MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 1357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015931	ACCCT	2	10	2698	2707	20 %	20 %	0 %	60 %	347522558
2	NC_015931	CTAGC	2	10	3534	3543	20 %	20 %	20 %	40 %	347522559
3	NC_015931	CCACG	2	10	3655	3664	20 %	0 %	20 %	60 %	347522559
4	NC_015931	TCACG	2	10	5990	5999	20 %	20 %	20 %	40 %	347522561
5	NC_015931	GCCTC	2	10	6112	6121	0 %	20 %	20 %	60 %	347522561
6	NC_015931	ACACG	2	10	8034	8043	40 %	0 %	20 %	40 %	347522563
7	NC_015931	CGCCT	2	10	9062	9071	0 %	20 %	20 %	60 %	347522564
8	NC_015931	CTACG	2	10	10629	10638	20 %	20 %	20 %	40 %	347522566
9	NC_015931	GCTAG	2	10	10800	10809	20 %	20 %	40 %	20 %	347522566
10	NC_015931	TCGCC	2	10	10967	10976	0 %	20 %	20 %	60 %	347522567
11	NC_015931	CGTGC	2	10	10989	10998	0 %	20 %	40 %	40 %	347522567
12	NC_015931	TCGTA	2	10	14528	14537	20 %	40 %	20 %	20 %	347522571
13	NC_015931	CTGGC	2	10	14574	14583	0 %	20 %	40 %	40 %	347522571
14	NC_015931	ATACA	2	10	15597	15606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015931	TGGCT	2	10	17267	17276	0 %	40 %	40 %	20 %	347522574
16	NC_015931	TGTTT	2	10	18315	18324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015931	GTATC	2	10	19192	19201	20 %	40 %	20 %	20 %	347522577
18	NC_015931	CACTA	2	10	20550	20559	40 %	20 %	0 %	40 %	347522580
19	NC_015931	CCAGC	2	10	22697	22706	20 %	0 %	20 %	60 %	347522582
20	NC_015931	AGCCG	2	10	22882	22891	20 %	0 %	40 %	40 %	347522582
21	NC_015931	CACGT	2	10	25429	25438	20 %	20 %	20 %	40 %	347522586
22	NC_015931	TTGTC	2	10	26936	26945	0 %	60 %	20 %	20 %	347522587
23	NC_015931	CTAGG	2	10	28122	28131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015931	TTGCC	2	10	28555	28564	0 %	40 %	20 %	40 %	347522588
25	NC_015931	ACACA	2	10	32354	32363	60 %	0 %	0 %	40 %	347522590
26	NC_015931	AGTGG	2	10	37681	37690	20 %	20 %	60 %	0 %	347522598
27	NC_015931	CGGAG	2	10	41655	41664	20 %	0 %	60 %	20 %	347522603
28	NC_015931	CACTC	2	10	41735	41744	20 %	20 %	0 %	60 %	347522603
29	NC_015931	GACAC	2	10	45848	45857	40 %	0 %	20 %	40 %	347522608
30	NC_015931	ACGTG	2	10	47879	47888	20 %	20 %	40 %	20 %	347522610
31	NC_015931	GGCAT	2	10	50852	50861	20 %	20 %	40 %	20 %	347522614
32	NC_015931	GCCAG	2	10	52433	52442	20 %	0 %	40 %	40 %	347522615
33	NC_015931	CGCCT	2	10	53282	53291	0 %	20 %	20 %	60 %	347522615
34	NC_015931	CGCGG	2	10	53407	53416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015931	CCGTA	2	10	53487	53496	20 %	20 %	20 %	40 %	347522616
36	NC_015931	ACCTT	2	10	54653	54662	20 %	40 %	0 %	40 %	347522617
37	NC_015931	GTATT	2	10	54693	54702	20 %	60 %	20 %	0 %	347522617
38	NC_015931	AAGCT	2	10	59064	59073	40 %	20 %	20 %	20 %	347522623
39	NC_015931	GGCGG	2	10	61077	61086	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015931	CGCGC	2	10	61905	61914	0 %	0 %	40 %	60 %	347522627
41	NC_015931	CCCGC	2	10	66325	66334	0 %	0 %	20 %	80 %	347522630
42	NC_015931	TCCCA	2	10	68620	68629	20 %	20 %	0 %	60 %	347522632
43	NC_015931	ATGCG	2	10	69590	69599	20 %	20 %	40 %	20 %	347522632
44	NC_015931	ACACG	2	10	71349	71358	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015931	TCCTA	2	10	71613	71622	20 %	40 %	0 %	40 %	347522634
46	NC_015931	GATGT	2	10	73486	73495	20 %	40 %	40 %	0 %	347522635
47	NC_015931	CGAGC	2	10	74046	74055	20 %	0 %	40 %	40 %	347522636
48	NC_015931	CGACC	2	10	74730	74739	20 %	0 %	20 %	60 %	347522638
49	NC_015931	AGGAT	2	10	74900	74909	40 %	20 %	40 %	0 %	347522638
50	NC_015931	CCATA	2	10	74999	75008	40 %	20 %	0 %	40 %	347522638
51	NC_015931	AGGCT	2	10	78675	78684	20 %	20 %	40 %	20 %	347522646
52	NC_015931	CTCAC	2	10	79442	79451	20 %	20 %	0 %	60 %	347522647
53	NC_015931	AAACC	2	10	81053	81062	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015931	CTGCC	2	10	81531	81540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_015931	GGGGC	2	10	82807	82816	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015931	CGGCC	2	10	83410	83419	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_015931	GGCTG	2	10	83428	83437	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015931	TTTGG	2	10	84156	84165	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015931	CGAGC	2	10	84408	84417	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015931	GGGTC	2	10	85016	85025	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015931	GCCGG	2	10	85692	85701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015931	GCCGG	2	10	86320	86329	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015931	CCCCG	3	15	86415	86429	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_015931	CGTGC	2	10	86783	86792	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015931	TGCCG	2	10	86803	86812	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015931	TCCTC	2	10	87097	87106	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015931	TGGGT	2	10	87369	87378	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015931	TACTC	2	10	90850	90859	20 %	40 %	0 %	40 %	347522651
69	NC_015931	TGACT	2	10	94019	94028	20 %	40 %	20 %	20 %	347522654
70	NC_015931	CTCTT	2	10	95475	95484	0 %	60 %	0 %	40 %	347522656
71	NC_015931	ATACC	2	10	95652	95661	40 %	20 %	0 %	40 %	347522656
72	NC_015931	TCCTC	2	10	96031	96040	0 %	40 %	0 %	60 %	347522656
73	NC_015931	CAACA	2	10	97245	97254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015931	ATCCT	2	10	97453	97462	20 %	40 %	0 %	40 %	347522657
75	NC_015931	TTATC	2	10	103132	103141	20 %	60 %	0 %	20 %	347522665
76	NC_015931	TTGCT	2	10	104466	104475	0 %	60 %	20 %	20 %	347522665
77	NC_015931	TACCT	2	10	104912	104921	20 %	40 %	0 %	40 %	347522665
78	NC_015931	GATAA	2	10	106001	106010	60 %	20 %	20 %	0 %	347522668
79	NC_015931	GCTAT	2	10	106188	106197	20 %	40 %	20 %	20 %	347522669
80	NC_015931	TGGTA	2	10	109510	109519	20 %	40 %	40 %	0 %	347522673
81	NC_015931	GAATC	2	10	109758	109767	40 %	20 %	20 %	20 %	347522673
82	NC_015931	ACTAG	2	10	109872	109881	40 %	20 %	20 %	20 %	347522673
83	NC_015931	GGCGA	2	10	112182	112191	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015931	TAACG	2	10	114048	114057	40 %	20 %	20 %	20 %	347522678
85	NC_015931	CCAGC	2	10	114537	114546	20 %	0 %	20 %	60 %	347522679
86	NC_015931	ACTCT	2	10	118354	118363	20 %	40 %	0 %	40 %	347522685
87	NC_015931	AAGCT	2	10	118378	118387	40 %	20 %	20 %	20 %	347522685
88	NC_015931	GCATT	2	10	119232	119241	20 %	40 %	20 %	20 %	347522687
89	NC_015931	GCTAT	2	10	119294	119303	20 %	40 %	20 %	20 %	347522687
90	NC_015931	TAGAG	2	10	123046	123055	40 %	20 %	40 %	0 %	347522692
91	NC_015931	GCCCC	2	10	127864	127873	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
92	NC_015931	GCGTG	2	10	130159	130168	0 %	20 %	60 %	20 %	347522699
93	NC_015931	CCCGA	2	10	130691	130700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_015931	TGGAG	2	10	130965	130974	20 %	20 %	60 %	0 %	347522700
95	NC_015931	TCACA	2	10	131911	131920	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015931	TCAAC	2	10	132978	132987	40 %	20 %	0 %	40 %	347522702
97	NC_015931	CCGGC	2	10	133145	133154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_015931	TCTCG	2	10	135637	135646	0 %	40 %	20 %	40 %	347522704
99	NC_015931	AGGCT	2	10	136039	136048	20 %	20 %	40 %	20 %	347522704
100	NC_015931	CCTCT	2	10	136896	136905	0 %	40 %	0 %	60 %	347522705
101	NC_015931	ACTAT	2	10	141977	141986	40 %	40 %	0 %	20 %	347522713
102	NC_015931	ATAGT	2	10	142081	142090	40 %	40 %	20 %	0 %	347522713
103	NC_015931	GTCAT	2	10	142507	142516	20 %	40 %	20 %	20 %	347522713
104	NC_015931	TGTGT	2	10	146358	146367	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015931	GTATA	2	10	148304	148313	40 %	40 %	20 %	0 %	347522719
106	NC_015931	GCAAG	2	10	148524	148533	40 %	0 %	40 %	20 %	347522719
107	NC_015931	CGTCC	2	10	150444	150453	0 %	20 %	20 %	60 %	347522721
108	NC_015931	ATTGT	2	10	150920	150929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015931	AGTAT	2	10	153226	153235	40 %	40 %	20 %	0 %	347522726
110	NC_015931	ATGTT	2	10	153590	153599	20 %	60 %	20 %	0 %	347522726
111	NC_015931	TAGAG	2	10	154614	154623	40 %	20 %	40 %	0 %	347522727
112	NC_015931	GATTG	2	10	156486	156495	20 %	40 %	40 %	0 %	347522730
113	NC_015931	CCTAT	2	10	156617	156626	20 %	40 %	0 %	40 %	347522730
114	NC_015931	TTGGA	2	10	156895	156904	20 %	40 %	40 %	0 %	347522731
115	NC_015931	GCTTA	2	10	157730	157739	20 %	40 %	20 %	20 %	347522732
116	NC_015931	AGTTA	2	10	158061	158070	40 %	40 %	20 %	0 %	347522733
117	NC_015931	TCTCG	2	10	159864	159873	0 %	40 %	20 %	40 %	347522737
118	NC_015931	TAGTG	2	10	160456	160465	20 %	40 %	40 %	0 %	347522737
119	NC_015931	GAGTA	2	10	162729	162738	40 %	20 %	40 %	0 %	347522741
120	NC_015931	TGCGG	2	10	166063	166072	0 %	20 %	60 %	20 %	347522746
121	NC_015931	TAATT	2	10	168815	168824	40 %	60 %	0 %	0 %	347522750
122	NC_015931	GTAGT	2	10	169726	169735	20 %	40 %	40 %	0 %	347522750
123	NC_015931	TAGTC	2	10	170620	170629	20 %	40 %	20 %	20 %	347522751
124	NC_015931	GAAGA	2	10	171210	171219	60 %	0 %	40 %	0 %	347522752
125	NC_015931	ATGCT	2	10	171514	171523	20 %	40 %	20 %	20 %	347522753
126	NC_015931	TGTTA	2	10	171557	171566	20 %	60 %	20 %	0 %	347522753
127	NC_015931	TATGG	2	10	173510	173519	20 %	40 %	40 %	0 %	347522754
128	NC_015931	GCTGC	2	10	174717	174726	0 %	20 %	40 %	40 %	347522755
129	NC_015931	CTTCT	2	10	175916	175925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015931	AAGAA	2	10	178244	178253	80 %	0 %	20 %	0 %	347522759
131	NC_015931	CTATG	2	10	180083	180092	20 %	40 %	20 %	20 %	347522761
132	NC_015931	GAGCC	2	10	181028	181037	20 %	0 %	40 %	40 %	347522762
133	NC_015931	CCTAC	2	10	182054	182063	20 %	20 %	0 %	60 %	347522764
134	NC_015931	GATAA	2	10	183992	184001	60 %	20 %	20 %	0 %	347522766
135	NC_015931	AAGAG	2	10	185615	185624	60 %	0 %	40 %	0 %	347522768
136	NC_015931	CCCCA	2	10	188504	188513	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
137	NC_015931	GAAGA	2	10	192875	192884	60 %	0 %	40 %	0 %	347522775
138	NC_015931	GCAGA	2	10	194687	194696	40 %	0 %	40 %	20 %	347522775
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141	NC_015931	TGGAG	2	10	201677	201686	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_015931	GTTAG	2	10	201866	201875	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_015931	CTCTG	2	10	205030	205039	0 %	40 %	20 %	40 %	347522788
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177	NC_015931	GCTTG	2	10	251851	251860	0 %	40 %	40 %	20 %	347522838
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197	NC_015931	GCGCG	2	10	278462	278471	0 %	0 %	60 %	40 %	347522863
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256	NC_015931	GAGAG	2	10	348616	348625	40 %	0 %	60 %	0 %	347522938
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258	NC_015931	GACTA	2	10	351238	351247	40 %	20 %	20 %	20 %	347522940
259	NC_015931	GATGA	2	10	351606	351615	40 %	20 %	40 %	0 %	347522940
260	NC_015931	AAAAC	2	10	355574	355583	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_015931	GTGTA	2	10	356357	356366	20 %	40 %	40 %	0 %	347522945
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264	NC_015931	AGTCG	2	10	359678	359687	20 %	20 %	40 %	20 %	347522950
265	NC_015931	CCAGC	2	10	370870	370879	20 %	0 %	20 %	60 %	347522956
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267	NC_015931	CTCAC	2	10	374318	374327	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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283	NC_015931	GGTCA	2	10	389528	389537	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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394	NC_015931	GGCTA	2	10	535255	535264	20 %	20 %	40 %	20 %	347523131
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398	NC_015931	GCCAA	2	10	544364	544373	40 %	0 %	20 %	40 %	347523140
399	NC_015931	TCTCC	2	10	545267	545276	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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