MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp25

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015922	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
2	NC_015922	TAA	2	6	437	442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
3	NC_015922	TTA	2	6	460	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
4	NC_015922	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
5	NC_015922	TCT	2	6	534	539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
6	NC_015922	TCT	2	6	606	611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
7	NC_015922	TTA	2	6	630	635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
8	NC_015922	AAG	2	6	715	720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128168
9	NC_015922	TCT	2	6	830	835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
10	NC_015922	TGA	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
11	NC_015922	ATT	2	6	1175	1180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
12	NC_015922	AAT	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
13	NC_015922	CAC	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343128168
14	NC_015922	GAT	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
15	NC_015922	GGA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128168
16	NC_015922	TAG	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
17	NC_015922	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
18	NC_015922	TTC	2	6	2195	2200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
19	NC_015922	TCT	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
20	NC_015922	TAG	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
21	NC_015922	TCT	2	6	2280	2285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
22	NC_015922	ATG	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
23	NC_015922	GTG	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343128168
24	NC_015922	CTT	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
25	NC_015922	CAT	2	6	2569	2574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128168
26	NC_015922	TTC	2	6	2576	2581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
27	NC_015922	TTC	2	6	2759	2764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
28	NC_015922	TCA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128168
29	NC_015922	TAG	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
30	NC_015922	CTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
31	NC_015922	AGT	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
32	NC_015922	TTC	2	6	3104	3109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
33	NC_015922	ATT	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
34	NC_015922	TCT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
35	NC_015922	TCC	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343128168
36	NC_015922	TTA	2	6	3235	3240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
37	NC_015922	TCA	2	6	3273	3278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128168
38	NC_015922	AGA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128168
39	NC_015922	TTC	2	6	3323	3328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
40	NC_015922	CTC	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343128168
41	NC_015922	TTC	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
42	NC_015922	TTC	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
43	NC_015922	TCT	2	6	3813	3818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
44	NC_015922	ATT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
45	NC_015922	CTT	2	6	3922	3927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
46	NC_015922	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
47	NC_015922	AGT	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
48	NC_015922	TGT	2	6	4020	4025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128168
49	NC_015922	AAT	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
50	NC_015922	GTC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128168
51	NC_015922	GAA	2	6	4104	4109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128168
52	NC_015922	TTA	2	6	4146	4151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
53	NC_015922	TAA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
54	NC_015922	ATT	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128169
55	NC_015922	TAC	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128169
56	NC_015922	AAC	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128169
57	NC_015922	CAA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128169
58	NC_015922	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128169
59	NC_015922	TAC	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128169
60	NC_015922	CTA	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128169
61	NC_015922	ATT	2	6	5835	5840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128170
62	NC_015922	ATT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128170
63	NC_015922	ACA	2	6	5856	5861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128170
64	NC_015922	GTT	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128171
65	NC_015922	GAC	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128171
66	NC_015922	ATT	2	6	7705	7710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128172
67	NC_015922	CCA	2	6	7730	7735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343128172
68	NC_015922	AGG	2	6	7788	7793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128172
69	NC_015922	ATA	2	6	7806	7811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128172
70	NC_015922	AAG	2	6	7881	7886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128172
71	NC_015922	AAG	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128172
72	NC_015922	ATA	2	6	8108	8113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128172
73	NC_015922	GAA	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128172
74	NC_015922	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128172
75	NC_015922	TGA	2	6	8494	8499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128172
76	NC_015922	TGC	2	6	10151	10156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128174
77	NC_015922	ATT	2	6	10174	10179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128174
78	NC_015922	TGT	2	6	10245	10250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128174
79	NC_015922	TCA	2	6	10323	10328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128174
80	NC_015922	AAC	2	6	10429	10434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128174
81	NC_015922	CAA	2	6	10452	10457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128174
82	NC_015922	TAT	2	6	10461	10466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128174
83	NC_015922	AAT	2	6	10468	10473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128174
84	NC_015922	ATA	2	6	10524	10529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128174
85	NC_015922	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128175
86	NC_015922	TCA	2	6	10661	10666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128175
87	NC_015922	TCT	2	6	10697	10702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128175
88	NC_015922	AAT	2	6	10764	10769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128175
89	NC_015922	AAC	2	6	10993	10998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128175
90	NC_015922	TTC	2	6	10999	11004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128175
91	NC_015922	TGC	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128175
92	NC_015922	TAA	2	6	11041	11046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128175
93	NC_015922	TAA	3	9	11053	11061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128175
94	NC_015922	TAT	2	6	11062	11067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128175
95	NC_015922	TTC	2	6	11825	11830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128176
96	NC_015922	CTT	2	6	12040	12045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128176
97	NC_015922	ATT	2	6	12219	12224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128176
98	NC_015922	TCA	2	6	12264	12269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128176
99	NC_015922	ATC	2	6	12522	12527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128177
100	NC_015922	TTA	2	6	12533	12538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128177
101	NC_015922	TAA	2	6	12633	12638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128177
102	NC_015922	ATT	2	6	12679	12684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128177
103	NC_015922	AAT	2	6	12717	12722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128177
104	NC_015922	TAT	3	9	12744	12752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128177
105	NC_015922	ATT	2	6	12867	12872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128177
106	NC_015922	GAA	2	6	12889	12894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128177
107	NC_015922	TTC	2	6	12957	12962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128177
108	NC_015922	AGA	2	6	13015	13020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128177
109	NC_015922	CCT	2	6	13081	13086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343128177
110	NC_015922	ATT	2	6	13105	13110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128177
111	NC_015922	TCC	2	6	13142	13147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343128178
112	NC_015922	CTT	2	6	13266	13271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128178
113	NC_015922	TAA	2	6	13369	13374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128178
114	NC_015922	AAT	2	6	13473	13478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128178
115	NC_015922	ATT	2	6	13623	13628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128178
116	NC_015922	TAA	2	6	13726	13731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128179
117	NC_015922	ATT	2	6	13748	13753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128179
118	NC_015922	TGT	2	6	13820	13825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128179
119	NC_015922	TTA	2	6	13908	13913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128179
120	NC_015922	GTT	2	6	14190	14195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128179
121	NC_015922	TAA	3	9	14215	14223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128179
122	NC_015922	AAG	2	6	14224	14229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128179
123	NC_015922	TAT	2	6	14329	14334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128179
124	NC_015922	TAG	2	6	14444	14449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128179
125	NC_015922	TAG	2	6	14484	14489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128179
126	NC_015922	TAG	2	6	14523	14528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128179
127	NC_015922	AGT	2	6	14563	14568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128179
128	NC_015922	CTT	2	6	14590	14595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128179
129	NC_015922	TTA	2	6	14667	14672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128179
130	NC_015922	ATT	2	6	15393	15398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128180
131	NC_015922	CTT	2	6	15420	15425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128180
132	NC_015922	TTA	2	6	15436	15441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128180
133	NC_015922	ATC	2	6	15584	15589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128180
134	NC_015922	TAT	2	6	15730	15735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128180
135	NC_015922	TGG	2	6	15772	15777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343128180
136	NC_015922	CAA	2	6	15778	15783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128180
137	NC_015922	AAT	2	6	15793	15798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128180
138	NC_015922	TTG	2	6	16295	16300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128181
139	NC_015922	ATG	2	6	16322	16327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128181
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142	NC_015922	TAA	2	6	16437	16442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128181
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144	NC_015922	TGA	2	6	16842	16847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128182
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147	NC_015922	ATT	2	6	18078	18083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128184
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149	NC_015922	TAA	2	6	18126	18131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128184
150	NC_015922	ACA	2	6	19650	19655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128186
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162	NC_015922	TAT	2	6	22354	22359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128189
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170	NC_015922	ATT	2	6	22944	22949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128190
171	NC_015922	AAT	2	6	23020	23025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128190

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.