Hexa-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 1233

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1001NC_015942CCTGAA2122516724251673533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344200619
1002NC_015942TGCATC2122521396252140716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200622
1003NC_015942GCCAGC2122521960252197116.67 %0 %33.33 %50 %344200623
1004NC_015942ATCCCG2122524087252409816.67 %16.67 %16.67 %50 %344200627
1005NC_015942CGCGCA2122524791252480216.67 %0 %33.33 %50 %344200627
1006NC_015942GCGCCA2122525853252586416.67 %0 %33.33 %50 %344200627
1007NC_015942TGCGGG212253187625318870 %16.67 %66.67 %16.67 %344200633
1008NC_015942AATAGC2122531942253195350 %16.67 %16.67 %16.67 %344200633
1009NC_015942CAGGAT2122532062253207333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344200633
1010NC_015942GACAAT2122532804253281550 %16.67 %16.67 %16.67 %344200635
1011NC_015942ATAACG2122532870253288150 %16.67 %16.67 %16.67 %344200635
1012NC_015942TGTCCT212253574225357530 %50 %16.67 %33.33 %344200636
1013NC_015942ATATTC2122536189253620033.33 %50 %0 %16.67 %344200637
1014NC_015942GCAGAA2122540862254087350 %0 %33.33 %16.67 %344200643
1015NC_015942CGCCTG212254145025414610 %16.67 %33.33 %50 %344200644
1016NC_015942ATCACC2122542750254276133.33 %16.67 %0 %50 %344200645
1017NC_015942CGCCAG2122544021254403216.67 %0 %33.33 %50 %344200646
1018NC_015942CATTGG2122552227255223816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %Non-Coding
1019NC_015942GAAGCA2122555544255555550 %0 %33.33 %16.67 %344200654
1020NC_015942CCCTCC212256306325630740 %16.67 %0 %83.33 %344200658
1021NC_015942ATCCAG2122564247256425833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344200660
1022NC_015942GTAGGT2122574358257436916.67 %33.33 %50 %0 %344200671
1023NC_015942GATAGG2122582383258239433.33 %16.67 %50 %0 %344200679
1024NC_015942TGTTTA2122583035258304616.67 %66.67 %16.67 %0 %344200680
1025NC_015942TCGATG2122584460258447116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %344200681
1026NC_015942TGCCAT2122584918258492916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200681
1027NC_015942GCGCCA3182589519258953616.67 %0 %33.33 %50 %344200685
1028NC_015942ACATAA3182590630259064766.67 %16.67 %0 %16.67 %Non-Coding
1029NC_015942AAACAG2122592644259265566.67 %0 %16.67 %16.67 %Non-Coding
1030NC_015942GCCGTT212259651025965210 %33.33 %33.33 %33.33 %344200694
1031NC_015942TACGGC2122604522260453316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344200700
1032NC_015942CCAGCG2122607733260774416.67 %0 %33.33 %50 %344200701
1033NC_015942TGGGTA2122609017260902816.67 %33.33 %50 %0 %Non-Coding
1034NC_015942ATGGCG2122610322261033316.67 %16.67 %50 %16.67 %344200703
1035NC_015942GGCCGA2122613051261306216.67 %0 %50 %33.33 %344200704
1036NC_015942CTTCAC2122621183262119416.67 %33.33 %0 %50 %344200713
1037NC_015942CAGGCC2122621657262166816.67 %0 %33.33 %50 %344200714
1038NC_015942AGAAAA2122627573262758483.33 %0 %16.67 %0 %Non-Coding
1039NC_015942CTACAT2122627691262770233.33 %33.33 %0 %33.33 %344200722
1040NC_015942GCCGCG212263529526353060 %0 %50 %50 %344200728
1041NC_015942ATCCAC2122637520263753133.33 %16.67 %0 %50 %344200729
1042NC_015942CATCGG2122655518265552916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344200742
1043NC_015942AGGTAA2122666089266610050 %16.67 %33.33 %0 %344200751
1044NC_015942CAGCAC2122668283266829433.33 %0 %16.67 %50 %344200755
1045NC_015942GGTCCC212267336126733720 %16.67 %33.33 %50 %344200762
1046NC_015942ATCTAA2122674721267473250 %33.33 %0 %16.67 %344200766
1047NC_015942CTTCAT2122687997268800816.67 %50 %0 %33.33 %344200790
1048NC_015942GGATCG2122688056268806716.67 %16.67 %50 %16.67 %344200790
1049NC_015942CAGGCG2122697529269754016.67 %0 %50 %33.33 %344200794
1050NC_015942ACCCGG2122709154270916516.67 %0 %33.33 %50 %344200810
1051NC_015942GACCAT2122712462271247333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344200813
1052NC_015942AGGGCT2122713034271304516.67 %16.67 %50 %16.67 %344200814
1053NC_015942CTGGAG2122713774271378516.67 %16.67 %50 %16.67 %344200815
1054NC_015942GGCGAG2122714928271493916.67 %0 %66.67 %16.67 %344200816
1055NC_015942CACGGC2122717627271763816.67 %0 %33.33 %50 %344200819
1056NC_015942AGGAGC2122718558271856933.33 %0 %50 %16.67 %344200819
1057NC_015942TGAGAT2122724714272472533.33 %33.33 %33.33 %0 %344200825
1058NC_015942ATAGAG2122724840272485150 %16.67 %33.33 %0 %344200826
1059NC_015942ACCGCC2122728266272827716.67 %0 %16.67 %66.67 %344200831
1060NC_015942TGCTGG212272900827290190 %33.33 %50 %16.67 %344200831
1061NC_015942ATACAG2122730440273045150 %16.67 %16.67 %16.67 %344200833
1062NC_015942ACAACC2122738964273897550 %0 %0 %50 %344200843
1063NC_015942GTTCCC212273918827391990 %33.33 %16.67 %50 %344200843
1064NC_015942GCCTAC2122740371274038216.67 %16.67 %16.67 %50 %344200845
1065NC_015942GGTCAA2122740955274096633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344200845
1066NC_015942AATGCC2122746276274628733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344200852
1067NC_015942CATCAC2122746582274659333.33 %16.67 %0 %50 %344200853
1068NC_015942CAGCCC2122751562275157316.67 %0 %16.67 %66.67 %344200859
1069NC_015942ACCAGC2122751785275179633.33 %0 %16.67 %50 %344200859
1070NC_015942GCCTGC212275570227557130 %16.67 %33.33 %50 %344200863
1071NC_015942CGCGCT212276033827603490 %16.67 %33.33 %50 %344200867
1072NC_015942CGTCCC212276464127646520 %16.67 %16.67 %66.67 %344200871
1073NC_015942GCATTG2122770000277001116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %344200877
1074NC_015942GCAGGG2122770305277031616.67 %0 %66.67 %16.67 %344200878
1075NC_015942GCTTCA2122780297278030816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200886
1076NC_015942TGCAGC2122783092278310316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344200889
1077NC_015942GGCGCT212278523327852440 %16.67 %50 %33.33 %344200890
1078NC_015942CATTCC2122785248278525916.67 %33.33 %0 %50 %344200890
1079NC_015942TCGGCT212278821327882240 %33.33 %33.33 %33.33 %344200893
1080NC_015942TGCTCC212278862127886320 %33.33 %16.67 %50 %344200893
1081NC_015942TCCCCT212279013427901450 %33.33 %0 %66.67 %344200894
1082NC_015942ATCGCC2122790698279070916.67 %16.67 %16.67 %50 %344200895
1083NC_015942CGCCGA2122792094279210516.67 %0 %33.33 %50 %344200896
1084NC_015942CGGCAC2122796084279609516.67 %0 %33.33 %50 %344200900
1085NC_015942ATATTG2122801833280184433.33 %50 %16.67 %0 %344200907
1086NC_015942TGGTTC212280564228056530 %50 %33.33 %16.67 %344200912
1087NC_015942ATGTTT2122806089280610016.67 %66.67 %16.67 %0 %344200912
1088NC_015942GCTTAC2122806327280633816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200913
1089NC_015942TTCGAC2122809633280964416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200916
1090NC_015942CAATAT2122810160281017150 %33.33 %0 %16.67 %344200917
1091NC_015942GAAATT2122810546281055750 %33.33 %16.67 %0 %344200917
1092NC_015942GAACAG2122810687281069850 %0 %33.33 %16.67 %344200917
1093NC_015942TGCTGT212281343928134500 %50 %33.33 %16.67 %344200921
1094NC_015942CCGCTC212281567728156880 %16.67 %16.67 %66.67 %344200923
1095NC_015942CACACC2122816655281666633.33 %0 %0 %66.67 %344200923
1096NC_015942CAAATT2122817092281710350 %33.33 %0 %16.67 %344200923
1097NC_015942GTTCCA2122823549282356016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200930
1098NC_015942GCCAGC2122824906282491716.67 %0 %33.33 %50 %344200932
1099NC_015942TACCAG2122826094282610533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344200933
1100NC_015942CACCGC2122827717282772816.67 %0 %16.67 %66.67 %344200934
1101NC_015942CGCCCG212283698528369960 %0 %33.33 %66.67 %344200944
1102NC_015942TGCATC2122837683283769416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344200945
1103NC_015942CGGCCC212284433728443480 %0 %33.33 %66.67 %344200951
1104NC_015942CGGCAT2122845336284534716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344200953
1105NC_015942ATGGTA2122848321284833233.33 %33.33 %33.33 %0 %344200958
1106NC_015942GCACCG2122848972284898316.67 %0 %33.33 %50 %344200959
1107NC_015942CCAGCC2122852165285217616.67 %0 %16.67 %66.67 %344200963
1108NC_015942ATCACC2122855392285540333.33 %16.67 %0 %50 %344200966
1109NC_015942CCTGGA2122858121285813216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344200969
1110NC_015942GCCAGT2122858421285843216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344200969
1111NC_015942CAAGCC2122859074285908533.33 %0 %16.67 %50 %344200970
1112NC_015942CCGCTC212286030728603180 %16.67 %16.67 %66.67 %344200970
1113NC_015942AGCGCA2122869216286922733.33 %0 %33.33 %33.33 %344200983
1114NC_015942GCACCA2122870000287001133.33 %0 %16.67 %50 %344200985
1115NC_015942ATCCGC2122877436287744716.67 %16.67 %16.67 %50 %344200992
1116NC_015942GCCTGC212288208828820990 %16.67 %33.33 %50 %344200997
1117NC_015942CCGGTC212288350728835180 %16.67 %33.33 %50 %344200999
1118NC_015942TGGGCA2122883920288393116.67 %16.67 %50 %16.67 %344201000
1119NC_015942AGGAAG2122884669288468050 %0 %50 %0 %344201001
1120NC_015942GAGGCG2122887910288792116.67 %0 %66.67 %16.67 %Non-Coding
1121NC_015942GGCTTT212288812428881350 %50 %33.33 %16.67 %344201006
1122NC_015942TAACCA2122894441289445250 %16.67 %0 %33.33 %344201011
1123NC_015942TCCCGC212289728528972960 %16.67 %16.67 %66.67 %344201014
1124NC_015942TGTGTC212290761929076300 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
1125NC_015942GTCGTA2122911758291176916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %344201036
1126NC_015942CCATTT2122913004291301516.67 %50 %0 %33.33 %344201038
1127NC_015942GCGGCT212291654929165600 %16.67 %50 %33.33 %344201045
1128NC_015942TCGGCA2122916873291688416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201045
1129NC_015942GGGTTT212292169429217050 %50 %50 %0 %344201047
1130NC_015942TGGCTC212292883429288450 %33.33 %33.33 %33.33 %344201056
1131NC_015942CAGTAC2122929570292958133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201058
1132NC_015942CGGACG2122932538293254916.67 %0 %50 %33.33 %344201061
1133NC_015942TCCCGC212293274529327560 %16.67 %16.67 %66.67 %344201061
1134NC_015942CCGCAC2122933578293358916.67 %0 %16.67 %66.67 %344201061
1135NC_015942CAGCTT2122934218293422916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344201061
1136NC_015942TTGCCA2122934370293438116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344201062
1137NC_015942GTCAGC2122936722293673316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201064
1138NC_015942CGATCA2122938835293884633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201067
1139NC_015942ATGGCG2122941213294122416.67 %16.67 %50 %16.67 %344201072
1140NC_015942GGATAC2122942226294223733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344201075
1141NC_015942GCAGTA2122946182294619333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344201079
1142NC_015942CTATAC2122946888294689933.33 %33.33 %0 %33.33 %344201082
1143NC_015942CCATCG2122947851294786216.67 %16.67 %16.67 %50 %344201083
1144NC_015942CAGAAG2122950156295016750 %0 %33.33 %16.67 %Non-Coding
1145NC_015942ATGGCA2122950405295041633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
1146NC_015942TCCGGC212295249829525090 %16.67 %33.33 %50 %344201088
1147NC_015942AAAGGA2122953928295393966.67 %0 %33.33 %0 %344201089
1148NC_015942ATTGCC2122956028295603916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344201090
1149NC_015942CTTTGA2122957438295744916.67 %50 %16.67 %16.67 %344201092
1150NC_015942TCAACG2122958202295821333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201092
1151NC_015942CGCTAT2122958420295843116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344201092
1152NC_015942CATTCG2122959216295922716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %344201095
1153NC_015942ATGCCG2122962077296208816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201101
1154NC_015942CCCAAT2122965947296595833.33 %16.67 %0 %50 %344201106
1155NC_015942GCATAA2122966390296640150 %16.67 %16.67 %16.67 %344201106
1156NC_015942TGACGG2122968695296870616.67 %16.67 %50 %16.67 %344201109
1157NC_015942CATGAG2122971129297114033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344201110
1158NC_015942AGGGGA2122971990297200133.33 %0 %66.67 %0 %344201111
1159NC_015942CTGACC2122982227298223816.67 %16.67 %16.67 %50 %344201122
1160NC_015942CCAATA2122987944298795550 %16.67 %0 %33.33 %344201127
1161NC_015942CGGTGG212298942029894310 %16.67 %66.67 %16.67 %344201129
1162NC_015942GTTTCC212299597429959850 %50 %16.67 %33.33 %Non-Coding
1163NC_015942GCCTTC212299794329979540 %33.33 %16.67 %50 %344201139
1164NC_015942GGGCGC212299805329980640 %0 %66.67 %33.33 %344201139
1165NC_015942TCGTCT212299914329991540 %50 %16.67 %33.33 %344201140
1166NC_015942TTTCAC2122999278299928916.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
1167NC_015942GCGGGA2123003012300302316.67 %0 %66.67 %16.67 %344201147
1168NC_015942GTCGGC212301092730109380 %16.67 %50 %33.33 %344201152
1169NC_015942CCTACG2123011397301140816.67 %16.67 %16.67 %50 %344201153
1170NC_015942GATATT2123014342301435333.33 %50 %16.67 %0 %344201155
1171NC_015942GGGGGC212301521130152220 %0 %83.33 %16.67 %344201156
1172NC_015942CGCTGA2123019730301974116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201163
1173NC_015942CCGCCT212302999230300030 %16.67 %16.67 %66.67 %344201167
1174NC_015942GTATTT2123031187303119816.67 %66.67 %16.67 %0 %344201168
1175NC_015942CAGCAC2123034592303460333.33 %0 %16.67 %50 %344201171
1176NC_015942ATCTCA2123036780303679133.33 %33.33 %0 %33.33 %344201172
1177NC_015942GACCTG2123043829304384016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201179
1178NC_015942ACCCCC2123051463305147416.67 %0 %0 %83.33 %344201192
1179NC_015942ATGATC2123052537305254833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %344201195
1180NC_015942AAGCTG2123055433305544433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344201196
1181NC_015942CCATGA2123057388305739933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201198
1182NC_015942TATCTG2123057743305775416.67 %50 %16.67 %16.67 %344201198
1183NC_015942CACCGG2123060270306028116.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
1184NC_015942CGCCGG212306132830613390 %0 %50 %50 %344201200
1185NC_015942CATCGG2123067060306707116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201210
1186NC_015942TCGAAC2123070917307092833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201213
1187NC_015942CGATAA2123075632307564350 %16.67 %16.67 %16.67 %344201217
1188NC_015942AGCAGG2123078633307864433.33 %0 %50 %16.67 %344201219
1189NC_015942GCTCCC212307911030791210 %16.67 %16.67 %66.67 %344201219
1190NC_015942GCAACC2123079153307916433.33 %0 %16.67 %50 %344201219
1191NC_015942GCAGGG2123081024308103516.67 %0 %66.67 %16.67 %344201221
1192NC_015942GGGATA2123082626308263733.33 %16.67 %50 %0 %344201222
1193NC_015942AGGATG2123083539308355033.33 %16.67 %50 %0 %344201222
1194NC_015942CGGTGA2123085563308557416.67 %16.67 %50 %16.67 %344201224
1195NC_015942ACATAA2123090177309018866.67 %16.67 %0 %16.67 %Non-Coding
1196NC_015942AATTAG2123098367309837850 %33.33 %16.67 %0 %344201233
1197NC_015942AAACCA2123101846310185766.67 %0 %0 %33.33 %Non-Coding
1198NC_015942GTTATG2123107829310784016.67 %50 %33.33 %0 %344201241
1199NC_015942GCTCTC212311075931107700 %33.33 %16.67 %50 %344201244
1200NC_015942ACTCGA2123112651311266233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201244
1201NC_015942GTGATG2123113362311337316.67 %33.33 %50 %0 %344201244
1202NC_015942CCAGGG2123118030311804116.67 %0 %50 %33.33 %344201249
1203NC_015942CACGCG2123120120312013116.67 %0 %33.33 %50 %344201250
1204NC_015942TGGCTT212312126431212750 %50 %33.33 %16.67 %344201251
1205NC_015942TGCGCC212312368931237000 %16.67 %33.33 %50 %344201253
1206NC_015942GCTCCA2123129033312904416.67 %16.67 %16.67 %50 %344201261
1207NC_015942GGCGCT212313077131307820 %16.67 %50 %33.33 %344201263
1208NC_015942TGGTGC212313341731334280 %33.33 %50 %16.67 %344201266
1209NC_015942CCCCTG212313572731357380 %16.67 %16.67 %66.67 %344201268
1210NC_015942GCCCCT212313662931366400 %16.67 %16.67 %66.67 %344201269
1211NC_015942GCTGGT212313760231376130 %33.33 %50 %16.67 %344201270
1212NC_015942TCGGCC212313958331395940 %16.67 %33.33 %50 %344201272
1213NC_015942CCGGCA2123141520314153116.67 %0 %33.33 %50 %344201274
1214NC_015942CGTTGC212314410031441110 %33.33 %33.33 %33.33 %344201276
1215NC_015942TGGCGG212314453531445460 %16.67 %66.67 %16.67 %344201276
1216NC_015942CCACCT2123148086314809716.67 %16.67 %0 %66.67 %344201280
1217NC_015942TGGGCC212315054031505510 %16.67 %50 %33.33 %Non-Coding
1218NC_015942AAATAC2123155595315560666.67 %16.67 %0 %16.67 %Non-Coding
1219NC_015942ACCAAC2123167102316711350 %0 %0 %50 %344201294
1220NC_015942GAAGCG2123167979316799033.33 %0 %50 %16.67 %344201295
1221NC_015942CCCAAT2123171477317148833.33 %16.67 %0 %50 %344201296
1222NC_015942CAGGAT2123175285317529633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %344201298
1223NC_015942TGCTGG212317997131799820 %33.33 %50 %16.67 %344201308
1224NC_015942CCGTCG212318235131823620 %16.67 %33.33 %50 %344201311
1225NC_015942CATGGC2123183296318330716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201312
1226NC_015942TCACCA2123185423318543433.33 %16.67 %0 %50 %344201314
1227NC_015942TGCCTT212318694031869510 %50 %16.67 %33.33 %344201315
1228NC_015942CCGAAT2123194596319460733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %344201326
1229NC_015942CATGGC2123197486319749716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %344201329
1230NC_015942ATACCC2123199309319932033.33 %16.67 %0 %50 %344201330
1231NC_015942GATACC2123201965320197633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
1232NC_015942AACGAC2123204255320426650 %0 %16.67 %33.33 %344201334
1233NC_015942GGATGT2123206738320674916.67 %33.33 %50 %0 %Non-Coding