MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	GC	3	6	5286	5291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015943	GT	3	6	5344	5349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015943	CT	3	6	7642	7647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015943	CT	4	8	8211	8218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015943	GA	3	6	8300	8305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015943	GT	3	6	8488	8493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015943	TG	3	6	8509	8514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015943	TA	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015943	GT	3	6	8777	8782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015943	GA	3	6	9430	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015943	GA	3	6	9508	9513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015943	GC	3	6	10142	10147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015943	CA	3	6	10171	10176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015943	GT	3	6	10619	10624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015943	TC	3	6	10798	10803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015943	GT	3	6	11321	11326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015943	GT	3	6	11646	11651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015943	GC	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015943	GT	3	6	13335	13340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015943	GA	3	6	13415	13420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015943	GA	3	6	13886	13891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015943	TC	3	6	13894	13899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015943	TC	3	6	15952	15957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015943	TA	3	6	17364	17369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015943	GT	3	6	17422	17427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015943	AT	3	6	17807	17812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015943	GT	3	6	19383	19388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015943	TC	3	6	19549	19554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015943	TG	3	6	20749	20754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015943	GT	3	6	29315	29320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015943	GT	3	6	30367	30372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015943	GC	3	6	32531	32536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015943	GT	3	6	33391	33396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015943	AC	3	6	33419	33424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015943	AT	3	6	34114	34119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015943	GA	4	8	37730	37737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015943	GT	3	6	41701	41706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015943	CG	3	6	42303	42308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015943	AG	3	6	42311	42316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015943	AG	4	8	43107	43114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015943	AG	3	6	43806	43811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015943	TC	3	6	45090	45095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015943	AC	3	6	46527	46532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015943	TC	3	6	46977	46982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015943	AC	3	6	47203	47208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015943	GA	3	6	47319	47324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015943	TG	3	6	47491	47496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015943	TA	3	6	53882	53887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015943	AT	3	6	54660	54665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015943	AG	3	6	54755	54760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015943	TG	3	6	61187	61192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015943	TC	3	6	61489	61494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015943	CA	3	6	61686	61691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015943	AT	3	6	61852	61857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015943	TG	3	6	63518	63523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015943	TG	3	6	64119	64124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015943	GA	3	6	64174	64179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015943	AT	3	6	64957	64962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015943	CA	3	6	65112	65117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015943	CG	4	8	65331	65338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015943	GA	3	6	65520	65525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015943	GT	4	8	65529	65536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015943	GT	3	6	65681	65686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015943	CG	4	8	66083	66090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015943	CG	3	6	66219	66224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015943	TA	3	6	66292	66297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015943	CG	3	6	67794	67799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015943	GA	3	6	67859	67864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015943	GT	3	6	67877	67882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015943	GC	3	6	67945	67950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015943	CG	3	6	68040	68045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015943	AG	3	6	68151	68156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015943	AC	3	6	69572	69577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015943	TG	3	6	69586	69591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015943	TG	3	6	69820	69825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015943	CA	3	6	72191	72196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015943	AC	3	6	73266	73271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015943	GT	3	6	74597	74602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015943	TG	3	6	74805	74810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015943	GC	3	6	75560	75565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015943	CG	3	6	75655	75660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015943	AG	3	6	76474	76479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015943	AG	3	6	78028	78033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015943	AG	3	6	78168	78173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015943	CT	4	8	78217	78224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015943	TC	3	6	78827	78832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015943	CA	3	6	78879	78884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015943	AG	3	6	79914	79919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015943	TA	3	6	82809	82814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015943	CA	3	6	82827	82832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015943	TA	3	6	84405	84410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015943	AT	4	8	84448	84455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015943	TA	3	6	84507	84512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015943	GT	3	6	84624	84629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015943	TG	3	6	86642	86647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015943	AT	3	6	88026	88031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015943	AT	4	8	88060	88067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015943	GA	3	6	89493	89498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015943	TC	3	6	91158	91163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015943	GC	3	6	91249	91254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015943	GC	3	6	91262	91267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015943	AG	3	6	92240	92245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015943	TA	3	6	94365	94370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015943	TA	3	6	94859	94864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015943	CA	3	6	94908	94913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015943	GA	3	6	94943	94948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015943	GC	3	6	97357	97362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015943	AG	3	6	98183	98188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015943	GT	3	6	98907	98912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015943	GA	4	8	99914	99921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015943	CA	3	6	101169	101174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015943	CA	3	6	101605	101610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015943	AT	3	6	101967	101972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015943	GA	3	6	102038	102043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015943	TA	3	6	103666	103671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015943	TC	3	6	103873	103878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015943	CT	3	6	103964	103969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015943	GA	3	6	103977	103982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015943	TG	3	6	104819	104824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015943	AC	3	6	105201	105206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015943	TC	3	6	105472	105477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015943	CG	3	6	105801	105806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015943	AC	3	6	105939	105944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015943	AC	3	6	106077	106082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015943	GT	3	6	106194	106199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015943	TG	3	6	109565	109570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015943	CA	3	6	110032	110037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015943	CA	3	6	110934	110939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015943	CT	3	6	111775	111780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015943	AC	3	6	112030	112035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015943	TC	3	6	112527	112532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015943	AT	3	6	112598	112603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015943	AC	3	6	114402	114407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015943	CT	3	6	115126	115131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015943	GT	3	6	116195	116200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015943	CA	3	6	116570	116575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015943	TC	3	6	116655	116660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015943	TG	3	6	118167	118172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015943	GT	3	6	119025	119030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015943	GC	3	6	128524	128529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015943	AC	3	6	132359	132364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015943	CA	3	6	133296	133301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015943	AT	3	6	135499	135504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015943	GT	3	6	135712	135717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015943	TA	3	6	135797	135802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015943	TG	4	8	135949	135956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015943	AT	3	6	145420	145425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015943	AT	3	6	145585	145590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015943	AT	4	8	146532	146539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015943	GA	4	8	146599	146606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015943	CT	3	6	147935	147940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015943	TA	3	6	149458	149463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015943	TA	3	6	150196	150201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015943	GA	3	6	150465	150470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015943	CA	3	6	152144	152149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015943	GT	3	6	152925	152930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015943	TC	3	6	165663	165668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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159	NC_015943	AT	3	6	166042	166047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.