MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 5118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015948	TG	3	6	1061	1066	0 %	50 %	50 %	0 %	344210306
2	NC_015948	CG	3	6	1951	1956	0 %	0 %	50 %	50 %	344210307
3	NC_015948	CG	3	6	2703	2708	0 %	0 %	50 %	50 %	344210308
4	NC_015948	TG	3	6	2930	2935	0 %	50 %	50 %	0 %	344210308
5	NC_015948	CG	3	6	4228	4233	0 %	0 %	50 %	50 %	344210309
6	NC_015948	CA	3	6	4493	4498	50 %	0 %	0 %	50 %	344210309
7	NC_015948	CG	4	8	5222	5229	0 %	0 %	50 %	50 %	344210310
8	NC_015948	CG	3	6	6027	6032	0 %	0 %	50 %	50 %	344210310
9	NC_015948	TC	3	6	6657	6662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015948	CG	3	6	7252	7257	0 %	0 %	50 %	50 %	344210311
11	NC_015948	GC	3	6	7576	7581	0 %	0 %	50 %	50 %	344210312
12	NC_015948	AG	3	6	8105	8110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015948	GC	4	8	8524	8531	0 %	0 %	50 %	50 %	344210313
14	NC_015948	GT	3	6	8919	8924	0 %	50 %	50 %	0 %	344210313
15	NC_015948	GC	3	6	9057	9062	0 %	0 %	50 %	50 %	344210313
16	NC_015948	CG	3	6	9208	9213	0 %	0 %	50 %	50 %	344210313
17	NC_015948	GC	3	6	9376	9381	0 %	0 %	50 %	50 %	344210313
18	NC_015948	GC	3	6	9405	9410	0 %	0 %	50 %	50 %	344210313
19	NC_015948	CG	3	6	9526	9531	0 %	0 %	50 %	50 %	344210313
20	NC_015948	CA	3	6	9861	9866	50 %	0 %	0 %	50 %	344210313
21	NC_015948	AC	3	6	11219	11224	50 %	0 %	0 %	50 %	344210314
22	NC_015948	GC	3	6	13497	13502	0 %	0 %	50 %	50 %	344210317
23	NC_015948	GC	3	6	14130	14135	0 %	0 %	50 %	50 %	344210319
24	NC_015948	GA	3	6	14498	14503	50 %	0 %	50 %	0 %	344210319
25	NC_015948	TG	3	6	15048	15053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015948	CA	3	6	15074	15079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015948	CG	3	6	15348	15353	0 %	0 %	50 %	50 %	344210320
28	NC_015948	TC	3	6	15478	15483	0 %	50 %	0 %	50 %	344210320
29	NC_015948	GA	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	344210321
30	NC_015948	GA	3	6	17178	17183	50 %	0 %	50 %	0 %	344210323
31	NC_015948	TG	3	6	17342	17347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015948	GC	3	6	17671	17676	0 %	0 %	50 %	50 %	344210324
33	NC_015948	GC	3	6	18216	18221	0 %	0 %	50 %	50 %	344210324
34	NC_015948	TG	3	6	18809	18814	0 %	50 %	50 %	0 %	344210325
35	NC_015948	TC	3	6	19088	19093	0 %	50 %	0 %	50 %	344210325
36	NC_015948	GT	3	6	19139	19144	0 %	50 %	50 %	0 %	344210325
37	NC_015948	GC	3	6	19361	19366	0 %	0 %	50 %	50 %	344210325
38	NC_015948	AT	3	6	19377	19382	50 %	50 %	0 %	0 %	344210325
39	NC_015948	GC	3	6	20635	20640	0 %	0 %	50 %	50 %	344210326
40	NC_015948	GC	3	6	22739	22744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015948	GC	3	6	24112	24117	0 %	0 %	50 %	50 %	344210330
42	NC_015948	GC	3	6	24672	24677	0 %	0 %	50 %	50 %	344210330
43	NC_015948	CT	3	6	24959	24964	0 %	50 %	0 %	50 %	344210330
44	NC_015948	GT	3	6	25159	25164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015948	CG	3	6	27207	27212	0 %	0 %	50 %	50 %	344210333
46	NC_015948	GC	4	8	27373	27380	0 %	0 %	50 %	50 %	344210333
47	NC_015948	CG	3	6	27406	27411	0 %	0 %	50 %	50 %	344210333
48	NC_015948	GA	3	6	27486	27491	50 %	0 %	50 %	0 %	344210333
49	NC_015948	CT	3	6	27721	27726	0 %	50 %	0 %	50 %	344210334
50	NC_015948	CG	3	6	27768	27773	0 %	0 %	50 %	50 %	344210334
51	NC_015948	CG	3	6	28396	28401	0 %	0 %	50 %	50 %	344210335
52	NC_015948	CG	3	6	28424	28429	0 %	0 %	50 %	50 %	344210335
53	NC_015948	GC	3	6	28661	28666	0 %	0 %	50 %	50 %	344210335
54	NC_015948	CG	3	6	28724	28729	0 %	0 %	50 %	50 %	344210335
55	NC_015948	CG	3	6	29164	29169	0 %	0 %	50 %	50 %	344210336
56	NC_015948	GC	3	6	29199	29204	0 %	0 %	50 %	50 %	344210336
57	NC_015948	GC	3	6	29636	29641	0 %	0 %	50 %	50 %	344210336
58	NC_015948	CG	3	6	29961	29966	0 %	0 %	50 %	50 %	344210337
59	NC_015948	AG	3	6	30831	30836	50 %	0 %	50 %	0 %	344210339
60	NC_015948	CT	3	6	31020	31025	0 %	50 %	0 %	50 %	344210339
61	NC_015948	CT	3	6	31179	31184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015948	AC	3	6	31252	31257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015948	AG	3	6	31710	31715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015948	TG	3	6	32215	32220	0 %	50 %	50 %	0 %	344210340
65	NC_015948	CA	3	6	32317	32322	50 %	0 %	0 %	50 %	344210340
66	NC_015948	CG	3	6	32973	32978	0 %	0 %	50 %	50 %	344210342
67	NC_015948	CG	3	6	34160	34165	0 %	0 %	50 %	50 %	344210343
68	NC_015948	GC	3	6	34543	34548	0 %	0 %	50 %	50 %	344210343
69	NC_015948	AC	3	6	34978	34983	50 %	0 %	0 %	50 %	344210344
70	NC_015948	TG	3	6	35795	35800	0 %	50 %	50 %	0 %	344210345
71	NC_015948	CG	3	6	39527	39532	0 %	0 %	50 %	50 %	344210346
72	NC_015948	CT	3	6	40332	40337	0 %	50 %	0 %	50 %	344210348
73	NC_015948	CG	3	6	42723	42728	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
74	NC_015948	GC	3	6	43456	43461	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
75	NC_015948	GC	3	6	44386	44391	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
76	NC_015948	GC	3	6	44648	44653	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
77	NC_015948	GA	4	8	44840	44847	50 %	0 %	50 %	0 %	344210350
78	NC_015948	CG	4	8	45570	45577	0 %	0 %	50 %	50 %	344210350
79	NC_015948	AG	3	6	47293	47298	50 %	0 %	50 %	0 %	344210351
80	NC_015948	AC	3	6	47303	47308	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
81	NC_015948	CA	3	6	47845	47850	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
82	NC_015948	AC	3	6	48198	48203	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
83	NC_015948	AC	3	6	48371	48376	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
84	NC_015948	AT	3	6	48424	48429	50 %	50 %	0 %	0 %	344210351
85	NC_015948	GC	3	6	48549	48554	0 %	0 %	50 %	50 %	344210351
86	NC_015948	CT	3	6	49178	49183	0 %	50 %	0 %	50 %	344210351
87	NC_015948	AT	4	8	49889	49896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015948	AG	3	6	50772	50777	50 %	0 %	50 %	0 %	344210354
89	NC_015948	CT	3	6	51246	51251	0 %	50 %	0 %	50 %	344210355
90	NC_015948	CG	3	6	51743	51748	0 %	0 %	50 %	50 %	344210355
91	NC_015948	GC	3	6	51971	51976	0 %	0 %	50 %	50 %	344210356
92	NC_015948	CG	3	6	52779	52784	0 %	0 %	50 %	50 %	344210357
93	NC_015948	CG	3	6	52896	52901	0 %	0 %	50 %	50 %	344210357
94	NC_015948	CA	3	6	53055	53060	50 %	0 %	0 %	50 %	344210357
95	NC_015948	GC	3	6	53279	53284	0 %	0 %	50 %	50 %	344210357
96	NC_015948	CT	3	6	53936	53941	0 %	50 %	0 %	50 %	344210358
97	NC_015948	TG	3	6	54119	54124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015948	TG	3	6	54180	54185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015948	CT	3	6	54191	54196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015948	TC	3	6	54253	54258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015948	GT	3	6	54293	54298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015948	CG	3	6	55746	55751	0 %	0 %	50 %	50 %	344210359
103	NC_015948	CG	3	6	56065	56070	0 %	0 %	50 %	50 %	344210360
104	NC_015948	GC	3	6	56478	56483	0 %	0 %	50 %	50 %	344210360
105	NC_015948	GT	3	6	56559	56564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015948	TG	3	6	57152	57157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015948	GC	3	6	57418	57423	0 %	0 %	50 %	50 %	344210362
108	NC_015948	GT	3	6	57559	57564	0 %	50 %	50 %	0 %	344210362
109	NC_015948	GC	3	6	57575	57580	0 %	0 %	50 %	50 %	344210362
110	NC_015948	AG	3	6	58198	58203	50 %	0 %	50 %	0 %	344210363
111	NC_015948	GC	3	6	58421	58426	0 %	0 %	50 %	50 %	344210363
112	NC_015948	GC	3	6	60931	60936	0 %	0 %	50 %	50 %	344210366
113	NC_015948	GC	3	6	62170	62175	0 %	0 %	50 %	50 %	344210367
114	NC_015948	GT	3	6	63222	63227	0 %	50 %	50 %	0 %	344210368
115	NC_015948	GC	3	6	63753	63758	0 %	0 %	50 %	50 %	344210368
116	NC_015948	CG	3	6	64748	64753	0 %	0 %	50 %	50 %	344210369
117	NC_015948	CG	3	6	65510	65515	0 %	0 %	50 %	50 %	344210369
118	NC_015948	GA	3	6	66051	66056	50 %	0 %	50 %	0 %	344210370
119	NC_015948	AC	3	6	66124	66129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015948	TC	3	6	66413	66418	0 %	50 %	0 %	50 %	344210371
121	NC_015948	CA	3	6	66846	66851	50 %	0 %	0 %	50 %	344210371
122	NC_015948	CA	3	6	66874	66879	50 %	0 %	0 %	50 %	344210371
123	NC_015948	CA	3	6	67068	67073	50 %	0 %	0 %	50 %	344210371
124	NC_015948	GC	3	6	68928	68933	0 %	0 %	50 %	50 %	344210372
125	NC_015948	GC	3	6	69650	69655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015948	GC	3	6	70750	70755	0 %	0 %	50 %	50 %	344210375
127	NC_015948	TG	3	6	71605	71610	0 %	50 %	50 %	0 %	344210376
128	NC_015948	CG	3	6	71911	71916	0 %	0 %	50 %	50 %	344210376
129	NC_015948	CA	3	6	72894	72899	50 %	0 %	0 %	50 %	344210378
130	NC_015948	TG	3	6	73912	73917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015948	CG	3	6	73998	74003	0 %	0 %	50 %	50 %	344210380
132	NC_015948	CA	3	6	74315	74320	50 %	0 %	0 %	50 %	344210380
133	NC_015948	GC	3	6	75813	75818	0 %	0 %	50 %	50 %	344210383
134	NC_015948	TC	3	6	76246	76251	0 %	50 %	0 %	50 %	344210383
135	NC_015948	GC	3	6	76499	76504	0 %	0 %	50 %	50 %	344210384
136	NC_015948	GC	3	6	76582	76587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015948	GC	3	6	76599	76604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015948	TG	3	6	77186	77191	0 %	50 %	50 %	0 %	344210385
139	NC_015948	GC	3	6	77434	77439	0 %	0 %	50 %	50 %	344210385
140	NC_015948	CG	3	6	78371	78376	0 %	0 %	50 %	50 %	344210386
141	NC_015948	CG	3	6	78411	78416	0 %	0 %	50 %	50 %	344210386
142	NC_015948	GC	3	6	78910	78915	0 %	0 %	50 %	50 %	344210387
143	NC_015948	GC	3	6	79084	79089	0 %	0 %	50 %	50 %	344210387
144	NC_015948	CA	3	6	79474	79479	50 %	0 %	0 %	50 %	344210387
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