MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 5792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	TCG	2	6	77	82	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209943
2	NC_015944	CAA	2	6	147	152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209943
3	NC_015944	TCT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209943
4	NC_015944	CTG	2	6	188	193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209943
5	NC_015944	GAA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209943
6	NC_015944	AGT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209943
7	NC_015944	CGA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
8	NC_015944	ATC	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209943
9	NC_015944	ACG	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
10	NC_015944	ACG	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
11	NC_015944	ATC	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209943
12	NC_015944	GAC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
13	NC_015944	GAT	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209943
14	NC_015944	CGA	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209943
15	NC_015944	TAG	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209944
16	NC_015944	TCG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209944
17	NC_015944	GTC	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209944
18	NC_015944	GCG	2	6	2460	2465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
19	NC_015944	GGC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
20	NC_015944	CGG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
21	NC_015944	CGA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209945
22	NC_015944	CAG	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209945
23	NC_015944	ACA	2	6	2716	2721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209945
24	NC_015944	GGA	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209945
25	NC_015944	TAC	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209945
26	NC_015944	CGG	3	9	3073	3081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209945
27	NC_015944	CCG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209946
28	NC_015944	TCG	2	6	3187	3192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209946
29	NC_015944	TCA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209946
30	NC_015944	TCG	3	9	3373	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209946
31	NC_015944	TGC	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209946
32	NC_015944	GAT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209947
33	NC_015944	AAC	2	6	4428	4433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
34	NC_015944	AAC	2	6	4439	4444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
35	NC_015944	GAC	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
36	NC_015944	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209947
37	NC_015944	GGC	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
38	NC_015944	TGA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209947
39	NC_015944	CAG	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
40	NC_015944	GTC	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209947
41	NC_015944	CTC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209947
42	NC_015944	CTC	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209947
43	NC_015944	AAC	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
44	NC_015944	ACA	2	6	5271	5276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209947
45	NC_015944	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209947
46	NC_015944	CAG	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
47	NC_015944	CGA	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209947
48	NC_015944	CGG	2	6	5941	5946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
49	NC_015944	GTT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209947
50	NC_015944	GGC	2	6	6123	6128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
51	NC_015944	GTC	2	6	6129	6134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209947
52	NC_015944	GGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209947
53	NC_015944	GTC	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
54	NC_015944	CGG	2	6	6280	6285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209948
55	NC_015944	CGA	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
56	NC_015944	ACG	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
57	NC_015944	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209948
58	NC_015944	ACG	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
59	NC_015944	GAG	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
60	NC_015944	GAC	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
61	NC_015944	TCA	2	6	6774	6779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209948
62	NC_015944	CAG	2	6	6795	6800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
63	NC_015944	TCG	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
64	NC_015944	TGT	2	6	6920	6925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209948
65	NC_015944	TTC	2	6	6936	6941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209948
66	NC_015944	TTA	2	6	6943	6948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209948
67	NC_015944	CTG	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
68	NC_015944	CCG	2	6	7071	7076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209948
69	NC_015944	GAA	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209948
70	NC_015944	CGC	2	6	7235	7240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209948
71	NC_015944	TCC	2	6	7330	7335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209948
72	NC_015944	CGT	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
73	NC_015944	CGG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209948
74	NC_015944	CAC	2	6	7547	7552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209948
75	NC_015944	TCC	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209948
76	NC_015944	GGA	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
77	NC_015944	GAG	2	6	7734	7739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
78	NC_015944	CGG	2	6	7784	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209948
79	NC_015944	TCG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209948
80	NC_015944	TGA	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209948
81	NC_015944	CAG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
82	NC_015944	GAT	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209948
83	NC_015944	GCC	2	6	8262	8267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209948
84	NC_015944	ACG	2	6	8319	8324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209948
85	NC_015944	GGA	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209948
86	NC_015944	GGT	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209948
87	NC_015944	GTA	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209948
88	NC_015944	CAC	3	9	8471	8479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209948
89	NC_015944	TCC	2	6	8584	8589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209948
90	NC_015944	CGA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209949
91	NC_015944	GAC	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209949
92	NC_015944	ACC	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209949
93	NC_015944	CTC	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209949
94	NC_015944	GAG	2	6	9112	9117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209949
95	NC_015944	AGG	2	6	9170	9175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209949
96	NC_015944	ATC	2	6	9220	9225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209949
97	NC_015944	TCG	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209949
98	NC_015944	GCC	2	6	9329	9334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209949
99	NC_015944	AGC	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209949
100	NC_015944	GGA	2	6	9742	9747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209950
101	NC_015944	CCT	2	6	9784	9789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209950
102	NC_015944	CGC	2	6	9871	9876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209950
103	NC_015944	CGA	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209950
104	NC_015944	AGT	2	6	9988	9993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209950
105	NC_015944	CGG	2	6	10011	10016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209950
106	NC_015944	CGT	3	9	10033	10041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
107	NC_015944	TCG	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
108	NC_015944	CGA	2	6	10102	10107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209950
109	NC_015944	CGT	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
110	NC_015944	TCA	2	6	10141	10146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209950
111	NC_015944	CAT	2	6	10189	10194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209950
112	NC_015944	ACG	2	6	10206	10211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209950
113	NC_015944	CGT	2	6	10303	10308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209950
114	NC_015944	TGG	2	6	10922	10927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209951
115	NC_015944	GTT	2	6	10940	10945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209951
116	NC_015944	GAT	2	6	10960	10965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209951
117	NC_015944	GGA	2	6	10966	10971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209951
118	NC_015944	ACC	2	6	10972	10977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209951
119	NC_015944	GAA	2	6	11101	11106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209951
120	NC_015944	CCG	2	6	11177	11182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209951
121	NC_015944	TCC	2	6	11222	11227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209951
122	NC_015944	GAC	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209951
123	NC_015944	GGC	2	6	11265	11270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209951
124	NC_015944	ACG	2	6	11349	11354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209951
125	NC_015944	GAG	2	6	11392	11397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209951
126	NC_015944	TCG	2	6	11411	11416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209951
127	NC_015944	CCT	2	6	11417	11422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209951
128	NC_015944	ACG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209951
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133	NC_015944	CTC	2	6	11770	11775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209951
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249	NC_015944	GGC	2	6	22483	22488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209961
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495	NC_015944	CAG	2	6	43123	43128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209977
496	NC_015944	CCT	2	6	43203	43208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209977
497	NC_015944	CGG	2	6	43253	43258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209977
498	NC_015944	CGT	2	6	43270	43275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209977
499	NC_015944	CCA	2	6	43335	43340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209977
500	NC_015944	CGT	2	6	43469	43474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209977

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