MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp56

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015920	TTTTCT	2	12	269	280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343127221
2	NC_015920	TAATAT	2	12	3450	3461	50 %	50 %	0 %	0 %	343127222
3	NC_015920	ATTAAT	2	12	3477	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	343127222
4	NC_015920	AATAGG	2	12	3777	3788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	343127222
5	NC_015920	TAAATA	2	12	4560	4571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127223
6	NC_015920	AAAAGA	2	12	7214	7225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015920	CATTCT	2	12	9847	9858	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	343127227
8	NC_015920	GCTCTC	2	12	10497	10508	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	343127228
9	NC_015920	ATTTTC	2	12	14337	14348	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127235
10	NC_015920	CAGTTT	2	12	14510	14521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	343127235
11	NC_015920	GAAATC	2	12	14577	14588	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127235
12	NC_015920	CTCAGC	2	12	14967	14978	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	343127236
13	NC_015920	GTTTTT	2	12	16788	16799	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	343127238
14	NC_015920	TTTCTA	2	12	20100	20111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127242
15	NC_015920	CTCGTA	2	12	20380	20391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	343127242
16	NC_015920	TTTCAT	2	12	22069	22080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	343127243
17	NC_015920	AAGGAA	2	12	24571	24582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127247
18	NC_015920	AGAGAA	2	12	25389	25400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127247
19	NC_015920	GCAAAC	2	12	25454	25465	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	343127247
20	NC_015920	AAGCTA	2	12	25756	25767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	343127248
21	NC_015920	TGAAAA	2	12	26840	26851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127250
22	NC_015920	AATTTA	2	12	27932	27943	50 %	50 %	0 %	0 %	343127251
23	NC_015920	AATTTA	2	12	28019	28030	50 %	50 %	0 %	0 %	343127251
24	NC_015920	ATATTA	2	12	29260	29271	50 %	50 %	0 %	0 %	343127252

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.