MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp25

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015922	GACT	2	8	24	31	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015922	ATTC	2	8	258	265	25 %	50 %	0 %	25 %	343128167
3	NC_015922	TTAT	2	8	410	417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015922	TAAA	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	343128168
5	NC_015922	AATA	2	8	875	882	75 %	25 %	0 %	0 %	343128168
6	NC_015922	CTTT	2	8	1092	1099	0 %	75 %	0 %	25 %	343128168
7	NC_015922	TCCT	2	8	1955	1962	0 %	50 %	0 %	50 %	343128168
8	NC_015922	GATA	2	8	2272	2279	50 %	25 %	25 %	0 %	343128168
9	NC_015922	CTTT	2	8	2583	2590	0 %	75 %	0 %	25 %	343128168
10	NC_015922	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	343128168
11	NC_015922	TAAA	3	12	3627	3638	75 %	25 %	0 %	0 %	343128168
12	NC_015922	GTTT	2	8	4111	4118	0 %	75 %	25 %	0 %	343128168
13	NC_015922	TTGT	2	8	4209	4216	0 %	75 %	25 %	0 %	343128168
14	NC_015922	TTAA	2	8	4334	4341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015922	TTTA	2	8	4563	4570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015922	TATT	2	8	4625	4632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015922	AAAT	2	8	5744	5751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015922	TAAT	2	8	6153	6160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015922	GGAA	2	8	6473	6480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015922	AAAC	2	8	6760	6767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015922	ATTT	2	8	7004	7011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015922	ATTT	2	8	7208	7215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015922	TCTT	2	8	7846	7853	0 %	75 %	0 %	25 %	343128172
24	NC_015922	AATT	2	8	8224	8231	50 %	50 %	0 %	0 %	343128172
25	NC_015922	AAAC	2	8	8372	8379	75 %	0 %	0 %	25 %	343128172
26	NC_015922	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015922	TAAA	2	8	8728	8735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015922	AATT	2	8	8927	8934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015922	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015922	TTTA	2	8	9129	9136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015922	TTAA	2	8	9170	9177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015922	TTAA	2	8	9182	9189	50 %	50 %	0 %	0 %	343128173
33	NC_015922	ATAA	3	12	9765	9776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015922	ATTG	2	8	10798	10805	25 %	50 %	25 %	0 %	343128175
35	NC_015922	AATA	2	8	11108	11115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015922	GATT	2	8	11358	11365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015922	ATTT	2	8	11634	11641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015922	ATAA	2	8	11642	11649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015922	CTTT	2	8	12228	12235	0 %	75 %	0 %	25 %	343128176
40	NC_015922	AATT	2	8	12271	12278	50 %	50 %	0 %	0 %	343128176
41	NC_015922	TTTA	2	8	12444	12451	25 %	75 %	0 %	0 %	343128177
42	NC_015922	ATTT	2	8	13129	13136	25 %	75 %	0 %	0 %	343128177
43	NC_015922	TGTT	2	8	13782	13789	0 %	75 %	25 %	0 %	343128179
44	NC_015922	TATT	2	8	13956	13963	25 %	75 %	0 %	0 %	343128179
45	NC_015922	TCTT	2	8	14309	14316	0 %	75 %	0 %	25 %	343128179
46	NC_015922	ATTT	2	8	14375	14382	25 %	75 %	0 %	0 %	343128179
47	NC_015922	ATTG	2	8	15527	15534	25 %	50 %	25 %	0 %	343128180
48	NC_015922	GTTT	2	8	15564	15571	0 %	75 %	25 %	0 %	343128180
49	NC_015922	GTTG	2	8	15805	15812	0 %	50 %	50 %	0 %	343128180
50	NC_015922	AAAT	2	8	15816	15823	75 %	25 %	0 %	0 %	343128180
51	NC_015922	TATT	2	8	16008	16015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015922	ATTA	2	8	16049	16056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015922	TCAT	2	8	16124	16131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015922	ATTA	2	8	16220	16227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015922	AATA	2	8	16547	16554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015922	TAAA	2	8	16919	16926	75 %	25 %	0 %	0 %	343128182
57	NC_015922	TAAG	2	8	16999	17006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015922	AATT	2	8	17093	17100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015922	ATCT	2	8	17196	17203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015922	TTTA	2	8	17699	17706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015922	TAAA	2	8	17778	17785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015922	CTTT	2	8	18830	18837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015922	AATT	2	8	19204	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015922	AGAA	2	8	19443	19450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015922	AGCA	2	8	19497	19504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015922	ATTT	2	8	19630	19637	25 %	75 %	0 %	0 %	343128186
67	NC_015922	TAAA	2	8	19943	19950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015922	AATT	2	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015922	AGAT	2	8	20512	20519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015922	ACAA	2	8	20702	20709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015922	AAGA	2	8	20803	20810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015922	AGAA	2	8	20949	20956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015922	TAAT	2	8	21781	21788	50 %	50 %	0 %	0 %	343128188
74	NC_015922	TTGA	2	8	22255	22262	25 %	50 %	25 %	0 %	343128189
75	NC_015922	AAAT	2	8	22612	22619	75 %	25 %	0 %	0 %	343128189

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.