MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 2453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	GGAAA	2	10	724	733	60 %	0 %	40 %	0 %	344995334
2	NC_015949	AGGCG	2	10	1284	1293	20 %	0 %	60 %	20 %	344995334
3	NC_015949	AAGCT	2	10	1844	1853	40 %	20 %	20 %	20 %	344995335
4	NC_015949	ATAAA	2	10	2838	2847	80 %	20 %	0 %	0 %	344995336
5	NC_015949	CTTCT	2	10	2880	2889	0 %	60 %	0 %	40 %	344995336
6	NC_015949	TTTAG	2	10	3386	3395	20 %	60 %	20 %	0 %	344995336
7	NC_015949	CTTCT	2	10	3630	3639	0 %	60 %	0 %	40 %	344995336
8	NC_015949	GGATA	2	10	4184	4193	40 %	20 %	40 %	0 %	344995338
9	NC_015949	GCGAT	2	10	7711	7720	20 %	20 %	40 %	20 %	344995340
10	NC_015949	AAAAG	2	10	7757	7766	80 %	0 %	20 %	0 %	344995340
11	NC_015949	TGTGT	2	10	8337	8346	0 %	60 %	40 %	0 %	344995340
12	NC_015949	AGACA	2	10	8561	8570	60 %	0 %	20 %	20 %	344995340
13	NC_015949	TCTTT	2	10	9070	9079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015949	CTTAA	2	10	9134	9143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015949	AAGGA	2	10	9912	9921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015949	AAGAA	2	10	11051	11060	80 %	0 %	20 %	0 %	344995341
17	NC_015949	CTAAT	2	10	12368	12377	40 %	40 %	0 %	20 %	344995342
18	NC_015949	TTTAA	2	10	12822	12831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015949	CAAAG	2	10	14186	14195	60 %	0 %	20 %	20 %	344995343
20	NC_015949	AAACC	2	10	14221	14230	60 %	0 %	0 %	40 %	344995343
21	NC_015949	TTCAA	2	10	15790	15799	40 %	40 %	0 %	20 %	344995343
22	NC_015949	AGACA	2	10	16311	16320	60 %	0 %	20 %	20 %	344995343
23	NC_015949	TTTTA	2	10	17590	17599	20 %	80 %	0 %	0 %	344995345
24	NC_015949	ATTAT	2	10	18700	18709	40 %	60 %	0 %	0 %	344995345
25	NC_015949	AACCT	2	10	19059	19068	40 %	20 %	0 %	40 %	344995345
26	NC_015949	TGTGG	2	10	19270	19279	0 %	40 %	60 %	0 %	344995345
27	NC_015949	GTACA	2	10	20024	20033	40 %	20 %	20 %	20 %	344995345
28	NC_015949	AAGGT	2	10	20756	20765	40 %	20 %	40 %	0 %	344995345
29	NC_015949	AAGGT	2	10	21203	21212	40 %	20 %	40 %	0 %	344995345
30	NC_015949	GAACC	2	10	22832	22841	40 %	0 %	20 %	40 %	344995345
31	NC_015949	AGAGA	2	10	23272	23281	60 %	0 %	40 %	0 %	344995345
32	NC_015949	GAAAA	2	10	24497	24506	80 %	0 %	20 %	0 %	344995347
33	NC_015949	AAATT	2	10	24888	24897	60 %	40 %	0 %	0 %	344995347
34	NC_015949	GTACA	2	10	26594	26603	40 %	20 %	20 %	20 %	344995347
35	NC_015949	AAGGT	2	10	27326	27335	40 %	20 %	40 %	0 %	344995347
36	NC_015949	AAGGT	2	10	27773	27782	40 %	20 %	40 %	0 %	344995347
37	NC_015949	GAGGT	2	10	30427	30436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015949	AAATC	2	10	30887	30896	60 %	20 %	0 %	20 %	344995348
39	NC_015949	CATTA	2	10	32509	32518	40 %	40 %	0 %	20 %	344995349
40	NC_015949	TCAAT	2	10	32556	32565	40 %	40 %	0 %	20 %	344995349
41	NC_015949	CTTTT	2	10	36175	36184	0 %	80 %	0 %	20 %	344995351
42	NC_015949	GTTTT	2	10	36643	36652	0 %	80 %	20 %	0 %	344995352
43	NC_015949	GAAAA	2	10	37344	37353	80 %	0 %	20 %	0 %	344995353
44	NC_015949	AAGAC	2	10	38202	38211	60 %	0 %	20 %	20 %	344995354
45	NC_015949	CAAAG	2	10	39779	39788	60 %	0 %	20 %	20 %	344995355
46	NC_015949	CAGAA	2	10	39870	39879	60 %	0 %	20 %	20 %	344995355
47	NC_015949	AACAA	2	10	40843	40852	80 %	0 %	0 %	20 %	344995356
48	NC_015949	TTTTA	2	10	41182	41191	20 %	80 %	0 %	0 %	344995357
49	NC_015949	AGTAC	2	10	42381	42390	40 %	20 %	20 %	20 %	344995357
50	NC_015949	CATTT	2	10	42976	42985	20 %	60 %	0 %	20 %	344995358
51	NC_015949	CCTTT	2	10	44667	44676	0 %	60 %	0 %	40 %	344995360
52	NC_015949	CTTTT	2	10	44964	44973	0 %	80 %	0 %	20 %	344995360
53	NC_015949	TCTTT	2	10	45365	45374	0 %	80 %	0 %	20 %	344995361
54	NC_015949	GGTCT	2	10	47848	47857	0 %	40 %	40 %	20 %	344995364
55	NC_015949	GCTTT	2	10	48362	48371	0 %	60 %	20 %	20 %	344995365
56	NC_015949	TTTCC	2	10	48680	48689	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015949	AGTAA	2	10	49407	49416	60 %	20 %	20 %	0 %	344995366
58	NC_015949	GACCT	2	10	53405	53414	20 %	20 %	20 %	40 %	344995370
59	NC_015949	AAGAA	2	10	53981	53990	80 %	0 %	20 %	0 %	344995371
60	NC_015949	AAGAA	2	10	54149	54158	80 %	0 %	20 %	0 %	344995371
61	NC_015949	ACAGC	2	10	54213	54222	40 %	0 %	20 %	40 %	344995371
62	NC_015949	AAAAG	2	10	55325	55334	80 %	0 %	20 %	0 %	344995372
63	NC_015949	AAGGA	2	10	56497	56506	60 %	0 %	40 %	0 %	344995373
64	NC_015949	GGCGG	2	10	57271	57280	0 %	0 %	80 %	20 %	344995375
65	NC_015949	AAAAG	2	10	57412	57421	80 %	0 %	20 %	0 %	344995375
66	NC_015949	AAAAT	2	10	59064	59073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015949	TGATA	2	10	59085	59094	40 %	40 %	20 %	0 %	344995377
68	NC_015949	GTGTT	2	10	60170	60179	0 %	60 %	40 %	0 %	344995378
69	NC_015949	CAAAG	2	10	61208	61217	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015949	ATGTG	2	10	62080	62089	20 %	40 %	40 %	0 %	344995379
71	NC_015949	GAAAA	2	10	62131	62140	80 %	0 %	20 %	0 %	344995379
72	NC_015949	ACAAT	2	10	62533	62542	60 %	20 %	0 %	20 %	344995379
73	NC_015949	GCTTT	2	10	63438	63447	0 %	60 %	20 %	20 %	344995380
74	NC_015949	ATCAA	2	10	63601	63610	60 %	20 %	0 %	20 %	344995380
75	NC_015949	CATGT	2	10	64836	64845	20 %	40 %	20 %	20 %	344995380
76	NC_015949	CATCA	2	10	66198	66207	40 %	20 %	0 %	40 %	344995381
77	NC_015949	ATACA	2	10	68393	68402	60 %	20 %	0 %	20 %	344995382
78	NC_015949	CATAT	2	10	68510	68519	40 %	40 %	0 %	20 %	344995382
79	NC_015949	ATGTT	2	10	69672	69681	20 %	60 %	20 %	0 %	344995383
80	NC_015949	TTATC	2	10	70433	70442	20 %	60 %	0 %	20 %	344995384
81	NC_015949	AGATA	2	10	72010	72019	60 %	20 %	20 %	0 %	344995386
82	NC_015949	AAGCC	2	10	72976	72985	40 %	0 %	20 %	40 %	344995387
83	NC_015949	CTTTG	2	10	75838	75847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015949	AAGGG	2	10	76208	76217	40 %	0 %	60 %	0 %	344995388
85	NC_015949	TCATT	2	10	78513	78522	20 %	60 %	0 %	20 %	344995389
86	NC_015949	CAAGA	2	10	80951	80960	60 %	0 %	20 %	20 %	344995392
87	NC_015949	CCTTT	2	10	83238	83247	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015949	AAGAA	2	10	85371	85380	80 %	0 %	20 %	0 %	344995394
89	NC_015949	TTCCA	2	10	85864	85873	20 %	40 %	0 %	40 %	344995395
90	NC_015949	AATAT	2	10	87494	87503	60 %	40 %	0 %	0 %	344995398
91	NC_015949	TATTT	2	10	87581	87590	20 %	80 %	0 %	0 %	344995398
92	NC_015949	AAAGA	2	10	88547	88556	80 %	0 %	20 %	0 %	344995399
93	NC_015949	ATTTT	2	10	90910	90919	20 %	80 %	0 %	0 %	344995401
94	NC_015949	TCATT	2	10	91421	91430	20 %	60 %	0 %	20 %	344995402
95	NC_015949	ATATG	2	10	92711	92720	40 %	40 %	20 %	0 %	344995403
96	NC_015949	ACATA	2	10	93085	93094	60 %	20 %	0 %	20 %	344995403
97	NC_015949	CAGAG	2	10	96518	96527	40 %	0 %	40 %	20 %	344995404
98	NC_015949	CGAGT	2	10	97745	97754	20 %	20 %	40 %	20 %	344995405
99	NC_015949	GGCGG	2	10	98973	98982	0 %	0 %	80 %	20 %	344995406
100	NC_015949	AGGAG	2	10	101321	101330	40 %	0 %	60 %	0 %	344995408
101	NC_015949	GCTTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	344995408
102	NC_015949	ATATC	2	10	102118	102127	40 %	40 %	0 %	20 %	344995410
103	NC_015949	GAGAT	2	10	103464	103473	40 %	20 %	40 %	0 %	344995413
104	NC_015949	CACAG	2	10	104623	104632	40 %	0 %	20 %	40 %	344995414
105	NC_015949	CTTTT	2	10	107168	107177	0 %	80 %	0 %	20 %	344995417
106	NC_015949	TATTT	2	10	110411	110420	20 %	80 %	0 %	0 %	344995419
107	NC_015949	TATAC	2	10	110994	111003	40 %	40 %	0 %	20 %	344995419
108	NC_015949	AAAGA	2	10	112304	112313	80 %	0 %	20 %	0 %	344995419
109	NC_015949	TGCAA	2	10	113112	113121	40 %	20 %	20 %	20 %	344995420
110	NC_015949	CTTTC	2	10	113201	113210	0 %	60 %	0 %	40 %	344995420
111	NC_015949	AAAAT	2	10	115138	115147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015949	ACCTC	2	10	115378	115387	20 %	20 %	0 %	60 %	344995421
113	NC_015949	CCCAG	2	10	116248	116257	20 %	0 %	20 %	60 %	344995422
114	NC_015949	TCTTT	2	10	116529	116538	0 %	80 %	0 %	20 %	344995422
115	NC_015949	GTTTC	2	10	116612	116621	0 %	60 %	20 %	20 %	344995422
116	NC_015949	AAAAG	2	10	117098	117107	80 %	0 %	20 %	0 %	344995422
117	NC_015949	CATTG	2	10	117269	117278	20 %	40 %	20 %	20 %	344995422
118	NC_015949	AATCA	2	10	117521	117530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015949	AGGGC	2	10	121061	121070	20 %	0 %	60 %	20 %	344995425
120	NC_015949	ACACA	2	10	121729	121738	60 %	0 %	0 %	40 %	344995425
121	NC_015949	TAAAA	2	10	122681	122690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015949	CAAGC	2	10	124196	124205	40 %	0 %	20 %	40 %	344995426
123	NC_015949	ATCCA	2	10	124320	124329	40 %	20 %	0 %	40 %	344995426
124	NC_015949	AGGTT	2	10	124479	124488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015949	ATAAA	2	10	124632	124641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015949	ATTTT	2	10	124694	124703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015949	ATCTT	2	10	125645	125654	20 %	60 %	0 %	20 %	344995427
128	NC_015949	TAGTA	2	10	127140	127149	40 %	40 %	20 %	0 %	344995428
129	NC_015949	ACAGA	2	10	128592	128601	60 %	0 %	20 %	20 %	344995429
130	NC_015949	AAAAG	2	10	128861	128870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015949	AATAG	2	10	129923	129932	60 %	20 %	20 %	0 %	344995430
132	NC_015949	TTATA	2	10	130699	130708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015949	AAGAC	2	10	131349	131358	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015949	TAAGA	2	10	132013	132022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015949	GAAAA	2	10	133720	133729	80 %	0 %	20 %	0 %	344995431
136	NC_015949	TATTG	2	10	137316	137325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015949	AATTT	2	10	138230	138239	40 %	60 %	0 %	0 %	344995436
138	NC_015949	CTTAA	2	10	138450	138459	40 %	40 %	0 %	20 %	344995436
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