MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	C	6	6	1489	1494	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_015944	G	6	6	10529	10534	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015944	C	6	6	11586	11591	0 %	0 %	0 %	100 %	344209951
4	NC_015944	G	6	6	14242	14247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015944	T	6	6	17190	17195	0 %	100 %	0 %	0 %	344209956
6	NC_015944	T	6	6	25916	25921	0 %	100 %	0 %	0 %	344209963
7	NC_015944	G	6	6	28549	28554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015944	G	6	6	29620	29625	0 %	0 %	100 %	0 %	344209966
9	NC_015944	C	6	6	32426	32431	0 %	0 %	0 %	100 %	344209968
10	NC_015944	C	7	7	33538	33544	0 %	0 %	0 %	100 %	344209969
11	NC_015944	A	6	6	35794	35799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015944	C	6	6	45031	45036	0 %	0 %	0 %	100 %	344209977
13	NC_015944	A	6	6	46258	46263	100 %	0 %	0 %	0 %	344209977
14	NC_015944	C	6	6	50636	50641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_015944	T	6	6	51861	51866	0 %	100 %	0 %	0 %	344209980
16	NC_015944	G	6	6	59043	59048	0 %	0 %	100 %	0 %	344209985
17	NC_015944	A	6	6	61644	61649	100 %	0 %	0 %	0 %	344209989
18	NC_015944	A	7	7	63007	63013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015944	G	6	6	64971	64976	0 %	0 %	100 %	0 %	344209994
20	NC_015944	C	6	6	75223	75228	0 %	0 %	0 %	100 %	344210005
21	NC_015944	G	6	6	90185	90190	0 %	0 %	100 %	0 %	344210023
22	NC_015944	T	6	6	94775	94780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015944	A	6	6	101635	101640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015944	G	6	6	111999	112004	0 %	0 %	100 %	0 %	344210048
25	NC_015944	G	6	6	114646	114651	0 %	0 %	100 %	0 %	344210050
26	NC_015944	T	7	7	115593	115599	0 %	100 %	0 %	0 %	344210051
27	NC_015944	A	7	7	120238	120244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015944	C	6	6	138085	138090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_015944	T	6	6	144126	144131	0 %	100 %	0 %	0 %	344210078
30	NC_015944	G	6	6	157950	157955	0 %	0 %	100 %	0 %	344210090
31	NC_015944	C	6	6	163898	163903	0 %	0 %	0 %	100 %	344210094
32	NC_015944	A	6	6	164972	164977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015944	C	6	6	165653	165658	0 %	0 %	0 %	100 %	344210095
34	NC_015944	A	6	6	166103	166108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015944	G	6	6	168580	168585	0 %	0 %	100 %	0 %	344210097
36	NC_015944	T	6	6	174187	174192	0 %	100 %	0 %	0 %	344210102
37	NC_015944	T	6	6	177550	177555	0 %	100 %	0 %	0 %	344210104
38	NC_015944	A	6	6	178056	178061	100 %	0 %	0 %	0 %	344210104
39	NC_015944	C	6	6	178730	178735	0 %	0 %	0 %	100 %	344210105
40	NC_015944	C	6	6	181201	181206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_015944	T	6	6	181711	181716	0 %	100 %	0 %	0 %	344210107
42	NC_015944	T	6	6	184068	184073	0 %	100 %	0 %	0 %	344210108
43	NC_015944	A	7	7	187961	187967	100 %	0 %	0 %	0 %	344210111
44	NC_015944	G	6	6	189977	189982	0 %	0 %	100 %	0 %	344210112
45	NC_015944	A	6	6	195484	195489	100 %	0 %	0 %	0 %	344210119
46	NC_015944	G	6	6	195492	195497	0 %	0 %	100 %	0 %	344210119
47	NC_015944	C	6	6	197409	197414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_015944	T	7	7	200972	200978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015944	G	6	6	214215	214220	0 %	0 %	100 %	0 %	344210133
50	NC_015944	C	6	6	216675	216680	0 %	0 %	0 %	100 %	344210136
51	NC_015944	C	6	6	219120	219125	0 %	0 %	0 %	100 %	344210137
52	NC_015944	A	6	6	233230	233235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015944	C	6	6	234596	234601	0 %	0 %	0 %	100 %	344210151
54	NC_015944	T	10	10	234828	234837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015944	G	7	7	236950	236956	0 %	0 %	100 %	0 %	344210153
56	NC_015944	C	6	6	244051	244056	0 %	0 %	0 %	100 %	344210160
57	NC_015944	C	6	6	246018	246023	0 %	0 %	0 %	100 %	344210162
58	NC_015944	G	6	6	249048	249053	0 %	0 %	100 %	0 %	344210165
59	NC_015944	A	6	6	255705	255710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015944	C	6	6	262453	262458	0 %	0 %	0 %	100 %	344210176
61	NC_015944	C	6	6	265788	265793	0 %	0 %	0 %	100 %	344210178
62	NC_015944	T	6	6	269446	269451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015944	C	6	6	270027	270032	0 %	0 %	0 %	100 %	344210182
64	NC_015944	T	7	7	281468	281474	0 %	100 %	0 %	0 %	344210194
65	NC_015944	C	7	7	288077	288083	0 %	0 %	0 %	100 %	344210202
66	NC_015944	A	6	6	293296	293301	100 %	0 %	0 %	0 %	344210209
67	NC_015944	G	6	6	295233	295238	0 %	0 %	100 %	0 %	344210211
68	NC_015944	G	6	6	302149	302154	0 %	0 %	100 %	0 %	344210215
69	NC_015944	A	6	6	304239	304244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015944	C	6	6	309119	309124	0 %	0 %	0 %	100 %	344210221
71	NC_015944	A	6	6	309715	309720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015944	C	6	6	311900	311905	0 %	0 %	0 %	100 %	344210223
73	NC_015944	A	6	6	315984	315989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015944	A	6	6	323265	323270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015944	T	6	6	323378	323383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015944	G	6	6	326914	326919	0 %	0 %	100 %	0 %	344210238
77	NC_015944	C	6	6	329595	329600	0 %	0 %	0 %	100 %	344210240
78	NC_015944	C	6	6	336389	336394	0 %	0 %	0 %	100 %	344210245
79	NC_015944	G	6	6	336589	336594	0 %	0 %	100 %	0 %	344210245
80	NC_015944	T	6	6	345974	345979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015944	G	6	6	346906	346911	0 %	0 %	100 %	0 %	344210255
82	NC_015944	C	6	6	354126	354131	0 %	0 %	0 %	100 %	344210264
83	NC_015944	A	7	7	359455	359461	100 %	0 %	0 %	0 %	344210268
84	NC_015944	T	6	6	360022	360027	0 %	100 %	0 %	0 %	344210268
85	NC_015944	C	6	6	361828	361833	0 %	0 %	0 %	100 %	344210268
86	NC_015944	C	6	6	363466	363471	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_015944	A	6	6	364067	364072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015944	G	6	6	364188	364193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015944	G	6	6	364674	364679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015944	G	7	7	366308	366314	0 %	0 %	100 %	0 %	344210274
91	NC_015944	A	6	6	366416	366421	100 %	0 %	0 %	0 %	344210274
92	NC_015944	G	6	6	366919	366924	0 %	0 %	100 %	0 %	344210275
93	NC_015944	A	6	6	368706	368711	100 %	0 %	0 %	0 %	344210277
94	NC_015944	T	6	6	370568	370573	0 %	100 %	0 %	0 %	344210278
95	NC_015944	A	6	6	378051	378056	100 %	0 %	0 %	0 %	344210283
96	NC_015944	A	6	6	379709	379714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015944	T	6	6	384037	384042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015944	C	6	6	385223	385228	0 %	0 %	0 %	100 %	344210288
99	NC_015944	C	6	6	389481	389486	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_015944	C	6	6	390836	390841	0 %	0 %	0 %	100 %	344210292
101	NC_015944	G	6	6	393056	393061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015944	T	6	6	395411	395416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015944	G	6	6	398133	398138	0 %	0 %	100 %	0 %	344210297
104	NC_015944	A	6	6	398887	398892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015944	G	6	6	405396	405401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.