MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 41342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015945	AAC	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
2	NC_015945	GAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
3	NC_015945	TAA	2	6	371	376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201338
4	NC_015945	CAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
5	NC_015945	ATT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
6	NC_015945	TGG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201338
7	NC_015945	CAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
8	NC_015945	TTA	2	6	826	831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
9	NC_015945	TGA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201338
10	NC_015945	GAA	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
11	NC_015945	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
12	NC_015945	TAT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
13	NC_015945	ATT	2	6	1149	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
14	NC_015945	CAA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
15	NC_015945	AGT	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201338
16	NC_015945	GAA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
17	NC_015945	CTT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201338
18	NC_015945	CCG	2	6	1823	1828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201339
19	NC_015945	CCA	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201339
20	NC_015945	CAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201339
21	NC_015945	AGG	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201339
22	NC_015945	ATT	3	9	2037	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201339
23	NC_015945	AAG	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201339
24	NC_015945	TTA	2	6	2085	2090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201339
25	NC_015945	TGG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201339
26	NC_015945	TGA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201339
27	NC_015945	AAT	2	6	2124	2129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201339
28	NC_015945	TTG	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201340
29	NC_015945	AGA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201340
30	NC_015945	TAT	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201340
31	NC_015945	TGG	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201340
32	NC_015945	CTC	2	6	2560	2565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201340
33	NC_015945	ATG	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201340
34	NC_015945	AAC	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201340
35	NC_015945	TCC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201340
36	NC_015945	CTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201341
37	NC_015945	TAC	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201341
38	NC_015945	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201341
39	NC_015945	ACC	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201341
40	NC_015945	TAC	3	9	3287	3295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201341
41	NC_015945	AGG	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201341
42	NC_015945	AAG	2	6	3429	3434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201341
43	NC_015945	TTC	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201341
44	NC_015945	GTA	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201341
45	NC_015945	TAT	2	6	3752	3757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201342
46	NC_015945	TCA	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201342
47	NC_015945	TTG	2	6	3769	3774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201342
48	NC_015945	CAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201342
49	NC_015945	TCA	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201342
50	NC_015945	AGA	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201342
51	NC_015945	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201342
52	NC_015945	GTT	3	9	4513	4521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201342
53	NC_015945	CAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201342
54	NC_015945	TCA	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201342
55	NC_015945	TTA	2	6	4685	4690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201342
56	NC_015945	CAA	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201342
57	NC_015945	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201343
58	NC_015945	TCT	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201343
59	NC_015945	TCT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201343
60	NC_015945	ATC	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201343
61	NC_015945	TGA	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201343
62	NC_015945	GTT	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201343
63	NC_015945	CTC	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201344
64	NC_015945	CTT	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201344
65	NC_015945	TTC	2	6	5648	5653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201344
66	NC_015945	TGG	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201344
67	NC_015945	ATC	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201344
68	NC_015945	AAT	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201344
69	NC_015945	CCA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201344
70	NC_015945	TCC	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201344
71	NC_015945	TAC	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201344
72	NC_015945	AAG	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201344
73	NC_015945	AAT	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201344
74	NC_015945	GAA	2	6	6228	6233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201345
75	NC_015945	ATT	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201345
76	NC_015945	ACC	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201345
77	NC_015945	GGC	2	6	6417	6422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201345
78	NC_015945	GGT	2	6	6441	6446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201345
79	NC_015945	CAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201345
80	NC_015945	TTA	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201345
81	NC_015945	CAA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201345
82	NC_015945	AAT	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201345
83	NC_015945	TGC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201345
84	NC_015945	GTG	3	9	6902	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201345
85	NC_015945	GTG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201345
86	NC_015945	CTG	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201345
87	NC_015945	AGC	2	6	7098	7103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201345
88	NC_015945	GAA	3	9	7153	7161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201345
89	NC_015945	GAT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201345
90	NC_015945	TCA	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201345
91	NC_015945	ACA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201345
92	NC_015945	TTC	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201345
93	NC_015945	CTT	2	6	7367	7372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201345
94	NC_015945	AGA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201345
95	NC_015945	ATT	2	6	7486	7491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201345
96	NC_015945	ACC	2	6	7814	7819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201346
97	NC_015945	AAT	2	6	7831	7836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201346
98	NC_015945	GGT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
99	NC_015945	TGG	2	6	8181	8186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
100	NC_015945	GTT	2	6	8240	8245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201346
101	NC_015945	AAG	2	6	8265	8270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201346
102	NC_015945	AGC	2	6	8284	8289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201346
103	NC_015945	CTT	2	6	8291	8296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201346
104	NC_015945	GAA	2	6	8345	8350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201346
105	NC_015945	TTA	2	6	8364	8369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201346
106	NC_015945	ACA	2	6	8478	8483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201346
107	NC_015945	AAG	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201346
108	NC_015945	CAC	2	6	8629	8634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201346
109	NC_015945	TGG	2	6	8733	8738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
110	NC_015945	ACA	2	6	8739	8744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201346
111	NC_015945	CGC	2	6	8759	8764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201346
112	NC_015945	TGC	3	9	8770	8778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201346
113	NC_015945	CAT	2	6	8950	8955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201346
114	NC_015945	TGG	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
115	NC_015945	CAC	2	6	9040	9045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201346
116	NC_015945	TAT	2	6	9194	9199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201346
117	NC_015945	GTG	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
118	NC_015945	CTT	2	6	9356	9361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201347
119	NC_015945	AAG	2	6	9373	9378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201347
120	NC_015945	ATA	2	6	9400	9405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201347
121	NC_015945	GAA	2	6	9423	9428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201347
122	NC_015945	AGA	2	6	9593	9598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201347
123	NC_015945	ACC	2	6	9621	9626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201347
124	NC_015945	GAA	2	6	9648	9653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201347
125	NC_015945	TAT	2	6	9709	9714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201347
126	NC_015945	CAT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201347
127	NC_015945	TTA	2	6	9732	9737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201347
128	NC_015945	TTG	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201347
129	NC_015945	CAA	2	6	9789	9794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201347
130	NC_015945	GAC	2	6	10349	10354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201348
131	NC_015945	GGA	2	6	10364	10369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201348
132	NC_015945	ATG	2	6	10385	10390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201348
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135	NC_015945	ATG	2	6	10680	10685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201348
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152	NC_015945	CTT	2	6	12046	12051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201351
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253	NC_015945	TCT	2	6	22381	22386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201361
254	NC_015945	TAT	2	6	22791	22796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201362
255	NC_015945	TGA	2	6	22903	22908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201362
256	NC_015945	CTT	2	6	22930	22935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201362
257	NC_015945	AGC	3	9	22943	22951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201362
258	NC_015945	AAC	2	6	22977	22982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201362
259	NC_015945	AGC	2	6	23003	23008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201362
260	NC_015945	TGG	2	6	23047	23052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201362
261	NC_015945	TCA	2	6	23055	23060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201362
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499	NC_015945	AAG	2	6	43842	43847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201385
500	NC_015945	CTT	2	6	43869	43874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201385

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