MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015921	AAAACC	2	12	3264	3275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015921	GGATTA	2	12	3612	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
3	NC_015921	AAGAAA	2	12	7149	7160	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127330
4	NC_015921	CAATAG	2	12	8652	8663	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127332
5	NC_015921	CAATAA	2	12	9075	9086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127332
6	NC_015921	TCTATT	2	12	9107	9118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127332
7	NC_015921	AATAAA	2	12	9515	9526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127333
8	NC_015921	CAGATA	2	12	11181	11192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127335
9	NC_015921	ATATTA	2	12	11619	11630	50 %	50 %	0 %	0 %	343127336
10	NC_015921	AAATTA	2	12	13492	13503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127338
11	NC_015921	GAAAAA	2	12	15850	15861	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127341
12	NC_015921	CTTGGA	2	12	16295	16306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	343127341
13	NC_015921	TAAAGG	2	12	16315	16326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	343127341
14	NC_015921	TAAATT	2	12	18573	18584	50 %	50 %	0 %	0 %	343127344
15	NC_015921	AACTAT	2	12	19053	19064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127344
16	NC_015921	CAACAT	2	12	20692	20703	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	343127345
17	NC_015921	AAATTA	2	12	22632	22643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127347
18	NC_015921	TTCAAA	2	12	22670	22681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127347
19	NC_015921	GTAAAT	2	12	26380	26391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343127351
20	NC_015921	TCAAAC	2	12	28733	28744	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	343127355
21	NC_015921	TCAATT	2	12	32246	32257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127359
22	NC_015921	TATCAA	2	12	32829	32840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127359
23	NC_015921	AGAAGC	2	12	33739	33750	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	343127359
24	NC_015921	AACTTT	2	12	37775	37786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127362
25	NC_015921	TAAATT	2	12	37868	37879	50 %	50 %	0 %	0 %	343127362
26	NC_015921	ATTTTT	2	12	38726	38737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	343127363
27	NC_015921	TAAATT	2	12	38990	39001	50 %	50 %	0 %	0 %	343127363
28	NC_015921	GAAAGA	2	12	39048	39059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127363
29	NC_015921	TATGAA	2	12	39868	39879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343127364
30	NC_015921	AATATA	2	12	39899	39910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127364
31	NC_015921	AAAATC	2	12	41123	41134	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127365
32	NC_015921	ATTAAA	2	12	42876	42887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127367
33	NC_015921	TAAATT	2	12	43815	43826	50 %	50 %	0 %	0 %	343127368
34	NC_015921	AATTAA	2	12	45406	45417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015921	TATATC	2	12	47637	47648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127372
36	NC_015921	AAATAA	2	12	48379	48390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127373
37	NC_015921	TAAAAA	2	12	49650	49661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127375
38	NC_015921	TAAAAA	2	12	50430	50441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127376
39	NC_015921	TCAAAT	2	12	51441	51452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127378
40	NC_015921	TTTGAC	2	12	51777	51788	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	343127378
41	NC_015921	TTTAAA	2	12	54448	54459	50 %	50 %	0 %	0 %	343127380
42	NC_015921	TTAAAA	2	12	57331	57342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127384
43	NC_015921	AAATTT	2	12	57352	57363	50 %	50 %	0 %	0 %	343127384
44	NC_015921	AAAAAT	2	12	57672	57683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127384
45	NC_015921	GAAAAA	2	12	57835	57846	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127384
46	NC_015921	GAAAAT	2	12	65848	65859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127393
47	NC_015921	AAAAAT	2	12	67855	67866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127394
48	NC_015921	ACTATC	2	12	68512	68523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127394
49	NC_015921	ATTCAA	2	12	68862	68873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127394
50	NC_015921	TGAAAA	2	12	69517	69528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127394
51	NC_015921	ATAAAA	2	12	69616	69627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127395
52	NC_015921	TAATTT	2	12	69758	69769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127395
53	NC_015921	ACCAAA	2	12	71509	71520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127397
54	NC_015921	AATTGA	2	12	72165	72176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343127397
55	NC_015921	TAGAAA	2	12	72263	72274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127397
56	NC_015921	AATAGA	2	12	73299	73310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127398
57	NC_015921	TTGCTA	2	12	76211	76222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	343127402
58	NC_015921	ATTCCA	2	12	77095	77106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127403
59	NC_015921	TGGAAT	2	12	77405	77416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127403
60	NC_015921	AAAAGA	2	12	77654	77665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127403
61	NC_015921	CCATTC	2	12	78467	78478	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	343127404
62	NC_015921	TAAATC	2	12	78598	78609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127404
63	NC_015921	TTTTAT	2	12	80672	80683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	343127406
64	NC_015921	TACAAA	2	12	81197	81208	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127407
65	NC_015921	AATTTT	2	12	81449	81460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127408
66	NC_015921	AATACT	2	12	85714	85725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015921	TTAAAC	2	12	88548	88559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127413
68	NC_015921	CAATTT	2	12	88567	88578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127413
69	NC_015921	ACATTA	2	12	88641	88652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127413
70	NC_015921	CAGAAA	2	12	90548	90559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343127415
71	NC_015921	TCTTTT	2	12	95241	95252	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343127420
72	NC_015921	TGGACT	2	12	99977	99988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	343127423
73	NC_015921	TTCATT	2	12	100644	100655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127425
74	NC_015921	AAAACT	2	12	101289	101300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015921	AAATGC	2	12	107406	107417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127431
76	NC_015921	AAAATC	2	12	111501	111512	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127435
77	NC_015921	TAAACT	2	12	111653	111664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127435
78	NC_015921	CAATAT	2	12	111703	111714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127436
79	NC_015921	AAATAG	2	12	114306	114317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127438
80	NC_015921	AATTTT	2	12	117285	117296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127441
81	NC_015921	AAGATC	2	12	117633	117644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127442
82	NC_015921	AAATCA	2	12	117700	117711	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127442
83	NC_015921	AATTTC	2	12	119642	119653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127445
84	NC_015921	ATCTTT	2	12	121777	121788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127448
85	NC_015921	TTTCTT	2	12	122061	122072	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343127448
86	NC_015921	CTTAGA	2	12	123537	123548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343127449
87	NC_015921	AATTCT	2	12	124704	124715	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127451
88	NC_015921	ATCTGA	2	12	128008	128019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	343127454
89	NC_015921	TGATAT	2	12	132106	132117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343127456
90	NC_015921	ATTTTT	2	12	132467	132478	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	343127457
91	NC_015921	TTTGGA	2	12	134840	134851	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	343127458
92	NC_015921	TTAAAA	2	12	135174	135185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127458
93	NC_015921	AAAATA	2	12	135563	135574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127458
94	NC_015921	AAACTA	2	12	136935	136946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127459
95	NC_015921	ATTTTA	2	12	139447	139458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127461
96	NC_015921	ATCCCA	2	12	140281	140292	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	343127461
97	NC_015921	CTAAAT	2	12	141188	141199	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127461
98	NC_015921	ACTAAG	2	12	142393	142404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127462
99	NC_015921	AAAAGA	2	12	143687	143698	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343127463
100	NC_015921	AAAATA	2	12	145798	145809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127466
101	NC_015921	AAATCA	2	12	146209	146220	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127467
102	NC_015921	TTTCAT	2	12	146900	146911	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127467
103	NC_015921	CATTGC	2	12	147295	147306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	343127468
104	NC_015921	TCAACT	2	12	149345	149356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127469
105	NC_015921	CAAGAA	2	12	152250	152261	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343127472
106	NC_015921	GTTGGA	2	12	152348	152359	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	343127472
107	NC_015921	AATTCA	2	12	153150	153161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127473
108	NC_015921	TTAAAT	2	12	154664	154675	50 %	50 %	0 %	0 %	343127474
109	NC_015921	AACTAC	2	12	154735	154746	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	343127474
110	NC_015921	TAAAAA	2	12	156336	156347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127475
111	NC_015921	AATACT	2	12	156469	156480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	343127475
112	NC_015921	AATTAA	2	12	156814	156825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127475
113	NC_015921	ATTATA	2	12	157174	157185	50 %	50 %	0 %	0 %	343127475
114	NC_015921	AAGACA	2	12	157390	157401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	343127476
115	NC_015921	GAAAAT	2	12	159115	159126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127479
116	NC_015921	CTAGAA	2	12	160230	160241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127480
117	NC_015921	ATTTTT	2	12	160645	160656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	343127480
118	NC_015921	TCATAT	2	12	161113	161124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	343127481
119	NC_015921	ATCTTT	2	12	161634	161645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127481
120	NC_015921	TCTTGC	2	12	162778	162789	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	343127483
121	NC_015921	AATCAA	2	12	167906	167917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127486
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240	NC_015921	GCTTTT	2	12	342212	342223	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	343127650
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351	NC_015921	CTATTG	2	12	486252	486263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	343127774
352	NC_015921	AATTTA	2	12	487024	487035	50 %	50 %	0 %	0 %	343127775
353	NC_015921	ATTGAT	2	12	489390	489401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343127779
354	NC_015921	ATTTTA	2	12	492874	492885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
355	NC_015921	CTATTT	2	12	493123	493134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127782
356	NC_015921	CTGTTA	2	12	495362	495373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	343127785
357	NC_015921	ATGTTT	2	12	496645	496656	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	343127787
358	NC_015921	TATGAA	2	12	499860	499871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	343127793
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410	NC_015921	ATTGAT	2	12	589231	589242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343127879
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448	NC_015921	CATGGT	3	18	641386	641403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	343127917
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450	NC_015921	TTAAAA	2	12	646663	646674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_015921	GGAATG	2	12	687677	687688	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	343127950
471	NC_015921	TTGATG	2	12	689413	689424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	343127953
472	NC_015921	TGATTT	2	12	690641	690652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	343127954
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