MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 13363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015947	GGCG	2	8	84	91	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015947	CCAT	2	8	109	116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015947	GATG	2	8	187	194	25 %	25 %	50 %	0 %	344205422
4	NC_015947	GTCG	2	8	985	992	0 %	25 %	50 %	25 %	344205422
5	NC_015947	CCGC	2	8	1146	1153	0 %	0 %	25 %	75 %	344205422
6	NC_015947	CGCT	2	8	1316	1323	0 %	25 %	25 %	50 %	344205422
7	NC_015947	TGCC	2	8	1432	1439	0 %	25 %	25 %	50 %	344205422
8	NC_015947	TTTA	2	8	1688	1695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015947	CCCG	2	8	2002	2009	0 %	0 %	25 %	75 %	344205423
10	NC_015947	GCAG	2	8	2088	2095	25 %	0 %	50 %	25 %	344205423
11	NC_015947	CAGC	2	8	3173	3180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015947	CCAC	2	8	3671	3678	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015947	CCAG	2	8	3948	3955	25 %	0 %	25 %	50 %	344205424
14	NC_015947	GGCC	2	8	4146	4153	0 %	0 %	50 %	50 %	344205424
15	NC_015947	TCGG	2	8	4645	4652	0 %	25 %	50 %	25 %	344205424
16	NC_015947	GCCT	2	8	4741	4748	0 %	25 %	25 %	50 %	344205424
17	NC_015947	CACC	2	8	4833	4840	25 %	0 %	0 %	75 %	344205424
18	NC_015947	TCGA	2	8	5258	5265	25 %	25 %	25 %	25 %	344205425
19	NC_015947	GGCC	2	8	5275	5282	0 %	0 %	50 %	50 %	344205425
20	NC_015947	CCAG	2	8	6138	6145	25 %	0 %	25 %	50 %	344205425
21	NC_015947	CGAA	2	8	6234	6241	50 %	0 %	25 %	25 %	344205425
22	NC_015947	TCGA	2	8	7274	7281	25 %	25 %	25 %	25 %	344205425
23	NC_015947	CCTT	2	8	8059	8066	0 %	50 %	0 %	50 %	344205426
24	NC_015947	CTGG	2	8	8237	8244	0 %	25 %	50 %	25 %	344205426
25	NC_015947	GCTG	2	8	8899	8906	0 %	25 %	50 %	25 %	344205427
26	NC_015947	CCAC	2	8	9234	9241	25 %	0 %	0 %	75 %	344205427
27	NC_015947	TCGA	2	8	9463	9470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015947	CGAT	2	8	10494	10501	25 %	25 %	25 %	25 %	344205428
29	NC_015947	ACCT	2	8	10541	10548	25 %	25 %	0 %	50 %	344205428
30	NC_015947	AAGT	2	8	10667	10674	50 %	25 %	25 %	0 %	344205428
31	NC_015947	TCGA	2	8	11203	11210	25 %	25 %	25 %	25 %	344205429
32	NC_015947	TCGA	2	8	12152	12159	25 %	25 %	25 %	25 %	344205430
33	NC_015947	GGTG	2	8	12175	12182	0 %	25 %	75 %	0 %	344205430
34	NC_015947	AGTA	2	8	12367	12374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015947	ACCA	2	8	13125	13132	50 %	0 %	0 %	50 %	344205432
36	NC_015947	CTGG	2	8	13770	13777	0 %	25 %	50 %	25 %	344205433
37	NC_015947	GCAC	2	8	14069	14076	25 %	0 %	25 %	50 %	344205433
38	NC_015947	CGCC	2	8	14277	14284	0 %	0 %	25 %	75 %	344205433
39	NC_015947	GGCC	2	8	14288	14295	0 %	0 %	50 %	50 %	344205433
40	NC_015947	CCAT	2	8	14369	14376	25 %	25 %	0 %	50 %	344205433
41	NC_015947	GGCC	2	8	14796	14803	0 %	0 %	50 %	50 %	344205433
42	NC_015947	GCCT	2	8	15275	15282	0 %	25 %	25 %	50 %	344205435
43	NC_015947	CGGC	2	8	15467	15474	0 %	0 %	50 %	50 %	344205435
44	NC_015947	GCAG	2	8	15634	15641	25 %	0 %	50 %	25 %	344205435
45	NC_015947	GTGC	2	8	16168	16175	0 %	25 %	50 %	25 %	344205436
46	NC_015947	CGGT	2	8	16706	16713	0 %	25 %	50 %	25 %	344205436
47	NC_015947	CTGG	2	8	16854	16861	0 %	25 %	50 %	25 %	344205436
48	NC_015947	GTTC	2	8	17987	17994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015947	ACTG	2	8	18026	18033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015947	GCAG	2	8	19627	19634	25 %	0 %	50 %	25 %	344205439
51	NC_015947	CCTT	2	8	20441	20448	0 %	50 %	0 %	50 %	344205440
52	NC_015947	TGCT	2	8	20672	20679	0 %	50 %	25 %	25 %	344205440
53	NC_015947	GGCT	2	8	20843	20850	0 %	25 %	50 %	25 %	344205440
54	NC_015947	CGGC	2	8	21080	21087	0 %	0 %	50 %	50 %	344205440
55	NC_015947	CGTG	2	8	21188	21195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015947	CCTT	2	8	21242	21249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015947	CCAT	2	8	21298	21305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015947	TCGG	2	8	21312	21319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015947	GTGG	2	8	21805	21812	0 %	25 %	75 %	0 %	344205441
60	NC_015947	GCCG	2	8	22252	22259	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
61	NC_015947	CGGC	2	8	22394	22401	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
62	NC_015947	ATCG	2	8	22468	22475	25 %	25 %	25 %	25 %	344205441
63	NC_015947	GCGT	2	8	22818	22825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015947	ACCG	2	8	22932	22939	25 %	0 %	25 %	50 %	344205442
65	NC_015947	GCCA	2	8	23002	23009	25 %	0 %	25 %	50 %	344205442
66	NC_015947	GCCG	2	8	23029	23036	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
67	NC_015947	GCCG	2	8	23422	23429	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
68	NC_015947	TGGC	2	8	23472	23479	0 %	25 %	50 %	25 %	344205442
69	NC_015947	GATC	2	8	23826	23833	25 %	25 %	25 %	25 %	344205442
70	NC_015947	GCCG	3	12	23887	23898	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
71	NC_015947	GCAC	2	8	24360	24367	25 %	0 %	25 %	50 %	344205442
72	NC_015947	GCCG	2	8	24952	24959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015947	CGGC	2	8	25006	25013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015947	CCGT	2	8	25601	25608	0 %	25 %	25 %	50 %	344205444
75	NC_015947	CGGC	2	8	26024	26031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015947	GCCC	2	8	26134	26141	0 %	0 %	25 %	75 %	344205445
77	NC_015947	TCGT	2	8	26413	26420	0 %	50 %	25 %	25 %	344205445
78	NC_015947	GCAC	2	8	27133	27140	25 %	0 %	25 %	50 %	344205446
79	NC_015947	GCCG	2	8	27627	27634	0 %	0 %	50 %	50 %	344205446
80	NC_015947	CACG	2	8	27635	27642	25 %	0 %	25 %	50 %	344205446
81	NC_015947	AGCA	2	8	28213	28220	50 %	0 %	25 %	25 %	344205446
82	NC_015947	GGGT	2	8	28328	28335	0 %	25 %	75 %	0 %	344205446
83	NC_015947	GCTG	2	8	28514	28521	0 %	25 %	50 %	25 %	344205446
84	NC_015947	AAGG	2	8	28564	28571	50 %	0 %	50 %	0 %	344205446
85	NC_015947	TGCA	2	8	28874	28881	25 %	25 %	25 %	25 %	344205446
86	NC_015947	GGCT	2	8	29181	29188	0 %	25 %	50 %	25 %	344205446
87	NC_015947	GCCG	2	8	29531	29538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015947	CGGC	2	8	29578	29585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015947	CAGC	2	8	29898	29905	25 %	0 %	25 %	50 %	344205447
90	NC_015947	GCCG	2	8	30030	30037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015947	CGGC	2	8	30039	30046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015947	GCAT	2	8	30164	30171	25 %	25 %	25 %	25 %	344205448
93	NC_015947	CGGT	2	8	30203	30210	0 %	25 %	50 %	25 %	344205448
94	NC_015947	CACG	2	8	30291	30298	25 %	0 %	25 %	50 %	344205448
95	NC_015947	TCCT	2	8	30458	30465	0 %	50 %	0 %	50 %	344205448
96	NC_015947	CCTT	2	8	30899	30906	0 %	50 %	0 %	50 %	344205448
97	NC_015947	CGCC	2	8	31059	31066	0 %	0 %	25 %	75 %	344205448
98	NC_015947	CACG	2	8	31116	31123	25 %	0 %	25 %	50 %	344205448
99	NC_015947	TTCA	2	8	31801	31808	25 %	50 %	0 %	25 %	344205449
100	NC_015947	CTCC	2	8	32284	32291	0 %	25 %	0 %	75 %	344205450
101	NC_015947	TCCT	2	8	33058	33065	0 %	50 %	0 %	50 %	344205451
102	NC_015947	GCAT	2	8	33327	33334	25 %	25 %	25 %	25 %	344205451
103	NC_015947	GCGG	2	8	33348	33355	0 %	0 %	75 %	25 %	344205451
104	NC_015947	GCCG	2	8	34067	34074	0 %	0 %	50 %	50 %	344205452
105	NC_015947	GGCA	2	8	34714	34721	25 %	0 %	50 %	25 %	344205452
106	NC_015947	GCCT	2	8	35128	35135	0 %	25 %	25 %	50 %	344205453
107	NC_015947	GCTG	2	8	35721	35728	0 %	25 %	50 %	25 %	344205454
108	NC_015947	GTCG	2	8	35848	35855	0 %	25 %	50 %	25 %	344205454
109	NC_015947	CGGC	2	8	36309	36316	0 %	0 %	50 %	50 %	344205454
110	NC_015947	GGAC	2	8	36449	36456	25 %	0 %	50 %	25 %	344205454
111	NC_015947	GCCG	2	8	36633	36640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015947	CGGC	2	8	36693	36700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015947	CGGC	2	8	36815	36822	0 %	0 %	50 %	50 %	344205455
114	NC_015947	AGCG	2	8	37768	37775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015947	CGGC	2	8	37805	37812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015947	GCCG	2	8	38379	38386	0 %	0 %	50 %	50 %	344205456
117	NC_015947	GACC	2	8	38499	38506	25 %	0 %	25 %	50 %	344205456
118	NC_015947	CCGC	2	8	38690	38697	0 %	0 %	25 %	75 %	344205456
119	NC_015947	ACCG	2	8	39205	39212	25 %	0 %	25 %	50 %	344205456
120	NC_015947	ACCA	2	8	40060	40067	50 %	0 %	0 %	50 %	344205456
121	NC_015947	GGCC	2	8	40419	40426	0 %	0 %	50 %	50 %	344205457
122	NC_015947	TGCG	2	8	40449	40456	0 %	25 %	50 %	25 %	344205457
123	NC_015947	GGGC	2	8	41162	41169	0 %	0 %	75 %	25 %	344205457
124	NC_015947	TGCC	2	8	42447	42454	0 %	25 %	25 %	50 %	344205459
125	NC_015947	GGTG	2	8	42778	42785	0 %	25 %	75 %	0 %	344205459
126	NC_015947	GCCG	2	8	44008	44015	0 %	0 %	50 %	50 %	344205460
127	NC_015947	CGGG	2	8	44475	44482	0 %	0 %	75 %	25 %	344205460
128	NC_015947	GTGG	2	8	44863	44870	0 %	25 %	75 %	0 %	344205461
129	NC_015947	CGGC	2	8	45168	45175	0 %	0 %	50 %	50 %	344205461
130	NC_015947	GCTG	2	8	45609	45616	0 %	25 %	50 %	25 %	344205461
131	NC_015947	GTGG	2	8	45646	45653	0 %	25 %	75 %	0 %	344205461
132	NC_015947	CCGG	2	8	46866	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	344205463
133	NC_015947	TGCG	2	8	47556	47563	0 %	25 %	50 %	25 %	344205464
134	NC_015947	TGCA	2	8	48210	48217	25 %	25 %	25 %	25 %	344205465
135	NC_015947	CCTC	2	8	48241	48248	0 %	25 %	0 %	75 %	344205465
136	NC_015947	GCCG	2	8	48650	48657	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
137	NC_015947	ACCG	2	8	48699	48706	25 %	0 %	25 %	50 %	344205465
138	NC_015947	AAGG	2	8	48753	48760	50 %	0 %	50 %	0 %	344205465
139	NC_015947	AGCC	2	8	49604	49611	25 %	0 %	25 %	50 %	344205465
140	NC_015947	ACCC	2	8	49996	50003	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_015947	ATGG	2	8	50194	50201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015947	GATC	2	8	50373	50380	25 %	25 %	25 %	25 %	344205466
143	NC_015947	TCCA	2	8	51383	51390	25 %	25 %	0 %	50 %	344205467
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