MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 6152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	GCC	2	6	75	80	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209486
2	NC_015943	CAG	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209486
3	NC_015943	TGT	2	6	320	325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209486
4	NC_015943	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209486
5	NC_015943	ATG	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209486
6	NC_015943	ATG	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209486
7	NC_015943	TGA	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209486
8	NC_015943	TCA	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209486
9	NC_015943	TTG	2	6	827	832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209486
10	NC_015943	CGA	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209486
11	NC_015943	GGA	2	6	915	920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209486
12	NC_015943	GGC	2	6	1081	1086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209486
13	NC_015943	GTT	2	6	1164	1169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209486
14	NC_015943	CGA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209486
15	NC_015943	GGA	3	9	1462	1470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209487
16	NC_015943	ATC	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209487
17	NC_015943	CAG	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209487
18	NC_015943	GTT	2	6	1714	1719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209487
19	NC_015943	TCG	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
20	NC_015943	TCG	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
21	NC_015943	ATC	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209487
22	NC_015943	GCG	2	6	2136	2141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209487
23	NC_015943	GCC	3	9	2169	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209487
24	NC_015943	ATG	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209487
25	NC_015943	GCT	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
26	NC_015943	GAT	2	6	2444	2449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209487
27	NC_015943	GGC	2	6	2465	2470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209487
28	NC_015943	GTT	2	6	2578	2583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209487
29	NC_015943	CTT	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209487
30	NC_015943	GGC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209487
31	NC_015943	GCC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209487
32	NC_015943	TCG	3	9	2733	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
33	NC_015943	GAC	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209487
34	NC_015943	GAC	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209487
35	NC_015943	CCT	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209487
36	NC_015943	CGA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209487
37	NC_015943	GCG	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209487
38	NC_015943	ATC	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209487
39	NC_015943	ACC	2	6	3136	3141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209487
40	NC_015943	GCC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209487
41	NC_015943	GAG	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209487
42	NC_015943	CCT	2	6	3256	3261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209487
43	NC_015943	TCG	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
44	NC_015943	TCG	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
45	NC_015943	CGC	2	6	3478	3483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209487
46	NC_015943	TCG	2	6	3491	3496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209487
47	NC_015943	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209488
48	NC_015943	GTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209488
49	NC_015943	CCG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209488
50	NC_015943	GCC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209488
51	NC_015943	CGA	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209488
52	NC_015943	AGT	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209488
53	NC_015943	CTC	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209488
54	NC_015943	CCT	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209488
55	NC_015943	TCG	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209488
56	NC_015943	CAC	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209488
57	NC_015943	CCG	2	6	4533	4538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209488
58	NC_015943	CGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209488
59	NC_015943	CGT	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209488
60	NC_015943	ACT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209489
61	NC_015943	ACA	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209489
62	NC_015943	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209489
63	NC_015943	TTC	2	6	5665	5670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209490
64	NC_015943	TGC	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209490
65	NC_015943	ACA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209490
66	NC_015943	AAC	2	6	5782	5787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209490
67	NC_015943	GAC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209490
68	NC_015943	AGT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209490
69	NC_015943	CCA	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209490
70	NC_015943	CGT	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209490
71	NC_015943	GAC	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209490
72	NC_015943	CTG	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209490
73	NC_015943	GGT	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209490
74	NC_015943	TGG	2	6	6236	6241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209490
75	NC_015943	ACT	2	6	6351	6356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209490
76	NC_015943	GCC	2	6	6399	6404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209490
77	NC_015943	TGC	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209490
78	NC_015943	ATC	2	6	6513	6518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209490
79	NC_015943	GTG	2	6	6571	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209490
80	NC_015943	CGA	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209490
81	NC_015943	ATG	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209490
82	NC_015943	GAC	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209490
83	NC_015943	TGG	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209491
84	NC_015943	TGG	2	6	6894	6899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209491
85	NC_015943	TCC	2	6	6929	6934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209491
86	NC_015943	GCA	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209491
87	NC_015943	ATG	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209491
88	NC_015943	AAC	2	6	7099	7104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209491
89	NC_015943	CAT	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209491
90	NC_015943	TGA	3	9	7143	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209491
91	NC_015943	TGG	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209492
92	NC_015943	AGT	2	6	7456	7461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209492
93	NC_015943	CTT	2	6	7522	7527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209492
94	NC_015943	TTC	2	6	7548	7553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209492
95	NC_015943	GAT	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209493
96	NC_015943	TCG	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209493
97	NC_015943	CGG	2	6	7813	7818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209493
98	NC_015943	TGC	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209494
99	NC_015943	GCC	2	6	14078	14083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209495
100	NC_015943	CTG	2	6	14111	14116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209495
101	NC_015943	CTG	2	6	14129	14134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209495
102	NC_015943	CGA	2	6	14194	14199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209495
103	NC_015943	TCG	2	6	14202	14207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209495
104	NC_015943	TCG	2	6	14256	14261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209495
105	NC_015943	AGA	2	6	14292	14297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209495
106	NC_015943	CAC	2	6	14394	14399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209495
107	NC_015943	CCT	2	6	14416	14421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209495
108	NC_015943	ACG	2	6	14484	14489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209495
109	NC_015943	CAG	2	6	14528	14533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209495
110	NC_015943	GGA	2	6	14644	14649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209495
111	NC_015943	CCA	2	6	15078	15083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209496
112	NC_015943	GAT	2	6	15089	15094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209496
113	NC_015943	GAA	2	6	15182	15187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209496
114	NC_015943	GCT	2	6	15209	15214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209496
115	NC_015943	CTG	2	6	15252	15257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209496
116	NC_015943	GAG	2	6	15305	15310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209496
117	NC_015943	GGA	2	6	15334	15339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209496
118	NC_015943	CTG	2	6	15497	15502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209497
119	NC_015943	GAA	3	9	15568	15576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209497
120	NC_015943	GAC	2	6	15673	15678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209497
121	NC_015943	TGA	2	6	15699	15704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209497
122	NC_015943	GCT	2	6	15762	15767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209497
123	NC_015943	GAT	2	6	15784	15789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209497
124	NC_015943	TGA	2	6	15834	15839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209497
125	NC_015943	GAC	2	6	15883	15888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209497
126	NC_015943	TGA	2	6	16496	16501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209498
127	NC_015943	GCG	2	6	16515	16520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209498
128	NC_015943	GTT	2	6	16551	16556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209498
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132	NC_015943	CTA	2	6	16771	16776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209499
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252	NC_015943	CGC	2	6	26049	26054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209508
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284	NC_015943	CGG	2	6	29585	29590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209515
285	NC_015943	CGC	2	6	29627	29632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209515
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361	NC_015943	GCA	2	6	35784	35789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209524
362	NC_015943	GAA	2	6	35910	35915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209524
363	NC_015943	GAT	2	6	35964	35969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209524
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366	NC_015943	TGG	2	6	36335	36340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209524
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370	NC_015943	CTC	2	6	36618	36623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209525
371	NC_015943	TCG	2	6	36670	36675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209525
372	NC_015943	TCG	2	6	36761	36766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209525
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496	NC_015943	TTC	3	9	48255	48263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209542
497	NC_015943	CTC	2	6	48270	48275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209542
498	NC_015943	TCA	2	6	48292	48297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209542
499	NC_015943	TCA	2	6	48358	48363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209542
500	NC_015943	CTT	2	6	48390	48395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209542

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