MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 3641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015947	GGCCA	2	10	4717	4726	20 %	0 %	40 %	40 %	344205424
2	NC_015947	AACGC	2	10	6924	6933	40 %	0 %	20 %	40 %	344205425
3	NC_015947	TGCCC	2	10	8833	8842	0 %	20 %	20 %	60 %	344205427
4	NC_015947	AAGAC	2	10	9948	9957	60 %	0 %	20 %	20 %	344205428
5	NC_015947	TCGCC	2	10	14100	14109	0 %	20 %	20 %	60 %	344205433
6	NC_015947	GACCG	2	10	15318	15327	20 %	0 %	40 %	40 %	344205435
7	NC_015947	CGCGC	2	10	16879	16888	0 %	0 %	40 %	60 %	344205436
8	NC_015947	CACCG	2	10	19889	19898	20 %	0 %	20 %	60 %	344205439
9	NC_015947	GCAGC	2	10	20728	20737	20 %	0 %	40 %	40 %	344205440
10	NC_015947	GGTCG	2	10	22216	22225	0 %	20 %	60 %	20 %	344205441
11	NC_015947	GCACC	2	10	23940	23949	20 %	0 %	20 %	60 %	344205442
12	NC_015947	GGTCG	2	10	25119	25128	0 %	20 %	60 %	20 %	344205443
13	NC_015947	GGCTG	2	10	25881	25890	0 %	20 %	60 %	20 %	344205444
14	NC_015947	TGCCC	2	10	32326	32335	0 %	20 %	20 %	60 %	344205450
15	NC_015947	GTGGC	2	10	35414	35423	0 %	20 %	60 %	20 %	344205453
16	NC_015947	GCTCG	2	10	38112	38121	0 %	20 %	40 %	40 %	344205456
17	NC_015947	CTCGG	2	10	38833	38842	0 %	20 %	40 %	40 %	344205456
18	NC_015947	CCGTT	2	10	39281	39290	0 %	40 %	20 %	40 %	344205456
19	NC_015947	CCGAC	2	10	39773	39782	20 %	0 %	20 %	60 %	344205456
20	NC_015947	TGCGC	2	10	43093	43102	0 %	20 %	40 %	40 %	344205459
21	NC_015947	GCGCC	2	10	47377	47386	0 %	0 %	40 %	60 %	344205464
22	NC_015947	CTGCC	2	10	48020	48029	0 %	20 %	20 %	60 %	344205464
23	NC_015947	GACTG	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	344205465
24	NC_015947	CGGCG	2	10	48602	48611	0 %	0 %	60 %	40 %	344205465
25	NC_015947	CATGG	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	344205465
26	NC_015947	AGCAC	2	10	50625	50634	40 %	0 %	20 %	40 %	344205466
27	NC_015947	GCCAT	2	10	50786	50795	20 %	20 %	20 %	40 %	344205466
28	NC_015947	TGGCG	2	10	51121	51130	0 %	20 %	60 %	20 %	344205467
29	NC_015947	CTGGC	2	10	53111	53120	0 %	20 %	40 %	40 %	344205469
30	NC_015947	TGGCG	2	10	53255	53264	0 %	20 %	60 %	20 %	344205469
31	NC_015947	CTGGC	2	10	53666	53675	0 %	20 %	40 %	40 %	344205469
32	NC_015947	AGCCG	2	10	54357	54366	20 %	0 %	40 %	40 %	344205469
33	NC_015947	TGGCG	2	10	55502	55511	0 %	20 %	60 %	20 %	344205471
34	NC_015947	TGGCG	2	10	57531	57540	0 %	20 %	60 %	20 %	344205473
35	NC_015947	GCAGC	2	10	59349	59358	20 %	0 %	40 %	40 %	344205475
36	NC_015947	TTCCC	2	10	63019	63028	0 %	40 %	0 %	60 %	344205478
37	NC_015947	GGCGA	2	10	63113	63122	20 %	0 %	60 %	20 %	344205478
38	NC_015947	CTGCG	2	10	64595	64604	0 %	20 %	40 %	40 %	344205479
39	NC_015947	CGCTG	2	10	65252	65261	0 %	20 %	40 %	40 %	344205480
40	NC_015947	GCGCG	2	10	66925	66934	0 %	0 %	60 %	40 %	344205481
41	NC_015947	GTGGA	2	10	68335	68344	20 %	20 %	60 %	0 %	344205482
42	NC_015947	GGCGA	2	10	70486	70495	20 %	0 %	60 %	20 %	344205483
43	NC_015947	CAGGC	2	10	70502	70511	20 %	0 %	40 %	40 %	344205483
44	NC_015947	AGGCC	2	10	71308	71317	20 %	0 %	40 %	40 %	344205484
45	NC_015947	CGCAG	2	10	73558	73567	20 %	0 %	40 %	40 %	344205484
46	NC_015947	GCTGT	2	10	78153	78162	0 %	40 %	40 %	20 %	344205488
47	NC_015947	GGCGA	2	10	79193	79202	20 %	0 %	60 %	20 %	344205489
48	NC_015947	TGCGC	2	10	79666	79675	0 %	20 %	40 %	40 %	344205489
49	NC_015947	GCGAA	2	10	80100	80109	40 %	0 %	40 %	20 %	344205489
50	NC_015947	CGCTG	2	10	80584	80593	0 %	20 %	40 %	40 %	344205490
51	NC_015947	GCCAT	2	10	81907	81916	20 %	20 %	20 %	40 %	344205491
52	NC_015947	TGGCC	2	10	82539	82548	0 %	20 %	40 %	40 %	344205492
53	NC_015947	GGCTG	2	10	82856	82865	0 %	20 %	60 %	20 %	344205493
54	NC_015947	CTGGC	2	10	83014	83023	0 %	20 %	40 %	40 %	344205493
55	NC_015947	CAGTC	2	10	84703	84712	20 %	20 %	20 %	40 %	344205493
56	NC_015947	CGCTG	2	10	88510	88519	0 %	20 %	40 %	40 %	344205496
57	NC_015947	GCCAG	2	10	89175	89184	20 %	0 %	40 %	40 %	344205497
58	NC_015947	GCCAT	2	10	89804	89813	20 %	20 %	20 %	40 %	344205497
59	NC_015947	GCAGC	2	10	91166	91175	20 %	0 %	40 %	40 %	344205499
60	NC_015947	GTGCA	2	10	91900	91909	20 %	20 %	40 %	20 %	344205500
61	NC_015947	CAGCG	2	10	91998	92007	20 %	0 %	40 %	40 %	344205500
62	NC_015947	CATCG	2	10	93588	93597	20 %	20 %	20 %	40 %	344205501
63	NC_015947	ATCGC	2	10	94405	94414	20 %	20 %	20 %	40 %	344205501
64	NC_015947	CGCAG	2	10	95931	95940	20 %	0 %	40 %	40 %	344205502
65	NC_015947	GGGCA	2	10	96161	96170	20 %	0 %	60 %	20 %	344205502
66	NC_015947	CAGCG	2	10	96720	96729	20 %	0 %	40 %	40 %	344205502
67	NC_015947	ACGGC	2	10	97747	97756	20 %	0 %	40 %	40 %	344205504
68	NC_015947	CTCAC	2	10	101991	102000	20 %	20 %	0 %	60 %	344205507
69	NC_015947	GCGCG	2	10	106243	106252	0 %	0 %	60 %	40 %	344205510
70	NC_015947	ATCGC	2	10	106529	106538	20 %	20 %	20 %	40 %	344205510
71	NC_015947	GCCCA	2	10	108575	108584	20 %	0 %	20 %	60 %	344205510
72	NC_015947	CGGGC	2	10	109805	109814	0 %	0 %	60 %	40 %	344205511
73	NC_015947	GTGCT	2	10	112977	112986	0 %	40 %	40 %	20 %	344205514
74	NC_015947	GGCGC	2	10	113316	113325	0 %	0 %	60 %	40 %	344205515
75	NC_015947	CGGCC	2	10	113358	113367	0 %	0 %	40 %	60 %	344205515
76	NC_015947	ATGGA	2	10	113840	113849	40 %	20 %	40 %	0 %	344205515
77	NC_015947	CGCGG	2	10	114292	114301	0 %	0 %	60 %	40 %	344205516
78	NC_015947	GTGCT	2	10	114456	114465	0 %	40 %	40 %	20 %	344205516
79	NC_015947	CCCGA	2	10	115212	115221	20 %	0 %	20 %	60 %	344205516
80	NC_015947	GCCCG	2	10	115820	115829	0 %	0 %	40 %	60 %	344205516
81	NC_015947	AAGGC	2	10	117000	117009	40 %	0 %	40 %	20 %	344205518
82	NC_015947	CGGCG	2	10	117216	117225	0 %	0 %	60 %	40 %	344205518
83	NC_015947	AGCGC	2	10	118786	118795	20 %	0 %	40 %	40 %	344205520
84	NC_015947	GCCCA	2	10	118919	118928	20 %	0 %	20 %	60 %	344205520
85	NC_015947	CCTGG	2	10	120611	120620	0 %	20 %	40 %	40 %	344205521
86	NC_015947	GATCC	2	10	124836	124845	20 %	20 %	20 %	40 %	344205525
87	NC_015947	GCTGG	2	10	126784	126793	0 %	20 %	60 %	20 %	344205527
88	NC_015947	TGATC	2	10	128754	128763	20 %	40 %	20 %	20 %	344205529
89	NC_015947	CTGGC	2	10	128893	128902	0 %	20 %	40 %	40 %	344205529
90	NC_015947	CCGAT	2	10	128906	128915	20 %	20 %	20 %	40 %	344205529
91	NC_015947	GGCGT	2	10	129448	129457	0 %	20 %	60 %	20 %	344205529
92	NC_015947	GACCC	2	10	131003	131012	20 %	0 %	20 %	60 %	344205533
93	NC_015947	GCGCA	2	10	137169	137178	20 %	0 %	40 %	40 %	344205539
94	NC_015947	TTCAG	2	10	138409	138418	20 %	40 %	20 %	20 %	344205540
95	NC_015947	TGCGC	2	10	139005	139014	0 %	20 %	40 %	40 %	344205540
96	NC_015947	CGGGG	2	10	139267	139276	0 %	0 %	80 %	20 %	344205540
97	NC_015947	GCGTG	2	10	139426	139435	0 %	20 %	60 %	20 %	344205541
98	NC_015947	GCTGC	2	10	139922	139931	0 %	20 %	40 %	40 %	344205541
99	NC_015947	CGTGC	2	10	140036	140045	0 %	20 %	40 %	40 %	344205541
100	NC_015947	CGGCG	2	10	140101	140110	0 %	0 %	60 %	40 %	344205541
101	NC_015947	GCACG	2	10	142380	142389	20 %	0 %	40 %	40 %	344205546
102	NC_015947	ATCGC	2	10	143678	143687	20 %	20 %	20 %	40 %	344205547
103	NC_015947	CACGC	2	10	143769	143778	20 %	0 %	20 %	60 %	344205547
104	NC_015947	GGGCG	2	10	143857	143866	0 %	0 %	80 %	20 %	344205547
105	NC_015947	GCCGA	2	10	144516	144525	20 %	0 %	40 %	40 %	344205549
106	NC_015947	CGCGA	2	10	146813	146822	20 %	0 %	40 %	40 %	344205553
107	NC_015947	CGGCG	2	10	148042	148051	0 %	0 %	60 %	40 %	344205553
108	NC_015947	CGATG	2	10	153446	153455	20 %	20 %	40 %	20 %	344205555
109	NC_015947	CCGAA	2	10	154806	154815	40 %	0 %	20 %	40 %	344205557
110	NC_015947	GCCGC	2	10	154826	154835	0 %	0 %	40 %	60 %	344205557
111	NC_015947	GCGCG	2	10	156664	156673	0 %	0 %	60 %	40 %	344205559
112	NC_015947	CGCGT	2	10	157172	157181	0 %	20 %	40 %	40 %	344205560
113	NC_015947	GGCAG	2	10	160753	160762	20 %	0 %	60 %	20 %	344205565
114	NC_015947	GCCAC	2	10	160795	160804	20 %	0 %	20 %	60 %	344205565
115	NC_015947	CTGGT	2	10	162528	162537	0 %	40 %	40 %	20 %	344205566
116	NC_015947	GCCAC	2	10	163851	163860	20 %	0 %	20 %	60 %	344205567
117	NC_015947	GATCG	2	10	164134	164143	20 %	20 %	40 %	20 %	344205567
118	NC_015947	GATCA	2	10	164152	164161	40 %	20 %	20 %	20 %	344205567
119	NC_015947	CCGCG	2	10	164493	164502	0 %	0 %	40 %	60 %	344205567
120	NC_015947	GCCAC	2	10	165072	165081	20 %	0 %	20 %	60 %	344205568
121	NC_015947	CGGGT	2	10	167233	167242	0 %	20 %	60 %	20 %	344205569
122	NC_015947	TCGAT	2	10	169287	169296	20 %	40 %	20 %	20 %	344205571
123	NC_015947	GGACT	2	10	169707	169716	20 %	20 %	40 %	20 %	344205572
124	NC_015947	TGGCC	2	10	170361	170370	0 %	20 %	40 %	40 %	344205572
125	NC_015947	GGCGC	2	10	173175	173184	0 %	0 %	60 %	40 %	344205573
126	NC_015947	CGGCG	2	10	173219	173228	0 %	0 %	60 %	40 %	344205573
127	NC_015947	GGCTG	2	10	173737	173746	0 %	20 %	60 %	20 %	344205574
128	NC_015947	CACCG	2	10	174977	174986	20 %	0 %	20 %	60 %	344205574
129	NC_015947	GGTGC	2	10	181198	181207	0 %	20 %	60 %	20 %	344205578
130	NC_015947	CCGGC	2	10	181427	181436	0 %	0 %	40 %	60 %	344205578
131	NC_015947	TGGGC	2	10	183175	183184	0 %	20 %	60 %	20 %	344205580
132	NC_015947	CGGCC	2	10	183308	183317	0 %	0 %	40 %	60 %	344205580
133	NC_015947	ATCGC	2	10	183373	183382	20 %	20 %	20 %	40 %	344205580
134	NC_015947	GCGCC	2	10	184112	184121	0 %	0 %	40 %	60 %	344205581
135	NC_015947	GCTGC	2	10	184326	184335	0 %	20 %	40 %	40 %	344205581
136	NC_015947	GGCCG	2	10	186251	186260	0 %	0 %	60 %	40 %	344205583
137	NC_015947	TGCGC	2	10	192350	192359	0 %	20 %	40 %	40 %	344205589
138	NC_015947	GGCGA	2	10	200290	200299	20 %	0 %	60 %	20 %	344205598
139	NC_015947	TGGCA	2	10	200393	200402	20 %	20 %	40 %	20 %	344205598
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149	NC_015947	CATGC	2	10	218355	218364	20 %	20 %	20 %	40 %	344205612
150	NC_015947	GCGCC	2	10	220230	220239	0 %	0 %	40 %	60 %	344205614
151	NC_015947	GGCCG	2	10	220242	220251	0 %	0 %	60 %	40 %	344205614
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156	NC_015947	GGCCG	2	10	223625	223634	0 %	0 %	60 %	40 %	344205618
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158	NC_015947	GCGAT	2	10	225180	225189	20 %	20 %	40 %	20 %	344205620
159	NC_015947	CCGGC	2	10	225988	225997	0 %	0 %	40 %	60 %	344205621
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161	NC_015947	GCCCG	2	10	226316	226325	0 %	0 %	40 %	60 %	344205621
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169	NC_015947	CTGCG	2	10	237952	237961	0 %	20 %	40 %	40 %	344205630
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247	NC_015947	GGCCA	2	10	341863	341872	20 %	0 %	40 %	40 %	344205728
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250	NC_015947	GTCGC	2	10	344161	344170	0 %	20 %	40 %	40 %	344205730
251	NC_015947	CCTGC	2	10	344412	344421	0 %	20 %	20 %	60 %	344205730
252	NC_015947	GCACC	2	10	345387	345396	20 %	0 %	20 %	60 %	344205731
253	NC_015947	GGCAT	2	10	346514	346523	20 %	20 %	40 %	20 %	344205732
254	NC_015947	ATCGC	2	10	346628	346637	20 %	20 %	20 %	40 %	344205732
255	NC_015947	GCCAA	2	10	347164	347173	40 %	0 %	20 %	40 %	344205733
256	NC_015947	GCCGC	3	15	347574	347588	0 %	0 %	40 %	60 %	344205733
257	NC_015947	GGCCA	2	10	347797	347806	20 %	0 %	40 %	40 %	344205733
258	NC_015947	GGCGT	2	10	348409	348418	0 %	20 %	60 %	20 %	344205733
259	NC_015947	CGCCA	2	10	348810	348819	20 %	0 %	20 %	60 %	344205733
260	NC_015947	GCCGA	2	10	350342	350351	20 %	0 %	40 %	40 %	344205735
261	NC_015947	GCGCC	2	10	352461	352470	0 %	0 %	40 %	60 %	344205735
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