCAC	2	12	61883	61894	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344995379
41	NC_015949	TCATGG	2	12	61910	61921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995379
42	NC_015949	GAATAA	2	12	62005	62016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344995379
43	NC_015949	GGGCCG	2	12	62902	62913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344995380
44	NC_015949	TTTGTC	2	12	70070	70081	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344995384
45	NC_015949	ACCAAT	2	12	77608	77619	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	344995389
46	NC_015949	GTTGAC	2	12	77969	77980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995389
47	NC_015949	CAAGAA	2	12	78081	78092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	344995389
48	NC_015949	GTAAAC	2	12	80669	80680	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344995392
49	NC_015949	ATCTTC	2	12	82611	82622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	344995393
50	NC_015949	AGAAAA	2	12	85272	85283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995394
51	NC_015949	GTTGAG	2	12	85315	85326	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344995394
52	NC_015949	ACTATG	2	12	85493	85504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995394
53	NC_015949	TTTTGT	2	12	92488	92499	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	344995403
54	NC_015949	TATCTT	2	12	92682	92693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	344995403
55	NC_015949	GTATGA	2	12	96230	96241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995404
56	NC_015949	CATCGG	2	12	99531	99542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344995407
57	NC_015949	AAAAGG	2	12	105335	105346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995414
58	NC_015949	TGACGA	2	12	109784	109795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344995418
59	NC_015949	TTGTGC	2	12	115762	115773	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344995421
60	NC_015949	AGCAAA	2	12	121601	121612	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	344995425
61	NC_015949	ATTAGC	2	12	129887	129898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995430
62	NC_015949	AAGATT	2	12	130041	130052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	344995430
63	NC_015949	TTGAGT	2	12	130252	130263	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	344995430
64	NC_015949	TCGGGT	2	12	135187	135198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344995432
65	NC_015949	AAGAAT	2	12	144120	144131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344995439
66	NC_015949	GATAAG	2	12	145251	145262	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	344995440
67	NC_015949	TGAGGT	2	12	149528	149539	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344995444
68	NC_015949	AAATGG	2	12	149552	149563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	344995444
69	NC_015949	ATTGCA	2	12	150373	150384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995445
70	NC_015949	TGCAAC	2	12	150687	150698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344995445
71	NC_015949	AGACAA	2	12	158752	158763	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	344995450
72	NC_015949	TTATGG	2	12	158911	158922	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	344995450
73	NC_015949	TTGCAA	2	12	161447	161458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995451
74	NC_015949	AGATAA	2	12	162182	162193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344995452
75	NC_015949	AGCATG	2	12	169779	169790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344995457
76	NC_015949	TTGCAA	2	12	174394	174405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995461
77	NC_015949	ATGGTA	2	12	174650	174661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995461
78	NC_015949	GTTTGG	2	12	176350	176361	0 %	50 %	50 %	0 %	344995462
79	NC_015949	TTTTTA	2	12	177876	177887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	344995464
80	NC_015949	TTGTCA	2	12	178024	178035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	344995464
81	NC_015949	GAACAG	2	12	181165	181176	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344995467
82	NC_015949	TTGAGA	2	12	185710	185721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995474
83	NC_015949	AAATTA	2	12	187739	187750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995474
84	NC_015949	AAAAGA	2	12	190488	190499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995479
85	NC_015949	TCTTGT	2	12	192455	192466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344995480
86	NC_015949	TAAAGA	2	12	194067	194078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344995481
87	NC_015949	ATTAAT	2	12	196889	196900	50 %	50 %	0 %	0 %	344995482
88	NC_015949	TAAATA	2	12	197154	197165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995482
89	NC_015949	AAATGA	2	12	197397	197408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344995483
90	NC_015949	CAGGAG	2	12	200579	200590	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344995486
91	NC_015949	GTTACA	2	12	201121	201132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344995486
92	NC_015949	GAAAAA	2	12	202839	202850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995488
93	NC_015949	AAAATA	2	12	210672	210683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	344995495
94	NC_015949	TCTTGT	2	12	216506	216517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344995497
95	NC_015949	GCTTTT	2	12	217715	217726	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344995498
96	NC_015949	AATAGA	2	12	221970	221981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344995504
97	NC_015949	GAAAAA	2	12	223732	223743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995506
98	NC_015949	AGAAAA	2	12	224934	224945	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995507
99	NC_015949	TGGTGC	2	12	227531	227542	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344995510
100	NC_015949	AAAAAG	2	12	229496	229507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995512
101	NC_015949	AACCTC	2	12	230717	230728	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344995515
102	NC_015949	CGGCAA	2	12	234831	234842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995519
103	NC_015949	TCTATG	2	12	240037	240048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	344995520
104	NC_015949	CCATCA	2	12	240477	240488	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344995520
105	NC_015949	AAAAGG	2	12	243826	243837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995523
106	NC_015949	CGCATA	2	12	246807	246818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344995525
107	NC_015949	ATTCAT	2	12	247689	247700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	344995526
108	NC_015949	AGAAAA	2	12	252431	252442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	344995529
109	NC_015949	AAAGAG	2	12	252513	252524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995529
110	NC_015949	GTTGAG	2	12	252954	252965	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344995529
111	NC_015949	GTAAAG	2	12	256433	256444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	344995532
112	NC_015949	TTATTG	2	12	257307	257318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	344995533
113	NC_015949	ACTTTG	2	12	259850	259861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	344995535
114	NC_015949	TATTGA	2	12	265020	265031	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	344995541
115	NC_015949	TTCAAC	2	12	266283	266294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995541
116	NC_015949	TCAAAA	2	12	269008	269019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	344995545
117	NC_015949	TTGATT	2	12	269987	269998	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	344995545
118	NC_015949	ATTCAA	2	12	274494	274505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344995552
119	NC_015949	TATCAA	2	12	274902	274913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344995552
120	NC_015949	GCGAAA	2	12	277209	277220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344995553
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123	NC_015949	AATGTG	2	12	283477	283488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995557
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348	NC_015949	ATAACT	2	12	852555	852566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344996081
349	NC_015949	ATTGCA	2	12	853798	853809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344996082
350	NC_015949	TCAACA	2	12	854580	854591	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	344996083
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452	NC_015949	TTCAAG	2	12	1096079	1096090	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344996286
453	NC_015949	CTTTTA	2	12	1097186	1097197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	344996287
454	NC_015949	CTTTTT	2	12	1105891	1105902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	344996295
455	NC_015949	TGAAAG	2	12	1107690	1107701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	344996296
456	NC_015949	CTGGTT	2	12	1110093	1110104	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344996300
457	NC_015949	CAAGGT	2	12	1110878	1110889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344996300
458	NC_015949	TGAAAA	2	12	1114722	1114733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	344996303
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460	NC_015949	CAGATG	2	12	1115856	1115867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344996305
461	NC_015949	ATTAGA	2	12	1118273	1118284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	344996309
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463	NC_015949	TGTTGG	2	12	1119103	1119114	0 %	50 %	50 %	0 %	344996309
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