MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 1886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	GGAAA	2	10	724	733	60 %	0 %	40 %	0 %	344995334
2	NC_015949	AGGCG	2	10	1284	1293	20 %	0 %	60 %	20 %	344995334
3	NC_015949	AAGCT	2	10	1844	1853	40 %	20 %	20 %	20 %	344995335
4	NC_015949	ATAAA	2	10	2838	2847	80 %	20 %	0 %	0 %	344995336
5	NC_015949	CTTCT	2	10	2880	2889	0 %	60 %	0 %	40 %	344995336
6	NC_015949	TTTAG	2	10	3386	3395	20 %	60 %	20 %	0 %	344995336
7	NC_015949	CTTCT	2	10	3630	3639	0 %	60 %	0 %	40 %	344995336
8	NC_015949	GGATA	2	10	4184	4193	40 %	20 %	40 %	0 %	344995338
9	NC_015949	GCGAT	2	10	7711	7720	20 %	20 %	40 %	20 %	344995340
10	NC_015949	AAAAG	2	10	7757	7766	80 %	0 %	20 %	0 %	344995340
11	NC_015949	TGTGT	2	10	8337	8346	0 %	60 %	40 %	0 %	344995340
12	NC_015949	AGACA	2	10	8561	8570	60 %	0 %	20 %	20 %	344995340
13	NC_015949	AAGAA	2	10	11051	11060	80 %	0 %	20 %	0 %	344995341
14	NC_015949	CTAAT	2	10	12368	12377	40 %	40 %	0 %	20 %	344995342
15	NC_015949	CAAAG	2	10	14186	14195	60 %	0 %	20 %	20 %	344995343
16	NC_015949	AAACC	2	10	14221	14230	60 %	0 %	0 %	40 %	344995343
17	NC_015949	TTCAA	2	10	15790	15799	40 %	40 %	0 %	20 %	344995343
18	NC_015949	AGACA	2	10	16311	16320	60 %	0 %	20 %	20 %	344995343
19	NC_015949	TTTTA	2	10	17590	17599	20 %	80 %	0 %	0 %	344995345
20	NC_015949	ATTAT	2	10	18700	18709	40 %	60 %	0 %	0 %	344995345
21	NC_015949	AACCT	2	10	19059	19068	40 %	20 %	0 %	40 %	344995345
22	NC_015949	TGTGG	2	10	19270	19279	0 %	40 %	60 %	0 %	344995345
23	NC_015949	GTACA	2	10	20024	20033	40 %	20 %	20 %	20 %	344995345
24	NC_015949	AAGGT	2	10	20756	20765	40 %	20 %	40 %	0 %	344995345
25	NC_015949	AAGGT	2	10	21203	21212	40 %	20 %	40 %	0 %	344995345
26	NC_015949	GAACC	2	10	22832	22841	40 %	0 %	20 %	40 %	344995345
27	NC_015949	AGAGA	2	10	23272	23281	60 %	0 %	40 %	0 %	344995345
28	NC_015949	GAAAA	2	10	24497	24506	80 %	0 %	20 %	0 %	344995347
29	NC_015949	AAATT	2	10	24888	24897	60 %	40 %	0 %	0 %	344995347
30	NC_015949	GTACA	2	10	26594	26603	40 %	20 %	20 %	20 %	344995347
31	NC_015949	AAGGT	2	10	27326	27335	40 %	20 %	40 %	0 %	344995347
32	NC_015949	AAGGT	2	10	27773	27782	40 %	20 %	40 %	0 %	344995347
33	NC_015949	AAATC	2	10	30887	30896	60 %	20 %	0 %	20 %	344995348
34	NC_015949	CATTA	2	10	32509	32518	40 %	40 %	0 %	20 %	344995349
35	NC_015949	TCAAT	2	10	32556	32565	40 %	40 %	0 %	20 %	344995349
36	NC_015949	CTTTT	2	10	36175	36184	0 %	80 %	0 %	20 %	344995351
37	NC_015949	GTTTT	2	10	36643	36652	0 %	80 %	20 %	0 %	344995352
38	NC_015949	GAAAA	2	10	37344	37353	80 %	0 %	20 %	0 %	344995353
39	NC_015949	AAGAC	2	10	38202	38211	60 %	0 %	20 %	20 %	344995354
40	NC_015949	CAAAG	2	10	39779	39788	60 %	0 %	20 %	20 %	344995355
41	NC_015949	CAGAA	2	10	39870	39879	60 %	0 %	20 %	20 %	344995355
42	NC_015949	AACAA	2	10	40843	40852	80 %	0 %	0 %	20 %	344995356
43	NC_015949	TTTTA	2	10	41182	41191	20 %	80 %	0 %	0 %	344995357
44	NC_015949	AGTAC	2	10	42381	42390	40 %	20 %	20 %	20 %	344995357
45	NC_015949	CATTT	2	10	42976	42985	20 %	60 %	0 %	20 %	344995358
46	NC_015949	CCTTT	2	10	44667	44676	0 %	60 %	0 %	40 %	344995360
47	NC_015949	CTTTT	2	10	44964	44973	0 %	80 %	0 %	20 %	344995360
48	NC_015949	TCTTT	2	10	45365	45374	0 %	80 %	0 %	20 %	344995361
49	NC_015949	GGTCT	2	10	47848	47857	0 %	40 %	40 %	20 %	344995364
50	NC_015949	GCTTT	2	10	48362	48371	0 %	60 %	20 %	20 %	344995365
51	NC_015949	AGTAA	2	10	49407	49416	60 %	20 %	20 %	0 %	344995366
52	NC_015949	GACCT	2	10	53405	53414	20 %	20 %	20 %	40 %	344995370
53	NC_015949	AAGAA	2	10	53981	53990	80 %	0 %	20 %	0 %	344995371
54	NC_015949	AAGAA	2	10	54149	54158	80 %	0 %	20 %	0 %	344995371
55	NC_015949	ACAGC	2	10	54213	54222	40 %	0 %	20 %	40 %	344995371
56	NC_015949	AAAAG	2	10	55325	55334	80 %	0 %	20 %	0 %	344995372
57	NC_015949	AAGGA	2	10	56497	56506	60 %	0 %	40 %	0 %	344995373
58	NC_015949	GGCGG	2	10	57271	57280	0 %	0 %	80 %	20 %	344995375
59	NC_015949	AAAAG	2	10	57412	57421	80 %	0 %	20 %	0 %	344995375
60	NC_015949	TGATA	2	10	59085	59094	40 %	40 %	20 %	0 %	344995377
61	NC_015949	GTGTT	2	10	60170	60179	0 %	60 %	40 %	0 %	344995378
62	NC_015949	ATGTG	2	10	62080	62089	20 %	40 %	40 %	0 %	344995379
63	NC_015949	GAAAA	2	10	62131	62140	80 %	0 %	20 %	0 %	344995379
64	NC_015949	ACAAT	2	10	62533	62542	60 %	20 %	0 %	20 %	344995379
65	NC_015949	GCTTT	2	10	63438	63447	0 %	60 %	20 %	20 %	344995380
66	NC_015949	ATCAA	2	10	63601	63610	60 %	20 %	0 %	20 %	344995380
67	NC_015949	CATGT	2	10	64836	64845	20 %	40 %	20 %	20 %	344995380
68	NC_015949	CATCA	2	10	66198	66207	40 %	20 %	0 %	40 %	344995381
69	NC_015949	ATACA	2	10	68393	68402	60 %	20 %	0 %	20 %	344995382
70	NC_015949	CATAT	2	10	68510	68519	40 %	40 %	0 %	20 %	344995382
71	NC_015949	ATGTT	2	10	69672	69681	20 %	60 %	20 %	0 %	344995383
72	NC_015949	TTATC	2	10	70433	70442	20 %	60 %	0 %	20 %	344995384
73	NC_015949	AGATA	2	10	72010	72019	60 %	20 %	20 %	0 %	344995386
74	NC_015949	AAGCC	2	10	72976	72985	40 %	0 %	20 %	40 %	344995387
75	NC_015949	AAGGG	2	10	76208	76217	40 %	0 %	60 %	0 %	344995388
76	NC_015949	TCATT	2	10	78513	78522	20 %	60 %	0 %	20 %	344995389
77	NC_015949	CAAGA	2	10	80951	80960	60 %	0 %	20 %	20 %	344995392
78	NC_015949	AAGAA	2	10	85371	85380	80 %	0 %	20 %	0 %	344995394
79	NC_015949	TTCCA	2	10	85864	85873	20 %	40 %	0 %	40 %	344995395
80	NC_015949	AATAT	2	10	87494	87503	60 %	40 %	0 %	0 %	344995398
81	NC_015949	TATTT	2	10	87581	87590	20 %	80 %	0 %	0 %	344995398
82	NC_015949	AAAGA	2	10	88547	88556	80 %	0 %	20 %	0 %	344995399
83	NC_015949	ATTTT	2	10	90910	90919	20 %	80 %	0 %	0 %	344995401
84	NC_015949	TCATT	2	10	91421	91430	20 %	60 %	0 %	20 %	344995402
85	NC_015949	ATATG	2	10	92711	92720	40 %	40 %	20 %	0 %	344995403
86	NC_015949	ACATA	2	10	93085	93094	60 %	20 %	0 %	20 %	344995403
87	NC_015949	CAGAG	2	10	96518	96527	40 %	0 %	40 %	20 %	344995404
88	NC_015949	CGAGT	2	10	97745	97754	20 %	20 %	40 %	20 %	344995405
89	NC_015949	GGCGG	2	10	98973	98982	0 %	0 %	80 %	20 %	344995406
90	NC_015949	AGGAG	2	10	101321	101330	40 %	0 %	60 %	0 %	344995408
91	NC_015949	GCTTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	344995408
92	NC_015949	ATATC	2	10	102118	102127	40 %	40 %	0 %	20 %	344995410
93	NC_015949	GAGAT	2	10	103464	103473	40 %	20 %	40 %	0 %	344995413
94	NC_015949	CACAG	2	10	104623	104632	40 %	0 %	20 %	40 %	344995414
95	NC_015949	CTTTT	2	10	107168	107177	0 %	80 %	0 %	20 %	344995417
96	NC_015949	TATTT	2	10	110411	110420	20 %	80 %	0 %	0 %	344995419
97	NC_015949	TATAC	2	10	110994	111003	40 %	40 %	0 %	20 %	344995419
98	NC_015949	AAAGA	2	10	112304	112313	80 %	0 %	20 %	0 %	344995419
99	NC_015949	TGCAA	2	10	113112	113121	40 %	20 %	20 %	20 %	344995420
100	NC_015949	CTTTC	2	10	113201	113210	0 %	60 %	0 %	40 %	344995420
101	NC_015949	ACCTC	2	10	115378	115387	20 %	20 %	0 %	60 %	344995421
102	NC_015949	CCCAG	2	10	116248	116257	20 %	0 %	20 %	60 %	344995422
103	NC_015949	TCTTT	2	10	116529	116538	0 %	80 %	0 %	20 %	344995422
104	NC_015949	GTTTC	2	10	116612	116621	0 %	60 %	20 %	20 %	344995422
105	NC_015949	AAAAG	2	10	117098	117107	80 %	0 %	20 %	0 %	344995422
106	NC_015949	CATTG	2	10	117269	117278	20 %	40 %	20 %	20 %	344995422
107	NC_015949	AGGGC	2	10	121061	121070	20 %	0 %	60 %	20 %	344995425
108	NC_015949	ACACA	2	10	121729	121738	60 %	0 %	0 %	40 %	344995425
109	NC_015949	CAAGC	2	10	124196	124205	40 %	0 %	20 %	40 %	344995426
110	NC_015949	ATCCA	2	10	124320	124329	40 %	20 %	0 %	40 %	344995426
111	NC_015949	ATCTT	2	10	125645	125654	20 %	60 %	0 %	20 %	344995427
112	NC_015949	TAGTA	2	10	127140	127149	40 %	40 %	20 %	0 %	344995428
113	NC_015949	ACAGA	2	10	128592	128601	60 %	0 %	20 %	20 %	344995429
114	NC_015949	AATAG	2	10	129923	129932	60 %	20 %	20 %	0 %	344995430
115	NC_015949	GAAAA	2	10	133720	133729	80 %	0 %	20 %	0 %	344995431
116	NC_015949	AATTT	2	10	138230	138239	40 %	60 %	0 %	0 %	344995436
117	NC_015949	CTTAA	2	10	138450	138459	40 %	40 %	0 %	20 %	344995436
118	NC_015949	AGAAA	2	10	139497	139506	80 %	0 %	20 %	0 %	344995437
119	NC_015949	TGCGA	2	10	141226	141235	20 %	20 %	40 %	20 %	344995438
120	NC_015949	GAGAA	2	10	144799	144808	60 %	0 %	40 %	0 %	344995440
121	NC_015949	TGCAG	2	10	145468	145477	20 %	20 %	40 %	20 %	344995440
122	NC_015949	CAATC	2	10	146270	146279	40 %	20 %	0 %	40 %	344995441
123	NC_015949	AGACG	2	10	149284	149293	40 %	0 %	40 %	20 %	344995443
124	NC_015949	TCTGA	2	10	149417	149426	20 %	40 %	20 %	20 %	344995443
125	NC_015949	GCACC	2	10	150352	150361	20 %	0 %	20 %	60 %	344995445
126	NC_015949	AAAGC	2	10	151347	151356	60 %	0 %	20 %	20 %	344995446
127	NC_015949	TAAGT	2	10	153040	153049	40 %	40 %	20 %	0 %	344995447
128	NC_015949	ATCTT	2	10	154198	154207	20 %	60 %	0 %	20 %	344995447
129	NC_015949	AGTGC	2	10	154229	154238	20 %	20 %	40 %	20 %	344995447
130	NC_015949	AGTTA	2	10	154780	154789	40 %	40 %	20 %	0 %	344995447
131	NC_015949	TGGAT	2	10	156510	156519	20 %	40 %	40 %	0 %	344995449
132	NC_015949	GCTTG	2	10	156634	156643	0 %	40 %	40 %	20 %	344995449
133	NC_015949	GATAA	2	10	164565	164574	60 %	20 %	20 %	0 %	344995453
134	NC_015949	TTCAA	2	10	165456	165465	40 %	40 %	0 %	20 %	344995453
135	NC_015949	AGACA	2	10	165977	165986	60 %	0 %	20 %	20 %	344995453
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