MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	GC	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	344209943
2	NC_015944	CG	3	6	741	746	0 %	0 %	50 %	50 %	344209943
3	NC_015944	AG	3	6	826	831	50 %	0 %	50 %	0 %	344209943
4	NC_015944	CT	3	6	1116	1121	0 %	50 %	0 %	50 %	344209943
5	NC_015944	AT	3	6	1445	1450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015944	CT	3	6	1563	1568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015944	TC	3	6	1589	1594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015944	AT	3	6	1714	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015944	CT	3	6	2203	2208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015944	AC	3	6	2290	2295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015944	AT	3	6	2325	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015944	AG	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	344209945
13	NC_015944	CT	3	6	2915	2920	0 %	50 %	0 %	50 %	344209945
14	NC_015944	TA	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015944	CA	3	6	6728	6733	50 %	0 %	0 %	50 %	344209948
16	NC_015944	CG	3	6	7982	7987	0 %	0 %	50 %	50 %	344209948
17	NC_015944	AC	3	6	9280	9285	50 %	0 %	0 %	50 %	344209949
18	NC_015944	CT	3	6	9445	9450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015944	AC	3	6	9547	9552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015944	CG	3	6	9791	9796	0 %	0 %	50 %	50 %	344209950
21	NC_015944	AC	3	6	10455	10460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015944	AT	3	6	10539	10544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015944	AC	3	6	10820	10825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015944	TC	3	6	11658	11663	0 %	50 %	0 %	50 %	344209951
25	NC_015944	TC	3	6	12937	12942	0 %	50 %	0 %	50 %	344209952
26	NC_015944	GA	3	6	13241	13246	50 %	0 %	50 %	0 %	344209953
27	NC_015944	AC	3	6	14112	14117	50 %	0 %	0 %	50 %	344209953
28	NC_015944	GA	3	6	14267	14272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015944	AC	3	6	15431	15436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015944	AC	3	6	15489	15494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015944	AT	3	6	15961	15966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015944	TG	3	6	16388	16393	0 %	50 %	50 %	0 %	344209955
33	NC_015944	CT	3	6	16835	16840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015944	TG	3	6	18514	18519	0 %	50 %	50 %	0 %	344209956
35	NC_015944	TC	3	6	18601	18606	0 %	50 %	0 %	50 %	344209956
36	NC_015944	TA	3	6	18771	18776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015944	AC	3	6	20359	20364	50 %	0 %	0 %	50 %	344209959
38	NC_015944	TA	3	6	20907	20912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015944	CT	3	6	21343	21348	0 %	50 %	0 %	50 %	344209960
40	NC_015944	AC	3	6	21425	21430	50 %	0 %	0 %	50 %	344209960
41	NC_015944	TA	3	6	21461	21466	50 %	50 %	0 %	0 %	344209960
42	NC_015944	CA	3	6	22698	22703	50 %	0 %	0 %	50 %	344209961
43	NC_015944	CT	3	6	22705	22710	0 %	50 %	0 %	50 %	344209961
44	NC_015944	CT	3	6	23723	23728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015944	TA	3	6	23793	23798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015944	TC	3	6	23996	24001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015944	GT	3	6	24174	24179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015944	TA	3	6	24615	24620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015944	AT	3	6	24822	24827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015944	CA	4	8	25186	25193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015944	AT	3	6	25631	25636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015944	TC	3	6	25884	25889	0 %	50 %	0 %	50 %	344209963
53	NC_015944	CT	3	6	26609	26614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015944	CT	3	6	26862	26867	0 %	50 %	0 %	50 %	344209964
55	NC_015944	AT	3	6	27002	27007	50 %	50 %	0 %	0 %	344209964
56	NC_015944	CG	3	6	27478	27483	0 %	0 %	50 %	50 %	344209964
57	NC_015944	TC	3	6	27548	27553	0 %	50 %	0 %	50 %	344209964
58	NC_015944	GC	3	6	28061	28066	0 %	0 %	50 %	50 %	344209964
59	NC_015944	TA	3	6	28463	28468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015944	GT	3	6	29112	29117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015944	AC	3	6	29309	29314	50 %	0 %	0 %	50 %	344209966
62	NC_015944	AG	3	6	29522	29527	50 %	0 %	50 %	0 %	344209966
63	NC_015944	AC	3	6	30059	30064	50 %	0 %	0 %	50 %	344209967
64	NC_015944	GA	3	6	30066	30071	50 %	0 %	50 %	0 %	344209967
65	NC_015944	GC	3	6	31963	31968	0 %	0 %	50 %	50 %	344209968
66	NC_015944	GT	3	6	32229	32234	0 %	50 %	50 %	0 %	344209968
67	NC_015944	GC	3	6	33141	33146	0 %	0 %	50 %	50 %	344209969
68	NC_015944	GA	3	6	33771	33776	50 %	0 %	50 %	0 %	344209969
69	NC_015944	GA	3	6	34354	34359	50 %	0 %	50 %	0 %	344209969
70	NC_015944	TG	3	6	34812	34817	0 %	50 %	50 %	0 %	344209970
71	NC_015944	CG	3	6	35571	35576	0 %	0 %	50 %	50 %	344209970
72	NC_015944	TG	3	6	35813	35818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015944	TG	3	6	35864	35869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015944	CT	3	6	35967	35972	0 %	50 %	0 %	50 %	344209971
75	NC_015944	CA	3	6	36103	36108	50 %	0 %	0 %	50 %	344209971
76	NC_015944	AG	3	6	36447	36452	50 %	0 %	50 %	0 %	344209971
77	NC_015944	CG	3	6	36548	36553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015944	AT	3	6	37829	37834	50 %	50 %	0 %	0 %	344209972
79	NC_015944	CT	3	6	38220	38225	0 %	50 %	0 %	50 %	344209973
80	NC_015944	TG	3	6	38332	38337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015944	CA	3	6	38998	39003	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
82	NC_015944	AC	3	6	39042	39047	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
83	NC_015944	GT	3	6	39831	39836	0 %	50 %	50 %	0 %	344209974
84	NC_015944	CA	3	6	39898	39903	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
85	NC_015944	CA	3	6	40135	40140	50 %	0 %	0 %	50 %	344209974
86	NC_015944	TC	3	6	41358	41363	0 %	50 %	0 %	50 %	344209974
87	NC_015944	GA	3	6	41584	41589	50 %	0 %	50 %	0 %	344209975
88	NC_015944	AG	3	6	41656	41661	50 %	0 %	50 %	0 %	344209975
89	NC_015944	CA	3	6	42366	42371	50 %	0 %	0 %	50 %	344209976
90	NC_015944	TC	3	6	43998	44003	0 %	50 %	0 %	50 %	344209977
91	NC_015944	GC	3	6	44346	44351	0 %	0 %	50 %	50 %	344209977
92	NC_015944	GC	3	6	44946	44951	0 %	0 %	50 %	50 %	344209977
93	NC_015944	TC	3	6	45528	45533	0 %	50 %	0 %	50 %	344209977
94	NC_015944	TA	3	6	47166	47171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015944	GC	3	6	47627	47632	0 %	0 %	50 %	50 %	344209978
96	NC_015944	AT	3	6	48496	48501	50 %	50 %	0 %	0 %	344209978
97	NC_015944	CA	3	6	49447	49452	50 %	0 %	0 %	50 %	344209979
98	NC_015944	TA	3	6	49505	49510	50 %	50 %	0 %	0 %	344209979
99	NC_015944	TA	3	6	49966	49971	50 %	50 %	0 %	0 %	344209979
100	NC_015944	TC	3	6	50067	50072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015944	TG	3	6	50400	50405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015944	CG	3	6	50684	50689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015944	TA	3	6	50765	50770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015944	CA	3	6	51137	51142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015944	AG	3	6	52016	52021	50 %	0 %	50 %	0 %	344209980
106	NC_015944	GC	3	6	53022	53027	0 %	0 %	50 %	50 %	344209981
107	NC_015944	CT	3	6	53760	53765	0 %	50 %	0 %	50 %	344209981
108	NC_015944	CA	3	6	53897	53902	50 %	0 %	0 %	50 %	344209981
109	NC_015944	TC	3	6	54110	54115	0 %	50 %	0 %	50 %	344209982
110	NC_015944	CG	3	6	54171	54176	0 %	0 %	50 %	50 %	344209982
111	NC_015944	TC	3	6	54487	54492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015944	GC	3	6	54822	54827	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
113	NC_015944	GT	3	6	55399	55404	0 %	50 %	50 %	0 %	344209983
114	NC_015944	GC	3	6	55521	55526	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
115	NC_015944	CG	3	6	55947	55952	0 %	0 %	50 %	50 %	344209983
116	NC_015944	TC	3	6	56418	56423	0 %	50 %	0 %	50 %	344209983
117	NC_015944	GT	3	6	56620	56625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015944	CG	4	8	56951	56958	0 %	0 %	50 %	50 %	344209984
119	NC_015944	CT	3	6	57120	57125	0 %	50 %	0 %	50 %	344209984
120	NC_015944	CT	3	6	59291	59296	0 %	50 %	0 %	50 %	344209985
121	NC_015944	CG	3	6	59609	59614	0 %	0 %	50 %	50 %	344209986
122	NC_015944	GC	3	6	60027	60032	0 %	0 %	50 %	50 %	344209986
123	NC_015944	GC	3	6	60493	60498	0 %	0 %	50 %	50 %	344209987
124	NC_015944	GT	3	6	61623	61628	0 %	50 %	50 %	0 %	344209989
125	NC_015944	CT	3	6	61880	61885	0 %	50 %	0 %	50 %	344209990
126	NC_015944	GT	3	6	62245	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	344209990
127	NC_015944	GT	3	6	62880	62885	0 %	50 %	50 %	0 %	344209991
128	NC_015944	CG	3	6	63259	63264	0 %	0 %	50 %	50 %	344209992
129	NC_015944	AG	3	6	64260	64265	50 %	0 %	50 %	0 %	344209993
130	NC_015944	GC	3	6	64302	64307	0 %	0 %	50 %	50 %	344209993
131	NC_015944	GC	3	6	64367	64372	0 %	0 %	50 %	50 %	344209993
132	NC_015944	CG	3	6	65115	65120	0 %	0 %	50 %	50 %	344209994
133	NC_015944	CA	4	8	65450	65457	50 %	0 %	0 %	50 %	344209995
134	NC_015944	GA	3	6	65937	65942	50 %	0 %	50 %	0 %	344209995
135	NC_015944	CG	3	6	66033	66038	0 %	0 %	50 %	50 %	344209995
136	NC_015944	AC	3	6	66126	66131	50 %	0 %	0 %	50 %	344209995
137	NC_015944	GC	3	6	66729	66734	0 %	0 %	50 %	50 %	344209995
138	NC_015944	GT	3	6	68770	68775	0 %	50 %	50 %	0 %	344209996
139	NC_015944	GA	3	6	69423	69428	50 %	0 %	50 %	0 %	344209996
140	NC_015944	AT	3	6	71107	71112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015944	AG	3	6	71726	71731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015944	CT	3	6	72158	72163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015944	AC	3	6	72272	72277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015944	CG	3	6	72541	72546	0 %	0 %	50 %	50 %	344210001
145	NC_015944	GC	3	6	72661	72666	0 %	0 %	50 %	50 %	344210001
146	NC_015944	CG	3	6	72961	72966	0 %	0 %	50 %	50 %	344210002
147	NC_015944	GC	3	6	73587	73592	0 %	0 %	50 %	50 %	344210003
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