MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 8612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015948	TGAC	2	8	2	9	25 %	25 %	25 %	25 %	344210306
2	NC_015948	ACGC	2	8	1094	1101	25 %	0 %	25 %	50 %	344210306
3	NC_015948	CGGC	2	8	1124	1131	0 %	0 %	50 %	50 %	344210306
4	NC_015948	TCGT	2	8	1685	1692	0 %	50 %	25 %	25 %	344210307
5	NC_015948	CCTT	2	8	2162	2169	0 %	50 %	0 %	50 %	344210307
6	NC_015948	GGGT	2	8	3537	3544	0 %	25 %	75 %	0 %	344210309
7	NC_015948	TATC	2	8	4173	4180	25 %	50 %	0 %	25 %	344210309
8	NC_015948	CAAC	2	8	6431	6438	50 %	0 %	0 %	50 %	344210310
9	NC_015948	AACG	2	8	6612	6619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015948	CGAC	2	8	6780	6787	25 %	0 %	25 %	50 %	344210311
11	NC_015948	TAGT	2	8	7791	7798	25 %	50 %	25 %	0 %	344210312
12	NC_015948	AAAC	2	8	8059	8066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015948	CGCT	2	8	8993	9000	0 %	25 %	25 %	50 %	344210313
14	NC_015948	CGAC	2	8	11189	11196	25 %	0 %	25 %	50 %	344210314
15	NC_015948	CGAC	2	8	11272	11279	25 %	0 %	25 %	50 %	344210314
16	NC_015948	CGTC	2	8	11551	11558	0 %	25 %	25 %	50 %	344210315
17	NC_015948	TGCC	2	8	11713	11720	0 %	25 %	25 %	50 %	344210315
18	NC_015948	GTTG	2	8	11995	12002	0 %	50 %	50 %	0 %	344210315
19	NC_015948	CATC	2	8	12309	12316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015948	GACG	2	8	12391	12398	25 %	0 %	50 %	25 %	344210316
21	NC_015948	CGCC	2	8	12556	12563	0 %	0 %	25 %	75 %	344210316
22	NC_015948	ACTG	2	8	12706	12713	25 %	25 %	25 %	25 %	344210316
23	NC_015948	CGTC	2	8	12814	12821	0 %	25 %	25 %	50 %	344210316
24	NC_015948	CGAC	2	8	14504	14511	25 %	0 %	25 %	50 %	344210319
25	NC_015948	CCGG	2	8	15101	15108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015948	CAGT	2	8	15629	15636	25 %	25 %	25 %	25 %	344210321
27	NC_015948	GTCG	2	8	15872	15879	0 %	25 %	50 %	25 %	344210321
28	NC_015948	TCAC	2	8	16009	16016	25 %	25 %	0 %	50 %	344210321
29	NC_015948	GTCG	2	8	16360	16367	0 %	25 %	50 %	25 %	344210322
30	NC_015948	TCCG	2	8	16545	16552	0 %	25 %	25 %	50 %	344210323
31	NC_015948	GATA	2	8	17309	17316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015948	GACA	2	8	18549	18556	50 %	0 %	25 %	25 %	344210325
33	NC_015948	CGGG	2	8	18683	18690	0 %	0 %	75 %	25 %	344210325
34	NC_015948	TTCT	2	8	19156	19163	0 %	75 %	0 %	25 %	344210325
35	NC_015948	TGGG	2	8	19739	19746	0 %	25 %	75 %	0 %	344210325
36	NC_015948	CGGC	2	8	19858	19865	0 %	0 %	50 %	50 %	344210325
37	NC_015948	TGAC	2	8	20038	20045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015948	GTCG	2	8	20285	20292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015948	ACTC	2	8	20370	20377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015948	GGGC	2	8	20483	20490	0 %	0 %	75 %	25 %	344210326
41	NC_015948	CGTC	2	8	20768	20775	0 %	25 %	25 %	50 %	344210326
42	NC_015948	GACC	2	8	21749	21756	25 %	0 %	25 %	50 %	344210327
43	NC_015948	TGCG	2	8	22128	22135	0 %	25 %	50 %	25 %	344210328
44	NC_015948	TGAC	2	8	22390	22397	25 %	25 %	25 %	25 %	344210328
45	NC_015948	CGAA	2	8	22624	22631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015948	GTCG	2	8	23389	23396	0 %	25 %	50 %	25 %	344210329
47	NC_015948	CGGC	2	8	23530	23537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015948	CCGA	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	344210330
49	NC_015948	CGGT	2	8	23730	23737	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
50	NC_015948	CGGT	2	8	23835	23842	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
51	NC_015948	CGAA	2	8	23928	23935	50 %	0 %	25 %	25 %	344210330
52	NC_015948	GTCG	2	8	24050	24057	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
53	NC_015948	GGCG	2	8	24067	24074	0 %	0 %	75 %	25 %	344210330
54	NC_015948	ACGG	2	8	24338	24345	25 %	0 %	50 %	25 %	344210330
55	NC_015948	CCCG	2	8	24395	24402	0 %	0 %	25 %	75 %	344210330
56	NC_015948	GTTC	2	8	24409	24416	0 %	50 %	25 %	25 %	344210330
57	NC_015948	CGAA	2	8	25295	25302	50 %	0 %	25 %	25 %	344210331
58	NC_015948	AGCC	2	8	25389	25396	25 %	0 %	25 %	50 %	344210331
59	NC_015948	GTCG	2	8	25458	25465	0 %	25 %	50 %	25 %	344210331
60	NC_015948	CGCT	2	8	25515	25522	0 %	25 %	25 %	50 %	344210331
61	NC_015948	GACG	2	8	25640	25647	25 %	0 %	50 %	25 %	344210331
62	NC_015948	CGGC	2	8	25664	25671	0 %	0 %	50 %	50 %	344210331
63	NC_015948	AATC	2	8	25935	25942	50 %	25 %	0 %	25 %	344210332
64	NC_015948	TCGC	2	8	26721	26728	0 %	25 %	25 %	50 %	344210333
65	NC_015948	TTGT	2	8	26786	26793	0 %	75 %	25 %	0 %	344210333
66	NC_015948	GCCG	2	8	27150	27157	0 %	0 %	50 %	50 %	344210333
67	NC_015948	GGCC	2	8	27830	27837	0 %	0 %	50 %	50 %	344210334
68	NC_015948	GTCG	2	8	27929	27936	0 %	25 %	50 %	25 %	344210334
69	NC_015948	CTCA	2	8	28022	28029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015948	ACCC	2	8	29082	29089	25 %	0 %	0 %	75 %	344210336
71	NC_015948	GTCG	2	8	29625	29632	0 %	25 %	50 %	25 %	344210336
72	NC_015948	GTCG	2	8	29842	29849	0 %	25 %	50 %	25 %	344210337
73	NC_015948	ACCG	2	8	30038	30045	25 %	0 %	25 %	50 %	344210337
74	NC_015948	TGTC	2	8	30148	30155	0 %	50 %	25 %	25 %	344210337
75	NC_015948	CGGC	2	8	30179	30186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015948	TCAT	2	8	30649	30656	25 %	50 %	0 %	25 %	344210338
77	NC_015948	CGGT	2	8	32166	32173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015948	GCGG	2	8	32664	32671	0 %	0 %	75 %	25 %	344210341
79	NC_015948	GCGA	2	8	32934	32941	25 %	0 %	50 %	25 %	344210342
80	NC_015948	CCGG	2	8	33535	33542	0 %	0 %	50 %	50 %	344210343
81	NC_015948	CGAC	2	8	33672	33679	25 %	0 %	25 %	50 %	344210343
82	NC_015948	CGGA	2	8	33897	33904	25 %	0 %	50 %	25 %	344210343
83	NC_015948	CGCC	2	8	34003	34010	0 %	0 %	25 %	75 %	344210343
84	NC_015948	ACAG	2	8	34313	34320	50 %	0 %	25 %	25 %	344210343
85	NC_015948	GGGC	2	8	35061	35068	0 %	0 %	75 %	25 %	344210344
86	NC_015948	TTCC	2	8	35131	35138	0 %	50 %	0 %	50 %	344210344
87	NC_015948	CCCG	2	8	35603	35610	0 %	0 %	25 %	75 %	344210345
88	NC_015948	TCGC	2	8	35649	35656	0 %	25 %	25 %	50 %	344210345
89	NC_015948	CGCC	2	8	35676	35683	0 %	0 %	25 %	75 %	344210345
90	NC_015948	CGAG	2	8	36528	36535	25 %	0 %	50 %	25 %	344210345
91	NC_015948	GTAC	2	8	37142	37149	25 %	25 %	25 %	25 %	344210345
92	NC_015948	CGTT	2	8	37520	37527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015948	GCGG	2	8	37660	37667	0 %	0 %	75 %	25 %	344210346
94	NC_015948	GGTG	2	8	37996	38003	0 %	25 %	75 %	0 %	344210346
95	NC_015948	CGCT	2	8	38023	38030	0 %	25 %	25 %	50 %	344210346
96	NC_015948	CCGG	2	8	38365	38372	0 %	0 %	50 %	50 %	344210346
97	NC_015948	CAAC	2	8	38639	38646	50 %	0 %	0 %	50 %	344210346
98	NC_015948	CGGG	2	8	39648	39655	0 %	0 %	75 %	25 %	344210346
99	NC_015948	TGAC	2	8	39826	39833	25 %	25 %	25 %	25 %	344210347
100	NC_015948	GGTG	2	8	39898	39905	0 %	25 %	75 %	0 %	344210347
101	NC_015948	CGCA	2	8	40049	40056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015948	CGAC	2	8	40252	40259	25 %	0 %	25 %	50 %	344210348
103	NC_015948	TTGC	2	8	40266	40273	0 %	50 %	25 %	25 %	344210348
104	NC_015948	GTCG	2	8	40773	40780	0 %	25 %	50 %	25 %	344210348
105	NC_015948	AACG	2	8	40957	40964	50 %	0 %	25 %	25 %	344210348
106	NC_015948	GCTG	2	8	43472	43479	0 %	25 %	50 %	25 %	344210349
107	NC_015948	CCGC	2	8	43535	43542	0 %	0 %	25 %	75 %	344210349
108	NC_015948	GCCG	2	8	43628	43635	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
109	NC_015948	GACC	2	8	43802	43809	25 %	0 %	25 %	50 %	344210349
110	NC_015948	CGAC	2	8	44178	44185	25 %	0 %	25 %	50 %	344210349
111	NC_015948	GTGC	2	8	44433	44440	0 %	25 %	50 %	25 %	344210349
112	NC_015948	GCTG	2	8	44480	44487	0 %	25 %	50 %	25 %	344210349
113	NC_015948	CCGC	2	8	44674	44681	0 %	0 %	25 %	75 %	344210349
114	NC_015948	GAGG	2	8	44795	44802	25 %	0 %	75 %	0 %	344210350
115	NC_015948	GCCC	2	8	45622	45629	0 %	0 %	25 %	75 %	344210350
116	NC_015948	GCTG	2	8	45694	45701	0 %	25 %	50 %	25 %	344210350
117	NC_015948	CTCC	2	8	45723	45730	0 %	25 %	0 %	75 %	344210350
118	NC_015948	CGAC	2	8	46344	46351	25 %	0 %	25 %	50 %	344210351
119	NC_015948	TCAC	2	8	48266	48273	25 %	25 %	0 %	50 %	344210351
120	NC_015948	CGGA	2	8	48902	48909	25 %	0 %	50 %	25 %	344210351
121	NC_015948	CGGA	2	8	49487	49494	25 %	0 %	50 %	25 %	344210351
122	NC_015948	GCAC	2	8	49987	49994	25 %	0 %	25 %	50 %	344210353
123	NC_015948	CGAG	2	8	51154	51161	25 %	0 %	50 %	25 %	344210355
124	NC_015948	ACGC	2	8	51326	51333	25 %	0 %	25 %	50 %	344210355
125	NC_015948	GTGC	2	8	51383	51390	0 %	25 %	50 %	25 %	344210355
126	NC_015948	GAAT	2	8	51538	51545	50 %	25 %	25 %	0 %	344210355
127	NC_015948	AGCG	2	8	51573	51580	25 %	0 %	50 %	25 %	344210355
128	NC_015948	CCGA	2	8	51843	51850	25 %	0 %	25 %	50 %	344210355
129	NC_015948	CCGA	2	8	51869	51876	25 %	0 %	25 %	50 %	344210355
130	NC_015948	GCGG	2	8	52160	52167	0 %	0 %	75 %	25 %	344210356
131	NC_015948	TCGC	2	8	52573	52580	0 %	25 %	25 %	50 %	344210356
132	NC_015948	GCCG	2	8	52719	52726	0 %	0 %	50 %	50 %	344210357
133	NC_015948	CGTC	2	8	53010	53017	0 %	25 %	25 %	50 %	344210357
134	NC_015948	TCGC	2	8	53139	53146	0 %	25 %	25 %	50 %	344210357
135	NC_015948	GGCG	2	8	53186	53193	0 %	0 %	75 %	25 %	344210357
136	NC_015948	GACC	2	8	53406	53413	25 %	0 %	25 %	50 %	344210357
137	NC_015948	GGTA	2	8	53540	53547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015948	GACG	2	8	53698	53705	25 %	0 %	50 %	25 %	344210358
139	NC_015948	AACG	2	8	54433	54440	50 %	0 %	25 %	25 %	344210359
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141	NC_015948	TCCG	2	8	54853	54860	0 %	25 %	25 %	50 %	344210359
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