MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	TCTTT	2	10	9070	9079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015949	CTTAA	2	10	9134	9143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015949	AAGGA	2	10	9912	9921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015949	TTTAA	2	10	12822	12831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015949	GAGGT	2	10	30427	30436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015949	TTTCC	2	10	48680	48689	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015949	AAAAT	2	10	59064	59073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015949	CAAAG	2	10	61208	61217	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015949	CTTTG	2	10	75838	75847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015949	CCTTT	2	10	83238	83247	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015949	AAAAT	2	10	115138	115147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015949	AATCA	2	10	117521	117530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015949	TAAAA	2	10	122681	122690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015949	AGGTT	2	10	124479	124488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015949	ATAAA	2	10	124632	124641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015949	ATTTT	2	10	124694	124703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015949	AAAAG	2	10	128861	128870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015949	TTATA	2	10	130699	130708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015949	AAGAC	2	10	131349	131358	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015949	TAAGA	2	10	132013	132022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015949	TATTG	2	10	137316	137325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015949	ATATA	2	10	140444	140453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015949	AATGC	2	10	147595	147604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015949	GAAAA	2	10	149092	149101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015949	TTTAA	2	10	155088	155097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015949	AAAAT	2	10	156159	156168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015949	TAACC	2	10	156350	156359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015949	TAAGT	2	10	159019	159028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015949	TAAAA	2	10	160147	160156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015949	TATGC	2	10	166132	166141	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015949	ATTTT	2	10	171325	171334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015949	ATTGC	2	10	190035	190044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015949	ATCAA	2	10	194920	194929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015949	CAGAC	2	10	195117	195126	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015949	AAAGA	2	10	198192	198201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015949	TAGAA	2	10	211419	211428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015949	TTTCA	2	10	212008	212017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015949	ATTTT	2	10	213282	213291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015949	AAAAT	2	10	217333	217342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015949	CTTTT	2	10	218003	218012	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015949	TGCCT	2	10	218133	218142	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015949	AGATG	2	10	218487	218496	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015949	TTGGG	2	10	219182	219191	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015949	ATTTC	2	10	219267	219276	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015949	TGTAG	2	10	219284	219293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015949	GTAGG	2	10	219907	219916	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015949	TAAAG	2	10	220997	221006	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015949	AAGTT	2	10	230592	230601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015949	TTTTG	2	10	231009	231018	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015949	AAAAT	2	10	232983	232992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015949	AAATT	2	10	241672	241681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015949	ATTTT	2	10	246407	246416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015949	TTAAG	2	10	248914	248923	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015949	CGAAA	2	10	260033	260042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015949	AATAT	2	10	281075	281084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015949	TCTTT	2	10	284183	284192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015949	TTAAA	2	10	285415	285424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015949	TTTTG	2	10	285444	285453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015949	TTAAC	2	10	285586	285595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015949	AAATT	2	10	285740	285749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015949	ACAAA	2	10	286075	286084	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015949	AAAGC	2	10	286314	286323	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015949	TGTAT	2	10	286475	286484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015949	TAAAT	2	10	290300	290309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015949	ATTTT	2	10	290866	290875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015949	TTTAT	2	10	302530	302539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015949	TACCT	2	10	307244	307253	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015949	GTAAA	2	10	312184	312193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015949	ATTTA	2	10	314051	314060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015949	TTTCC	2	10	323318	323327	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015949	CCCTT	2	10	325172	325181	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_015949	AAAGG	2	10	327761	327770	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015949	TGAGA	2	10	328131	328140	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015949	CAAGA	2	10	328442	328451	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015949	ATATA	2	10	331868	331877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015949	AGAAA	2	10	332241	332250	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015949	AGAAA	2	10	332594	332603	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015949	GTTTG	2	10	333429	333438	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015949	AATAT	2	10	333652	333661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015949	ACTTT	2	10	335884	335893	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015949	CTCAC	2	10	337668	337677	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015949	TAATT	2	10	339553	339562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015949	TTTAT	2	10	339786	339795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015949	ATTTG	2	10	352196	352205	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015949	GATAA	2	10	352689	352698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015949	ATTTT	2	10	353904	353913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015949	GAGAA	2	10	354767	354776	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015949	ATTTT	2	10	356694	356703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015949	TGCAG	2	10	356753	356762	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015949	TAGAA	2	10	366985	366994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015949	ATACA	2	10	367833	367842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015949	ATAAA	2	10	368008	368017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015949	ATTTT	2	10	368047	368056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015949	TTCTA	2	10	370672	370681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015949	TAATT	2	10	372808	372817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015949	TTGAT	2	10	373584	373593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015949	CCCCG	2	10	389384	389393	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
98	NC_015949	AGAAA	2	10	415658	415667	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015949	TAAAA	2	10	415696	415705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015949	TTATA	2	10	422320	422329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015949	CAAAC	2	10	432405	432414	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015949	AAAAT	2	10	441667	441676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015949	CAAAG	2	10	443906	443915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015949	ACAAA	2	10	454724	454733	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015949	CAAAT	2	10	460855	460864	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015949	AAAAT	2	10	462069	462078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015949	ATTTT	2	10	467927	467936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015949	AATAG	2	10	469606	469615	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015949	TATAA	2	10	478675	478684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015949	CAGGG	2	10	482999	483008	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015949	ATTAA	2	10	484734	484743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015949	TAGAA	2	10	493090	493099	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015949	TAACC	2	10	498903	498912	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015949	TGGAT	2	10	499063	499072	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015949	GCTTG	2	10	499187	499196	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015949	ATATT	2	10	500373	500382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015949	ATTTT	2	10	502272	502281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015949	TGAGA	2	10	507674	507683	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015949	AGAGG	2	10	520687	520696	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015949	GAAAA	2	10	521444	521453	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015949	TAAAA	2	10	527977	527986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015949	ATATA	2	10	539634	539643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015949	TAAAA	2	10	543725	543734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015949	TTTTA	2	10	551356	551365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015949	AATAC	2	10	560806	560815	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015949	TTTTA	2	10	581835	581844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015949	TAAAA	2	10	583718	583727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015949	AAATT	2	10	588961	588970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015949	AAATT	2	10	591346	591355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015949	TCGCC	2	10	591755	591764	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_015949	TTTTG	2	10	600747	600756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015949	TAATT	2	10	608893	608902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015949	ATATC	2	10	620405	620414	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015949	AGACA	2	10	622542	622551	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015949	TAAAA	2	10	622649	622658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015949	AGAAA	2	10	629857	629866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015949	GAGGG	2	10	716506	716515	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015949	AAAAT	2	10	717258	717267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015949	TATCA	2	10	728404	728413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015949	TATAA	2	10	728528	728537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015949	CAAAA	2	10	735931	735940	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015949	TTTAA	2	10	748226	748235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015949	ATTTT	2	10	762343	762352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015949	AAAAT	2	10	807346	807355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015949	AAGGG	2	10	823697	823706	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015949	ATTAT	2	10	836799	836808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015949	TATTG	2	10	842679	842688	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015949	TATCA	2	10	842736	842745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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150	NC_015949	ACTTT	2	10	872716	872725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_015949	TATTT	2	10	924816	924825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015949	AATTA	2	10	936759	936768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_015949	TTTTA	2	10	947930	947939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015949	CTTTT	2	10	964129	964138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_015949	TAAAA	2	10	964214	964223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015949	TAAAA	2	10	979896	979905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_015949	ATTTT	2	10	983632	983641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015949	ATTTT	2	10	1065218	1065227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_015949	CTTTT	2	10	2323635	2323644	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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