MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 5489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015947	GGT	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015947	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015947	GTT	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015947	CAC	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015947	CAG	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015947	GTT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015947	TGG	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015947	CGT	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015947	GTG	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015947	GCT	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015947	GCA	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015947	GGC	2	6	9415	9420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015947	CGG	2	6	9456	9461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015947	GCC	2	6	11497	11502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015947	CAC	2	6	11553	11558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015947	GCG	2	6	12343	12348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015947	CGA	2	6	12361	12366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015947	GCG	2	6	14880	14885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015947	ATC	2	6	14886	14891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015947	GGC	2	6	15984	15989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015947	GAC	2	6	17791	17796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015947	ATC	2	6	17804	17809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015947	TCT	2	6	17854	17859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015947	GAA	2	6	17903	17908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015947	TCG	2	6	17962	17967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015947	ATC	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015947	GAC	2	6	18119	18124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015947	CGG	2	6	18131	18136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015947	CGC	2	6	18194	18199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015947	GTC	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015947	TGA	2	6	18269	18274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015947	TTG	2	6	18296	18301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015947	GAA	2	6	18370	18375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015947	GGT	2	6	18484	18489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015947	CCG	2	6	18515	18520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015947	ACG	2	6	18526	18531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015947	CAC	2	6	19221	19226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015947	GGC	2	6	20023	20028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015947	GCC	2	6	20050	20055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015947	GGA	2	6	20104	20109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015947	CGC	2	6	21378	21383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015947	GTT	2	6	21472	21477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015947	GGA	2	6	22710	22715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015947	GCC	3	9	22783	22791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015947	GCC	2	6	22827	22832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015947	GGC	2	6	25037	25042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015947	CAG	2	6	25067	25072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015947	ACC	2	6	26052	26057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015947	CAG	2	6	29550	29555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015947	CGG	2	6	30006	30011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015947	GCC	2	6	30067	30072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015947	CGG	2	6	30101	30106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015947	ATG	2	6	31948	31953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015947	GAA	2	6	32674	32679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015947	GCA	2	6	32725	32730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015947	CAA	2	6	33932	33937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015947	GGC	2	6	33976	33981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015947	TTG	2	6	34968	34973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015947	CCA	2	6	35504	35509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015947	GCG	2	6	37733	37738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015947	CAA	2	6	37837	37842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015947	ACC	2	6	37863	37868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015947	TGC	2	6	40168	40173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015947	GAA	2	6	40185	40190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015947	GTC	2	6	41315	41320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015947	GAC	2	6	42334	42339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015947	GCG	2	6	43550	43555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015947	AGC	2	6	43632	43637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015947	CGC	2	6	44572	44577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015947	CAT	2	6	44605	44610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015947	TGC	2	6	46189	46194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015947	TGG	2	6	46198	46203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015947	GAT	2	6	46316	46321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015947	CGA	2	6	47251	47256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015947	CGG	2	6	47265	47270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015947	GCC	2	6	48112	48117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015947	ATG	2	6	48174	48179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015947	TCC	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015947	GGT	2	6	49920	49925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015947	CCT	2	6	51712	51717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015947	GAA	2	6	51731	51736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015947	GTG	2	6	55156	55161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015947	TGG	2	6	55196	55201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015947	GGC	2	6	55917	55922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015947	CCG	2	6	57669	57674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015947	GGC	2	6	57756	57761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015947	TCA	2	6	57802	57807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015947	CGC	2	6	58773	58778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015947	TCC	2	6	58816	58821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015947	CGG	2	6	58880	58885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015947	GAT	2	6	62934	62939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015947	CCG	2	6	62942	62947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015947	ACC	2	6	62964	62969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015947	GGC	2	6	62976	62981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015947	GCC	2	6	64883	64888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015947	CGG	2	6	64896	64901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015947	AGC	2	6	64907	64912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015947	CAG	2	6	65718	65723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015947	GAA	2	6	65833	65838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015947	CAC	2	6	65863	65868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015947	GTG	2	6	65923	65928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015947	CAC	2	6	66080	66085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015947	TGC	2	6	75603	75608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015947	GCG	2	6	76104	76109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015947	GTG	2	6	77579	77584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015947	GCC	2	6	77628	77633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015947	GCG	2	6	77661	77666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015947	GCC	2	6	77670	77675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015947	GAG	2	6	77718	77723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015947	GCG	2	6	78860	78865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015947	GCA	2	6	82252	82257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015947	GGT	2	6	82333	82338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015947	TCG	2	6	82348	82353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015947	GTC	2	6	82385	82390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015947	GTG	2	6	82424	82429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015947	GGT	2	6	84897	84902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015947	TGG	2	6	85294	85299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015947	CAC	2	6	88900	88905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015947	TTC	2	6	90246	90251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015947	AGT	2	6	90271	90276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015947	CAC	2	6	90296	90301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015947	TGC	2	6	90953	90958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015947	GGT	2	6	98723	98728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015947	GCT	2	6	102432	102437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015947	CGC	2	6	104337	104342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015947	CGG	2	6	104715	104720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015947	AGT	2	6	105415	105420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015947	CGG	2	6	109226	109231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015947	AGC	2	6	109248	109253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015947	CGG	2	6	109281	109286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015947	AGC	2	6	110310	110315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015947	GCC	2	6	110514	110519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015947	CAC	2	6	112110	112115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015947	GAA	2	6	121222	121227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015947	GGC	2	6	121229	121234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015947	GCC	2	6	121241	121246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015947	GAA	2	6	121795	121800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015947	GCC	2	6	121814	121819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015947	CAG	2	6	123716	123721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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