MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 5381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015942	TG	4	8	299	306	0 %	50 %	50 %	0 %	344198244
2	NC_015942	TA	5	10	1818	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015942	AC	3	6	2128	2133	50 %	0 %	0 %	50 %	344198245
4	NC_015942	CG	3	6	3763	3768	0 %	0 %	50 %	50 %	344198246
5	NC_015942	CG	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	344198247
6	NC_015942	CT	3	6	5628	5633	0 %	50 %	0 %	50 %	344198247
7	NC_015942	CG	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	344198247
8	NC_015942	CG	4	8	7640	7647	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
9	NC_015942	TC	3	6	7962	7967	0 %	50 %	0 %	50 %	344198249
10	NC_015942	GC	3	6	8879	8884	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
11	NC_015942	GC	3	6	9065	9070	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
12	NC_015942	CT	3	6	9119	9124	0 %	50 %	0 %	50 %	344198249
13	NC_015942	GC	3	6	9175	9180	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
14	NC_015942	GC	3	6	10695	10700	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
15	NC_015942	CG	3	6	10744	10749	0 %	0 %	50 %	50 %	344198249
16	NC_015942	CG	3	6	11701	11706	0 %	0 %	50 %	50 %	344198251
17	NC_015942	GC	3	6	12909	12914	0 %	0 %	50 %	50 %	344198252
18	NC_015942	CG	3	6	12972	12977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015942	GC	3	6	14640	14645	0 %	0 %	50 %	50 %	344198254
20	NC_015942	GC	3	6	16143	16148	0 %	0 %	50 %	50 %	344198255
21	NC_015942	GC	3	6	16209	16214	0 %	0 %	50 %	50 %	344198255
22	NC_015942	GC	3	6	16242	16247	0 %	0 %	50 %	50 %	344198255
23	NC_015942	CG	3	6	16654	16659	0 %	0 %	50 %	50 %	344198256
24	NC_015942	GC	3	6	17118	17123	0 %	0 %	50 %	50 %	344198256
25	NC_015942	GC	3	6	17769	17774	0 %	0 %	50 %	50 %	344198257
26	NC_015942	GC	3	6	18931	18936	0 %	0 %	50 %	50 %	344198258
27	NC_015942	CG	3	6	19145	19150	0 %	0 %	50 %	50 %	344198259
28	NC_015942	CG	3	6	19411	19416	0 %	0 %	50 %	50 %	344198259
29	NC_015942	GC	3	6	20405	20410	0 %	0 %	50 %	50 %	344198260
30	NC_015942	GC	3	6	20510	20515	0 %	0 %	50 %	50 %	344198260
31	NC_015942	CG	3	6	21528	21533	0 %	0 %	50 %	50 %	344198261
32	NC_015942	CG	3	6	21602	21607	0 %	0 %	50 %	50 %	344198261
33	NC_015942	TA	3	6	21626	21631	50 %	50 %	0 %	0 %	344198261
34	NC_015942	GC	3	6	21713	21718	0 %	0 %	50 %	50 %	344198261
35	NC_015942	GC	3	6	21743	21748	0 %	0 %	50 %	50 %	344198262
36	NC_015942	GC	3	6	22725	22730	0 %	0 %	50 %	50 %	344198262
37	NC_015942	AT	3	6	23005	23010	50 %	50 %	0 %	0 %	344198262
38	NC_015942	GC	3	6	24335	24340	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
39	NC_015942	CG	3	6	24476	24481	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
40	NC_015942	CG	3	6	24866	24871	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
41	NC_015942	GC	3	6	24939	24944	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
42	NC_015942	GC	3	6	25078	25083	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
43	NC_015942	GC	3	6	25154	25159	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
44	NC_015942	CG	3	6	25220	25225	0 %	0 %	50 %	50 %	344198263
45	NC_015942	TA	3	6	25853	25858	50 %	50 %	0 %	0 %	344198264
46	NC_015942	TA	3	6	26592	26597	50 %	50 %	0 %	0 %	344198264
47	NC_015942	GC	4	8	28172	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	344198265
48	NC_015942	AT	3	6	28577	28582	50 %	50 %	0 %	0 %	344198265
49	NC_015942	GC	3	6	28621	28626	0 %	0 %	50 %	50 %	344198265
50	NC_015942	GC	3	6	29801	29806	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
51	NC_015942	AT	3	6	30425	30430	50 %	50 %	0 %	0 %	344198267
52	NC_015942	CT	3	6	30488	30493	0 %	50 %	0 %	50 %	344198267
53	NC_015942	GC	3	6	31484	31489	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
54	NC_015942	GC	3	6	31908	31913	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
55	NC_015942	GC	3	6	33178	33183	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
56	NC_015942	GC	3	6	33321	33326	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
57	NC_015942	CG	3	6	33631	33636	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
58	NC_015942	CG	3	6	33674	33679	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
59	NC_015942	TG	3	6	34527	34532	0 %	50 %	50 %	0 %	344198267
60	NC_015942	CG	3	6	35473	35478	0 %	0 %	50 %	50 %	344198267
61	NC_015942	GC	4	8	38099	38106	0 %	0 %	50 %	50 %	344198269
62	NC_015942	CT	3	6	38472	38477	0 %	50 %	0 %	50 %	344198270
63	NC_015942	TC	3	6	39953	39958	0 %	50 %	0 %	50 %	344198270
64	NC_015942	TG	3	6	41217	41222	0 %	50 %	50 %	0 %	344198270
65	NC_015942	CG	3	6	41505	41510	0 %	0 %	50 %	50 %	344198270
66	NC_015942	CA	3	6	42591	42596	50 %	0 %	0 %	50 %	344198270
67	NC_015942	GT	3	6	43074	43079	0 %	50 %	50 %	0 %	344198271
68	NC_015942	GC	3	6	43447	43452	0 %	0 %	50 %	50 %	344198272
69	NC_015942	GC	3	6	43638	43643	0 %	0 %	50 %	50 %	344198272
70	NC_015942	GC	3	6	43817	43822	0 %	0 %	50 %	50 %	344198272
71	NC_015942	GC	3	6	44110	44115	0 %	0 %	50 %	50 %	344198272
72	NC_015942	GC	3	6	44411	44416	0 %	0 %	50 %	50 %	344198272
73	NC_015942	GC	4	8	44815	44822	0 %	0 %	50 %	50 %	344198273
74	NC_015942	CG	3	6	47796	47801	0 %	0 %	50 %	50 %	344198277
75	NC_015942	GC	3	6	48042	48047	0 %	0 %	50 %	50 %	344198278
76	NC_015942	GC	3	6	48262	48267	0 %	0 %	50 %	50 %	344198278
77	NC_015942	AT	3	6	50043	50048	50 %	50 %	0 %	0 %	344198280
78	NC_015942	GC	3	6	51230	51235	0 %	0 %	50 %	50 %	344198280
79	NC_015942	GC	3	6	51508	51513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015942	TA	3	6	51681	51686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015942	GC	3	6	52890	52895	0 %	0 %	50 %	50 %	344198283
82	NC_015942	GC	3	6	54699	54704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015942	GC	4	8	54778	54785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015942	GC	3	6	56111	56116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015942	CA	3	6	57563	57568	50 %	0 %	0 %	50 %	344198290
86	NC_015942	GC	3	6	58307	58312	0 %	0 %	50 %	50 %	344198290
87	NC_015942	GC	3	6	59616	59621	0 %	0 %	50 %	50 %	344198290
88	NC_015942	GC	3	6	60727	60732	0 %	0 %	50 %	50 %	344198291
89	NC_015942	GC	4	8	60855	60862	0 %	0 %	50 %	50 %	344198291
90	NC_015942	GC	4	8	60930	60937	0 %	0 %	50 %	50 %	344198291
91	NC_015942	AT	3	6	61144	61149	50 %	50 %	0 %	0 %	344198291
92	NC_015942	GC	3	6	61321	61326	0 %	0 %	50 %	50 %	344198291
93	NC_015942	GC	3	6	61829	61834	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
94	NC_015942	CG	3	6	62087	62092	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
95	NC_015942	GC	3	6	62107	62112	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
96	NC_015942	GC	3	6	62432	62437	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
97	NC_015942	GC	3	6	62468	62473	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
98	NC_015942	CG	3	6	62633	62638	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
99	NC_015942	CG	3	6	62920	62925	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
100	NC_015942	GA	3	6	63306	63311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015942	GA	3	6	63455	63460	50 %	0 %	50 %	0 %	344198293
102	NC_015942	CG	4	8	63727	63734	0 %	0 %	50 %	50 %	344198293
103	NC_015942	TC	3	6	63953	63958	0 %	50 %	0 %	50 %	344198293
104	NC_015942	GC	3	6	64572	64577	0 %	0 %	50 %	50 %	344198294
105	NC_015942	TC	3	6	65865	65870	0 %	50 %	0 %	50 %	344198295
106	NC_015942	GC	3	6	67196	67201	0 %	0 %	50 %	50 %	344198296
107	NC_015942	CG	3	6	68362	68367	0 %	0 %	50 %	50 %	344198298
108	NC_015942	GC	3	6	69440	69445	0 %	0 %	50 %	50 %	344198300
109	NC_015942	TC	3	6	69521	69526	0 %	50 %	0 %	50 %	344198300
110	NC_015942	AT	3	6	70370	70375	50 %	50 %	0 %	0 %	344198301
111	NC_015942	CT	3	6	70791	70796	0 %	50 %	0 %	50 %	344198301
112	NC_015942	AG	3	6	71362	71367	50 %	0 %	50 %	0 %	344198302
113	NC_015942	AT	3	6	72180	72185	50 %	50 %	0 %	0 %	344198303
114	NC_015942	AT	3	6	72607	72612	50 %	50 %	0 %	0 %	344198303
115	NC_015942	TA	3	6	72927	72932	50 %	50 %	0 %	0 %	344198303
116	NC_015942	TG	3	6	73275	73280	0 %	50 %	50 %	0 %	344198304
117	NC_015942	TG	3	6	73310	73315	0 %	50 %	50 %	0 %	344198304
118	NC_015942	GC	3	6	74246	74251	0 %	0 %	50 %	50 %	344198304
119	NC_015942	TC	3	6	74909	74914	0 %	50 %	0 %	50 %	344198305
120	NC_015942	CG	3	6	76779	76784	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
121	NC_015942	AG	3	6	76836	76841	50 %	0 %	50 %	0 %	344198306
122	NC_015942	GC	3	6	76890	76895	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
123	NC_015942	CG	3	6	77075	77080	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
124	NC_015942	GA	3	6	77993	77998	50 %	0 %	50 %	0 %	344198306
125	NC_015942	GC	4	8	78312	78319	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
126	NC_015942	GC	3	6	78536	78541	0 %	0 %	50 %	50 %	344198306
127	NC_015942	AC	3	6	78923	78928	50 %	0 %	0 %	50 %	344198307
128	NC_015942	TC	3	6	79104	79109	0 %	50 %	0 %	50 %	344198308
129	NC_015942	AT	4	8	79639	79646	50 %	50 %	0 %	0 %	344198308
130	NC_015942	TC	3	6	79842	79847	0 %	50 %	0 %	50 %	344198308
131	NC_015942	AT	3	6	80277	80282	50 %	50 %	0 %	0 %	344198310
132	NC_015942	TA	3	6	80331	80336	50 %	50 %	0 %	0 %	344198310
133	NC_015942	AG	3	6	80421	80426	50 %	0 %	50 %	0 %	344198310
134	NC_015942	CG	3	6	81453	81458	0 %	0 %	50 %	50 %	344198310
135	NC_015942	GC	3	6	82854	82859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015942	GC	3	6	83047	83052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015942	GC	3	6	84135	84140	0 %	0 %	50 %	50 %	344198312
138	NC_015942	GC	3	6	84283	84288	0 %	0 %	50 %	50 %	344198312
139	NC_015942	GC	3	6	84947	84952	0 %	0 %	50 %	50 %	344198313
140	NC_015942	TC	3	6	84963	84968	0 %	50 %	0 %	50 %	344198313
141	NC_015942	CA	3	6	85895	85900	50 %	0 %	0 %	50 %	344198314
142	NC_015942	GT	3	6	86591	86596	0 %	50 %	50 %	0 %	344198314
143	NC_015942	AG	3	6	87545	87550	50 %	0 %	50 %	0 %	344198315
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