MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015948	AACG	2	8	6612	6619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015948	AAAC	2	8	8059	8066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015948	CATC	2	8	12309	12316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015948	CCGG	2	8	15101	15108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015948	GATA	2	8	17309	17316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015948	TGAC	2	8	20038	20045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015948	GTCG	2	8	20285	20292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015948	ACTC	2	8	20370	20377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015948	CGAA	2	8	22624	22631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015948	CGGC	2	8	23530	23537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015948	CTCA	2	8	28022	28029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015948	CGGC	2	8	30179	30186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015948	CGGT	2	8	32166	32173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015948	CGTT	2	8	37520	37527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015948	CGCA	2	8	40049	40056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015948	GGTA	2	8	53540	53547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015948	AGTA	2	8	56587	56594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015948	CGAC	2	8	57131	57138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015948	TAAC	2	8	59844	59851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015948	GTCA	2	8	59858	59865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015948	CGTG	2	8	67314	67321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015948	AGCC	2	8	69110	69117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015948	GGCC	2	8	72118	72125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015948	TCGT	2	8	73640	73647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015948	CGGT	2	8	73895	73902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015948	ACTG	2	8	74411	74418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015948	CACG	2	8	77885	77892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015948	ACGA	2	8	81436	81443	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015948	TGAG	2	8	84513	84520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015948	GAAC	2	8	86961	86968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015948	CTCG	2	8	87894	87901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015948	TAAT	2	8	89728	89735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015948	GCCC	2	8	89762	89769	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015948	CGGA	2	8	95465	95472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015948	TCAG	2	8	95772	95779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015948	CGTG	2	8	96719	96726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015948	CTCA	2	8	96825	96832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015948	TCGC	2	8	96891	96898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015948	AACA	2	8	97085	97092	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015948	AGCG	2	8	101370	101377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015948	GCGG	2	8	103081	103088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015948	GACC	2	8	108336	108343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015948	CGAA	2	8	108405	108412	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015948	CGCT	2	8	109071	109078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015948	CCGA	2	8	109328	109335	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015948	ACCG	2	8	109501	109508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015948	TCCC	2	8	111025	111032	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_015948	CCAT	2	8	115620	115627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015948	GTCT	2	8	118889	118896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015948	GCAA	2	8	118983	118990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015948	ACCG	2	8	119053	119060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015948	GGGC	2	8	124709	124716	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015948	CGGC	2	8	126771	126778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015948	CGAA	2	8	136386	136393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015948	CAAT	2	8	138019	138026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015948	AGGC	2	8	141878	141885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015948	TCGC	2	8	150379	150386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015948	ACCC	2	8	151692	151699	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_015948	TGCG	2	8	153670	153677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015948	TGCT	2	8	158099	158106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015948	CCCA	2	8	158143	158150	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_015948	GACA	2	8	160488	160495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015948	ACCG	2	8	163823	163830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015948	ACGT	2	8	168600	168607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015948	TAAA	2	8	168903	168910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015948	AAAT	2	8	172412	172419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015948	ACTG	2	8	174143	174150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015948	CGAA	2	8	180432	180439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015948	TCGC	2	8	180722	180729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015948	GGTC	2	8	197670	197677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015948	ACCG	2	8	197753	197760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015948	CAGC	2	8	198655	198662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015948	TGGG	2	8	203491	203498	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015948	CCGG	2	8	204726	204733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015948	TCAT	2	8	204737	204744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015948	CCCA	2	8	206594	206601	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015948	GCTG	2	8	212007	212014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015948	CCGG	2	8	212534	212541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015948	CGAA	2	8	212746	212753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015948	TCGC	2	8	212809	212816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015948	TCGG	2	8	212892	212899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015948	GCCG	2	8	213685	213692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015948	GGAC	2	8	213811	213818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015948	CGAG	2	8	214205	214212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015948	CCCG	2	8	214430	214437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015948	GAAC	2	8	215489	215496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015948	TGGA	2	8	216328	216335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015948	CAAC	2	8	216749	216756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015948	TAGG	2	8	217177	217184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015948	GTTG	2	8	221415	221422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015948	TTAC	2	8	222920	222927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015948	CAAC	2	8	223056	223063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015948	TCCT	2	8	228890	228897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015948	TCAC	2	8	228904	228911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015948	GGGA	2	8	228947	228954	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015948	CGAG	2	8	232949	232956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015948	GCCG	2	8	233315	233322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015948	GTCC	2	8	233970	233977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015948	TGCT	2	8	238616	238623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015948	ACTC	2	8	238709	238716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015948	CCGG	2	8	238848	238855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015948	CCGG	2	8	238874	238881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015948	TTAT	2	8	239985	239992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015948	CCGG	2	8	248636	248643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015948	GACC	2	8	260993	261000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015948	ACTG	2	8	265523	265530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015948	GATG	2	8	265584	265591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015948	CCGA	2	8	266907	266914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015948	GTCG	2	8	268828	268835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015948	ACGG	2	8	271693	271700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015948	CTGG	2	8	275090	275097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015948	CGCT	2	8	275448	275455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015948	GACA	2	8	275630	275637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015948	CGCT	2	8	275699	275706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015948	TGTA	2	8	277668	277675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015948	CGCC	2	8	278361	278368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_015948	TGTT	2	8	278436	278443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015948	ACCG	2	8	278495	278502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015948	TCAC	2	8	278541	278548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015948	GATA	2	8	279669	279676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015948	CGCT	2	8	283663	283670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015948	ATTT	2	8	290200	290207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015948	GCAC	2	8	291472	291479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015948	CAAG	2	8	302238	302245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015948	CGGT	2	8	302662	302669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015948	GCCG	2	8	303084	303091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015948	GCCG	2	8	303204	303211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015948	TCGT	2	8	308686	308693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015948	GTGC	2	8	308707	308714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015948	CAGC	2	8	316630	316637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015948	GTCA	2	8	316662	316669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015948	CGTC	2	8	317751	317758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015948	TGGC	2	8	317795	317802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015948	CGGG	2	8	318974	318981	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015948	TCCC	2	8	320187	320194	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_015948	AATC	2	8	324176	324183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015948	TGAC	2	8	326567	326574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015948	GCGG	2	8	327372	327379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015948	CGAC	2	8	332976	332983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015948	ACTG	2	8	335546	335553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015948	CTCG	2	8	343959	343966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015948	AGTG	2	8	353328	353335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015948	GAAT	2	8	355416	355423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015948	AGGA	2	8	359913	359920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015948	CCTG	2	8	361187	361194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015948	GCTG	2	8	361243	361250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015948	GACG	2	8	361549	361556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015948	TCAT	2	8	364384	364391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015948	TGGT	2	8	375093	375100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015948	GCTC	2	8	377198	377205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015948	TCGC	2	8	389805	389812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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443	NC_015948	GTCT	2	8	1216218	1216225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_015948	TGAT	2	8	1227438	1227445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_015948	AGCG	2	8	1231994	1232001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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448	NC_015948	TCCG	2	8	1234179	1234186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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452	NC_015948	CGGT	2	8	1238698	1238705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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456	NC_015948	TGAT	2	8	1247627	1247634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_015948	CGAC	2	8	1254492	1254499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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460	NC_015948	CGGC	2	8	1266972	1266979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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462	NC_015948	CCGA	2	8	1274509	1274516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
463	NC_015948	ACAG	2	8	1276993	1277000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
464	NC_015948	TGAC	2	8	1284927	1284934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_015948	TGTT	2	8	1285657	1285664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015948	GATA	2	8	1286186	1286193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
467	NC_015948	GCCC	2	8	1294171	1294178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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471	NC_015948	AATA	2	8	1311496	1311503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_015948	GACC	2	8	1314729	1314736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
473	NC_015948	TTTA	2	8	1318442	1318449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_015948	TCGT	2	8	1321845	1321852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
476	NC_015948	GCAA	2	8	1325721	1325728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
477	NC_015948	TCGC	2	8	1325989	1325996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_015948	GCTG	2	8	1336855	1336862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_015948	GACC	2	8	1337057	1337064	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
482	NC_015948	GTCG	2	8	1337167	1337174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_015948	GAGC	2	8	1337257	1337264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_015948	CGAA	2	8	1337324	1337331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015948	GAGT	2	8	1337379	1337386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015948	TGTT	2	8	1338453	1338460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_015948	CGGC	2	8	1342709	1342716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_015948	ACGA	2	8	1342872	1342879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_015948	GTTT	2	8	1342947	1342954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015948	TGAT	2	8	1345862	1345869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_015948	GCGG	2	8	1348295	1348302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
492	NC_015948	CCGA	2	8	1355291	1355298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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495	NC_015948	CGAC	2	8	1362037	1362044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_015948	CGGC	2	8	1362897	1362904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_015948	CGGC	2	8	1362974	1362981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_015948	TGGC	2	8	1363046	1363053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_015948	GCGA	2	8	1363372	1363379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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