MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	TG	3	6	692	697	0 %	50 %	50 %	0 %	344209486
2	NC_015943	CT	3	6	887	892	0 %	50 %	0 %	50 %	344209486
3	NC_015943	CG	3	6	1114	1119	0 %	0 %	50 %	50 %	344209486
4	NC_015943	CT	3	6	1947	1952	0 %	50 %	0 %	50 %	344209487
5	NC_015943	GT	3	6	2146	2151	0 %	50 %	50 %	0 %	344209487
6	NC_015943	TG	3	6	2310	2315	0 %	50 %	50 %	0 %	344209487
7	NC_015943	CG	3	6	2486	2491	0 %	0 %	50 %	50 %	344209487
8	NC_015943	GT	3	6	3436	3441	0 %	50 %	50 %	0 %	344209487
9	NC_015943	GC	4	8	3462	3469	0 %	0 %	50 %	50 %	344209487
10	NC_015943	GC	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	344209489
11	NC_015943	TC	3	6	5650	5655	0 %	50 %	0 %	50 %	344209490
12	NC_015943	TA	3	6	5878	5883	50 %	50 %	0 %	0 %	344209490
13	NC_015943	GT	3	6	6592	6597	0 %	50 %	50 %	0 %	344209490
14	NC_015943	GA	3	6	6670	6675	50 %	0 %	50 %	0 %	344209490
15	NC_015943	AG	3	6	7029	7034	50 %	0 %	50 %	0 %	344209491
16	NC_015943	TC	3	6	7080	7085	0 %	50 %	0 %	50 %	344209491
17	NC_015943	TG	3	6	7927	7932	0 %	50 %	50 %	0 %	344209494
18	NC_015943	GA	3	6	14426	14431	50 %	0 %	50 %	0 %	344209495
19	NC_015943	TC	3	6	15429	15434	0 %	50 %	0 %	50 %	344209497
20	NC_015943	AG	3	6	19047	19052	50 %	0 %	50 %	0 %	344209502
21	NC_015943	AG	3	6	21399	21404	50 %	0 %	50 %	0 %	344209507
22	NC_015943	CG	3	6	21774	21779	0 %	0 %	50 %	50 %	344209507
23	NC_015943	GA	3	6	22984	22989	50 %	0 %	50 %	0 %	344209507
24	NC_015943	GT	3	6	23618	23623	0 %	50 %	50 %	0 %	344209507
25	NC_015943	GT	3	6	24194	24199	0 %	50 %	50 %	0 %	344209508
26	NC_015943	CA	3	6	25339	25344	50 %	0 %	0 %	50 %	344209508
27	NC_015943	AT	3	6	26462	26467	50 %	50 %	0 %	0 %	344209509
28	NC_015943	CA	3	6	26489	26494	50 %	0 %	0 %	50 %	344209509
29	NC_015943	AT	3	6	26908	26913	50 %	50 %	0 %	0 %	344209510
30	NC_015943	CG	3	6	29685	29690	0 %	0 %	50 %	50 %	344209515
31	NC_015943	GT	3	6	31811	31816	0 %	50 %	50 %	0 %	344209518
32	NC_015943	AG	3	6	33037	33042	50 %	0 %	50 %	0 %	344209520
33	NC_015943	GA	3	6	34591	34596	50 %	0 %	50 %	0 %	344209523
34	NC_015943	AT	3	6	35531	35536	50 %	50 %	0 %	0 %	344209524
35	NC_015943	CT	3	6	35586	35591	0 %	50 %	0 %	50 %	344209524
36	NC_015943	CA	3	6	36242	36247	50 %	0 %	0 %	50 %	344209524
37	NC_015943	TG	3	6	36958	36963	0 %	50 %	50 %	0 %	344209525
38	NC_015943	AC	3	6	37136	37141	50 %	0 %	0 %	50 %	344209525
39	NC_015943	CA	3	6	37517	37522	50 %	0 %	0 %	50 %	344209525
40	NC_015943	GA	3	6	37805	37810	50 %	0 %	50 %	0 %	344209526
41	NC_015943	CA	3	6	38415	38420	50 %	0 %	0 %	50 %	344209526
42	NC_015943	GT	3	6	38615	38620	0 %	50 %	50 %	0 %	344209526
43	NC_015943	CA	3	6	39009	39014	50 %	0 %	0 %	50 %	344209526
44	NC_015943	CG	4	8	39445	39452	0 %	0 %	50 %	50 %	344209527
45	NC_015943	AC	3	6	39915	39920	50 %	0 %	0 %	50 %	344209527
46	NC_015943	GT	3	6	40147	40152	0 %	50 %	50 %	0 %	344209527
47	NC_015943	GC	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	344209528
48	NC_015943	AC	3	6	43220	43225	50 %	0 %	0 %	50 %	344209535
49	NC_015943	GT	3	6	43472	43477	0 %	50 %	50 %	0 %	344209536
50	NC_015943	TC	3	6	43541	43546	0 %	50 %	0 %	50 %	344209536
51	NC_015943	AC	3	6	45629	45634	50 %	0 %	0 %	50 %	344209541
52	NC_015943	CT	3	6	45974	45979	0 %	50 %	0 %	50 %	344209541
53	NC_015943	GT	3	6	46255	46260	0 %	50 %	50 %	0 %	344209541
54	NC_015943	TC	3	6	48314	48319	0 %	50 %	0 %	50 %	344209542
55	NC_015943	GC	3	6	48668	48673	0 %	0 %	50 %	50 %	344209543
56	NC_015943	TG	3	6	49378	49383	0 %	50 %	50 %	0 %	344209544
57	NC_015943	GT	3	6	49437	49442	0 %	50 %	50 %	0 %	344209544
58	NC_015943	AC	3	6	49462	49467	50 %	0 %	0 %	50 %	344209544
59	NC_015943	AG	3	6	49762	49767	50 %	0 %	50 %	0 %	344209545
60	NC_015943	GA	3	6	50751	50756	50 %	0 %	50 %	0 %	344209545
61	NC_015943	GC	3	6	50982	50987	0 %	0 %	50 %	50 %	344209545
62	NC_015943	GA	3	6	51155	51160	50 %	0 %	50 %	0 %	344209545
63	NC_015943	AC	3	6	51885	51890	50 %	0 %	0 %	50 %	344209546
64	NC_015943	GA	3	6	52307	52312	50 %	0 %	50 %	0 %	344209546
65	NC_015943	AT	3	6	52534	52539	50 %	50 %	0 %	0 %	344209546
66	NC_015943	GT	3	6	52736	52741	0 %	50 %	50 %	0 %	344209546
67	NC_015943	AG	3	6	52953	52958	50 %	0 %	50 %	0 %	344209547
68	NC_015943	GT	3	6	53368	53373	0 %	50 %	50 %	0 %	344209547
69	NC_015943	GA	3	6	53621	53626	50 %	0 %	50 %	0 %	344209547
70	NC_015943	CG	3	6	54246	54251	0 %	0 %	50 %	50 %	344209548
71	NC_015943	AG	3	6	54324	54329	50 %	0 %	50 %	0 %	344209548
72	NC_015943	GT	3	6	54940	54945	0 %	50 %	50 %	0 %	344209549
73	NC_015943	TC	3	6	55214	55219	0 %	50 %	0 %	50 %	344209550
74	NC_015943	GA	3	6	55646	55651	50 %	0 %	50 %	0 %	344209550
75	NC_015943	GA	3	6	57497	57502	50 %	0 %	50 %	0 %	344209551
76	NC_015943	AG	3	6	58698	58703	50 %	0 %	50 %	0 %	344209551
77	NC_015943	GT	3	6	61966	61971	0 %	50 %	50 %	0 %	344209553
78	NC_015943	AG	3	6	62005	62010	50 %	0 %	50 %	0 %	344209553
79	NC_015943	GA	3	6	62545	62550	50 %	0 %	50 %	0 %	344209554
80	NC_015943	TG	3	6	62561	62566	0 %	50 %	50 %	0 %	344209554
81	NC_015943	GA	3	6	63085	63090	50 %	0 %	50 %	0 %	344209555
82	NC_015943	GT	3	6	63134	63139	0 %	50 %	50 %	0 %	344209556
83	NC_015943	AG	3	6	63940	63945	50 %	0 %	50 %	0 %	344209557
84	NC_015943	TG	3	6	64461	64466	0 %	50 %	50 %	0 %	344209558
85	NC_015943	GT	3	6	64738	64743	0 %	50 %	50 %	0 %	344209558
86	NC_015943	CG	3	6	67562	67567	0 %	0 %	50 %	50 %	344209559
87	NC_015943	TC	3	6	70337	70342	0 %	50 %	0 %	50 %	344209563
88	NC_015943	CA	3	6	73356	73361	50 %	0 %	0 %	50 %	344209565
89	NC_015943	AC	3	6	73400	73405	50 %	0 %	0 %	50 %	344209565
90	NC_015943	AC	3	6	73547	73552	50 %	0 %	0 %	50 %	344209565
91	NC_015943	CT	4	8	76848	76855	0 %	50 %	0 %	50 %	344209568
92	NC_015943	CT	3	6	76938	76943	0 %	50 %	0 %	50 %	344209568
93	NC_015943	GA	3	6	77065	77070	50 %	0 %	50 %	0 %	344209568
94	NC_015943	AT	3	6	79618	79623	50 %	50 %	0 %	0 %	344209570
95	NC_015943	GA	4	8	79846	79853	50 %	0 %	50 %	0 %	344209570
96	NC_015943	CT	3	6	80954	80959	0 %	50 %	0 %	50 %	344209572
97	NC_015943	CT	3	6	81052	81057	0 %	50 %	0 %	50 %	344209572
98	NC_015943	CA	3	6	82035	82040	50 %	0 %	0 %	50 %	344209572
99	NC_015943	GA	4	8	82057	82064	50 %	0 %	50 %	0 %	344209572
100	NC_015943	GA	3	6	82672	82677	50 %	0 %	50 %	0 %	344209573
101	NC_015943	CT	3	6	83503	83508	0 %	50 %	0 %	50 %	344209575
102	NC_015943	TC	3	6	84961	84966	0 %	50 %	0 %	50 %	344209576
103	NC_015943	CT	3	6	87266	87271	0 %	50 %	0 %	50 %	344209579
104	NC_015943	CA	3	6	89546	89551	50 %	0 %	0 %	50 %	344209582
105	NC_015943	TG	3	6	89953	89958	0 %	50 %	50 %	0 %	344209583
106	NC_015943	AT	3	6	90480	90485	50 %	50 %	0 %	0 %	344209583
107	NC_015943	GC	3	6	90568	90573	0 %	0 %	50 %	50 %	344209583
108	NC_015943	GT	3	6	92004	92009	0 %	50 %	50 %	0 %	344209584
109	NC_015943	GC	3	6	92034	92039	0 %	0 %	50 %	50 %	344209584
110	NC_015943	TC	3	6	92470	92475	0 %	50 %	0 %	50 %	344209585
111	NC_015943	TC	3	6	92639	92644	0 %	50 %	0 %	50 %	344209585
112	NC_015943	GA	3	6	92790	92795	50 %	0 %	50 %	0 %	344209585
113	NC_015943	CA	3	6	93835	93840	50 %	0 %	0 %	50 %	344209586
114	NC_015943	CA	3	6	94323	94328	50 %	0 %	0 %	50 %	344209587
115	NC_015943	TG	3	6	96777	96782	0 %	50 %	50 %	0 %	344209592
116	NC_015943	TG	3	6	100894	100899	0 %	50 %	50 %	0 %	344209599
117	NC_015943	TG	3	6	104484	104489	0 %	50 %	50 %	0 %	344209603
118	NC_015943	TG	3	6	105435	105440	0 %	50 %	50 %	0 %	344209605
119	NC_015943	AC	4	8	106806	106813	50 %	0 %	0 %	50 %	344209606
120	NC_015943	CG	3	6	107638	107643	0 %	0 %	50 %	50 %	344209607
121	NC_015943	GC	3	6	108654	108659	0 %	0 %	50 %	50 %	344209608
122	NC_015943	GA	3	6	108831	108836	50 %	0 %	50 %	0 %	344209608
123	NC_015943	TA	3	6	109197	109202	50 %	50 %	0 %	0 %	344209608
124	NC_015943	TC	3	6	110263	110268	0 %	50 %	0 %	50 %	344209609
125	NC_015943	GT	3	6	110347	110352	0 %	50 %	50 %	0 %	344209609
126	NC_015943	CA	3	6	111269	111274	50 %	0 %	0 %	50 %	344209611
127	NC_015943	TG	3	6	111693	111698	0 %	50 %	50 %	0 %	344209611
128	NC_015943	TG	3	6	113548	113553	0 %	50 %	50 %	0 %	344209616
129	NC_015943	AT	3	6	113789	113794	50 %	50 %	0 %	0 %	344209616
130	NC_015943	GA	3	6	114098	114103	50 %	0 %	50 %	0 %	344209616
131	NC_015943	CT	3	6	114901	114906	0 %	50 %	0 %	50 %	344209617
132	NC_015943	CA	3	6	117760	117765	50 %	0 %	0 %	50 %	344209622
133	NC_015943	TG	3	6	118495	118500	0 %	50 %	50 %	0 %	344209624
134	NC_015943	CA	3	6	119460	119465	50 %	0 %	0 %	50 %	344209626
135	NC_015943	CG	3	6	120153	120158	0 %	0 %	50 %	50 %	344209627
136	NC_015943	GT	3	6	120205	120210	0 %	50 %	50 %	0 %	344209627
137	NC_015943	GT	3	6	120608	120613	0 %	50 %	50 %	0 %	344209627
138	NC_015943	TG	3	6	121224	121229	0 %	50 %	50 %	0 %	344209629
139	NC_015943	TC	3	6	122268	122273	0 %	50 %	0 %	50 %	344209630
140	NC_015943	AG	3	6	122587	122592	50 %	0 %	50 %	0 %	344209630
141	NC_015943	GC	3	6	123230	123235	0 %	0 %	50 %	50 %	344209631
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