MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015948	C	7	7	966	972	0 %	0 %	0 %	100 %	344210306
2	NC_015948	G	6	6	1828	1833	0 %	0 %	100 %	0 %	344210307
3	NC_015948	G	7	7	3561	3567	0 %	0 %	100 %	0 %	344210309
4	NC_015948	T	6	6	13398	13403	0 %	100 %	0 %	0 %	344210317
5	NC_015948	C	6	6	44470	44475	0 %	0 %	0 %	100 %	344210349
6	NC_015948	T	6	6	45814	45819	0 %	100 %	0 %	0 %	344210350
7	NC_015948	G	6	6	67155	67160	0 %	0 %	100 %	0 %	344210371
8	NC_015948	C	6	6	98597	98602	0 %	0 %	0 %	100 %	344210408
9	NC_015948	G	6	6	100443	100448	0 %	0 %	100 %	0 %	344210412
10	NC_015948	C	6	6	100554	100559	0 %	0 %	0 %	100 %	344210412
11	NC_015948	G	6	6	101588	101593	0 %	0 %	100 %	0 %	344210413
12	NC_015948	G	6	6	102589	102594	0 %	0 %	100 %	0 %	344210415
13	NC_015948	G	6	6	140662	140667	0 %	0 %	100 %	0 %	344210455
14	NC_015948	T	7	7	174706	174712	0 %	100 %	0 %	0 %	344210498
15	NC_015948	A	6	6	190178	190183	100 %	0 %	0 %	0 %	344210513
16	NC_015948	G	7	7	196353	196359	0 %	0 %	100 %	0 %	344210518
17	NC_015948	G	6	6	199287	199292	0 %	0 %	100 %	0 %	344210521
18	NC_015948	C	6	6	207666	207671	0 %	0 %	0 %	100 %	344210527
19	NC_015948	C	6	6	245717	245722	0 %	0 %	0 %	100 %	344210563
20	NC_015948	T	6	6	250783	250788	0 %	100 %	0 %	0 %	344210567
21	NC_015948	C	6	6	253369	253374	0 %	0 %	0 %	100 %	344210568
22	NC_015948	C	6	6	261529	261534	0 %	0 %	0 %	100 %	344210577
23	NC_015948	T	6	6	276836	276841	0 %	100 %	0 %	0 %	344210586
24	NC_015948	C	6	6	281557	281562	0 %	0 %	0 %	100 %	344210590
25	NC_015948	G	6	6	295957	295962	0 %	0 %	100 %	0 %	344210605
26	NC_015948	G	6	6	299135	299140	0 %	0 %	100 %	0 %	344210606
27	NC_015948	C	6	6	308275	308280	0 %	0 %	0 %	100 %	344210616
28	NC_015948	G	6	6	308403	308408	0 %	0 %	100 %	0 %	344210616
29	NC_015948	C	6	6	322354	322359	0 %	0 %	0 %	100 %	344210635
30	NC_015948	T	6	6	323571	323576	0 %	100 %	0 %	0 %	344210637
31	NC_015948	C	6	6	329603	329608	0 %	0 %	0 %	100 %	344210645
32	NC_015948	G	6	6	340043	340048	0 %	0 %	100 %	0 %	344210655
33	NC_015948	A	6	6	340615	340620	100 %	0 %	0 %	0 %	344210655
34	NC_015948	A	6	6	342826	342831	100 %	0 %	0 %	0 %	344210657
35	NC_015948	C	6	6	347620	347625	0 %	0 %	0 %	100 %	344210661
36	NC_015948	T	6	6	353447	353452	0 %	100 %	0 %	0 %	344210666
37	NC_015948	A	6	6	359609	359614	100 %	0 %	0 %	0 %	344210672
38	NC_015948	G	6	6	375171	375176	0 %	0 %	100 %	0 %	344210694
39	NC_015948	G	6	6	376581	376586	0 %	0 %	100 %	0 %	344210695
40	NC_015948	C	6	6	385257	385262	0 %	0 %	0 %	100 %	344210706
41	NC_015948	G	6	6	415459	415464	0 %	0 %	100 %	0 %	344210736
42	NC_015948	C	6	6	416568	416573	0 %	0 %	0 %	100 %	344210737
43	NC_015948	G	6	6	459737	459742	0 %	0 %	100 %	0 %	344210781
44	NC_015948	C	6	6	461384	461389	0 %	0 %	0 %	100 %	344210783
45	NC_015948	C	6	6	477678	477683	0 %	0 %	0 %	100 %	344210797
46	NC_015948	A	6	6	502051	502056	100 %	0 %	0 %	0 %	344210825
47	NC_015948	T	7	7	517034	517040	0 %	100 %	0 %	0 %	344210840
48	NC_015948	G	6	6	526895	526900	0 %	0 %	100 %	0 %	344210849
49	NC_015948	T	6	6	530199	530204	0 %	100 %	0 %	0 %	344210854
50	NC_015948	C	6	6	533471	533476	0 %	0 %	0 %	100 %	344210857
51	NC_015948	C	6	6	545073	545078	0 %	0 %	0 %	100 %	344210872
52	NC_015948	G	6	6	577968	577973	0 %	0 %	100 %	0 %	344210901
53	NC_015948	G	6	6	579012	579017	0 %	0 %	100 %	0 %	344210902
54	NC_015948	G	6	6	600344	600349	0 %	0 %	100 %	0 %	344210923
55	NC_015948	G	6	6	658137	658142	0 %	0 %	100 %	0 %	344210983
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59	NC_015948	G	6	6	678417	678422	0 %	0 %	100 %	0 %	344211007
60	NC_015948	G	6	6	685516	685521	0 %	0 %	100 %	0 %	344211014
61	NC_015948	C	6	6	687143	687148	0 %	0 %	0 %	100 %	344211016
62	NC_015948	C	6	6	692993	692998	0 %	0 %	0 %	100 %	344211026
63	NC_015948	C	6	6	709553	709558	0 %	0 %	0 %	100 %	344211042
64	NC_015948	C	6	6	709751	709756	0 %	0 %	0 %	100 %	344211042
65	NC_015948	G	6	6	732228	732233	0 %	0 %	100 %	0 %	344211063
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75	NC_015948	G	6	6	829641	829646	0 %	0 %	100 %	0 %	344211169
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79	NC_015948	C	6	6	843511	843516	0 %	0 %	0 %	100 %	344211182
80	NC_015948	C	6	6	847812	847817	0 %	0 %	0 %	100 %	344211187
81	NC_015948	G	6	6	851985	851990	0 %	0 %	100 %	0 %	344211192
82	NC_015948	C	6	6	853747	853752	0 %	0 %	0 %	100 %	344211194
83	NC_015948	G	6	6	854902	854907	0 %	0 %	100 %	0 %	344211196
84	NC_015948	C	6	6	886615	886620	0 %	0 %	0 %	100 %	344211221
85	NC_015948	C	6	6	887377	887382	0 %	0 %	0 %	100 %	344211221
86	NC_015948	G	6	6	898388	898393	0 %	0 %	100 %	0 %	344211230
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89	NC_015948	G	6	6	963230	963235	0 %	0 %	100 %	0 %	344211300
90	NC_015948	T	6	6	963327	963332	0 %	100 %	0 %	0 %	344211301
91	NC_015948	C	7	7	997919	997925	0 %	0 %	0 %	100 %	344211341
92	NC_015948	C	6	6	1003462	1003467	0 %	0 %	0 %	100 %	344211346
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98	NC_015948	A	6	6	1085307	1085312	100 %	0 %	0 %	0 %	344211434
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100	NC_015948	A	6	6	1140446	1140451	100 %	0 %	0 %	0 %	344211488
101	NC_015948	T	7	7	1144584	1144590	0 %	100 %	0 %	0 %	344211491
102	NC_015948	G	7	7	1150982	1150988	0 %	0 %	100 %	0 %	344211495
103	NC_015948	G	6	6	1151095	1151100	0 %	0 %	100 %	0 %	344211495
104	NC_015948	G	6	6	1182783	1182788	0 %	0 %	100 %	0 %	344211524
105	NC_015948	A	6	6	1185007	1185012	100 %	0 %	0 %	0 %	344211527
106	NC_015948	C	6	6	1187807	1187812	0 %	0 %	0 %	100 %	344211530
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108	NC_015948	G	6	6	1199798	1199803	0 %	0 %	100 %	0 %	344211540
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111	NC_015948	G	6	6	1233577	1233582	0 %	0 %	100 %	0 %	344211564
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114	NC_015948	C	6	6	1251544	1251549	0 %	0 %	0 %	100 %	344211583
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120	NC_015948	T	6	6	1319215	1319220	0 %	100 %	0 %	0 %	344211650
121	NC_015948	G	6	6	1322639	1322644	0 %	0 %	100 %	0 %	344211654
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124	NC_015948	C	6	6	1346911	1346916	0 %	0 %	0 %	100 %	344211687
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136	NC_015948	A	6	6	1433249	1433254	100 %	0 %	0 %	0 %	344211775
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.