MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 6520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015942	TTCA	2	8	3193607	3193614	25 %	50 %	0 %	25 %	344201325
6502	NC_015942	TGCC	2	8	3194074	3194081	0 %	25 %	25 %	50 %	344201325
6503	NC_015942	AGAT	2	8	3194962	3194969	50 %	25 %	25 %	0 %	344201326
6504	NC_015942	GGCA	2	8	3196402	3196409	25 %	0 %	50 %	25 %	344201328
6505	NC_015942	TTGA	2	8	3196952	3196959	25 %	50 %	25 %	0 %	344201329
6506	NC_015942	AGAA	2	8	3198939	3198946	75 %	0 %	25 %	0 %	344201330
6507	NC_015942	GCAT	2	8	3199078	3199085	25 %	25 %	25 %	25 %	344201330
6508	NC_015942	GTCT	2	8	3200294	3200301	0 %	50 %	25 %	25 %	344201332
6509	NC_015942	TTGA	2	8	3200721	3200728	25 %	50 %	25 %	0 %	344201332
6510	NC_015942	CAAA	2	8	3202372	3202379	75 %	0 %	0 %	25 %	344201333
6511	NC_015942	TACG	2	8	3202662	3202669	25 %	25 %	25 %	25 %	344201333
6512	NC_015942	CTAT	2	8	3202813	3202820	25 %	50 %	0 %	25 %	344201333
6513	NC_015942	ATTT	2	8	3203046	3203053	25 %	75 %	0 %	0 %	344201333
6514	NC_015942	GATA	2	8	3203593	3203600	50 %	25 %	25 %	0 %	344201333
6515	NC_015942	CCCA	2	8	3204002	3204009	25 %	0 %	0 %	75 %	344201334
6516	NC_015942	GCCA	2	8	3204179	3204186	25 %	0 %	25 %	50 %	344201334
6517	NC_015942	TCGC	2	8	3204824	3204831	0 %	25 %	25 %	50 %	344201336
6518	NC_015942	TAAA	2	8	3205863	3205870	75 %	25 %	0 %	0 %	344201336
6519	NC_015942	CATC	2	8	3206410	3206417	25 %	25 %	0 %	50 %	344201336
6520	NC_015942	CCCG	2	8	3206550	3206557	0 %	0 %	25 %	75 %	344201336

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.