MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 29622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	ATG	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995334
2	NC_015949	AGG	2	6	95	100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995334
3	NC_015949	AAC	2	6	378	383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995334
4	NC_015949	TGT	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995334
5	NC_015949	AAC	3	9	427	435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995334
6	NC_015949	ACC	2	6	474	479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995334
7	NC_015949	CGG	2	6	513	518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344995334
8	NC_015949	CAT	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995334
9	NC_015949	GAC	2	6	703	708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995334
10	NC_015949	AAG	2	6	740	745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995334
11	NC_015949	AAG	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995334
12	NC_015949	ATA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995334
13	NC_015949	TCA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995334
14	NC_015949	CCA	2	6	811	816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995334
15	NC_015949	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995334
16	NC_015949	CAA	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995334
17	NC_015949	AAG	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995334
18	NC_015949	AAT	3	9	1415	1423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995334
19	NC_015949	TGT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995335
20	NC_015949	CTG	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995335
21	NC_015949	CAA	2	6	1706	1711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995335
22	NC_015949	ACA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995335
23	NC_015949	AGA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995335
24	NC_015949	AAG	2	6	1926	1931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995335
25	NC_015949	AGA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995335
26	NC_015949	TTG	2	6	2018	2023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995335
27	NC_015949	TTG	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995335
28	NC_015949	AGA	3	9	2115	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995335
29	NC_015949	CAA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995335
30	NC_015949	GAT	2	6	2505	2510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995335
31	NC_015949	GAC	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995335
32	NC_015949	TTC	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995335
33	NC_015949	CTA	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995336
34	NC_015949	AAT	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995336
35	NC_015949	CTT	2	6	3239	3244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995336
36	NC_015949	ATA	2	6	3284	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995336
37	NC_015949	AGG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995336
38	NC_015949	AGA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995336
39	NC_015949	ACA	2	6	3515	3520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995336
40	NC_015949	GAC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995336
41	NC_015949	AGA	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995336
42	NC_015949	CTT	2	6	3907	3912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995337
43	NC_015949	GTT	3	9	3991	3999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995337
44	NC_015949	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995337
45	NC_015949	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995337
46	NC_015949	ATA	2	6	4060	4065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995337
47	NC_015949	CAC	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995338
48	NC_015949	TTC	2	6	4486	4491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995338
49	NC_015949	GGT	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995338
50	NC_015949	TGT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995338
51	NC_015949	TGA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995338
52	NC_015949	ATG	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995338
53	NC_015949	ACA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995338
54	NC_015949	CAA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995338
55	NC_015949	GGT	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995338
56	NC_015949	CTG	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995338
57	NC_015949	CTT	2	6	5124	5129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995338
58	NC_015949	AGA	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995338
59	NC_015949	GGC	2	6	5327	5332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344995338
60	NC_015949	AAG	2	6	5652	5657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995338
61	NC_015949	CTT	3	9	5721	5729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995338
62	NC_015949	CCA	2	6	5790	5795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995338
63	NC_015949	ACC	2	6	5937	5942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995338
64	NC_015949	AAG	2	6	5954	5959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995338
65	NC_015949	TTC	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995338
66	NC_015949	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995338
67	NC_015949	AAG	2	6	6041	6046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995338
68	NC_015949	AGA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995338
69	NC_015949	GAA	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995339
70	NC_015949	ATT	2	6	6230	6235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995339
71	NC_015949	GAA	2	6	6250	6255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995339
72	NC_015949	AGA	2	6	6471	6476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
73	NC_015949	ACC	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995340
74	NC_015949	TGC	2	6	6581	6586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995340
75	NC_015949	TTG	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995340
76	NC_015949	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995340
77	NC_015949	CAA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995340
78	NC_015949	TGA	2	6	6950	6955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995340
79	NC_015949	ATC	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995340
80	NC_015949	GAC	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995340
81	NC_015949	AAT	2	6	7106	7111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995340
82	NC_015949	CAA	2	6	7136	7141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995340
83	NC_015949	AAG	2	6	7225	7230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
84	NC_015949	TTG	2	6	7342	7347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995340
85	NC_015949	AGA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
86	NC_015949	AGA	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
87	NC_015949	TCA	2	6	7527	7532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995340
88	NC_015949	GAA	2	6	7653	7658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
89	NC_015949	AAG	2	6	7778	7783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
90	NC_015949	GAA	2	6	7821	7826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
91	NC_015949	GTG	2	6	7918	7923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995340
92	NC_015949	GAA	2	6	7953	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
93	NC_015949	TTG	2	6	7963	7968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995340
94	NC_015949	CAA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995340
95	NC_015949	CAC	2	6	7992	7997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995340
96	NC_015949	AAG	2	6	8155	8160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
97	NC_015949	ATG	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995340
98	NC_015949	AAG	2	6	8196	8201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
99	NC_015949	GAT	3	9	8262	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995340
100	NC_015949	TTG	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995340
101	NC_015949	TTG	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995340
102	NC_015949	TCT	2	6	8459	8464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995340
103	NC_015949	AAG	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995340
104	NC_015949	TTG	2	6	8578	8583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995340
105	NC_015949	GAT	3	9	8601	8609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995340
106	NC_015949	GAG	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995340
107	NC_015949	TAA	2	6	10646	10651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995341
108	NC_015949	ATG	2	6	10789	10794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995341
109	NC_015949	AGC	2	6	10845	10850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995341
110	NC_015949	CAG	2	6	10993	10998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995341
111	NC_015949	TTA	2	6	11008	11013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995341
112	NC_015949	TAA	2	6	11093	11098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995341
113	NC_015949	AGA	2	6	11120	11125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995341
114	NC_015949	TGA	2	6	11138	11143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995341
115	NC_015949	AAG	2	6	11242	11247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995341
116	NC_015949	AGT	2	6	11255	11260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995341
117	NC_015949	TTA	2	6	11318	11323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995342
118	NC_015949	GGT	2	6	11400	11405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995342
119	NC_015949	AGT	2	6	11458	11463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995342
120	NC_015949	ATT	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995342
121	NC_015949	TTA	2	6	11551	11556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995342
122	NC_015949	TGA	2	6	11564	11569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995342
123	NC_015949	AAC	2	6	11638	11643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995342
124	NC_015949	ATT	2	6	11678	11683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995342
125	NC_015949	TTG	2	6	11705	11710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995342
126	NC_015949	AGT	2	6	11760	11765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995342
127	NC_015949	TGA	2	6	11769	11774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995342
128	NC_015949	GCA	2	6	11802	11807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995342
129	NC_015949	AAG	2	6	11818	11823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995342
130	NC_015949	GTA	2	6	11860	11865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995342
131	NC_015949	CAA	2	6	11974	11979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995342
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256	NC_015949	GCA	2	6	21642	21647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
257	NC_015949	GAC	2	6	21790	21795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
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