MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015943	C	6	6	1632	1637	0 %	0 %	0 %	100 %	344209487
2	NC_015943	C	6	6	3654	3659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_015943	G	6	6	17870	17875	0 %	0 %	100 %	0 %	344209501
4	NC_015943	G	6	6	18834	18839	0 %	0 %	100 %	0 %	344209502
5	NC_015943	C	6	6	19513	19518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_015943	C	6	6	31371	31376	0 %	0 %	0 %	100 %	344209518
7	NC_015943	C	6	6	31470	31475	0 %	0 %	0 %	100 %	344209518
8	NC_015943	G	6	6	36073	36078	0 %	0 %	100 %	0 %	344209524
9	NC_015943	T	6	6	42197	42202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015943	G	6	6	42996	43001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015943	A	6	6	46629	46634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015943	C	7	7	47129	47135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_015943	T	6	6	51350	51355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015943	A	6	6	53387	53392	100 %	0 %	0 %	0 %	344209547
15	NC_015943	T	7	7	53803	53809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015943	A	6	6	55445	55450	100 %	0 %	0 %	0 %	344209550
17	NC_015943	T	6	6	60883	60888	0 %	100 %	0 %	0 %	344209552
18	NC_015943	G	6	6	67710	67715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015943	T	7	7	69851	69857	0 %	100 %	0 %	0 %	344209562
20	NC_015943	C	6	6	70172	70177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_015943	A	7	7	71823	71829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015943	A	6	6	73062	73067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015943	T	6	6	75034	75039	0 %	100 %	0 %	0 %	344209567
24	NC_015943	C	6	6	78666	78671	0 %	0 %	0 %	100 %	344209569
25	NC_015943	T	6	6	84651	84656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015943	C	6	6	86394	86399	0 %	0 %	0 %	100 %	344209578
27	NC_015943	T	6	6	89468	89473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015943	G	6	6	93568	93573	0 %	0 %	100 %	0 %	344209586
29	NC_015943	A	6	6	95281	95286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015943	T	6	6	98033	98038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015943	A	6	6	101984	101989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015943	G	6	6	102461	102466	0 %	0 %	100 %	0 %	344209601
33	NC_015943	T	6	6	103166	103171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015943	C	6	6	106149	106154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_015943	T	6	6	112581	112586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015943	A	6	6	119242	119247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015943	C	6	6	121491	121496	0 %	0 %	0 %	100 %	344209629
38	NC_015943	T	6	6	124316	124321	0 %	100 %	0 %	0 %	344209632
39	NC_015943	C	6	6	136852	136857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_015943	G	6	6	136858	136863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015943	T	6	6	137648	137653	0 %	100 %	0 %	0 %	344209644
42	NC_015943	T	6	6	138827	138832	0 %	100 %	0 %	0 %	344209646
43	NC_015943	T	6	6	139094	139099	0 %	100 %	0 %	0 %	344209646
44	NC_015943	T	6	6	139234	139239	0 %	100 %	0 %	0 %	344209646
45	NC_015943	T	6	6	143762	143767	0 %	100 %	0 %	0 %	344209649
46	NC_015943	T	6	6	145364	145369	0 %	100 %	0 %	0 %	344209649
47	NC_015943	T	7	7	145726	145732	0 %	100 %	0 %	0 %	344209650
48	NC_015943	A	6	6	146549	146554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015943	G	6	6	150524	150529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015943	G	6	6	150608	150613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015943	G	6	6	152355	152360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015943	T	6	6	153329	153334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015943	A	6	6	157791	157796	100 %	0 %	0 %	0 %	344209661
54	NC_015943	A	6	6	162204	162209	100 %	0 %	0 %	0 %	344209664
55	NC_015943	A	6	6	167053	167058	100 %	0 %	0 %	0 %	344209667
56	NC_015943	A	6	6	168631	168636	100 %	0 %	0 %	0 %	344209668
57	NC_015943	G	6	6	168738	168743	0 %	0 %	100 %	0 %	344209668
58	NC_015943	C	6	6	169906	169911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_015943	G	6	6	174823	174828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015943	T	6	6	176845	176850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015943	G	6	6	177173	177178	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015943	C	6	6	179005	179010	0 %	0 %	0 %	100 %	344209679
63	NC_015943	T	6	6	179818	179823	0 %	100 %	0 %	0 %	344209679
64	NC_015943	A	6	6	183711	183716	100 %	0 %	0 %	0 %	344209683
65	NC_015943	T	6	6	184135	184140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015943	A	6	6	185239	185244	100 %	0 %	0 %	0 %	344209684
67	NC_015943	T	6	6	187749	187754	0 %	100 %	0 %	0 %	344209685
68	NC_015943	A	6	6	188183	188188	100 %	0 %	0 %	0 %	344209685
69	NC_015943	G	6	6	188611	188616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015943	A	6	6	197351	197356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015943	G	6	6	199312	199317	0 %	0 %	100 %	0 %	344209700
72	NC_015943	A	6	6	202233	202238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015943	C	6	6	203486	203491	0 %	0 %	0 %	100 %	344209705
74	NC_015943	T	6	6	206274	206279	0 %	100 %	0 %	0 %	344209707
75	NC_015943	A	6	6	208250	208255	100 %	0 %	0 %	0 %	344209708
76	NC_015943	C	6	6	211496	211501	0 %	0 %	0 %	100 %	344209712
77	NC_015943	T	6	6	215454	215459	0 %	100 %	0 %	0 %	344209715
78	NC_015943	T	7	7	215637	215643	0 %	100 %	0 %	0 %	344209715
79	NC_015943	T	6	6	219405	219410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015943	C	6	6	220169	220174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_015943	T	6	6	220348	220353	0 %	100 %	0 %	0 %	344209720
82	NC_015943	A	6	6	223007	223012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015943	A	6	6	226074	226079	100 %	0 %	0 %	0 %	344209723
84	NC_015943	G	6	6	228819	228824	0 %	0 %	100 %	0 %	344209725
85	NC_015943	A	6	6	229321	229326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015943	T	7	7	241795	241801	0 %	100 %	0 %	0 %	344209738
87	NC_015943	T	6	6	247430	247435	0 %	100 %	0 %	0 %	344209742
88	NC_015943	T	6	6	254397	254402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015943	C	6	6	254899	254904	0 %	0 %	0 %	100 %	344209746
90	NC_015943	A	6	6	260570	260575	100 %	0 %	0 %	0 %	344209753
91	NC_015943	G	6	6	261010	261015	0 %	0 %	100 %	0 %	344209753
92	NC_015943	G	6	6	261083	261088	0 %	0 %	100 %	0 %	344209754
93	NC_015943	C	6	6	262623	262628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_015943	C	6	6	262714	262719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_015943	A	6	6	264582	264587	100 %	0 %	0 %	0 %	344209757
96	NC_015943	T	6	6	278114	278119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015943	A	6	6	279635	279640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015943	C	6	6	288711	288716	0 %	0 %	0 %	100 %	344209778
99	NC_015943	T	6	6	288727	288732	0 %	100 %	0 %	0 %	344209778
100	NC_015943	C	7	7	289296	289302	0 %	0 %	0 %	100 %	344209779
101	NC_015943	A	6	6	290790	290795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015943	A	6	6	291738	291743	100 %	0 %	0 %	0 %	344209781
103	NC_015943	G	6	6	291952	291957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015943	G	6	6	294245	294250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015943	A	6	6	296753	296758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015943	T	6	6	297241	297246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015943	A	6	6	297829	297834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015943	T	6	6	300157	300162	0 %	100 %	0 %	0 %	344209791
109	NC_015943	T	6	6	303547	303552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015943	C	6	6	304728	304733	0 %	0 %	0 %	100 %	344209794
111	NC_015943	G	6	6	310530	310535	0 %	0 %	100 %	0 %	344209799
112	NC_015943	C	6	6	310665	310670	0 %	0 %	0 %	100 %	344209799
113	NC_015943	C	6	6	341960	341965	0 %	0 %	0 %	100 %	344209824
114	NC_015943	C	6	6	350005	350010	0 %	0 %	0 %	100 %	344209831
115	NC_015943	C	6	6	352368	352373	0 %	0 %	0 %	100 %	344209833
116	NC_015943	T	6	6	361012	361017	0 %	100 %	0 %	0 %	344209843
117	NC_015943	T	7	7	383360	383366	0 %	100 %	0 %	0 %	344209861
118	NC_015943	A	6	6	385367	385372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015943	C	6	6	386217	386222	0 %	0 %	0 %	100 %	344209863
120	NC_015943	G	6	6	389726	389731	0 %	0 %	100 %	0 %	344209865
121	NC_015943	C	6	6	396543	396548	0 %	0 %	0 %	100 %	344209871
122	NC_015943	A	6	6	398313	398318	100 %	0 %	0 %	0 %	344209873
123	NC_015943	C	6	6	400104	400109	0 %	0 %	0 %	100 %	344209875
124	NC_015943	A	6	6	400792	400797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015943	G	6	6	401179	401184	0 %	0 %	100 %	0 %	344209876
126	NC_015943	C	6	6	403642	403647	0 %	0 %	0 %	100 %	344209877
127	NC_015943	C	6	6	406486	406491	0 %	0 %	0 %	100 %	344209878
128	NC_015943	C	6	6	407128	407133	0 %	0 %	0 %	100 %	344209878
129	NC_015943	G	6	6	408641	408646	0 %	0 %	100 %	0 %	344209878
130	NC_015943	T	6	6	410884	410889	0 %	100 %	0 %	0 %	344209879
131	NC_015943	G	6	6	433017	433022	0 %	0 %	100 %	0 %	344209894
132	NC_015943	A	6	6	438867	438872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015943	G	6	6	448022	448027	0 %	0 %	100 %	0 %	344209907
134	NC_015943	C	6	6	450014	450019	0 %	0 %	0 %	100 %	344209908
135	NC_015943	T	6	6	457171	457176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015943	C	6	6	458821	458826	0 %	0 %	0 %	100 %	344209915
137	NC_015943	T	6	6	461684	461689	0 %	100 %	0 %	0 %	344209917
138	NC_015943	C	6	6	469990	469995	0 %	0 %	0 %	100 %	344209923
139	NC_015943	T	7	7	470791	470797	0 %	100 %	0 %	0 %	344209924
140	NC_015943	G	6	6	476752	476757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015943	T	6	6	483923	483928	0 %	100 %	0 %	0 %	344209938
142	NC_015943	C	6	6	488344	488349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_015943	C	6	6	488400	488405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_015943	C	6	6	488702	488707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_015943	G	6	6	488904	488909	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.