MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp25

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015922	TTTTCT	2	12	582	593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343128168
2	NC_015922	TTTCTT	2	12	760	771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343128168
3	NC_015922	CAAAAC	2	12	4608	4619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015922	GAAAAA	2	12	5255	5266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343128169
5	NC_015922	AATTAA	2	12	5769	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015922	TAAAAA	2	12	6371	6382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015922	GTTGAT	2	12	7552	7563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015922	AGTTAT	2	12	8042	8053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343128172
9	NC_015922	GATAAA	2	12	8381	8392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343128172
10	NC_015922	GCAAAG	2	12	8523	8534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015922	AGCGAG	2	12	10785	10796	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	343128175
12	NC_015922	TCTTTA	2	12	12150	12161	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343128176
13	NC_015922	TTTTAA	2	12	12338	12349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128176
14	NC_015922	AGTTTA	2	12	14271	14282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343128179
15	NC_015922	TTTGTA	2	12	14722	14733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	343128179
16	NC_015922	TAAAAA	2	12	16718	16729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015922	AAAATA	2	12	18028	18039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343128184
18	NC_015922	TTATTT	2	12	18304	18315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015922	TTGCTA	2	12	20864	20875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.