MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015942	CCTGTT	2	12	37658	37669	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015942	GCCCTT	2	12	52463	52474	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015942	AAACCG	2	12	95187	95198	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015942	ATCGGC	2	12	143701	143712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015942	GATCAG	2	12	143922	143933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015942	TTTATT	2	12	223120	223131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015942	GGTGAT	2	12	277711	277722	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015942	CAGACC	2	12	316293	316304	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015942	AAGCGT	2	12	361296	361307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015942	CGATTA	2	12	367014	367025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015942	GGCCTG	2	12	403427	403438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015942	CATCAG	2	12	405503	405514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015942	GACTTG	2	12	422187	422198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015942	ATGTTT	2	12	459795	459806	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015942	GGAGGT	2	12	468078	468089	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015942	ACAGCC	2	12	488024	488035	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015942	GGCTCT	2	12	511615	511626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015942	TTCTCA	2	12	511627	511638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015942	CCGAAG	2	12	580719	580730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015942	CAAAAA	2	12	610754	610765	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015942	TGGCGG	2	12	627186	627197	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015942	TGGAGG	2	12	709980	709991	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015942	TCCAGA	2	12	718805	718816	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015942	TGGAGG	2	12	773997	774008	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015942	ATATCC	2	12	791699	791710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015942	CGCCAG	2	12	798901	798912	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015942	ATGTTT	2	12	819352	819363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015942	GGTGAC	2	12	847757	847768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015942	TTCTTG	2	12	901929	901940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015942	TAGGGT	2	12	901953	901964	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015942	GTCTGT	2	12	903317	903328	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015942	CGGCTT	2	12	914175	914186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015942	ATGTTT	2	12	914278	914289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015942	GCTTGG	2	12	926598	926609	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015942	GGCTCT	2	12	926905	926916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015942	TTCTCA	2	12	926917	926928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015942	ATTTCC	2	12	953317	953328	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015942	AAGGGC	2	12	972873	972884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015942	CTGTCC	2	12	1060988	1060999	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015942	GCAAAA	3	18	1072951	1072968	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015942	CCATGT	2	12	1196841	1196852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015942	TGGCGG	2	12	1209660	1209671	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015942	GCCATT	2	12	1465080	1465091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015942	ATCGGC	2	12	1480945	1480956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015942	AGACGG	2	12	1481222	1481233	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015942	GTCTTG	2	12	1483273	1483284	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015942	GGCTGC	2	12	1483653	1483664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015942	CTGGCC	2	12	1499082	1499093	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015942	GGTGCG	2	12	1533118	1533129	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015942	CCAGCA	2	12	1539593	1539604	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015942	CATAAA	2	12	1542244	1542255	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015942	AGATCC	2	12	1564161	1564172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015942	CCTGTC	2	12	1598831	1598842	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015942	CGGCAC	2	12	1623697	1623708	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015942	GTTATT	2	12	1635424	1635435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015942	CGGACA	2	12	1673811	1673822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015942	ACCTGG	2	12	1710866	1710877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015942	AATAAA	2	12	1723230	1723241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015942	CCAGCC	2	12	1850105	1850116	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015942	CACCGG	2	12	1868897	1868908	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015942	TAAAAA	2	12	1877377	1877388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015942	AAGCGG	2	12	1889761	1889772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015942	GCCGCT	2	12	1900555	1900566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015942	GCCGCT	2	12	1900568	1900579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015942	TCCTTT	2	12	1903285	1903296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015942	GAAAAA	2	12	1915482	1915493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015942	GCAACC	2	12	1917771	1917782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015942	TATTAC	2	12	1947135	1947146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015942	TTTCTG	2	12	1968610	1968621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015942	CTCCGT	2	12	1969380	1969391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015942	CATGCC	2	12	2062383	2062394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015942	GCTCCA	2	12	2073246	2073257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015942	TATGAA	2	12	2092927	2092938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015942	ATGTTC	2	12	2115775	2115786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015942	ACGATA	2	12	2149754	2149765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015942	GCCTCC	2	12	2154967	2154978	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015942	CTATAT	2	12	2228779	2228790	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015942	ACCTGC	2	12	2340038	2340049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015942	CTGGAA	2	12	2341190	2341201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015942	GAACAA	2	12	2345784	2345795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015942	TCATTC	2	12	2441602	2441613	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015942	TGGAAC	2	12	2461139	2461150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015942	TCATAA	2	12	2499011	2499022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015942	TCGCAC	2	12	2512619	2512630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015942	CATTGG	2	12	2552227	2552238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015942	ACATAA	3	18	2590630	2590647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015942	AAACAG	2	12	2592644	2592655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015942	TGGGTA	2	12	2609017	2609028	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015942	AGAAAA	2	12	2627573	2627584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015942	GAGGCG	2	12	2887910	2887921	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015942	TGTGTC	2	12	2907619	2907630	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015942	CAGAAG	2	12	2950156	2950167	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015942	ATGGCA	2	12	2950405	2950416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015942	GTTTCC	2	12	2995974	2995985	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015942	TTTCAC	2	12	2999278	2999289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015942	CACCGG	2	12	3060270	3060281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015942	ACATAA	2	12	3090177	3090188	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015942	AAACCA	2	12	3101846	3101857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015942	TGGGCC	2	12	3150540	3150551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015942	AAATAC	2	12	3155595	3155606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015942	GATACC	2	12	3201965	3201976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015942	GGATGT	2	12	3206738	3206749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.