MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 4233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015947	GGCCA	2	10	4717	4726	20 %	0 %	40 %	40 %	344205424
2	NC_015947	AACGC	2	10	6924	6933	40 %	0 %	20 %	40 %	344205425
3	NC_015947	TGCCC	2	10	8833	8842	0 %	20 %	20 %	60 %	344205427
4	NC_015947	AAGAC	2	10	9948	9957	60 %	0 %	20 %	20 %	344205428
5	NC_015947	TAGCT	2	10	11532	11541	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015947	CAACA	2	10	13256	13265	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015947	TCGCC	2	10	14100	14109	0 %	20 %	20 %	60 %	344205433
8	NC_015947	GACCG	2	10	15318	15327	20 %	0 %	40 %	40 %	344205435
9	NC_015947	CCGCT	2	10	15929	15938	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015947	CGCGC	2	10	16879	16888	0 %	0 %	40 %	60 %	344205436
11	NC_015947	TGGCA	2	10	18041	18050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015947	TTTGC	2	10	18304	18313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015947	CACCG	2	10	19889	19898	20 %	0 %	20 %	60 %	344205439
14	NC_015947	GTCAT	2	10	20073	20082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015947	GCAGC	2	10	20728	20737	20 %	0 %	40 %	40 %	344205440
16	NC_015947	GGTCG	2	10	22216	22225	0 %	20 %	60 %	20 %	344205441
17	NC_015947	GCACC	2	10	23940	23949	20 %	0 %	20 %	60 %	344205442
18	NC_015947	GGTCG	2	10	25119	25128	0 %	20 %	60 %	20 %	344205443
19	NC_015947	GGCTG	2	10	25881	25890	0 %	20 %	60 %	20 %	344205444
20	NC_015947	GCAGC	2	10	31933	31942	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015947	TGCCC	2	10	32326	32335	0 %	20 %	20 %	60 %	344205450
22	NC_015947	ACACG	2	10	32742	32751	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015947	TGCCC	2	10	33890	33899	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015947	AGGGC	2	10	34921	34930	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015947	GTGGC	2	10	35414	35423	0 %	20 %	60 %	20 %	344205453
26	NC_015947	GGCGG	2	10	36588	36597	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015947	GCTCG	2	10	38112	38121	0 %	20 %	40 %	40 %	344205456
28	NC_015947	CTCGG	2	10	38833	38842	0 %	20 %	40 %	40 %	344205456
29	NC_015947	CCGTT	2	10	39281	39290	0 %	40 %	20 %	40 %	344205456
30	NC_015947	CCGAC	2	10	39773	39782	20 %	0 %	20 %	60 %	344205456
31	NC_015947	GAAGG	2	10	40320	40329	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015947	GCGCA	2	10	41337	41346	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015947	TGCGC	2	10	43093	43102	0 %	20 %	40 %	40 %	344205459
34	NC_015947	GGCTC	2	10	43646	43655	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015947	GCGCC	2	10	47377	47386	0 %	0 %	40 %	60 %	344205464
36	NC_015947	CTGCC	2	10	48020	48029	0 %	20 %	20 %	60 %	344205464
37	NC_015947	GACTG	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	344205465
38	NC_015947	CGGCG	2	10	48602	48611	0 %	0 %	60 %	40 %	344205465
39	NC_015947	CATGG	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	344205465
40	NC_015947	CCGCC	2	10	50252	50261	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
41	NC_015947	AGCAC	2	10	50625	50634	40 %	0 %	20 %	40 %	344205466
42	NC_015947	GCCAT	2	10	50786	50795	20 %	20 %	20 %	40 %	344205466
43	NC_015947	TGGCG	2	10	51121	51130	0 %	20 %	60 %	20 %	344205467
44	NC_015947	CTGGC	2	10	53111	53120	0 %	20 %	40 %	40 %	344205469
45	NC_015947	TGGCG	2	10	53255	53264	0 %	20 %	60 %	20 %	344205469
46	NC_015947	CTGGC	2	10	53666	53675	0 %	20 %	40 %	40 %	344205469
47	NC_015947	AGCCG	2	10	54357	54366	20 %	0 %	40 %	40 %	344205469
48	NC_015947	TGGCG	2	10	55502	55511	0 %	20 %	60 %	20 %	344205471
49	NC_015947	TGGCG	2	10	57531	57540	0 %	20 %	60 %	20 %	344205473
50	NC_015947	CGGAC	2	10	58790	58799	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015947	GCAGC	2	10	59349	59358	20 %	0 %	40 %	40 %	344205475
52	NC_015947	TTCCC	2	10	63019	63028	0 %	40 %	0 %	60 %	344205478
53	NC_015947	GGCGA	2	10	63113	63122	20 %	0 %	60 %	20 %	344205478
54	NC_015947	CTGCG	2	10	64595	64604	0 %	20 %	40 %	40 %	344205479
55	NC_015947	CGCTG	2	10	65252	65261	0 %	20 %	40 %	40 %	344205480
56	NC_015947	GCGCG	2	10	66925	66934	0 %	0 %	60 %	40 %	344205481
57	NC_015947	GTGGA	2	10	68335	68344	20 %	20 %	60 %	0 %	344205482
58	NC_015947	GGCGA	2	10	70486	70495	20 %	0 %	60 %	20 %	344205483
59	NC_015947	CAGGC	2	10	70502	70511	20 %	0 %	40 %	40 %	344205483
60	NC_015947	AGGCC	2	10	71308	71317	20 %	0 %	40 %	40 %	344205484
61	NC_015947	CGCAG	2	10	73558	73567	20 %	0 %	40 %	40 %	344205484
62	NC_015947	GCTGT	2	10	78153	78162	0 %	40 %	40 %	20 %	344205488
63	NC_015947	GTGCG	2	10	78879	78888	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015947	GGCGA	2	10	79193	79202	20 %	0 %	60 %	20 %	344205489
65	NC_015947	TGCGC	2	10	79666	79675	0 %	20 %	40 %	40 %	344205489
66	NC_015947	GCGAA	2	10	80100	80109	40 %	0 %	40 %	20 %	344205489
67	NC_015947	CGCTG	2	10	80584	80593	0 %	20 %	40 %	40 %	344205490
68	NC_015947	GCCAT	2	10	81907	81916	20 %	20 %	20 %	40 %	344205491
69	NC_015947	CGGAT	2	10	82293	82302	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015947	TGGCC	2	10	82539	82548	0 %	20 %	40 %	40 %	344205492
71	NC_015947	GGCTG	2	10	82856	82865	0 %	20 %	60 %	20 %	344205493
72	NC_015947	CTGGC	2	10	83014	83023	0 %	20 %	40 %	40 %	344205493
73	NC_015947	CAGTC	2	10	84703	84712	20 %	20 %	20 %	40 %	344205493
74	NC_015947	CGCTG	2	10	88510	88519	0 %	20 %	40 %	40 %	344205496
75	NC_015947	GCCAG	2	10	89175	89184	20 %	0 %	40 %	40 %	344205497
76	NC_015947	GCCAT	2	10	89804	89813	20 %	20 %	20 %	40 %	344205497
77	NC_015947	CGTGG	2	10	90173	90182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015947	GGGAG	2	10	90188	90197	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015947	GCAGC	2	10	91166	91175	20 %	0 %	40 %	40 %	344205499
80	NC_015947	GTGCA	2	10	91900	91909	20 %	20 %	40 %	20 %	344205500
81	NC_015947	CAGCG	2	10	91998	92007	20 %	0 %	40 %	40 %	344205500
82	NC_015947	CATCG	2	10	93588	93597	20 %	20 %	20 %	40 %	344205501
83	NC_015947	ATCGC	2	10	94405	94414	20 %	20 %	20 %	40 %	344205501
84	NC_015947	CGCAG	2	10	95931	95940	20 %	0 %	40 %	40 %	344205502
85	NC_015947	GGGCA	2	10	96161	96170	20 %	0 %	60 %	20 %	344205502
86	NC_015947	CAGCG	2	10	96720	96729	20 %	0 %	40 %	40 %	344205502
87	NC_015947	ACGGC	2	10	97747	97756	20 %	0 %	40 %	40 %	344205504
88	NC_015947	CTCAC	2	10	101991	102000	20 %	20 %	0 %	60 %	344205507
89	NC_015947	GCCGA	2	10	104131	104140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015947	CAGCG	2	10	104165	104174	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015947	GGCGG	2	10	104311	104320	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015947	GCGCG	2	10	106243	106252	0 %	0 %	60 %	40 %	344205510
93	NC_015947	ATCGC	2	10	106529	106538	20 %	20 %	20 %	40 %	344205510
94	NC_015947	GCCCA	2	10	108575	108584	20 %	0 %	20 %	60 %	344205510
95	NC_015947	CGGGC	2	10	109805	109814	0 %	0 %	60 %	40 %	344205511
96	NC_015947	GGCTC	2	10	110293	110302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015947	CTTTT	2	10	110332	110341	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015947	GTGCT	2	10	112977	112986	0 %	40 %	40 %	20 %	344205514
99	NC_015947	GGCGC	2	10	113316	113325	0 %	0 %	60 %	40 %	344205515
100	NC_015947	CGGCC	2	10	113358	113367	0 %	0 %	40 %	60 %	344205515
101	NC_015947	ATGGA	2	10	113840	113849	40 %	20 %	40 %	0 %	344205515
102	NC_015947	CGCGG	2	10	114292	114301	0 %	0 %	60 %	40 %	344205516
103	NC_015947	GTGCT	2	10	114456	114465	0 %	40 %	40 %	20 %	344205516
104	NC_015947	CCCGA	2	10	115212	115221	20 %	0 %	20 %	60 %	344205516
105	NC_015947	GCCCG	2	10	115820	115829	0 %	0 %	40 %	60 %	344205516
106	NC_015947	AAGGC	2	10	117000	117009	40 %	0 %	40 %	20 %	344205518
107	NC_015947	CGGCG	2	10	117216	117225	0 %	0 %	60 %	40 %	344205518
108	NC_015947	AGCGC	2	10	118786	118795	20 %	0 %	40 %	40 %	344205520
109	NC_015947	GCCCA	2	10	118919	118928	20 %	0 %	20 %	60 %	344205520
110	NC_015947	CCTGG	2	10	120611	120620	0 %	20 %	40 %	40 %	344205521
111	NC_015947	GATCC	2	10	124836	124845	20 %	20 %	20 %	40 %	344205525
112	NC_015947	GCTGG	2	10	126784	126793	0 %	20 %	60 %	20 %	344205527
113	NC_015947	TGATC	2	10	128754	128763	20 %	40 %	20 %	20 %	344205529
114	NC_015947	CTGGC	2	10	128893	128902	0 %	20 %	40 %	40 %	344205529
115	NC_015947	CCGAT	2	10	128906	128915	20 %	20 %	20 %	40 %	344205529
116	NC_015947	GGCGT	2	10	129448	129457	0 %	20 %	60 %	20 %	344205529
117	NC_015947	GACCC	2	10	131003	131012	20 %	0 %	20 %	60 %	344205533
118	NC_015947	GCGCA	2	10	137169	137178	20 %	0 %	40 %	40 %	344205539
119	NC_015947	TTCAG	2	10	138409	138418	20 %	40 %	20 %	20 %	344205540
120	NC_015947	TGCGC	2	10	139005	139014	0 %	20 %	40 %	40 %	344205540
121	NC_015947	CGGGG	2	10	139267	139276	0 %	0 %	80 %	20 %	344205540
122	NC_015947	GCGTG	2	10	139426	139435	0 %	20 %	60 %	20 %	344205541
123	NC_015947	GCTGC	2	10	139922	139931	0 %	20 %	40 %	40 %	344205541
124	NC_015947	CGTGC	2	10	140036	140045	0 %	20 %	40 %	40 %	344205541
125	NC_015947	CGGCG	2	10	140101	140110	0 %	0 %	60 %	40 %	344205541
126	NC_015947	GCACG	2	10	142380	142389	20 %	0 %	40 %	40 %	344205546
127	NC_015947	ATCGC	2	10	143678	143687	20 %	20 %	20 %	40 %	344205547
128	NC_015947	CACGC	2	10	143769	143778	20 %	0 %	20 %	60 %	344205547
129	NC_015947	GGGCG	2	10	143857	143866	0 %	0 %	80 %	20 %	344205547
130	NC_015947	GCCGA	2	10	144516	144525	20 %	0 %	40 %	40 %	344205549
131	NC_015947	CGCGA	2	10	146813	146822	20 %	0 %	40 %	40 %	344205553
132	NC_015947	CGGCG	2	10	148042	148051	0 %	0 %	60 %	40 %	344205553
133	NC_015947	ACAGG	2	10	152501	152510	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015947	CGATG	2	10	153446	153455	20 %	20 %	40 %	20 %	344205555
135	NC_015947	CCGAA	2	10	154806	154815	40 %	0 %	20 %	40 %	344205557
136	NC_015947	GCCGC	2	10	154826	154835	0 %	0 %	40 %	60 %	344205557
137	NC_015947	TGCAA	2	10	155128	155137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015947	GCGCG	2	10	156664	156673	0 %	0 %	60 %	40 %	344205559
139	NC_015947	CGCGT	2	10	157172	157181	0 %	20 %	40 %	40 %	344205560
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145	NC_015947	GATCA	2	10	164152	164161	40 %	20 %	20 %	20 %	344205567
146	NC_015947	CCGCG	2	10	164493	164502	0 %	0 %	40 %	60 %	344205567
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149	NC_015947	TCGAT	2	10	169287	169296	20 %	40 %	20 %	20 %	344205571
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151	NC_015947	TGGCC	2	10	170361	170370	0 %	20 %	40 %	40 %	344205572
152	NC_015947	GGCGC	2	10	173175	173184	0 %	0 %	60 %	40 %	344205573
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155	NC_015947	CACCG	2	10	174977	174986	20 %	0 %	20 %	60 %	344205574
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158	NC_015947	GGTGC	2	10	181198	181207	0 %	20 %	60 %	20 %	344205578
159	NC_015947	CCGGC	2	10	181427	181436	0 %	0 %	40 %	60 %	344205578
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179	NC_015947	ATGGC	2	10	215957	215966	20 %	20 %	40 %	20 %	344205611
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220	NC_015947	AAGCT	2	10	257219	257228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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245	NC_015947	CCCAT	2	10	297555	297564	20 %	20 %	0 %	60 %	344205684
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247	NC_015947	CGACC	2	10	302383	302392	20 %	0 %	20 %	60 %	344205690
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249	NC_015947	GACCG	2	10	302853	302862	20 %	0 %	40 %	40 %	344205690
250	NC_015947	GCCTG	2	10	302988	302997	0 %	20 %	40 %	40 %	344205690
251	NC_015947	TGGCC	2	10	303166	303175	0 %	20 %	40 %	40 %	344205691
252	NC_015947	TGGCG	2	10	305236	305245	0 %	20 %	60 %	20 %	344205692
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264	NC_015947	CCCGA	2	10	317448	317457	20 %	0 %	20 %	60 %	344205702
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269	NC_015947	GCGCA	2	10	320209	320218	20 %	0 %	40 %	40 %	344205705
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331	NC_015947	ACCGT	2	10	375256	375265	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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