MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	TG	3	6	692	697	0 %	50 %	50 %	0 %	344209486
2	NC_015943	CT	3	6	887	892	0 %	50 %	0 %	50 %	344209486
3	NC_015943	CG	3	6	1114	1119	0 %	0 %	50 %	50 %	344209486
4	NC_015943	CT	3	6	1947	1952	0 %	50 %	0 %	50 %	344209487
5	NC_015943	GT	3	6	2146	2151	0 %	50 %	50 %	0 %	344209487
6	NC_015943	TG	3	6	2310	2315	0 %	50 %	50 %	0 %	344209487
7	NC_015943	CG	3	6	2486	2491	0 %	0 %	50 %	50 %	344209487
8	NC_015943	GT	3	6	3436	3441	0 %	50 %	50 %	0 %	344209487
9	NC_015943	GC	4	8	3462	3469	0 %	0 %	50 %	50 %	344209487
10	NC_015943	GC	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	344209489
11	NC_015943	GC	3	6	5286	5291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015943	GT	3	6	5344	5349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015943	TC	3	6	5650	5655	0 %	50 %	0 %	50 %	344209490
14	NC_015943	TA	3	6	5878	5883	50 %	50 %	0 %	0 %	344209490
15	NC_015943	GT	3	6	6592	6597	0 %	50 %	50 %	0 %	344209490
16	NC_015943	GA	3	6	6670	6675	50 %	0 %	50 %	0 %	344209490
17	NC_015943	AG	3	6	7029	7034	50 %	0 %	50 %	0 %	344209491
18	NC_015943	TC	3	6	7080	7085	0 %	50 %	0 %	50 %	344209491
19	NC_015943	CT	3	6	7642	7647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015943	TG	3	6	7927	7932	0 %	50 %	50 %	0 %	344209494
21	NC_015943	CT	4	8	8211	8218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015943	GA	3	6	8300	8305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015943	GT	3	6	8488	8493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015943	TG	3	6	8509	8514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015943	TA	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015943	GT	3	6	8777	8782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015943	GA	3	6	9430	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015943	GA	3	6	9508	9513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015943	GC	3	6	10142	10147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015943	CA	3	6	10171	10176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015943	GT	3	6	10619	10624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015943	TC	3	6	10798	10803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015943	GT	3	6	11321	11326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015943	GT	3	6	11646	11651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015943	GC	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015943	GT	3	6	13335	13340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015943	GA	3	6	13415	13420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015943	GA	3	6	13886	13891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015943	TC	3	6	13894	13899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015943	GA	3	6	14426	14431	50 %	0 %	50 %	0 %	344209495
41	NC_015943	TC	3	6	15429	15434	0 %	50 %	0 %	50 %	344209497
42	NC_015943	TC	3	6	15952	15957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015943	TA	3	6	17364	17369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015943	GT	3	6	17422	17427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015943	AT	3	6	17807	17812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015943	AG	3	6	19047	19052	50 %	0 %	50 %	0 %	344209502
47	NC_015943	GT	3	6	19383	19388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015943	TC	3	6	19549	19554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015943	TG	3	6	20749	20754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015943	AG	3	6	21399	21404	50 %	0 %	50 %	0 %	344209507
51	NC_015943	CG	3	6	21774	21779	0 %	0 %	50 %	50 %	344209507
52	NC_015943	GA	3	6	22984	22989	50 %	0 %	50 %	0 %	344209507
53	NC_015943	GT	3	6	23618	23623	0 %	50 %	50 %	0 %	344209507
54	NC_015943	GT	3	6	24194	24199	0 %	50 %	50 %	0 %	344209508
55	NC_015943	CA	3	6	25339	25344	50 %	0 %	0 %	50 %	344209508
56	NC_015943	AT	3	6	26462	26467	50 %	50 %	0 %	0 %	344209509
57	NC_015943	CA	3	6	26489	26494	50 %	0 %	0 %	50 %	344209509
58	NC_015943	AT	3	6	26908	26913	50 %	50 %	0 %	0 %	344209510
59	NC_015943	GT	3	6	29315	29320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015943	CG	3	6	29685	29690	0 %	0 %	50 %	50 %	344209515
61	NC_015943	GT	3	6	30367	30372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015943	GT	3	6	31811	31816	0 %	50 %	50 %	0 %	344209518
63	NC_015943	GC	3	6	32531	32536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015943	AG	3	6	33037	33042	50 %	0 %	50 %	0 %	344209520
65	NC_015943	GT	3	6	33391	33396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015943	AC	3	6	33419	33424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015943	AT	3	6	34114	34119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015943	GA	3	6	34591	34596	50 %	0 %	50 %	0 %	344209523
69	NC_015943	AT	3	6	35531	35536	50 %	50 %	0 %	0 %	344209524
70	NC_015943	CT	3	6	35586	35591	0 %	50 %	0 %	50 %	344209524
71	NC_015943	CA	3	6	36242	36247	50 %	0 %	0 %	50 %	344209524
72	NC_015943	TG	3	6	36958	36963	0 %	50 %	50 %	0 %	344209525
73	NC_015943	AC	3	6	37136	37141	50 %	0 %	0 %	50 %	344209525
74	NC_015943	CA	3	6	37517	37522	50 %	0 %	0 %	50 %	344209525
75	NC_015943	GA	4	8	37730	37737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015943	GA	3	6	37805	37810	50 %	0 %	50 %	0 %	344209526
77	NC_015943	CA	3	6	38415	38420	50 %	0 %	0 %	50 %	344209526
78	NC_015943	GT	3	6	38615	38620	0 %	50 %	50 %	0 %	344209526
79	NC_015943	CA	3	6	39009	39014	50 %	0 %	0 %	50 %	344209526
80	NC_015943	CG	4	8	39445	39452	0 %	0 %	50 %	50 %	344209527
81	NC_015943	AC	3	6	39915	39920	50 %	0 %	0 %	50 %	344209527
82	NC_015943	GT	3	6	40147	40152	0 %	50 %	50 %	0 %	344209527
83	NC_015943	GC	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	344209528
84	NC_015943	GT	3	6	41701	41706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015943	CG	3	6	42303	42308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015943	AG	3	6	42311	42316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015943	AG	4	8	43107	43114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015943	AC	3	6	43220	43225	50 %	0 %	0 %	50 %	344209535
89	NC_015943	GT	3	6	43472	43477	0 %	50 %	50 %	0 %	344209536
90	NC_015943	TC	3	6	43541	43546	0 %	50 %	0 %	50 %	344209536
91	NC_015943	AG	3	6	43806	43811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015943	TC	3	6	45090	45095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015943	AC	3	6	45629	45634	50 %	0 %	0 %	50 %	344209541
94	NC_015943	CT	3	6	45974	45979	0 %	50 %	0 %	50 %	344209541
95	NC_015943	GT	3	6	46255	46260	0 %	50 %	50 %	0 %	344209541
96	NC_015943	AC	3	6	46527	46532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015943	TC	3	6	46977	46982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015943	AC	3	6	47203	47208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015943	GA	3	6	47319	47324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015943	TG	3	6	47491	47496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015943	TC	3	6	48314	48319	0 %	50 %	0 %	50 %	344209542
102	NC_015943	GC	3	6	48668	48673	0 %	0 %	50 %	50 %	344209543
103	NC_015943	TG	3	6	49378	49383	0 %	50 %	50 %	0 %	344209544
104	NC_015943	GT	3	6	49437	49442	0 %	50 %	50 %	0 %	344209544
105	NC_015943	AC	3	6	49462	49467	50 %	0 %	0 %	50 %	344209544
106	NC_015943	AG	3	6	49762	49767	50 %	0 %	50 %	0 %	344209545
107	NC_015943	GA	3	6	50751	50756	50 %	0 %	50 %	0 %	344209545
108	NC_015943	GC	3	6	50982	50987	0 %	0 %	50 %	50 %	344209545
109	NC_015943	GA	3	6	51155	51160	50 %	0 %	50 %	0 %	344209545
110	NC_015943	AC	3	6	51885	51890	50 %	0 %	0 %	50 %	344209546
111	NC_015943	GA	3	6	52307	52312	50 %	0 %	50 %	0 %	344209546
112	NC_015943	AT	3	6	52534	52539	50 %	50 %	0 %	0 %	344209546
113	NC_015943	GT	3	6	52736	52741	0 %	50 %	50 %	0 %	344209546
114	NC_015943	AG	3	6	52953	52958	50 %	0 %	50 %	0 %	344209547
115	NC_015943	GT	3	6	53368	53373	0 %	50 %	50 %	0 %	344209547
116	NC_015943	GA	3	6	53621	53626	50 %	0 %	50 %	0 %	344209547
117	NC_015943	TA	3	6	53882	53887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015943	CG	3	6	54246	54251	0 %	0 %	50 %	50 %	344209548
119	NC_015943	AG	3	6	54324	54329	50 %	0 %	50 %	0 %	344209548
120	NC_015943	AT	3	6	54660	54665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015943	AG	3	6	54755	54760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015943	GT	3	6	54940	54945	0 %	50 %	50 %	0 %	344209549
123	NC_015943	TC	3	6	55214	55219	0 %	50 %	0 %	50 %	344209550
124	NC_015943	GA	3	6	55646	55651	50 %	0 %	50 %	0 %	344209550
125	NC_015943	GA	3	6	57497	57502	50 %	0 %	50 %	0 %	344209551
126	NC_015943	AG	3	6	58698	58703	50 %	0 %	50 %	0 %	344209551
127	NC_015943	TG	3	6	61187	61192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015943	TC	3	6	61489	61494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015943	CA	3	6	61686	61691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015943	AT	3	6	61852	61857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015943	GT	3	6	61966	61971	0 %	50 %	50 %	0 %	344209553
132	NC_015943	AG	3	6	62005	62010	50 %	0 %	50 %	0 %	344209553
133	NC_015943	GA	3	6	62545	62550	50 %	0 %	50 %	0 %	344209554
134	NC_015943	TG	3	6	62561	62566	0 %	50 %	50 %	0 %	344209554
135	NC_015943	GA	3	6	63085	63090	50 %	0 %	50 %	0 %	344209555
136	NC_015943	GT	3	6	63134	63139	0 %	50 %	50 %	0 %	344209556
137	NC_015943	TG	3	6	63518	63523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015943	AG	3	6	63940	63945	50 %	0 %	50 %	0 %	344209557
139	NC_015943	TG	3	6	64119	64124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015943	GA	3	6	64174	64179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015943	TG	3	6	64461	64466	0 %	50 %	50 %	0 %	344209558
142	NC_015943	GT	3	6	64738	64743	0 %	50 %	50 %	0 %	344209558
143	NC_015943	AT	3	6	64957	64962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015943	CA	3	6	65112	65117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015943	CG	4	8	65331	65338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015943	GA	3	6	65520	65525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015943	GT	4	8	65529	65536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015943	GT	3	6	65681	65686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015943	CG	4	8	66083	66090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015943	CG	3	6	66219	66224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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