MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015945	CAATT	2	10	1548	1557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015945	AGTTA	2	10	3663	3672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015945	AATTT	2	10	11477	11486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015945	ATTTT	2	10	21241	21250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015945	CAATT	2	10	21914	21923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015945	CAATT	2	10	22637	22646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015945	CAAAA	2	10	22733	22742	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015945	TGTCT	2	10	32388	32397	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015945	TAAAC	2	10	44860	44869	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015945	ACTTT	2	10	51108	51117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015945	TTTAA	2	10	55970	55979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015945	TTGAT	2	10	75942	75951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015945	TTGAG	2	10	78495	78504	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015945	ATTTT	2	10	113950	113959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015945	AGTTT	2	10	119183	119192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015945	CGTAT	2	10	122189	122198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015945	CATTT	2	10	122212	122221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015945	TGGTT	2	10	130363	130372	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015945	CAATA	2	10	134020	134029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015945	AGAAA	2	10	134167	134176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015945	ATTGA	2	10	139266	139275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015945	TTAAT	2	10	152478	152487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015945	TAAAA	2	10	166407	166416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015945	CTTGC	2	10	177494	177503	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015945	TTTCT	2	10	183770	183779	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015945	AATCC	2	10	194005	194014	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015945	CTTTT	2	10	194995	195004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015945	AAAGG	2	10	196192	196201	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015945	TTTTA	2	10	196232	196241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015945	ATTGA	2	10	196390	196399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015945	ATTTT	2	10	220071	220080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015945	CATTT	2	10	243882	243891	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015945	CATCT	2	10	273687	273696	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015945	TATAT	2	10	275334	275343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015945	TTTTA	2	10	311902	311911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015945	AAAAG	2	10	325403	325412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015945	TTTTC	2	10	326019	326028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015945	AACAA	2	10	331522	331531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015945	TTTAT	2	10	363771	363780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015945	ATTTC	2	10	365346	365355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015945	ACTTC	2	10	374950	374959	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015945	CTAAA	2	10	395674	395683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015945	TTTTA	2	10	402771	402780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015945	TTGAT	2	10	423354	423363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015945	ACTAA	2	10	446934	446943	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015945	GGATA	2	10	457276	457285	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015945	GCAAG	2	10	460489	460498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015945	TACTT	2	10	461804	461813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015945	TTTTG	2	10	474593	474602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015945	TCCTT	2	10	478323	478332	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015945	AAAAT	2	10	508470	508479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015945	TTTAA	2	10	509732	509741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015945	TTGAA	2	10	524556	524565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015945	ATATT	2	10	530065	530074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015945	CATAT	2	10	538470	538479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015945	CAAAA	2	10	542933	542942	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015945	TCAAT	2	10	544438	544447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015945	CGGCA	2	10	544622	544631	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015945	AAAAC	2	10	592540	592549	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015945	TAAAA	2	10	610022	610031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015945	TTTGA	2	10	632942	632951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015945	ATATT	2	10	671365	671374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015945	ATCCT	2	10	671513	671522	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015945	AAAGT	2	10	677689	677698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015945	AACAA	2	10	679087	679096	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015945	AAAAT	2	10	705317	705326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015945	AAAAC	2	10	710361	710370	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015945	TTCTG	2	10	725389	725398	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015945	TAATA	2	10	752980	752989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015945	ATTCA	2	10	754217	754226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015945	AAAGA	2	10	766813	766822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015945	AGAGA	2	10	768063	768072	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015945	AAACC	2	10	769160	769169	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015945	AGAGA	2	10	775354	775363	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015945	TGTAT	2	10	779501	779510	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015945	AAGTT	2	10	789587	789596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015945	AATTT	2	10	792903	792912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015945	GCAAA	2	10	793652	793661	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015945	GATTT	2	10	798586	798595	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015945	GTTTT	2	10	801045	801054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015945	ATCAA	2	10	801178	801187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015945	GTTTT	2	10	801247	801256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015945	TAACA	2	10	813797	813806	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015945	TCCCG	2	10	815335	815344	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_015945	TACGG	2	10	816430	816439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015945	TTCAG	2	10	817831	817840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015945	TTCTA	2	10	818055	818064	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015945	CAAGG	2	10	840713	840722	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015945	TTTAA	2	10	845720	845729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015945	AAAGA	2	10	851926	851935	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015945	TGTAC	2	10	851980	851989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015945	TAAAA	2	10	855296	855305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015945	TGTTA	2	10	859080	859089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015945	TACGA	2	10	859162	859171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015945	ATTTT	2	10	859208	859217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015945	TGTAT	2	10	861359	861368	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015945	ACATC	2	10	864539	864548	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015945	GGTTA	2	10	867408	867417	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015945	TGCCG	2	10	887681	887690	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015945	AGTCC	2	10	892237	892246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015945	CAAAC	2	10	909402	909411	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015945	ATTTG	2	10	916530	916539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015945	GTTTT	2	10	916540	916549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015945	ATTTA	2	10	918813	918822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015945	ACGAT	2	10	948712	948721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015945	AATTT	2	10	956410	956419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015945	TTTTG	2	10	985500	985509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015945	TATCT	2	10	986745	986754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015945	CTTTT	2	10	1006089	1006098	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015945	TAAAA	2	10	1013300	1013309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015945	AGTAT	2	10	1024863	1024872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015945	TTTGG	2	10	1034902	1034911	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015945	CTTTT	2	10	1043008	1043017	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015945	TAACC	2	10	1043018	1043027	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015945	TTAGT	2	10	1072059	1072068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015945	ATTGA	2	10	1083201	1083210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015945	TAAAA	2	10	1101629	1101638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015945	AAACA	2	10	1103825	1103834	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015945	TAAAA	2	10	1126438	1126447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015945	ATCAA	2	10	1135524	1135533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015945	AAGAA	2	10	1144321	1144330	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015945	ATGTT	2	10	1151694	1151703	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015945	CGTTC	2	10	1162454	1162463	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015945	CTGGT	2	10	1162475	1162484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015945	AAAAT	2	10	1186253	1186262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015945	AAACT	2	10	1197563	1197572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015945	AATGA	2	10	1212087	1212096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015945	GGTTT	2	10	1230150	1230159	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015945	ATTAT	2	10	1241370	1241379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015945	ATTTT	2	10	1263032	1263041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015945	TTTAG	2	10	1269946	1269955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015945	AACTT	2	10	1273231	1273240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015945	TGTTT	2	10	1273384	1273393	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015945	TGGAT	2	10	1273527	1273536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015945	ACTAT	2	10	1289053	1289062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015945	TTTCT	2	10	1304542	1304551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015945	TTTTG	2	10	1330545	1330554	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015945	TTGAT	2	10	1341926	1341935	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015945	TTTTG	2	10	1346488	1346497	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015945	AAATA	2	10	1352353	1352362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015945	CTTTT	2	10	1370502	1370511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015945	AGAGA	2	10	1371662	1371671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015945	TGAGC	2	10	1394820	1394829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015945	ATCAA	2	10	1407784	1407793	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015945	ATTTT	2	10	1412442	1412451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015945	TTCCT	2	10	1428720	1428729	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_015945	AATAA	2	10	1958267	1958276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015945	TATAG	2	10	2859983	2859992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015945	TTAAA	2	10	2870549	2870558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015945	TTAGG	2	10	2878563	2878572	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_015945	GCAGG	2	10	3811816	3811825	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.