MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 1412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	ACCG	2	8	285	292	25 %	0 %	25 %	50 %	344209486
2	NC_015943	CGAA	2	8	566	573	50 %	0 %	25 %	25 %	344209486
3	NC_015943	GGCG	2	8	672	679	0 %	0 %	75 %	25 %	344209486
4	NC_015943	ATGG	2	8	2075	2082	25 %	25 %	50 %	0 %	344209487
5	NC_015943	TCGT	2	8	2159	2166	0 %	50 %	25 %	25 %	344209487
6	NC_015943	CGAG	2	8	2187	2194	25 %	0 %	50 %	25 %	344209487
7	NC_015943	CGAG	2	8	2227	2234	25 %	0 %	50 %	25 %	344209487
8	NC_015943	CTGC	2	8	2396	2403	0 %	25 %	25 %	50 %	344209487
9	NC_015943	CGCC	2	8	2954	2961	0 %	0 %	25 %	75 %	344209487
10	NC_015943	TCGA	2	8	3315	3322	25 %	25 %	25 %	25 %	344209487
11	NC_015943	TCTG	2	8	3603	3610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015943	AATG	2	8	4126	4133	50 %	25 %	25 %	0 %	344209488
13	NC_015943	GTTC	2	8	4585	4592	0 %	50 %	25 %	25 %	344209488
14	NC_015943	GTAT	2	8	5063	5070	25 %	50 %	25 %	0 %	344209489
15	NC_015943	ATGG	2	8	5336	5343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015943	GAAT	2	8	5564	5571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015943	GACG	2	8	5859	5866	25 %	0 %	50 %	25 %	344209490
18	NC_015943	GTAT	2	8	6020	6027	25 %	50 %	25 %	0 %	344209490
19	NC_015943	ATCG	2	8	6114	6121	25 %	25 %	25 %	25 %	344209490
20	NC_015943	GTCG	2	8	6191	6198	0 %	25 %	50 %	25 %	344209490
21	NC_015943	GCGG	2	8	6456	6463	0 %	0 %	75 %	25 %	344209490
22	NC_015943	CGGT	2	8	6529	6536	0 %	25 %	50 %	25 %	344209490
23	NC_015943	ACCA	2	8	6961	6968	50 %	0 %	0 %	50 %	344209491
24	NC_015943	AAAT	2	8	7725	7732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015943	GTCC	2	8	8275	8282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015943	GGAC	2	8	9479	9486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015943	CGAG	2	8	9873	9880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015943	CCCG	2	8	10098	10105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_015943	GAAC	2	8	11148	11155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015943	CAAC	2	8	12408	12415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015943	TAGG	2	8	12836	12843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015943	GGTT	2	8	13385	13392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015943	GTCG	2	8	14384	14391	0 %	25 %	50 %	25 %	344209495
34	NC_015943	AACC	2	8	14871	14878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015943	AACT	2	8	15743	15750	50 %	25 %	0 %	25 %	344209497
36	NC_015943	TCGT	2	8	16430	16437	0 %	50 %	25 %	25 %	344209498
37	NC_015943	CAGA	2	8	17521	17528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015943	AGGT	2	8	17655	17662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015943	ACGC	2	8	18282	18289	25 %	0 %	25 %	50 %	344209501
40	NC_015943	CGTG	2	8	18438	18445	0 %	25 %	50 %	25 %	344209501
41	NC_015943	ATTC	2	8	18842	18849	25 %	50 %	0 %	25 %	344209502
42	NC_015943	CAGC	2	8	19070	19077	25 %	0 %	25 %	50 %	344209502
43	NC_015943	TCGC	2	8	19172	19179	0 %	25 %	25 %	50 %	344209502
44	NC_015943	GACG	2	8	19254	19261	25 %	0 %	50 %	25 %	344209502
45	NC_015943	TAGT	2	8	19569	19576	25 %	50 %	25 %	0 %	344209503
46	NC_015943	CTGG	2	8	20288	20295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015943	CGCT	2	8	20868	20875	0 %	25 %	25 %	50 %	344209507
48	NC_015943	TTGC	2	8	20916	20923	0 %	50 %	25 %	25 %	344209507
49	NC_015943	TCCA	2	8	21081	21088	25 %	25 %	0 %	50 %	344209507
50	NC_015943	CTTT	2	8	21202	21209	0 %	75 %	0 %	25 %	344209507
51	NC_015943	CATC	2	8	21260	21267	25 %	25 %	0 %	50 %	344209507
52	NC_015943	GACT	2	8	21333	21340	25 %	25 %	25 %	25 %	344209507
53	NC_015943	GGCT	2	8	21346	21353	0 %	25 %	50 %	25 %	344209507
54	NC_015943	GGAC	2	8	21827	21834	25 %	0 %	50 %	25 %	344209507
55	NC_015943	GCCC	2	8	22008	22015	0 %	0 %	25 %	75 %	344209507
56	NC_015943	CAGT	2	8	22154	22161	25 %	25 %	25 %	25 %	344209507
57	NC_015943	ATGT	2	8	22477	22484	25 %	50 %	25 %	0 %	344209507
58	NC_015943	GCCC	2	8	23720	23727	0 %	0 %	25 %	75 %	344209508
59	NC_015943	GTCG	2	8	23749	23756	0 %	25 %	50 %	25 %	344209508
60	NC_015943	TCGG	2	8	23897	23904	0 %	25 %	50 %	25 %	344209508
61	NC_015943	CCGG	2	8	24450	24457	0 %	0 %	50 %	50 %	344209508
62	NC_015943	GTCT	2	8	24551	24558	0 %	50 %	25 %	25 %	344209508
63	NC_015943	GTTC	2	8	24846	24853	0 %	50 %	25 %	25 %	344209508
64	NC_015943	GTCG	2	8	25102	25109	0 %	25 %	50 %	25 %	344209508
65	NC_015943	CGGC	2	8	25278	25285	0 %	0 %	50 %	50 %	344209508
66	NC_015943	GATC	2	8	25757	25764	25 %	25 %	25 %	25 %	344209508
67	NC_015943	CCGG	2	8	27139	27146	0 %	0 %	50 %	50 %	344209511
68	NC_015943	CAGG	2	8	27799	27806	25 %	0 %	50 %	25 %	344209512
69	NC_015943	GCAT	2	8	27928	27935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015943	TGAA	2	8	28093	28100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015943	TGAC	3	12	28101	28112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015943	TCTG	2	8	28345	28352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015943	CTGG	2	8	28719	28726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015943	CCTT	2	8	28784	28791	0 %	50 %	0 %	50 %	344209514
75	NC_015943	CAGG	2	8	29101	29108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015943	CACT	2	8	29192	29199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015943	TTCC	2	8	29571	29578	0 %	50 %	0 %	50 %	344209515
78	NC_015943	TCGT	2	8	29920	29927	0 %	50 %	25 %	25 %	344209515
79	NC_015943	TTGT	2	8	30188	30195	0 %	75 %	25 %	0 %	344209515
80	NC_015943	GGGT	2	8	30973	30980	0 %	25 %	75 %	0 %	344209517
81	NC_015943	CGGT	2	8	31341	31348	0 %	25 %	50 %	25 %	344209518
82	NC_015943	ACCC	2	8	31381	31388	25 %	0 %	0 %	75 %	344209518
83	NC_015943	TGCT	2	8	31590	31597	0 %	50 %	25 %	25 %	344209518
84	NC_015943	CCCG	2	8	32035	32042	0 %	0 %	25 %	75 %	344209518
85	NC_015943	GTCA	2	8	32242	32249	25 %	25 %	25 %	25 %	344209519
86	NC_015943	GCGA	2	8	32690	32697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015943	GTGG	2	8	32709	32716	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015943	AATA	2	8	33141	33148	75 %	25 %	0 %	0 %	344209520
89	NC_015943	GTGG	2	8	33725	33732	0 %	25 %	75 %	0 %	344209521
90	NC_015943	GCTC	2	8	33755	33762	0 %	25 %	25 %	50 %	344209521
91	NC_015943	CCGA	2	8	33858	33865	25 %	0 %	25 %	50 %	344209522
92	NC_015943	GTCG	2	8	33866	33873	0 %	25 %	50 %	25 %	344209522
93	NC_015943	CGCT	2	8	34221	34228	0 %	25 %	25 %	50 %	344209523
94	NC_015943	AGCC	2	8	34509	34516	25 %	0 %	25 %	50 %	344209523
95	NC_015943	GGCC	2	8	36252	36259	0 %	0 %	50 %	50 %	344209524
96	NC_015943	CCAT	2	8	37246	37253	25 %	25 %	0 %	50 %	344209525
97	NC_015943	CAGT	2	8	37258	37265	25 %	25 %	25 %	25 %	344209525
98	NC_015943	CGGT	2	8	37297	37304	0 %	25 %	50 %	25 %	344209525
99	NC_015943	ATCC	2	8	37355	37362	25 %	25 %	0 %	50 %	344209525
100	NC_015943	TGCT	2	8	37525	37532	0 %	50 %	25 %	25 %	344209525
101	NC_015943	ATAC	2	8	37645	37652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015943	CCGA	2	8	37879	37886	25 %	0 %	25 %	50 %	344209526
103	NC_015943	AGCG	2	8	38299	38306	25 %	0 %	50 %	25 %	344209526
104	NC_015943	CGTT	2	8	39254	39261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015943	CTCG	2	8	39361	39368	0 %	25 %	25 %	50 %	344209527
106	NC_015943	CTGG	2	8	39865	39872	0 %	25 %	50 %	25 %	344209527
107	NC_015943	ACTC	2	8	40378	40385	25 %	25 %	0 %	50 %	344209528
108	NC_015943	GTTC	2	8	40679	40686	0 %	50 %	25 %	25 %	344209528
109	NC_015943	GTCG	2	8	40797	40804	0 %	25 %	50 %	25 %	344209528
110	NC_015943	GGGT	2	8	40998	41005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015943	GAAG	2	8	41279	41286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015943	TTTG	2	8	41630	41637	0 %	75 %	25 %	0 %	344209530
113	NC_015943	CCGG	2	8	41693	41700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015943	GACC	2	8	41861	41868	25 %	0 %	25 %	50 %	344209531
115	NC_015943	GACT	2	8	42003	42010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015943	GGCC	2	8	42110	42117	0 %	0 %	50 %	50 %	344209532
117	NC_015943	CAAC	2	8	42672	42679	50 %	0 %	0 %	50 %	344209534
118	NC_015943	CGAC	2	8	42685	42692	25 %	0 %	25 %	50 %	344209534
119	NC_015943	TCGC	2	8	43316	43323	0 %	25 %	25 %	50 %	344209535
120	NC_015943	GGCG	2	8	43377	43384	0 %	0 %	75 %	25 %	344209535
121	NC_015943	GTCG	2	8	43577	43584	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015943	ACCA	2	8	43691	43698	50 %	0 %	0 %	50 %	344209537
123	NC_015943	GGCA	2	8	43718	43725	25 %	0 %	50 %	25 %	344209537
124	NC_015943	TGAC	2	8	43868	43875	25 %	25 %	25 %	25 %	344209538
125	NC_015943	GATA	2	8	44287	44294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015943	ACCC	2	8	45467	45474	25 %	0 %	0 %	75 %	344209541
127	NC_015943	CCAC	2	8	45498	45505	25 %	0 %	0 %	75 %	344209541
128	NC_015943	GTGC	2	8	45682	45689	0 %	25 %	50 %	25 %	344209541
129	NC_015943	AGAT	2	8	46611	46618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015943	AATC	2	8	47082	47089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015943	GATA	2	8	47777	47784	50 %	25 %	25 %	0 %	344209542
132	NC_015943	GCTC	2	8	48223	48230	0 %	25 %	25 %	50 %	344209542
133	NC_015943	AGAT	2	8	48882	48889	50 %	25 %	25 %	0 %	344209544
134	NC_015943	CCCG	2	8	50581	50588	0 %	0 %	25 %	75 %	344209545
135	NC_015943	ACGA	2	8	50798	50805	50 %	0 %	25 %	25 %	344209545
136	NC_015943	CAGC	2	8	51279	51286	25 %	0 %	25 %	50 %	344209545
137	NC_015943	ACCT	2	8	51537	51544	25 %	25 %	0 %	50 %	344209546
138	NC_015943	CTTT	2	8	51663	51670	0 %	75 %	0 %	25 %	344209546
139	NC_015943	TGGG	2	8	51919	51926	0 %	25 %	75 %	0 %	344209546
140	NC_015943	GCAA	2	8	52217	52224	50 %	0 %	25 %	25 %	344209546
141	NC_015943	GACC	2	8	52690	52697	25 %	0 %	25 %	50 %	344209546
142	NC_015943	TCAG	2	8	53019	53026	25 %	25 %	25 %	25 %	344209547
143	NC_015943	GCCA	2	8	53522	53529	25 %	0 %	25 %	50 %	344209547
144	NC_015943	TATC	2	8	54192	54199	25 %	50 %	0 %	25 %	344209548
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