MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp56

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015920	TATC	2	8	759	766	25 %	50 %	0 %	25 %	343127221
2	NC_015920	TTTC	2	8	1110	1117	0 %	75 %	0 %	25 %	343127221
3	NC_015920	TTAA	2	8	1847	1854	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
4	NC_015920	ATCT	2	8	1971	1978	25 %	50 %	0 %	25 %	343127221
5	NC_015920	TTTA	2	8	2578	2585	25 %	75 %	0 %	0 %	343127221
6	NC_015920	GTTT	2	8	3006	3013	0 %	75 %	25 %	0 %	343127221
7	NC_015920	GCTA	2	8	3103	3110	25 %	25 %	25 %	25 %	343127221
8	NC_015920	ATCC	2	8	3386	3393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015920	AGGA	2	8	3747	3754	50 %	0 %	50 %	0 %	343127222
10	NC_015920	ATTA	2	8	4290	4297	50 %	50 %	0 %	0 %	343127223
11	NC_015920	TTCT	2	8	4676	4683	0 %	75 %	0 %	25 %	343127223
12	NC_015920	TAAT	2	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	343127223
13	NC_015920	TCAA	2	8	5582	5589	50 %	25 %	0 %	25 %	343127224
14	NC_015920	TCCT	2	8	5718	5725	0 %	50 %	0 %	50 %	343127225
15	NC_015920	TTTG	2	8	5803	5810	0 %	75 %	25 %	0 %	343127225
16	NC_015920	ATTT	2	8	6269	6276	25 %	75 %	0 %	0 %	343127226
17	NC_015920	TTTG	2	8	6414	6421	0 %	75 %	25 %	0 %	343127226
18	NC_015920	TTAA	2	8	6786	6793	50 %	50 %	0 %	0 %	343127226
19	NC_015920	CTAA	2	8	7406	7413	50 %	25 %	0 %	25 %	343127227
20	NC_015920	AAAG	2	8	8190	8197	75 %	0 %	25 %	0 %	343127227
21	NC_015920	CCAT	2	8	8370	8377	25 %	25 %	0 %	50 %	343127227
22	NC_015920	CAAA	2	8	8391	8398	75 %	0 %	0 %	25 %	343127227
23	NC_015920	GTTA	2	8	8611	8618	25 %	50 %	25 %	0 %	343127227
24	NC_015920	TCTA	2	8	8656	8663	25 %	50 %	0 %	25 %	343127227
25	NC_015920	CTTG	2	8	8712	8719	0 %	50 %	25 %	25 %	343127227
26	NC_015920	CCAA	2	8	8942	8949	50 %	0 %	0 %	50 %	343127227
27	NC_015920	TGTT	2	8	9140	9147	0 %	75 %	25 %	0 %	343127227
28	NC_015920	TGCC	2	8	9279	9286	0 %	25 %	25 %	50 %	343127227
29	NC_015920	TTTA	2	8	9625	9632	25 %	75 %	0 %	0 %	343127227
30	NC_015920	TCGC	2	8	9656	9663	0 %	25 %	25 %	50 %	343127227
31	NC_015920	TTGA	2	8	10024	10031	25 %	50 %	25 %	0 %	343127227
32	NC_015920	ATTT	2	8	10487	10494	25 %	75 %	0 %	0 %	343127227
33	NC_015920	GTTC	2	8	10532	10539	0 %	50 %	25 %	25 %	343127228
34	NC_015920	AAAC	2	8	10547	10554	75 %	0 %	0 %	25 %	343127228
35	NC_015920	AATT	2	8	10816	10823	50 %	50 %	0 %	0 %	343127229
36	NC_015920	ATTA	2	8	11189	11196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015920	AATC	2	8	11806	11813	50 %	25 %	0 %	25 %	343127230
38	NC_015920	AAGT	2	8	12406	12413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015920	AAAG	2	8	12877	12884	75 %	0 %	25 %	0 %	343127233
40	NC_015920	TAAA	2	8	12986	12993	75 %	25 %	0 %	0 %	343127233
41	NC_015920	TTTG	2	8	13095	13102	0 %	75 %	25 %	0 %	343127233
42	NC_015920	AACA	2	8	13358	13365	75 %	0 %	0 %	25 %	343127234
43	NC_015920	ATTT	2	8	15123	15130	25 %	75 %	0 %	0 %	343127236
44	NC_015920	TTTC	2	8	15229	15236	0 %	75 %	0 %	25 %	343127237
45	NC_015920	CTTA	2	8	15239	15246	25 %	50 %	0 %	25 %	343127237
46	NC_015920	TGAA	2	8	15497	15504	50 %	25 %	25 %	0 %	343127237
47	NC_015920	GTTT	2	8	16356	16363	0 %	75 %	25 %	0 %	343127238
48	NC_015920	GCAA	2	8	16424	16431	50 %	0 %	25 %	25 %	343127238
49	NC_015920	AGAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	25 %	0 %	343127238
50	NC_015920	ATTG	2	8	17198	17205	25 %	50 %	25 %	0 %	343127238
51	NC_015920	TTTC	2	8	17264	17271	0 %	75 %	0 %	25 %	343127238
52	NC_015920	AAAG	2	8	17671	17678	75 %	0 %	25 %	0 %	343127239
53	NC_015920	TTTG	2	8	18154	18161	0 %	75 %	25 %	0 %	343127240
54	NC_015920	AATT	2	8	18178	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	343127240
55	NC_015920	TACC	2	8	18523	18530	25 %	25 %	0 %	50 %	343127241
56	NC_015920	ACTT	2	8	18972	18979	25 %	50 %	0 %	25 %	343127241
57	NC_015920	TCCT	2	8	18991	18998	0 %	50 %	0 %	50 %	343127241
58	NC_015920	TAAC	2	8	19050	19057	50 %	25 %	0 %	25 %	343127241
59	NC_015920	ATTA	2	8	19687	19694	50 %	50 %	0 %	0 %	343127242
60	NC_015920	TTTA	2	8	19795	19802	25 %	75 %	0 %	0 %	343127242
61	NC_015920	AGTG	2	8	20352	20359	25 %	25 %	50 %	0 %	343127242
62	NC_015920	TCAG	2	8	20486	20493	25 %	25 %	25 %	25 %	343127242
63	NC_015920	TACA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	0 %	25 %	343127242
64	NC_015920	CAAT	2	8	21314	21321	50 %	25 %	0 %	25 %	343127242
65	NC_015920	TTGT	2	8	22236	22243	0 %	75 %	25 %	0 %	343127243
66	NC_015920	GGTT	2	8	22247	22254	0 %	50 %	50 %	0 %	343127243
67	NC_015920	AAGA	2	8	22282	22289	75 %	0 %	25 %	0 %	343127243
68	NC_015920	TTTA	2	8	23085	23092	25 %	75 %	0 %	0 %	343127245
69	NC_015920	AATC	2	8	23111	23118	50 %	25 %	0 %	25 %	343127245
70	NC_015920	AGAT	2	8	23731	23738	50 %	25 %	25 %	0 %	343127246
71	NC_015920	ATTT	2	8	23771	23778	25 %	75 %	0 %	0 %	343127246
72	NC_015920	TACT	2	8	23840	23847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015920	ATAA	2	8	23857	23864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015920	CTAG	2	8	23873	23880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015920	TGAT	2	8	24364	24371	25 %	50 %	25 %	0 %	343127247
76	NC_015920	GGAA	2	8	25309	25316	50 %	0 %	50 %	0 %	343127247
77	NC_015920	GGAG	2	8	26034	26041	25 %	0 %	75 %	0 %	343127248
78	NC_015920	GATA	2	8	26686	26693	50 %	25 %	25 %	0 %	343127249
79	NC_015920	ATCA	2	8	26696	26703	50 %	25 %	0 %	25 %	343127249
80	NC_015920	TAGA	2	8	26767	26774	50 %	25 %	25 %	0 %	343127249
81	NC_015920	TTGA	2	8	27090	27097	25 %	50 %	25 %	0 %	343127250
82	NC_015920	ACAA	2	8	27740	27747	75 %	0 %	0 %	25 %	343127251
83	NC_015920	ATTA	2	8	28444	28451	50 %	50 %	0 %	0 %	343127251
84	NC_015920	TTGA	2	8	28707	28714	25 %	50 %	25 %	0 %	343127252
85	NC_015920	GAAT	2	8	28855	28862	50 %	25 %	25 %	0 %	343127252
86	NC_015920	TAAT	2	8	28915	28922	50 %	50 %	0 %	0 %	343127252
87	NC_015920	ATAG	2	8	28936	28943	50 %	25 %	25 %	0 %	343127252
88	NC_015920	GAAT	2	8	29180	29187	50 %	25 %	25 %	0 %	343127252
89	NC_015920	GATT	2	8	29195	29202	25 %	50 %	25 %	0 %	343127252
90	NC_015920	TAAT	2	8	29432	29439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.