MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus garvieae ATCC 49156

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015930	TTCTA	2	10	25931	25940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015930	TAATT	2	10	25963	25972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015930	GCGGT	2	10	27352	27361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015930	TTATT	2	10	27555	27564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015930	GATTT	2	10	30853	30862	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015930	TATAA	2	10	43524	43533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015930	CAACC	5	25	51555	51579	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_015930	CAACA	3	15	51580	51594	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015930	CAACA	2	10	51600	51609	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015930	AAAGG	2	10	51694	51703	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015930	TTAAG	2	10	53486	53495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015930	TAAAA	2	10	61031	61040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015930	AAATT	2	10	69472	69481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015930	TAAAA	2	10	77346	77355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015930	TAATA	2	10	77928	77937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015930	ATCTT	2	10	91713	91722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015930	ACAGG	2	10	106456	106465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015930	TGTTA	2	10	115819	115828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015930	CTTTT	2	10	125329	125338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015930	AAGTA	2	10	130941	130950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015930	GGATT	2	10	142030	142039	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015930	TTTTA	2	10	143682	143691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015930	AAATG	2	10	145399	145408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015930	TAAAT	2	10	158431	158440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015930	GACAA	2	10	158460	158469	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015930	ATAGA	2	10	158480	158489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015930	TAAGT	2	10	161369	161378	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015930	AGCTT	2	10	165433	165442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015930	ATTAA	2	10	168034	168043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015930	GAAGA	2	10	172614	172623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015930	ACTTT	2	10	179942	179951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015930	AGAAA	2	10	181542	181551	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015930	TAAAA	2	10	181599	181608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015930	ATAAA	2	10	187066	187075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015930	TAAAG	2	10	194922	194931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015930	GAGCG	2	10	197732	197741	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015930	AGCGA	2	10	197801	197810	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015930	TAAAA	3	15	204795	204809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015930	AGCGA	2	10	213812	213821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015930	AGCGA	2	10	213880	213889	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015930	AGCGA	2	10	213948	213957	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015930	AGCGA	2	10	214016	214025	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015930	AGCGA	2	10	215998	216007	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015930	ATTTT	2	10	229128	229137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015930	TAGGA	2	10	236920	236929	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015930	TATAA	2	10	237831	237840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015930	GTTCT	2	10	244519	244528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015930	GGCTA	2	10	246733	246742	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015930	TCTTT	2	10	246748	246757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015930	TAAAA	2	10	249063	249072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015930	AAATG	2	10	253991	254000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015930	ACAGC	13	65	283937	284001	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015930	TATAA	2	10	298612	298621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015930	AGAGA	2	10	315607	315616	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015930	TAGAC	2	10	319644	319653	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015930	TTTAT	2	10	319832	319841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015930	TATAA	2	10	322746	322755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015930	GGAGA	2	10	327509	327518	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015930	AGAAA	2	10	332364	332373	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015930	AAGAG	2	10	336469	336478	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015930	TAATA	2	10	354952	354961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015930	AATTA	2	10	360912	360921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015930	GAAAT	2	10	366479	366488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015930	CGATA	2	10	377027	377036	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015930	TATAA	2	10	380965	380974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015930	ACAGA	2	10	383617	383626	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015930	TTCTA	2	10	389232	389241	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015930	TATAA	2	10	398927	398936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015930	ATATA	2	10	401188	401197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015930	AGAAA	2	10	405305	405314	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015930	AAAGC	2	10	417471	417480	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015930	TGTAG	2	10	431442	431451	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015930	AAAAG	2	10	437219	437228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015930	AATAA	2	10	437830	437839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015930	TAAAA	2	10	439695	439704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015930	TATAA	2	10	440369	440378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015930	AAAAT	2	10	444511	444520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015930	ATTAT	2	10	445108	445117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015930	AAAAG	2	10	445145	445154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015930	ACATG	2	10	456876	456885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015930	TAAAA	2	10	456970	456979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015930	ATGCC	2	10	473860	473869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015930	TGTTA	2	10	474091	474100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015930	ATAAA	2	10	488627	488636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015930	TTTTC	2	10	493898	493907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015930	CCGTT	2	10	494017	494026	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015930	ATAAA	2	10	500401	500410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015930	GGAAA	2	10	505391	505400	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015930	TTGTA	2	10	530759	530768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015930	AATTT	2	10	539380	539389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015930	TAAAA	2	10	539419	539428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015930	TCTTA	2	10	541449	541458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015930	ATAAA	2	10	545957	545966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015930	ATATA	2	10	547056	547065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015930	AATGA	2	10	553991	554000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015930	ACAGC	25	125	558319	558443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015930	AATGA	2	10	569078	569087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015930	TCATG	2	10	572824	572833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015930	AGGGA	2	10	583207	583216	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015930	ATAGA	2	10	609273	609282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015930	TTTTA	2	10	621388	621397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015930	AGATA	2	10	621421	621430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015930	TATAG	2	10	628187	628196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015930	TAATT	2	10	654210	654219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015930	TATAG	2	10	663562	663571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015930	CACTC	2	10	665180	665189	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_015930	CAGTA	2	10	671679	671688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015930	AATAA	2	10	673755	673764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015930	AAAGA	2	10	689471	689480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015930	TATAA	2	10	708682	708691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015930	ACAGC	40	200	734825	735024	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015930	GGTTA	2	10	735110	735119	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015930	AGAAA	2	10	735176	735185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015930	CTCTC	2	10	735205	735214	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_015930	TATAG	2	10	736477	736486	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015930	GATAT	2	10	740183	740192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015930	CATAA	2	10	753048	753057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015930	ATAAA	2	10	761542	761551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015930	TGAGT	2	10	765255	765264	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015930	AATGA	2	10	765298	765307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015930	TAAAA	2	10	774136	774145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015930	AGCAG	2	10	789866	789875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015930	TTGAA	2	10	790950	790959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015930	TAGAA	2	10	792272	792281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015930	CACAG	2	10	808184	808193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015930	AATTT	2	10	808197	808206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015930	GCTAA	2	10	831905	831914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015930	ACAGC	2	10	832635	832644	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015930	CAAAA	2	10	835682	835691	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015930	TATAA	2	10	848381	848390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015930	GGAAA	2	10	861016	861025	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015930	AAATT	2	10	862279	862288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015930	AAAAT	2	10	863101	863110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015930	AATTT	2	10	875140	875149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015930	TATAG	2	10	886971	886980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015930	TTTTG	2	10	888290	888299	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015930	ATATA	2	10	888318	888327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015930	TTTTG	2	10	893167	893176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015930	GGTTT	2	10	915391	915400	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015930	AATAT	2	10	918285	918294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015930	CTTTT	2	10	918323	918332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015930	AAAAT	2	10	926043	926052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015930	CAACA	2	10	927920	927929	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015930	ACTTC	2	10	930414	930423	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015930	AATTG	2	10	931926	931935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015930	TCATA	2	10	932124	932133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015930	TTTTA	2	10	937514	937523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015930	ATAGA	2	10	939988	939997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_015930	TAGAA	2	10	1587645	1587654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_015930	TCTTT	2	10	1736505	1736514	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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334	NC_015930	ATTTT	2	10	1816679	1816688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_015930	AAAAC	2	10	1943660	1943669	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
362	NC_015930	TCCCT	2	10	1944135	1944144	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
363	NC_015930	CTCCC	2	10	1946345	1946354	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
364	NC_015930	CACGA	2	10	1947688	1947697	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
365	NC_015930	CTCTC	2	10	1948096	1948105	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.