MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus garvieae ATCC 49156

Total Repeats: 806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015930	AAGAAA	2	12	3556	3567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347520609
2	NC_015930	TGGAGC	2	12	4012	4023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347520609
3	NC_015930	AAGCTG	2	12	4183	4194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347520609
4	NC_015930	CAAAAG	2	12	18346	18357	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347520619
5	NC_015930	CAGGTA	2	12	21575	21586	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347520622
6	NC_015930	TGTCGG	2	12	21669	21680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347520622
7	NC_015930	TGTTAT	2	12	21867	21878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347520622
8	NC_015930	TGAACG	2	12	22209	22220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347520622
9	NC_015930	GTATAT	2	12	23958	23969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015930	GAGATA	2	12	25494	25505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520624
11	NC_015930	ATCTTC	2	12	26226	26237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347520625
12	NC_015930	GTAGGC	2	12	28809	28820	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347520627
13	NC_015930	TCAATT	2	12	29036	29047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347520628
14	NC_015930	CTGTGT	2	12	29801	29812	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347520629
15	NC_015930	TCATTA	2	12	32154	32165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347520632
16	NC_015930	GTCTGT	2	12	34960	34971	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347520635
17	NC_015930	GATTGT	2	12	35997	36008	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347520636
18	NC_015930	GGAGCT	2	12	36457	36468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347520636
19	NC_015930	ACCATT	2	12	36789	36800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347520636
20	NC_015930	TTTGTT	2	12	44555	44566	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347520644
21	NC_015930	AGATGA	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520644
22	NC_015930	TCCAAG	2	12	49181	49192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520647
23	NC_015930	TTCGGC	2	12	50197	50208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347520647
24	NC_015930	TCATAG	2	12	50369	50380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347520647
25	NC_015930	CGGCTG	2	12	52212	52223	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347520649
26	NC_015930	TTTCCT	2	12	54097	54108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347520651
27	NC_015930	AGGTCA	2	12	54365	54376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015930	TGGCAT	2	12	57265	57276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520653
29	NC_015930	TCTTGT	2	12	59593	59604	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347520655
30	NC_015930	GTCCTT	2	12	61947	61958	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	347520658
31	NC_015930	TTATAA	2	12	64771	64782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015930	GTGCAA	2	12	66625	66636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347520663
33	NC_015930	AAAAAT	2	12	68941	68952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347520664
34	NC_015930	TAAGAT	2	12	69375	69386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347520664
35	NC_015930	CTTAAC	2	12	71863	71874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347520668
36	NC_015930	ATCCCA	2	12	72592	72603	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347520668
37	NC_015930	TGTAAC	2	12	73824	73835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347520668
38	NC_015930	TGCTGA	2	12	75462	75473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520670
39	NC_015930	TTTTTG	2	12	80286	80297	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347520675
40	NC_015930	CATGAC	2	12	83661	83672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520681
41	NC_015930	GTTCAC	2	12	84125	84136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347520682
42	NC_015930	GCTTAT	2	12	89051	89062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347520686
43	NC_015930	AGCCTT	2	12	89230	89241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347520686
44	NC_015930	AAAAAG	2	12	91449	91460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015930	CGTGGT	2	12	98065	98076	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347520695
46	NC_015930	ACTGAA	2	12	99099	99110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347520696
47	NC_015930	AGAAGC	2	12	101570	101581	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347520698
48	NC_015930	TATACT	2	12	102516	102527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347520699
49	NC_015930	TTATCA	2	12	105553	105564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347520703
50	NC_015930	ATTTTT	2	12	108695	108706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347520705
51	NC_015930	TAGAAG	2	12	109981	109992	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520706
52	NC_015930	TTAACC	2	12	110058	110069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347520706
53	NC_015930	ATGGAC	2	12	110120	110131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347520706
54	NC_015930	AGAAAC	2	12	113367	113378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347520710
55	NC_015930	TCTTAC	2	12	117819	117830	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347520716
56	NC_015930	TAAAAG	2	12	126500	126511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347520725
57	NC_015930	TGTTCT	2	12	129345	129356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347520727
58	NC_015930	GTTTAT	2	12	131586	131597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347520730
59	NC_015930	CGGAAA	2	12	138811	138822	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347520736
60	NC_015930	ATAAGT	2	12	138899	138910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347520737
61	NC_015930	ATTTAG	2	12	140917	140928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347520738
62	NC_015930	CGTAAT	2	12	142105	142116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015930	ACGTAA	2	12	145575	145586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347520741
64	NC_015930	ATTGCG	2	12	153085	153096	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520751
65	NC_015930	TTCTTT	2	12	157927	157938	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347520757
66	NC_015930	AGCTAA	2	12	159147	159158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347520759
67	NC_015930	TAAAGG	2	12	159276	159287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520759
68	NC_015930	GCAATC	2	12	161969	161980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520764
69	NC_015930	TACGCA	2	12	166126	166137	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520773
70	NC_015930	AATTGT	2	12	167318	167329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015930	ATAGAG	2	12	168076	168087	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015930	AAATGT	2	12	168289	168300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347520774
73	NC_015930	TTTTCT	2	12	169987	169998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015930	AACAGT	2	12	170817	170828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347520777
75	NC_015930	TAAAGG	2	12	171222	171233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520777
76	NC_015930	TTCGCG	2	12	171477	171488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347520778
77	NC_015930	CAAACA	2	12	171537	171548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347520778
78	NC_015930	TGCATC	2	12	171589	171600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347520778
79	NC_015930	GGTAAA	2	12	173242	173253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520781
80	NC_015930	GACCAA	2	12	173395	173406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347520781
81	NC_015930	CTTGAT	2	12	175608	175619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347520783
82	NC_015930	ATGCTG	2	12	177017	177028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520785
83	NC_015930	TGAAAA	2	12	180238	180249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347520792
84	NC_015930	CGTAAA	2	12	183814	183825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347520795
85	NC_015930	TCAAGG	2	12	184693	184704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347520796
86	NC_015930	TGTTCT	2	12	185816	185827	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347520797
87	NC_015930	TAAAAA	2	12	186426	186437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347520797
88	NC_015930	CTCAAG	2	12	190917	190928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520801
89	NC_015930	ATGGAA	2	12	191206	191217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347520802
90	NC_015930	AAATTC	2	12	197449	197460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347520804
91	NC_015930	TTGTCG	2	12	200360	200371	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347520807
92	NC_015930	TTGAAA	2	12	201154	201165	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347520807
93	NC_015930	TCAAGT	2	12	202626	202637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347520809
94	NC_015930	GCAAGC	2	12	205159	205170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347520812
95	NC_015930	ATAGGG	2	12	209871	209882	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347520815
96	NC_015930	TTGACG	2	12	215392	215403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520821
97	NC_015930	AAAATA	2	12	217284	217295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347520822
98	NC_015930	CAAAAC	2	12	217655	217666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347520822
99	NC_015930	CAACGT	2	12	221592	221603	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520826
100	NC_015930	TTAAAT	2	12	224872	224883	50 %	50 %	0 %	0 %	347520829
101	NC_015930	GTAGCT	2	12	225598	225609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520829
102	NC_015930	TGATGC	2	12	228506	228517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520831
103	NC_015930	GGCAGA	2	12	230671	230682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347520833
104	NC_015930	AATCAA	2	12	230989	231000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347520833
105	NC_015930	TACAAA	2	12	232926	232937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347520835
106	NC_015930	TTTGAA	2	12	233939	233950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347520835
107	NC_015930	TTGAAC	2	12	234363	234374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347520835
108	NC_015930	GCACCA	2	12	235462	235473	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347520836
109	NC_015930	AAAGAA	2	12	237875	237886	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347520839
110	NC_015930	GAAAGC	2	12	238829	238840	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347520839
111	NC_015930	AGCCAT	2	12	240100	240111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520840
112	NC_015930	TTTTGA	2	12	242089	242100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347520844
113	NC_015930	AGTTGA	2	12	245670	245681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015930	TTTGAA	2	12	246293	246304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347520849
115	NC_015930	CGATAC	2	12	252449	252460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347520855
116	NC_015930	CATAAT	2	12	252503	252514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347520855
117	NC_015930	CTTTCG	2	12	252545	252556	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	347520855
118	NC_015930	ATGTTG	2	12	255746	255757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347520856
119	NC_015930	CAAAGC	2	12	258138	258149	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347520858
120	NC_015930	GGCTTA	2	12	258942	258953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520859
121	NC_015930	ATTTTT	2	12	260110	260121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015930	GATTTT	2	12	270193	270204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347520869
123	NC_015930	AACCAG	2	12	274032	274043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347520874
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128	NC_015930	ACTTAC	2	12	281631	281642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347520883
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131	NC_015930	AACGTA	2	12	290714	290725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347520892
132	NC_015930	TGATCG	2	12	291009	291020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347520892
133	NC_015930	CTGAGG	2	12	291493	291504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347520893
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138	NC_015930	AATCAA	2	12	299713	299724	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347520901
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149	NC_015930	TAATAT	2	12	332333	332344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015930	TTTTCA	2	12	339006	339017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347520937
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229	NC_015930	TTAAAA	2	12	545977	545988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_015930	AGGCGA	2	12	546194	546205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347521135
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232	NC_015930	AGAAAC	2	12	550931	550942	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347521141
233	NC_015930	AGATAA	2	12	555621	555632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347521145
234	NC_015930	AGCGAA	2	12	555736	555747	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347521145
235	NC_015930	AGGAAA	2	12	556277	556288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347521145
236	NC_015930	AAAGAA	2	12	556434	556445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347521145
237	NC_015930	GCGAAA	2	12	556930	556941	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347521145
238	NC_015930	CGCAGG	2	12	559110	559121	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347521147
239	NC_015930	GGTAAC	2	12	559711	559722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347521147
240	NC_015930	TTATGC	2	12	565323	565334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347521152
241	NC_015930	AAAGCT	2	12	566099	566110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347521154
242	NC_015930	CCAGTT	2	12	571047	571058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347521158
243	NC_015930	AAAAGA	2	12	572740	572751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
244	NC_015930	TTGTTA	2	12	574667	574678	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
245	NC_015930	ATGGAC	2	12	576019	576030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347521162
246	NC_015930	ATTGCC	2	12	576432	576443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347521162
247	NC_015930	AACAGT	2	12	576711	576722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347521162
248	NC_015930	AAATAA	2	12	582314	582325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347521167
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254	NC_015930	AAATAA	2	12	608664	608675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015930	GATAAA	2	12	613426	613437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347521198
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259	NC_015930	TGTCAT	2	12	617106	617117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347521202
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262	NC_015930	TAGCAT	2	12	625704	625715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347521211
263	NC_015930	TTAAGA	2	12	629587	629598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347521218
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274	NC_015930	TCGCCG	2	12	650228	650239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347521240
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279	NC_015930	ATGGTG	2	12	658486	658497	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347521248
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293	NC_015930	AGCTCC	2	12	683172	683183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347521272
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302	NC_015930	GAAGTC	2	12	711092	711103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347521295
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308	NC_015930	CTATGA	2	12	718417	718428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347521301
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312	NC_015930	ACTTGT	2	12	725213	725224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347521306
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324	NC_015930	GCAGTC	2	12	753126	753137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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334	NC_015930	ACTTGG	2	12	773591	773602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347521356
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337	NC_015930	TCTCTT	2	12	786766	786777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_015930	TGAAGT	2	12	788581	788592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347521372
339	NC_015930	CTTTTC	2	12	795784	795795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347521382
340	NC_015930	GGAAAG	2	12	797268	797279	50 %	0 %	50 %	0 %	347521384
341	NC_015930	GAAGCA	2	12	802442	802453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347521389
342	NC_015930	GTAATG	2	12	803651	803662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347521390
343	NC_015930	GGTATC	2	12	808730	808741	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347521394
344	NC_015930	GCAATG	2	12	812134	812145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347521396
345	NC_015930	CAAAGG	2	12	812535	812546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347521396
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347	NC_015930	TATGTG	2	12	814246	814257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347521397
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459	NC_015930	TCCTTC	2	12	1099749	1099760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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463	NC_015930	TCTGAT	2	12	1112074	1112085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347521702
464	NC_015930	CCAGAT	2	12	1116325	1116336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347521706
465	NC_015930	GTTTTT	2	12	1117815	1117826	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347521706
466	NC_015930	TCTTTC	2	12	1120401	1120412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347521707
467	NC_015930	GCTGGT	2	12	1121279	1121290	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347521709
468	NC_015930	TCTTTT	2	12	1124747	1124758	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347521715
469	NC_015930	TTAGTT	2	12	1127535	1127546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
470	NC_015930	CCATCT	2	12	1128271	1128282	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	347521720
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474	NC_015930	TGCAAG	2	12	1153623	1153634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347521762
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477	NC_015930	AGAAAA	2	12	1166836	1166847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
478	NC_015930	AGGTTA	2	12	1169890	1169901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347521780
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480	NC_015930	AATAAA	2	12	1171364	1171375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015930	CTGCAT	2	12	1173005	1173016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347521783
482	NC_015930	GATCCT	2	12	1174325	1174336	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347521784
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492	NC_015930	CTTAAA	2	12	1198106	1198117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347521806
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495	NC_015930	AAAAAC	2	12	1199686	1199697	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
496	NC_015930	GTTCTT	2	12	1200517	1200528	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347521809
497	NC_015930	TAAGCT	2	12	1201037	1201048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
498	NC_015930	ATAGTC	2	12	1201778	1201789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347521811
499	NC_015930	GATATC	2	12	1203153	1203164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347521814
500	NC_015930	TGCCAT	2	12	1203196	1203207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347521814

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