MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 1100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	GCGA	2	8	489	496	25 %	0 %	50 %	25 %	344209943
2	NC_015944	GATC	2	8	999	1006	25 %	25 %	25 %	25 %	344209943
3	NC_015944	TTCT	2	8	1787	1794	0 %	75 %	0 %	25 %	344209944
4	NC_015944	CCCG	2	8	3304	3311	0 %	0 %	25 %	75 %	344209946
5	NC_015944	TACA	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015944	GTAC	2	8	4588	4595	25 %	25 %	25 %	25 %	344209947
7	NC_015944	CTCA	2	8	5450	5457	25 %	25 %	0 %	50 %	344209947
8	NC_015944	AGGC	2	8	5626	5633	25 %	0 %	50 %	25 %	344209947
9	NC_015944	TGGC	2	8	5719	5726	0 %	25 %	50 %	25 %	344209947
10	NC_015944	TGGT	2	8	6091	6098	0 %	50 %	50 %	0 %	344209947
11	NC_015944	CGAC	2	8	6301	6308	25 %	0 %	25 %	50 %	344209948
12	NC_015944	CGCC	2	8	7457	7464	0 %	0 %	25 %	75 %	344209948
13	NC_015944	CGAG	2	8	7618	7625	25 %	0 %	50 %	25 %	344209948
14	NC_015944	ACCC	2	8	7759	7766	25 %	0 %	0 %	75 %	344209948
15	NC_015944	TTCG	2	8	8561	8568	0 %	50 %	25 %	25 %	344209948
16	NC_015944	CTGT	2	8	8810	8817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015944	CAGT	2	8	9677	9684	25 %	25 %	25 %	25 %	344209950
18	NC_015944	GTCG	2	8	9829	9836	0 %	25 %	50 %	25 %	344209950
19	NC_015944	CGAC	2	8	11183	11190	25 %	0 %	25 %	50 %	344209951
20	NC_015944	CGAC	2	8	12112	12119	25 %	0 %	25 %	50 %	344209952
21	NC_015944	GTCC	2	8	12682	12689	0 %	25 %	25 %	50 %	344209952
22	NC_015944	TGGG	2	8	12772	12779	0 %	25 %	75 %	0 %	344209952
23	NC_015944	CGCA	2	8	13545	13552	25 %	0 %	25 %	50 %	344209953
24	NC_015944	GGTG	2	8	13599	13606	0 %	25 %	75 %	0 %	344209953
25	NC_015944	TTGC	2	8	14014	14021	0 %	50 %	25 %	25 %	344209953
26	NC_015944	TGTT	2	8	14259	14266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015944	GAGC	2	8	14377	14384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015944	GCCC	2	8	14610	14617	0 %	0 %	25 %	75 %	344209954
29	NC_015944	CCGA	2	8	14993	15000	25 %	0 %	25 %	50 %	344209954
30	NC_015944	GGCA	2	8	15110	15117	25 %	0 %	50 %	25 %	344209954
31	NC_015944	GATA	2	8	15720	15727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015944	TGGG	2	8	16228	16235	0 %	25 %	75 %	0 %	344209955
33	NC_015944	CTTC	2	8	16340	16347	0 %	50 %	0 %	50 %	344209955
34	NC_015944	ACGT	2	8	16404	16411	25 %	25 %	25 %	25 %	344209955
35	NC_015944	TTAG	2	8	16662	16669	25 %	50 %	25 %	0 %	344209955
36	NC_015944	ATGA	2	8	17732	17739	50 %	25 %	25 %	0 %	344209956
37	NC_015944	CGAA	2	8	18020	18027	50 %	0 %	25 %	25 %	344209956
38	NC_015944	GCTC	2	8	18445	18452	0 %	25 %	25 %	50 %	344209956
39	NC_015944	TGAG	2	8	18660	18667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015944	AAAC	2	8	18915	18922	75 %	0 %	0 %	25 %	344209957
41	NC_015944	CGAC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	25 %	50 %	344209957
42	NC_015944	CGAC	2	8	19161	19168	25 %	0 %	25 %	50 %	344209958
43	NC_015944	CAAC	2	8	19293	19300	50 %	0 %	0 %	50 %	344209958
44	NC_015944	GCAA	2	8	19465	19472	50 %	0 %	25 %	25 %	344209958
45	NC_015944	GCCA	2	8	20403	20410	25 %	0 %	25 %	50 %	344209959
46	NC_015944	TCCG	2	8	22026	22033	0 %	25 %	25 %	50 %	344209960
47	NC_015944	TACG	2	8	22158	22165	25 %	25 %	25 %	25 %	344209960
48	NC_015944	CTTG	2	8	23119	23126	0 %	50 %	25 %	25 %	344209961
49	NC_015944	AGCT	2	8	23226	23233	25 %	25 %	25 %	25 %	344209961
50	NC_015944	GATG	2	8	23355	23362	25 %	25 %	50 %	0 %	344209962
51	NC_015944	CAAG	2	8	23436	23443	50 %	0 %	25 %	25 %	344209962
52	NC_015944	GCAA	2	8	23447	23454	50 %	0 %	25 %	25 %	344209962
53	NC_015944	AACT	2	8	23807	23814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015944	GGCG	2	8	24101	24108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015944	TCTA	2	8	24595	24602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015944	TTAA	2	8	24765	24772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015944	ACAA	2	8	24981	24988	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015944	GCTG	2	8	25045	25052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015944	AGCA	2	8	25238	25245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015944	CTTC	2	8	25863	25870	0 %	50 %	0 %	50 %	344209963
61	NC_015944	TCGC	2	8	26383	26390	0 %	25 %	25 %	50 %	344209963
62	NC_015944	GACC	2	8	26854	26861	25 %	0 %	25 %	50 %	344209964
63	NC_015944	GGCA	2	8	27420	27427	25 %	0 %	50 %	25 %	344209964
64	NC_015944	CGCT	2	8	27554	27561	0 %	25 %	25 %	50 %	344209964
65	NC_015944	CGGT	2	8	28707	28714	0 %	25 %	50 %	25 %	344209965
66	NC_015944	TCGT	2	8	28774	28781	0 %	50 %	25 %	25 %	344209965
67	NC_015944	GTCG	2	8	29602	29609	0 %	25 %	50 %	25 %	344209966
68	NC_015944	GCTG	2	8	30300	30307	0 %	25 %	50 %	25 %	344209967
69	NC_015944	CGGA	2	8	30320	30327	25 %	0 %	50 %	25 %	344209967
70	NC_015944	TCGG	2	8	30527	30534	0 %	25 %	50 %	25 %	344209967
71	NC_015944	TCGA	2	8	30650	30657	25 %	25 %	25 %	25 %	344209967
72	NC_015944	GTCT	2	8	31170	31177	0 %	50 %	25 %	25 %	344209968
73	NC_015944	GACG	2	8	31237	31244	25 %	0 %	50 %	25 %	344209968
74	NC_015944	GCTG	2	8	31508	31515	0 %	25 %	50 %	25 %	344209968
75	NC_015944	TCAT	2	8	32542	32549	25 %	50 %	0 %	25 %	344209968
76	NC_015944	CGAG	2	8	33061	33068	25 %	0 %	50 %	25 %	344209969
77	NC_015944	CCCA	2	8	33404	33411	25 %	0 %	0 %	75 %	344209969
78	NC_015944	CGGT	2	8	33873	33880	0 %	25 %	50 %	25 %	344209969
79	NC_015944	TGAC	2	8	33885	33892	25 %	25 %	25 %	25 %	344209969
80	NC_015944	GCCG	2	8	33906	33913	0 %	0 %	50 %	50 %	344209969
81	NC_015944	TACG	2	8	33914	33921	25 %	25 %	25 %	25 %	344209969
82	NC_015944	GTTC	2	8	33942	33949	0 %	50 %	25 %	25 %	344209969
83	NC_015944	GTCG	2	8	34283	34290	0 %	25 %	50 %	25 %	344209969
84	NC_015944	CGGG	2	8	35917	35924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015944	GATC	2	8	36184	36191	25 %	25 %	25 %	25 %	344209971
86	NC_015944	GTGC	2	8	36244	36251	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
87	NC_015944	TCGC	2	8	36324	36331	0 %	25 %	25 %	50 %	344209971
88	NC_015944	TCGG	2	8	36404	36411	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
89	NC_015944	CGGT	2	8	36462	36469	0 %	25 %	50 %	25 %	344209971
90	NC_015944	TCGT	2	8	36992	36999	0 %	50 %	25 %	25 %	344209972
91	NC_015944	CGAC	2	8	37677	37684	25 %	0 %	25 %	50 %	344209972
92	NC_015944	GACA	2	8	37699	37706	50 %	0 %	25 %	25 %	344209972
93	NC_015944	ATCT	2	8	37786	37793	25 %	50 %	0 %	25 %	344209972
94	NC_015944	CTAT	2	8	37862	37869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015944	AGTA	2	8	37903	37910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015944	GACC	2	8	38313	38320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015944	ACGG	2	8	38855	38862	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
98	NC_015944	GCGA	2	8	38876	38883	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
99	NC_015944	GCGA	2	8	38989	38996	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
100	NC_015944	GCTC	2	8	39078	39085	0 %	25 %	25 %	50 %	344209974
101	NC_015944	ACGA	2	8	39449	39456	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
102	NC_015944	ACGA	2	8	39878	39885	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
103	NC_015944	GCCG	2	8	39937	39944	0 %	0 %	50 %	50 %	344209974
104	NC_015944	ACGA	2	8	39950	39957	50 %	0 %	25 %	25 %	344209974
105	NC_015944	CGAC	2	8	40044	40051	25 %	0 %	25 %	50 %	344209974
106	NC_015944	GATC	2	8	40288	40295	25 %	25 %	25 %	25 %	344209974
107	NC_015944	CTGA	2	8	40352	40359	25 %	25 %	25 %	25 %	344209974
108	NC_015944	GGCA	2	8	40432	40439	25 %	0 %	50 %	25 %	344209974
109	NC_015944	GCCG	2	8	40499	40506	0 %	0 %	50 %	50 %	344209974
110	NC_015944	GGGC	2	8	41985	41992	0 %	0 %	75 %	25 %	344209976
111	NC_015944	GTCG	2	8	42848	42855	0 %	25 %	50 %	25 %	344209976
112	NC_015944	GCGG	2	8	42897	42904	0 %	0 %	75 %	25 %	344209976
113	NC_015944	CGGA	2	8	42919	42926	25 %	0 %	50 %	25 %	344209976
114	NC_015944	ACGG	2	8	43142	43149	25 %	0 %	50 %	25 %	344209977
115	NC_015944	CCGG	2	8	43385	43392	0 %	0 %	50 %	50 %	344209977
116	NC_015944	GAAC	2	8	43849	43856	50 %	0 %	25 %	25 %	344209977
117	NC_015944	TTGG	2	8	44042	44049	0 %	50 %	50 %	0 %	344209977
118	NC_015944	TCCG	2	8	44474	44481	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
119	NC_015944	CGCT	2	8	44849	44856	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
120	NC_015944	GGGT	2	8	45519	45526	0 %	25 %	75 %	0 %	344209977
121	NC_015944	CGAA	2	8	45553	45560	50 %	0 %	25 %	25 %	344209977
122	NC_015944	GTGC	2	8	45643	45650	0 %	25 %	50 %	25 %	344209977
123	NC_015944	CGCC	2	8	46672	46679	0 %	0 %	25 %	75 %	344209977
124	NC_015944	CTCG	2	8	46688	46695	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
125	NC_015944	TCGC	2	8	46700	46707	0 %	25 %	25 %	50 %	344209977
126	NC_015944	CAAG	2	8	46834	46841	50 %	0 %	25 %	25 %	344209977
127	NC_015944	TACA	2	8	46943	46950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015944	CCGT	2	8	47443	47450	0 %	25 %	25 %	50 %	344209978
129	NC_015944	CGTT	2	8	48057	48064	0 %	50 %	25 %	25 %	344209978
130	NC_015944	CGAT	2	8	48907	48914	25 %	25 %	25 %	25 %	344209978
131	NC_015944	GGCT	2	8	49031	49038	0 %	25 %	50 %	25 %	344209978
132	NC_015944	TGGG	2	8	49135	49142	0 %	25 %	75 %	0 %	344209978
133	NC_015944	GGGT	2	8	49257	49264	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015944	ACCC	2	8	49622	49629	25 %	0 %	0 %	75 %	344209979
135	NC_015944	AGTG	2	8	49952	49959	25 %	25 %	50 %	0 %	344209979
136	NC_015944	GAAC	2	8	50047	50054	50 %	0 %	25 %	25 %	344209979
137	NC_015944	GTGG	2	8	51129	51136	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015944	GTAA	2	8	51255	51262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015944	GTCA	2	8	51286	51293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015944	CGAG	2	8	52592	52599	25 %	0 %	50 %	25 %	344209980
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142	NC_015944	CGCT	2	8	54677	54684	0 %	25 %	25 %	50 %	344209983
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